Николенко Алексей Геннадьевич
Заведующий лабораторией биохимии адаптивности насекомых

Состав лаборатории в алфавитном порядке

• Гайфуллина Луиза Римовна

  ФИО:   Гайфуллина Луиза Римовна

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

• Гатауллин Алмаз Рашитович

  ФИО:  Гатауллин Алмаз Рашитович

  аспирант

  Continue reading →

• Ильясов Рустем Абузарович

  ФИО:   Ильясов Рустем Абузарович

  Степень:   доктор биологических наук

  Должность:   старший научный сотрудник

  Continue reading →

• Каримова Алия Альфисовна

  ФИО:  Каримова Алия Альфисовна

  аспирант

  Continue reading →

• Николенко Алексей Геннадьевич

  

  ФИО:   Николенко Алексей Геннадьевич 

  Степень:   доктор биологических наук, профессор

  Должность:  заведующий лабораторией биохимии адаптивности насекомых

  Continue reading →

• Поскряков Александр Витальевич

  ФИО:   Поскряков Александр Витальевич

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   старший научный сотрудник

  Continue reading →

• Салтыкова Елена Станиславовна

  ФИО:   Салтыкова Елена Станиславовна

  Степень:   доктор биологических наук

  Должность:   старший научный сотрудник

  Continue reading →

• Соколянская Марина Павловна

  ФИО:   Соколянская Марина Павловна

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

За период исследований 2016-2020 гг в рамках темы НИР «Молекулярные механизмы реализации биологического потенциала растений и микроорганизмов» номер госрегистрации АААА-А16-116020350028-4, сотрудниками лаборатории биоинженерии растений и микроорганизмов ИБГ УФИЦ РАН получены чистые культуры ризобий из клубеньков эндемичных видов бобовых растений Южного Урала, принадлежащих к родам остролодочник (Oxytropis) и копеечник (Hedysarum) и проведен генетический анализ, показавший их филогенетическую близость к бактериям рода Mesorhizobium.

Показана возможность искусственной активации генов нитрогеназного комплекса и индукции азотфиксации у клубеньковых бактерий родов Rhizobium, Mesorhizobium и Sinorhizobium ex planta в свободноживущем состоянии путем привнесения в их геном гена регуляторного белка NifA под управлением индуцируемых бактериальных промоторов. При этом выявлена функциональная универсальность регуляторного белка NifA ризобий родов Rhizobium, Ensifer и Mesorhizobium в штаммах других родов микроорганизмов внутри группы клубеньковых бактерий.

Показана высокая частота конъюгативного переноса маркерных мобилизируемых плазмид между клетками близкородственных штаммов клубеньковых бактерий Rhizobium, Sinorhizobium (Ensifer), и Mesorhizobium.

Изучен характер колонизации корней культурных растений штаммами Rhizobium leguminosarum и Rhizobium galegae,с измененной экспрессией белка RapA1 и показана эффективность полученных de novo симбиотических систем. Показано, что на трансформированных корнях адсорбируется больше бактерий, чем на корнях контрольных растений, и эффективнее проходит процесс формирования биопленок, что вызывает стимуляцию процессов роста и развития трансформированных растений.

Получены штаммы ризобий Rhizobium leguminosarum с повышенной экспрессией генов pssA, pssB, rosR, регулирующих биосинтез экзополисахаридов, и изучена их способность к образованию биопленок на инертных поверхностях. Трансформация штаммов генами rosR и rapA1, положительно влияла на эффективность образования биопленок на корнях томата и рапса, в том числе трансгенных. Несмотря на это, было показано, что в долгосрочной перспективе для контроля состава ризосферы эффективным является трансформация растений генами агглютининов.

Показано, что конститутивная экспрессия гена PnXTH1 способствует увеличению размеров листьев и стебля табака, а также повышает стрессоустойчивость растений благодаря поддержанию клеточного растяжения в корнях и стеблях на более высоком уровне и способности более эффективно сохранять влагу в листьях, чем растения дикого типа. Конститутивная экспрессия гена глутатион-S-трансферазы AtGST способствует улучшению параметров роста побега и корня, как при нормальных условиях, так и при действии засухи, холода и засоления. Уровень экспрессии генов экспансинов, ксилоглюканэндотрансгликозилаз, глутатион-S-трансфераз и генов семейства ARGOS повышается при воздействии на растения гипотермии, засухи и засоления.

Созданы трансгенные растения рапса, амаранта, хлопчатника, репы и руколы конститутивно экспрессирующие гены ARGOS-LIKE и AtGST1 под контролем 35S промотора. Отобраны линии трансгенных растений, отличающиеся повышенной продуктивностью и устойчивостью к стрессовым факторам в условиях агроэкосистем.

Разработан метод безбактериального получения бородатых корней с помощью биобаллистической трансформации линейным ампликоном, содержащим A-, B-, C-, D-rol-гены с Т-бордерами Agrobacterium rhizogenes. Получены и исследованы на наличие целевых метаболитов культуры бородатых корней витании Withania somnifera, кок-сагыза Taraxacum kok-saghyz, крым-сагыза Taraxacum hybernum и водяного ореха Trapa natans L.

Работа по подготовке кадров

Перечень защищенных докторских и кандидатских диссертаций

докторская –

Баймиев Ан.Х. «Клубеньковые бактерии дикорастущих бобовых растений Южного Урала и молекулярное конструирование их искусственных ассоциаций с небобовыми растениями», 2012.

Кулуев Б.Р.Молекулярные механизмы регуляции размеров органов у растений. 2016.

кандидатские –

Постригань Б.Н. Активность промотора гена фитохелатинсинтазы риса и псевдофитохелатинового гена в модельных трансгенных растениях табака. 2009.

Вершинина З.Р. Лектины бобовых растений как инструмент для создания новых симбиотических систем. 2010.

Мухаметханов Н.Х. Анализ структуры и получение в прокариотической системе рекомбинантного белка G2 хантавирса серотипа Пуумала, изолированного из зоонозного очага на территории Республики Башкортостан. 2010.

Птицын К.Г. Молекулярно-генетический анализ клубеньковых бактерий дикорастущих бобовых растений трибы Vicieae, произрастающих на территории Республики Башкортостан. 2012

Ильясова А.А. Конститутивная гетерологичная экспрессиягенов ARGOS, AINTEGUMENTA и CLAVATA3 в трансгенных растениях табака. 2012

Машков О.И. Клонирование гена эндонуклеазы I бактериофага T7 и создание штаммов-суперпродуцентов. 2012

Дмитрюкова М.Ю. Влияние экспрессии гена леггемоглобина А сои на рост, дыхание и антиоксидантное состояние трансформированных растений табака (Nicotiana tabaccum L.). 2012

Благова Д.К. Искусственные ассоциации бактерий Rhizobium leguminosarum с корнями томата и табака, трансгенными по гену psl лектина гороха. 2013.

Фарафонтов Д.С. Метилирование ДНК и экспрессия генов транскрипционных факторов CBF у растений капусты Brassica oleracea L. при холодовой акклимации. 2013.

Иванова Е.С. Симбиотические гены как инструмент поиска и модификации клубеньковых бактерий дикорастущих бобовых растений Южного Урала. 2014.

Сафиуллина М.Г. Конститутивная и индуцибельная экспрессия генов экспансинов в трансгенных растениях табака. 2015.

Михайлова Е.В. Создание трансгенных растений с увеличенными размерами органов, и оценка экологической безопасности их возделывания. 2017.

Хакимова Л.Р. Бактериальный адгезин RAPA1 Rhizobium leguminosarum как инструмент в биоинженерии микробно-растительных симбиозов. 2017.

Гуменко Р.С. Получение штаммов клубеньковых бактерий с изменённой регуляцией генов нитрогеназного комплекса. 2020.

Кулуев А.Р. Молекулярно-генетическое исследование Triticum sinskajae A.Filat. et Kurk и филогения диплоидных пшениц. 2021.

Лавина А.М. Гены-регуляторы синтеза экзополисахаридов в формировании биопленок Rhizobium lеgumiпоsаrum. 2022.

Владимирова А.А. Исследование функциональной специфичности продукта гена nifA внутри группы клубеньковых бактерий. 2022.

Continue reading →

• Геращенков Григорий Алексеевич

  ФИО:   Геращенков Григорий Алексеевич 

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   старший научный сотрудник

  https://www.researchgate.net/profile/Grigory_Gerashchenkov

  Continue reading →

• Лавина Анна Михайловна

  ФИО:  Лавина Анна Михайловна

  Степень: кандидат биологических наук

  Должность:  научный сотрудник

  Continue reading →

• Матниязов Рустам Тахирович

  ФИО:   Матниязов Рустам Тахирович 

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

• Михайлова Елена Владимировна

  

  ФИО: Михайлова Елена Владимировна

  Степень:    кандидат биологических наук

  Должность:   старший научный сотрудник

  https://www.researchgate.net/profile/Elena_Mikhaylova2

  Continue reading →

• Никоноров Юрий Михайлович

  ФИО:   Никоноров Юрий Михайлович  

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   старший  научный сотрудник

  https://www.researchgate.net/profile/Iu_Nikonorov

  Continue reading →

• Рожнова Наталья Анатольевна

  ФИО:   Рожнова Наталья Анатольевна 

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

• Хакимова Лилия Ралисовна

  

  ФИО: Хакимова Лилия Ралисовна

  Степень:    кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

   

  Continue reading →

• Чемерис Алексей Викторович

  ФИО: Чемерис Алексей Викторович

  Степень: доктор биологических наук, профессор, Заслуженный деятель науки РБ. Заведующий лабораторией с 1995г. по 2015 г., зам. директора по научной работе – с 1999 по 2016 г.

  Должность: главный научный сотрудник

  https://www.researchgate.net/profile/Alexey_Chemeris

  Continue reading →

• Чубукова Ольга Вячеславовна

  ФИО:   Чубукова Ольга Вячеславовна 

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

Основные научные результаты

С целью познания факторов формирования генофонда, генетической реконструкции родства и происхождения современных народов Волго-Уральского региона (ВУР), Средней Азии, Кавказа и Сибири проведен комплексный анализ трех типов молекулярно-генетических маркеров: аутосомных, митохондиальных и Y-хромосомных. Полиморфизм ДНК ядерного генома изучен на основании полногеномного анализа 650 000 SNPs. Полиморфизм Y-хромосомы представлен 18 микросателлитными и 60 диаллельными локусами. Полиморфизм мтДНК изучен на основании анализа тридцати ПДРФ-локусов и секвенционного анализа нуклеотидной последовательности гипервариабельного сегмента I мтДНК. В ходе исследований проанализированы геномы 1600 индивидов из 10 популяций ВУР, 2000 индивидов из 24 этнических групп Кавказа, 1000 индивидов из 9 популяций Средней Азии и 500 индивидов из популяций Сибири. В лаборатории сформирован банк ДНК из 10 000 индивидов, представляющих 50-ти этнических групп Евразии. В результате комплексного анализа полиморфизма мтДНК, Y-хромосомы и аутосомных локусов впервые получены детальные характеристики структуры генофонда народов этих регионов, выявлены эволюционные взаимосвязи при формировании генофонда народов Евразии, сформирована целостная картина генетических взаимоотношений, непосредственно отражающих этническую историю, генетическое родство, филогенетические взаимоотношения и эволюцию современных народов Евразии.

Изучены молекулярно-генетические основы более 20 моногенных заболеваний (муковисцидоза, фенилкетонурии, миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, болезни Вильсона, гемофилии А, несиндромальной аутосомно-рецессивной глухоты, наследственных моторно-сенсорных нейропатий, синдрома ломкой X-хромосомы, несовершенного остеогенеза, адреногенитального синдрома, галактоземии и др.) в Республике Башкортостан. В генах изученных наследственных заболеваний в различных этнических группах установлены существенные особенности по спектру и частоте мутаций, определенные закономерности гено-фенотипической корреляции при данных заболеваниях и некоторые важные структурные особенности соответствующих генов. Разработаны и внедрены в практику медико-генетического консультирования наиболее оптимальные для региона, с учетом этнической принадлежности больных,  подходы пренатальной и пресимптоматической ДНК-диагностики.

Проведено молекулярно-генетическое изучение более 25 многофакторных заболеваний и комплексных признаков: онкологических (рака молочной железы, рака яичников, рака почки, хронического миелолейкоза), аллергических (бронхиальной астмы, атопического дерматита, аллергического ринита), психических (параноидной шизофрении, униполярной депрессии, хронического алкоголизма, опийной наркомании, агрессивного и суицидального поведения), болезни Паркинсона, остеопороза, гемохроматоза, псориаза, туберкулеза, свойств личности, темперамента и др. Изучение многофакторной патологии включало анализ полиморфизма более 1000 генов-кандидатов и полногеномный анализ ассоциаций 610 000 SNPs для ряда заболеваний. Для всех указанных заболеваний установлены генетические факторы повышенного и пониженного риска развития той или иной патологии, формы или характера течения заболевания, определены общие и этноспецифические аллели и гаплотипы риска. Проведенные исследования дают возможность детально охарактеризовать процесс взаимодействия генетических и средовых факторов риска заболеваний, спрогнозировать риск развития определенных заболеваний у человека и разработать профилактические мероприятия и индивидуальные рекомендации по изменению стиля жизни, что позволит минимизировать риск заболевания.

Список лиц, защитивших кандидатские диссертации в лаборатории

молекулярной генетики человека

1. Хидиятова И.М. «Использование рестрикционного полиморфизма ДНК в популяционно-генетических исследования». 1993 г.
2. Викторова Т.В. «Частота хромосомных аберраций и активность ядрышкообразующих районов акроцентрических хромосом у рабочих нефтехимических производств». 1993.
3. Викторов В.В. «Синдром полиорганной недостаточности при распространенных формах аппендикулярного перитонита у детей». 1996 г.
4. Миронов П.И. «Особенности изобелкового состава крови и процессов липопероксидации у детей с хроническими неспецифическими заболеваниями легких». 1992.
5. Ахмадеева Л.Р. «Миотоническая дистрофия в Республике Башкортостан». 1998.
6. Пушкарева А.Э. «Изучение полиморфизма ДНК у больных инфарктом миокарда». 1997.
7. Петрова С.Н. «Некоторые закономерности генетико-биохимической адаптации населения к условиям города с развитой химической промышленностью». 1998.
8. Камалтдинова Г.Я. «Роль генетических факторов риска в развитии гипертонической болезни». 1998.
9. Туктарова И.А. «Особенности липидного спектра сыворотки крови и полиморфизм аполипопротеинов В и Е в аспектах проблемы адаптации к условиям урбанизированной антропогенной среды». 1998.
10. Карунас А.С. «Молекулярно-генетическое изучение болезни Вильсона-Коновалова в Башкортостане». 1999.
11. Гринчук О.В. «Молекулярно-генетическое изучение мышечной дистрофии Дюшенна в Башкортостане». 1999.
12. Султанаева З.М. «Молекулярно-генетическое изучение гемофилии А в Башкортостане». 1999.
13. Фатхлисламова Р.И. «Молекулярно-генетическое изучение миотонической дистрофии в Башкортостане». 1999.
14. Бердина Л.М. «Исследование липопротеидного спектра и цитогенетической нестабильности хромосомного аппарата у жителей Башкортостана». 1999.
15. Вдовина Т.Р. «Врожденные пороки развития в системе генетического мониторинга новорожденных города Уфы». 1999.
16. Габитов Н.И. «Изучение генетических факторов развития артериальной гипертензии в различных  группах населения республики Башкортостан». 1999.
17. Закирова Л.К. «Клинико-цитогенетическое изучение хромосомных болезней у детей в республике Башкортостан». 1999.
18. Эткина И.А. «Клинико-генетические ассоциации у детей, больных бронхиальной астмой». 2000.
19. Нафикова А.Х. «Комплексное генетико-биохимическое исследование рабочих нефтехимического производства и больных группы «риска» алкогольного гепатита в городе Уфе».  2000.
20. Авхадеева С.Р. «Клинико-генетические особенности врожденной катаракты в республике Башкортостан». 2001.
21. Ахметова В.Л. «Молекулярно-генетический анализ гена фенилаланингидроксилазы у народов Волго-Уральского региона». 2001.
22. Бермишева М.А. «Генофонд народов Волго-Уральского региона по данным о полиморфизме митохондриальной ДНК и Y хромосомы». 2001.
23. Юрьев Е.Б. «Анализ генетических ассоциаций полиморфизма в генах кандидатах нейромедиаторной системы с острым алкогольным психозом». 2001.
24. Полюдова О.Н. «Изучение полиморфных ДНК-локусов как потенциальных генетических факторов риска эссенциальной гипертензии». 2001.
25. Морозова А.А. «Клинико-генетические ассоциации при железодефицитной анемии». 2001.
26. Байкова Г.В. «Клинико-генетическая характеристика муковисцидоза у детей республики Башкортостан». 2001.
27. Кутуев И.A. «Анализ гена хореи Гентингтона у больных и в популяциях Волго-Уральского региона». 2002.
28. Шагисултанова Е.И. «Изучение полиморфных ДНК-локусов как потенциальных генетических факторов риска инфаркта миокарда». 2002.
29. Гареева А.Э. «Исследование ассоциаций полиморфных вариантов генов переносчиков и рецепторов серотонина и дофамина с опийной наркоманией». 2002.
30. Хасанов А.Х. «Клинико-иммунологические особенности системных проявлений ревматоидного артрита и развития глюкокортикоидной зависимости при различных вариантах сочетания HLA детерминант». 2002.
31. Корытина Г.Ф. «Анализ гена трансмембранного регуляторного белка муковисцидоза у больных из Башкортостана и в популяциях Волго-Уральского региона». 2002.
32. Горбунова Е.В. «Исследование ассоциаций ряда генов-кандидатов с острым алкогольным психозом». 2002.
33. Асадуллина Г.В. «Липидный спектр мембран эритроцитов и полиморфные ДНК-локусы у больных эссенциальной гипертензией». 2002.
34. Насибуллин Т.Р. «Особенности генетической конституции у больных эссенциальной гипертензией по полиморфным ДНК-локусам». 2002.
35. Джемилева Л.У. «Анализ генов GJB2 и GJB3 у больных несиндромальной наследственной глухотой и в некоторых популяциях Волго-Уральского региона». 2002.
36. Зайнуллина А.Г. «Изучение ассоциаций полиморфных ДНК-локусов с параноидной шизофренией». 2002.
37. Нигматуллина А.Э. «Динамика показателей липидного спектра сыворотки крови и оценка эффективности физической реабилитации больных острым инфарктом миокарда». 2002.
38. Цисина К. «Гемодинамика и полиморфизм генов ренинангиотензиновой системы у больных острым инфарктом миокарда». 2002.
39. Калакуток З.Н. «Полиморфизм генов ренин-ангиотензин-альдостероновой системы и риск эссенциальной гипертензии у адыгов и русских». 2002.
40. Елисеева Н.А. «Цитогенетическая нестабильность и состояние антиоксидантной системы у жителей городов с развитой нефтехимической промышленностью и риск патологии молочной железы». 2002.
41. Галимова Р.Р. «Клинико-генетический анализ при множественной миеломе в Башкортостане». 2003.
42. Туктарова С.У.  «Психотические нарушения при церебральном атеросклерозе (клинико-генетические аспекты)». 2003.
43. Коршунова Т.Ю. «Анализ генетической структуры популяций Северного Кавказа по данным о полиморфизме митохондриального и ядерного геномов». 2004.
44. Батырова А.З. «Анализ полиморфизма ДНК ядерного и митохондриальных геномов в популяциях Средней Азии». 2004.
45. Гайсина Д.А. «Анализ ассоциаций генов нейромедиаторных систем с агрессивным поведением человека». 2004.
46. Кононова С.К. «Биоэтические проблемы применения ДНК-дагностики моногенных заболеваний в практике медико-генетической консультации Якутии»». 2004.
47. Гилязова И.Р. «Молекулярно-генетическое изучение болезни Паркинсона в Башкортостане». 2004.
48. Валиев Р.Р. «Анализ гена фибрилина-1 у больных синдромом Марфана». 2005.
49. Имангулова М.М. «Анализ генов предрасположенности к туберкулезу легких в Республике Башкортостан». 2005.
50. Фаттахова А.Х. «Исследование молекулярно-генетических основ предрасположенности к идиопатической эпилепсии». 2005.
51. Исламгулов Д.В. «Клинико-генетическое исследование умственной отсталости в республике Башкортостан». 2005.
52. Оразгалиева М.Г. «Анализ гена фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией и в популяциях Республики Казахстан». 2005.
53. Шалухина А.Р. «Эпидемиологическое и клинико-генетичекое исследование бронхиальной астмы в Республике Башкортостан». 2006.
54. Григорьева Л.В. «Молекулярно-генетическое исследование инфаркта миокарда в популяции якутов». 2006.
55. Юнусбаев Б.Б. «Популяционно-генетическое исследование народов Дагестана по данным о полиморфизме Y-хромосомы и Alu-инсерций». 2006.
56. Крупина Н.Б. «Эпидемиологическое и клинико-генетическое изучение наследственных моторно-сенсорных нейропатий в Республике Башкортостан» 2006.
57. Ишмухаметова А.Т. «Клинико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование миастении в Республике Башкортостан». 2006.
58. Исламова А.А. «Роль Y хромосомы и митохондриальной ДНК в нарушении сперматогенеза». 2007.
59. Гринберг Э.Р. «Молекулярно-генетический анализ тапеторетинальной абиотрофии в Республике Башкортостан». 2007.
60. Егорова О.В.  «Клинико-генетическое исследование больных миомой матки». 2007.
61. Зиннатуллина Г.Ф. «Определение факторов прогноза течения рака молочной железы на основании молекулярно-генетических исследований». 2007.
62. Барашков Н.А. «Молекулярно-генетическое изучение наследственной несиндромальной сенсоневральной глухоты в Республике Саха (Якутия)». 2007.
63. Магжанова А.Р. «Гено-фенотипические корреляции при болезни Вильсона-Коновалова». 2007.
64. Багаутдинова Э.Г.  «Молекулярно-генетическое изучение наследственных моторно-сенсорных нейропатий I типа в Республике Башкортостан» 2007.
65. Асадуллин А.Р.    «Клинико-генетические аспекты эндогенного депрессивного эпизода». 2007.
66. Багаутдинова Э.Г. «Молекулярно-генетическое изучение наследственных моторно-сенсорных нейропатий I типа в Республике Башкортостан» 2007.
67. Байтимеров А. Р. «Эпидемиологическое и клинико-генетическое изучение болезни Паркинсона в Республике Башкортостан». 2007.
68. Хузина А.Х. «Анализ предрасположенности к аллергическому риниту в Республике Башкортостан».  2008.
69. Галимова Э.С.  «Молекулярно-генетическое исследование псориаза». 2008.
70. Тазетдинов А.М. «Анализ генов 12SrRNA, tRNA, MYO7ASer(UCN) и USH2A у пациентов с наследственными формами нарушения зрения и слуха».
71. Казанцева А.В. «Молекулярно-генетические основы черт темперамента и личности». 2008.
72. Рамазанова Н.Н. «Клиническая значимость полиморфных вариантов гена индуцибельной синтазы оксида азота и генов цитокинов, регулирующих ее синтез, у детей, больных бронхиальной астмой». 2008.
73. Селезнева Л.И.  «Молекулярно-генетическое исследование остеопороза». 2008
74. Гончарова О.В. «Улучшение комплексной диагностики неходжкинских лимфом на основании клинико-генетических исследований». 2009.
75. Боготова З.И.  «Изучение генетической структуры популяций кабардинцев и балкарцев». 2009.
76. Лобов А.С. «Структура генофонда субпопуляций башкир». 2009.
77. Куличкин С.С. «Молекулярно-генетическое изучение наследственной предрасположенности к развитию хронического алкоголизма в популяциях якутов и эвенков Республики Саха (Якутия)». 2009.
78. Федорова Ю.Ю. «Анализ генов предрасположенности к развитию бронхиальной астмы в Республике Башкортостан». 2009.
79. Гринберг Я.И. «Комплексное медико – и популяционно-генетическое изучение населения республики Башкортостан генетика». 2009.
80. Мингазова Э.З. «Клинико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое изучение прогрессирующих спиноцеребеллярных атаксий в Республике Башкортостан».  2009.
81. Фасхутдинова Г.Г. «Молекулярно-генетическое изучение зависимости от психоактивных веществ». 2010.
82. Литвинов С.С. «Изучение генетической структуры народов Западного Кавказа по данным о полиморфизме Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и Alu-инсерций». 2010.
83. Носкова Т.В. «Молекулярно-генетическое изучение предрасположенности к развитию униполярной депрессии в Республике Башкортостан».2010.
84. Мурзагалеева Лира Валерьевна «Клинико-генетическое исследование аскаридоза в Республике Башкортостан» (к.м.н.). 2010.
85. Рамова Зумрад Фердинандовна «Распространенность и клинико-генетическая характеристика гипокортицизма у детей в Республике Башкортостан». 2010.
86. Минниахметов Ильдар Рамилевич «Молекулярно-генетическое исследование хронического миелолейкоза». 2011.
87. Надыршина Дина Даяновна «Эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование несовершенного остеогенеза». 2011.
88. Хуснутдинова Наталья Николаевна «Исследование мутаций в генах гемохроматоза и рецептора трансферрина 2 в популяциях Центральной Евразии и у больных многофакторными заболеваниями». 2012.
89. Мустафин Рустем Наилевич «Эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование нейрофиброматоза I типа в Республике Башкортостан». 2012.
90. Фарахтдинова Альбина Рауфовна «Молекулярно-генетическое изучение рака молочной железы». 2012.
91. Викторов Сергей Витальевич «Прогнозирование тяжести клинического течения  острых гнойно-воспалительных заболеваний челюстно-лицевой области у детей с применением генетических маркеров». 2012.
92. Гусманова Гульназ Таузиховна «Клинико-генетическое исследование циррозов печени». 2012.
93. Ахмерова Инесса Юрьевна «Клинико-эпидемиологическое и молекулярно-генетическое исследование шизофрении в Республике Башкортостан». 2012.
94. Лобов Семен Леонидович «Структурные особенности генов пендрина (SLC26A4) и престина (SLC26A5) у больных наследственной несиндромальной сенсоневральной глухотой». 2013.
95. Прокофьева Дарья Симоновна «Изучение генетических факторов риска развития рака яичников» 2013.
96. Халилова Зульфия Леонардовна «Анализ ассоциаций генов, участвующих в реализации стресс-реакции, с суицидальным поведением». 2013.
97. Кутлыева Лилия Разифовна «Молекулярно-генетическое изучение рака почки в Республике Башкортостан». 2013.
98. Рахимкулова Айгуль Айратовна «Молекулярно-генетическое исследование врожденной дисфункции коры надпочечников, обусловленной недостаточностью 21-гидроксилазы». 2013.
99. Скачкова Ирина Алексеевна «Анализ генов MFN2, GDAP1 и NEFL у больных наследственными моторно – сенсорными нейропатиями из Республики  Башкортостан». 2013.

100. Гималова Галия Фуатовна «Исследование молекулярно-генетических основ атопического дерматита». 2013.
101. Закиров Денис Филарисович «Изучение генетических факторов риска развития и эффективности терапии параноидной шизофрении». 2013.
102. Валиулина Аделина Рамиловна «Изучение роли генов нейропептидов и нейротрансмиттерных систем в развитии агрессивного поведения человека». 2013.
103. Кутлумбетова Юлия Юлаевна «Изучение роли генов рецепторов нейропептидов, половых гормонов и семейства нейротрофинов в формировании свойств личности». 2014.
104. Мальцев Андрей Владимирович «Исследование генетических факторов развития постменопаузального остеопороза в Волго-Уральском регионе». 2014.

Список лиц, защитивших докторские диссертации под руководством

профессора Э.К.Хуснутдиновой

1. Викторова Т.В. “Генофонд народов Волго-Уральского региона: полиморфизмф ядерной, митохондриальной ДНК и анализ мутаций в генах наследственных заболеваний”. 2002.
2. Мустафина О.Е. «Анализ предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям у городских жителей по показателям липидного гомеостаза крови и полиморфизму генов-кандидатов». 2004.
3. Лебедева Е.Р. «Интракраниальные аневризмы: факторы риска, ранняя диагностика» 2007.
4. Федорова С.Ф. «Этногеномика коренных народов Саха». 2008.
5. Хидиятова И.М. «Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных заболеваний нервной системы в Республике Башкортостан». 2008.
6. Беньковская Г.В. «Стресс-реакция как механизм реализации адаптивного потенциала особей и популяций насекомых». 2009.
7. Мурзабаева С.Ш. «Оптимизация медико-генетической службы Республики Башкортостан». 2010.
8. Кутуев Ильдус Альбертович «Генетическая структура и молекулярная филогеография народов Кавказа». 2010.
9. Джемилева Лиля Усеиновна «Молекулярно-генетический анализ наследственной несиндромальной сенсоневральной глухоты». 2011.
10. Карунас Александра Станиславовна «Молекулярно-генетическое исследование аллергических заболеваний». 2012.
11. Явловская Любовь Леонидовна «Клинико-генетические аспекты и прогнозирование диабетической ретинопатии у якутов при сахарном диабете 2 типа». 2014.

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ АДАПТАЦИИ РАСТЕНИЙ К СТРЕССАМ, ВЫЗЫВАЮЩИМ НАРУШЕНИЕ ВОДНОГО РЕЖИМА

Проводятся исследования разнообразия функциональной значимости АБК-регулируемых белков лектина АЗП и дегидринов в формировании устойчивости пшеницы к обезвоживанию, вызываемому засухой, гипотермией, натрий-хлоридным засолением, воздействием ионов кадмия.

АЗП – УЧАСТНИК РЕГУЛИРУЕМОЙ ЭНДОГЕННОЙ АБК УСТОЙЧИВОСТИ ПШЕНИЦЫ К ТОКСИЧЕСКИМ ИОНАМ НАТРИЯ И КАДМИЯ

Впервые продемонстрирована ключевая роль эндогенной АБК в регуляции индукции экспрессии АЗП в корнях проростков пшеницы в ответ на натрий-хлоридное засоление и кадмиевый стресс и его экскреции в окружающую корни среду. Будучи экскретируемым во внешнюю окружающую корни среду белком, АЗП становится как бы экзогенным лектином и проявляет способность ускорять отложение лигнина в клеточных стенках базальной части корней пшеницы в норме и интенсифицировать эти процессы при воздействии токсических ионов натрия и кадмия.

Выявленное свойство АЗП вносит важный вклад в торможение проникновения токсических ионов в ткани корня, сосуды ксилемы и побег и в снижение уровня повреждающего действия токсических ионов на ростовые процессы и в ускорение репарации роста растений в пост-стрессовый период.

Впервые продемонстрирована ключевая роль эндогенной АБК в регуляции индукции экспрессии АЗП в корнях проростков пшеницы в ответ на натрий-хлоридное засоление и кадмиевый стресс и его экскреции в окружающую корни среду.

Ко-иммунолокализация АБК и АЗП на поперечных срезах корней проростков пшеницы, преимущественно в клетках ризодермы и центрального цилиндра, в норме и при воздействии токсических ионов натрия и кадмия стресса позволила впервые визуализировать роль эндогенной АБК в контроле содержания АЗП. Выявлено, что воздействие ацетата кадмия вызывает пропорционально резкое усиление иммунофлуоресценции гормона и лектина в тканях, тогда как экзогенный АЗП способствует поддержанию заметно меньшего по уровню накопления как АБК, так и АЗП при стрессе.

Выявлена способность экзогенного АЗП снижать уровень вызываемой ионами натрия и кадмия продукции АФК и, как следствие, уменьшать уровень активности антиоксидантных ферментов в этих условиях, что указывает на вовлечение про-/антиоксидантной систем в спектр защитного действия АЗП на растения и отражается в поддержании интенсивности ростовых процессов растений при стрессе на уровне близком контролю.

Впервые продемонстрировано наличие альтернативных АБК путей гормональной регуляции транскрипции генов АЗП, а именно, 24-эпибрассинолидом (ЭБ), цитокинином 6-бенизаминопурином (БАП), метилжасмонатом (МеЖ), а также салициловой кислотой (СК), сочетающих в себе свойства активаторов ростовых процессов и индукторов стресс-устойчивости. При этом ЭБ, МеЖ и БАП индуцируют экспрессию этого гена независимо от эндогенной АБК, тогда как СК – опосредовано через вызываемое быстрое транзиторное накопление АБК в растениях пшеницы. Эти результаты указывают на вовлечение АЗП в проявление их рост-стимулирующего, предадаптирующего к возможным неблагоприятным ситуациям и защитного действия к стрессам, вызывающим нарушение водного режима, и в снижении уровня повреждающего эффекта стрессовых факторов на интенсивность ростовых процессов пшеницы.

Впервые в клетках различных тканей базальной части корней проростков пшеницы в норме и при нарушении водного режима визуализирована коиммунолокализация АБК, агглютинина зародыша пшеницы (АЗП) и дегидринов.

Фитогормоны-стимуляторы ростовых процессов 24-эпибрассинолид (ЭБ), салициловая кислота(СК) и метилжасмонат (МеЖ) участвуют в формировании лигнин-суберинового комплекса клеточных стенок корней пшеницы, укрепляющего их барьерные свойства при обезвоживании.

УЧАСТИЕ ДЕГИДРИНОВ В ФОРМИРОВАНИИ УСТОЙЧИВОСТИ ПШЕНИЦЫ К СТРЕССОВЫМ ФАКТОРАМ, ВЫЗЫВАЮЩИМ ОБЕЗВОЖИВАНИЕ

С использованием ингибитора биосинтеза АБК флуридона выявлены зависимые и независимые от стресс-индуцированнного накопления АБК пути регуляции транскрипции клонированного нами гена дегидрина TADHN и количественного уровня дегидринов.

ВКЛАД ДЕГИДРИНОВ В ПРОЯВЛЕНИЕ ПРЕДАДАПТИРУЮЩЕГО И ПРОТЕКТОРНОГО ДЕЙСТВИЯ ФИТОГОРМОНОВ НА РАСТЕНИЯ

Предобработка 24-эпибрассинолидом способствует уменьшению уровня негативного эффекта ацетата кадмия на деление апикальной меристемы корней пшеницы и ускорению восстановления митотической активности клеток в пост-стрессовый период.

Иной механизм гормональной регуляции уровня дегидринов выявлен в проростках пшеницы в ходе обработки салициловой кислотой (СК), а также в предобработанных СК и подвергнутых воздействию кадмия растениях.

Важный вклад в проявление предадаптирующего и защитного действия СК на растения пшеницы, подвергнутые кадмиевому стрессу, также вносит дегидрин с М.м. 28 кД, при этом СК-предобработанные растения характеризуются меньшим уровнем стресс-индуцированного накопления АБК и дегидринов, однако флуридон полностью предотвратил индуцируемый СК синтез обоих дегидринов в этих условиях. Полученные результаты указывают на ключевую роль вызываемого СК обратимого накопления АБК и поддержание повышенного уровня АБК в предобработанных СК растениях в регуляции количественного уровня дегидринов.

С использованием ингибитора биосинтеза АБК флуридона выявлены зависимые и независимые от стресс-индуцированнного накопления АБК пути регуляции транскрипции клонированного нами гена дегидрина TADHN и количественного уровня дегидринов.

С использованием вестерн-блот анализа обнаружены качественные и количественные сдвиги в содержании белков дегидринов в побегах предобработанных БАП, ЭБ или МеЖ пшеницы в норме и в условиях прогрессирующей засухи и выявлен их вклад в формирование засухоустойчивости растений.

МЕХАНИЗМЫ ГОРМОНАЛЬНОЙ РЕГУЛЯЦИИ СТРЕСС-УСТОЙЧИВОСТИ РАСТЕНИЙ ПШЕНИЦЫ

Роль эндогенных цитокининов в проявлении физиологического действия

фитогормонов 24-эпибрассинолида и метилжасмоната на растения пшеницы

Эндогенные цитокинины вовлекаются в реализацию ростстимулирующего и антистрессового действия метилжасмоната на растения пшеницы

Способность метилжасмоната вызывать быстрое транзиторное накопление цитокининов в норме и предотвращать падение их уровня при стрессе за счет регуляции транскрипции гена цитокининоксидазы и ее ферментативной активности проявляется в рост-стимулирующем и защитном действии метилжамоната на растения пшеницы. Эти данные указывают в пользу выполнения эндогенными цитокининами роли гормональных интермедиатов в реализации физиологического действия метилжасмоната на растения пшеницы.

Перестройки в протеоме иллюстрируют степень негативного действия стрессовых факторов на растения и эффективность обработки фитогормонами с целью уменьшения уровня повреждающего действия стрессов

Протеомный анализ позволил впервые выявить важный вклад вызываемых ЭБ и БАП перестроек в содержании белков, вовлеченных в процессы фотосинтеза, роста, энергетического обмена и защиты растений, а также в реализацию протекторного эффекта ЭБ и БАП на побеги проростков контрастных по засухоустойчивости сортов пшеницы в условиях прогрессивной засухи.

С использованием ингибитора синтеза брассиностероидов (БС) брассиназола (BRz) выявлен важный вклад эндогенных БС в регуляцию перестроек протеома и фосфопротеома побегов пшеницы в норме и при стрессе, тогда как предобработка BRz слабо повлияла на вызываемые БАП сдвиги в обмене белков, что указывает на наличие независимых от БС путей регуляции физиологических эффектов БАП на растения.

Заведующая лабораторией молекулярных механизмов устойчивости растений к стрессам

кандидат биологических наук,

Ласточкина Оксана Владимировна

Член Общества физиологов растений России, Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB)

Первый состав лаборатории – Ш.Я. Гилязетдинов, к.б.н., в.н.с.; Г.А. Геращенков, к.б.н., с.н.с.; Р.А. Фатхутдинова, к.б.н., н.с.; Е.Н. Балахонцев, к.б.н., в.н.с.; Ф.Ф. Исхаков, Н.А. Рожнова, к.б.н., н.с.; к.б.н., с.н.с.; Ф.М. Шакирова (д.б.н., зав. лаб.); И.А. Яхин, к.б.н., в.н.с.; М.В. Безрукова, к.б.н., н.с.; М.С. Юмагужин, к.б.н., с.н.с.

• Ласточкина Оксана Владимировна
  Степень: кандидат биологических наук
  Должность: заведующий лабораторией

• Авальбаев Азамат Мэлсович

  ФИО:   Авальбаев Азамат Мэлсович

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:  старший научный сотрудник

  Continue reading →

• Аллагулова Чулпан Рифовна

  ФИО:   Аллагулова Чулпан Рифовна

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

  Лубянова Алсу Ринатовна

  ФИО:   Лубянова Алсу Ринатовна

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

• Масленникова Дилара Ринатовна

  ФИО:   Масленникова Дилара Ринатовна

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

  Шакирова Фарида Миннихановна

  ФИО:   Шакирова Фарида Миннихановна 

  Степень: доктор биологических наук

  Должность: главный научный сотрудник

  Дополнительная информация

  Член Общества физиологов растений России, Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB), лауреат премии АН РБ им. В.К. Гирфанова.

  Continue reading →

• Юлдашев Руслан Адикович

  ФИО:   Юлдашев Руслан Адикович

  Степень:   кандидат биологических наук

  Должность:   научный сотрудник

  Continue reading →

• Яхин Олег Ильдусович

  Степень: кандидат биологических наук

  Должность: старший научный сотрудник

Изучение механизмов нейроиммунного взаимодействия в норме и при воспалительных нейродегенеративных заболеваниях

– Проведено изучение эффектов глутамата на адгезию мононуклеаров, полученных от больных рассеянным склерозом и здоровых доноров, в модельной системе in vitro с использованием первичных эндотелиальных клеток человека (HUVEC). Показано, что глутамат способствовал увеличению количества адгезированных нестимулированных лимфоцитов лимфоцитов к интактному, и, более значимо – к активированному TNFa эндотелию, причем, это характерно для клеток, полученных как от здоровых индивидуумов, так и от больных рассеянным склерозом. Показано также, что глутамат усиливает адгезионную способность антиген-стимулированных лимфоцитов здоровых доноров и больных рассеянным склерозом как к интактному, так и к активированному эндотелию. Глутамат в диапазоне концентраций 1 – 1000 мкМ усиливает адгезионные cвойства клеток Jurkat к фибронектину.

– Приоритетными являются данные об участии пары VLA-4/VCAM-1 в опосредовании эффектов глутамата на адгезию Т-клеток к эндотелиоцитам. Подтверждена вовлеченность преимущественно AMPA рецепторов в регуляцию адгезии Т-клеток и клеток Jurkat к компоненту экстраклеточного матрикса фибронектину.

– Впервые установлено опосредованное глутаматом снижение экспрессии молекулы адгезии VLA-4 в антиген-активированных СD³⁺-позитивных клетках больных рассеянным склерозом. Показано разнонаправленное действие глутамата и агонистов AMPA и NMDA рецепторов на миграционную активность СD³⁺ CD69⁺ CD25¯, СD³⁺ CD69¯ CD25⁺ и СD³⁺ CD69⁺ CD25⁺ клеток здоровых доноров и больных рассеянным склерозом.

– Впервые показана способность глицина и кинуреновой кислоты оказывать влияние на процессы адгезии к эндотелиоцитам иммунокомпетентных клеток больных рассеянным склерозом, что имеет значение для понимания значения периферических патогенетических механизмов этого заболевания.

Изыскание биологически активных веществ с использованием модельных систем in vitro

– Среди новых производных имидов малеопимаровой кислоты выявлено соединение, обладающее селективной

цитотоксической активностью, обусловленной регуляцией патогенетически значимой биомишени – топоизомеразы IIa. Данное соединение вызывает индукцию митохондриального пути апоптоза, арест клеточного цикла в фазе G2/M.

– Проведена оценка цитотоксическикх свойств конъюгатов ряда производных хинолизидинового алкалоида (-)-цитизина, а также термопсина с формилурацилом. Показано, что урацилсодержащий 3-амино-12-N-бензилцитизин проявляет выраженную активность в отношении клеточных линий опухолевого происхождения Jurkat и HepG2. Среди тиопроизводных хинолизидинового алкалоида (-)-цитизина выраженные цитотоксические свойства проявил лишь тиобензилцитизин.

– С целью поиска соединений с потенциальными противоопухолевыми свойствами был проведен биологический скрининг 545 соединений из коллекций официальных поставщиков. Все соединения для скрининга были отобраны на основе предварительного in silico профилирования.

Среди исследованных соединений выявлены активные молекулы, проявляющие активность в отношении клеточных линий опухолевого происхождения и не оказывающие влияния на жизнеспособность условно-нормальных клеток.

– Проведена оценка влияния новых соединений производных тритерпеноидов, 5-оксипиримидина на адгезию опухолевых клеток к фибронектину. Показано, что производные тритерпеноидов вызывали дозозависимое снижение адгезии к фибронектину. Производные 5-оксипиримидина не оказывали эффекта на адгезию клеток Jurkat к фибронектину, в тоже время, установлено усиление адгезионной активности антиген-стимулированных мононуклеаров при действии этих соединений, что согласуется с наличием у них выраженных противовоспалительных свойств.

– Для производных тритерпеновых кислот солодки и хинолизидиновых алкалоидов термопсиса проведена оценка их способности активировать систему интерферонов I типа с использованием тест-система Cignal GFP Reporter Assay Kit, которая позволяет идентифицировать соединения-индукторы IFN-I– регулируемого сигнального пути на основе анализа их влияния на активность ISRE-элементов. При инкубации клеток, трансфицированных ISRE-GFP репортерной конструкцией, с соединениями на фоне IFNa-2b (1000 ME/мл) были выявлены соединения, повышающие в среднем на 30 % относительный уровень флуоресценции, что указывает на способность данных веществ опосредованно модулировать систему интерферонов I типа.

Важнейшие научные результаты / The most important scientific results.

Исследованы особенности генетической архитектуры ассоциированных с возрастом заболеваний сердечно-сосудистой, нейроэндокринной и дыхательной систем с использованием в качестве маркеров полиморфных участков более 200 генов-кандидатов. Идентифицированы геномные маркеры предрасположенности к ассоциированным с возрастом заболеваниям, выявлены гены, имеющие потенциальную значимость как маркеры старения и мишени для геропротекторов. Выявлены паттерны генов, дифференциально экспрессирующихся в мононуклеарных клетках крови людей старческого возраста и долгожителей, пациентов с хронической обструктивной болезнью легких, сердечно-сосудистыми заболеваниями. Подтверждена гипотеза о роли полиморфизма, обусловленного инсерцией или делецией Alu-ретроэлементов в интроны генов, в вариабельности продолжительности жизни человека.  Сотрудники лаборатории принимают активное участие в работе отечественных и международных конференций в форме устных докладов и стендовых сообщений, читают курс лекций по современным проблемам цитогенетики, медицинской генетики, экологической генетики для студентов Башкирского Государственного Медицинского Университета и Башкирского Государственного Педагогического Университета, являются научными руководителями студенческих научных кружков, курсовых и дипломных работ, выполняемых на базе лаборатории. Исследования проводятся в рамках выполнения Программ фундаментальных научных исследований государственных академий наук, а также проектов, поддержанных Российским Фондом Фундаментальных Исследований, Российским Гуманитарным Научным Фондом, Академией Наук Республики Башкортостан, Федеральной Целевой Программой, Министерством науки и высшего образования РФ.

The members of the laboratory have defined the genetic architecture of age-associated diseases of the cardiovascular, neuroendocrine and respiratory systems using more than 200 polymorphic markers of candidate genes. Genomic markers of predisposition to age-associated diseases have been detected, and genes that have potential significance as markers of aging and targets for geroprotectors have been identified. The patterns of genes that are differentially expressed in blood mononuclear cells of people of old age and long-livers, patients with chronic obstructive pulmonary disease, cardiovascular diseases have been revealed. The hypothesis on the role of polymorphism caused by insertion or deletion of Alu retroelements into gene introns in the variability of human life span has been confirmed. The members of the laboratory actively present their findings at Russian and international scientific meetings, read courses of lectures on modern problems of cytogenetics, medical genetics, ecological genetics for students of the Bashkir State Medical University and the Bashkir State Pedagogical University, are the scientific leaders of student scientific societies, supervise Bachelor, Master, and PhD students. Research is performed within the framework of the programs of fundamental scientific research of the state academies of sciences, as well as projects supported by the Russian Foundation for Basic Research, the Russian Humanitarian Scientific Foundation, the Academy of Sciences of the Republic of Bashkortostan, the Federal Target Program, the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation

Ведущие научные кадры / Principal investigators:

Мустафина Ольга Евгеньевна – заведующий лабораторией с 2000-2019 г.г. 28.08.1955-01.04.2020, д.б.н., проф. заслуженный деятель науки. Под непосредственным руководством Мустафиной О.Е. или при её научном консультировании подготовлено 14 кандидатов наук и один доктор наук. Автор более 200 научных работ.

Olga Evgenievna Mustafina (28.08.1955-01.04.2020) – head of the laboratory in 2000-2019, professor, doctor of biological sciences, Honored Scientist. O.E. Mustafina has supervised 14 candidates of sciences (PhD) and one doctor of sciences (DS). Author of over 200 research papers.

Корытина Гульназ Фаритовна – д.б.н., доцент. С 2002 работает в Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН: аспирант (1997-2002), науч. сотр. (2002–2004), ст. науч. сотр. (2004–2019), зав. лаб. (2019 – по н.в.),  с 2019 года также  является профессором кафедры биологии БГМУ. Научные интересы связаны, главным образом, с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности, хронических заболеваний дыхательной системы и молекулярных основ адаптации человека к условиям хронического антропогенного загрязнения. Актуальная коллекция биоматериалов  больных с хронической обструктивной болезнью легких, детей с хроническими заболеваниями органов дыхания, рабочих с профессиональными заболеваниями органов дыхания и здоровых индивидов содержит более 2000 образцов ДНК и 200 образцов  РНК, принадлежащих к основным этническим группам, проживающим на территории Республики Башкортостан. В настоящее время ведутся работы по изучению закономерностей формирования патологического фенотипа в связи с экспрессией, полиморфизмом генов, эпигенетическими процессами.  Автор более 150 науч. работ. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, РИНЦ AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, Recearcher ID WOS A-1688-2014).

Контакты: e-mail: guly_kory@mail.ru, т. +7347 2356088, вн-тел. 4-04,2-32  кабинет №211 и 404.

Gulnaz F. Korytina, PhD, Prof., Head of the Laboratory of Physiological Genetics of Institute of Biochemistry and Genetics – Subdivision of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences, Professor of Department of Biology, Bashkir State Medical University

Research interests are related to the study of the genetics of complex diseases, in particular, chronic respiratory diseases (chronic obstructive pulmonary disease, childhood lung diseases, occupation asthma and chronic bronchitis), metabolic disorders (type 2 diabetes mellitus, obesity), cardiovascular diseases and the molecular basis of human adaptation to the conditions of chronic anthropogenic pollution, as well as molecular patterns of aging.  The current collection of biomaterials of patients with chronic obstructive pulmonary disease, children with chronic respiratory diseases, workers with professional diseases of respiratory and healthy individuals contains more than 2000 DNA samples and 200 RNA samples belonging to the main ethnic groups living in the Republic of Bashkortostan. At present, our laboratory work on the study of the patterns of formation of a pathological phenotype in connection with expression, gene polymorphism, and epigenetic processes. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, RSI AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, WOS Recearcher ID A-1688-2014). tel. +7347 2356088).

Contact Information:  e-mail: guly_kory@mail.ru,  +7347 2356088, 4-04, 2-32, laboratory room  №211, 404

Викторова Татьяна Викторовна, д.м.н., проф., гл.н.с (до 2018 г). Заслуженный деятель науки РБ (2014). С 1988 в ОБЦ БНЦ РАН: аспирант (1988-1992), м.н.с. (1992-1993), н.с. (1993-1995), с.н.с. (1995-2000), зав. лаб. экологической генетики человека (2000-2010), гл.н.с. 2010-2018. С 2003 г. работает в БГМУ – зав. кафедрой биологии. Научная деятельность посвящена изучению молекулярно-генетических основ формирования экологически-обусловленной многофакторной патологии человека. Под ее руководством подготовлено и защищено 23 кандидатских и 2 докторские диссертации. Автор более 300 научных работ (Recearcher ID J-4802-2014, Scopus ID (Viktorova T.V.)  7004732165 and   (Victorova T.V.) 6506939042,  ORCID http://orcid.org/0000-0001-8900-2480).

Контакты:   e-mail: t-vict@mail.ru

Viktorova Tatyana Viktorovna, Doctor of Medical Sciences, Prof., Chief Scientist at the IBG UFRC RAS (until 2018). Honored Scientist of the Republic of Belarus (2014). Had worked at the BSC RAS since 1988: post-graduate student (1988-1992), junior researcher (1992-1993), researcher (1993-1995), senior researcher (1995-2000), head of the Laboratory ecological human genetics (2000-2010), chief researcher 2010-2018. Since 2003 he has been a head of the Department of Biology at Bashkir State Medical University. Scientific activity is devoted to the study of the molecular-genetic foundations of the formation of ecologically-conditioned multifactorial human pathology. T. V. Viktorova has supervised 23 PhD and 2 doctoral dissertations. Author of over 300 scientific papers. (Recearcher ID J-4802-2014, Scopus ID (Viktorova T.V.)  7004732165 and   (Victorova T.V.) 6506939042,  ORCID http://orcid.org/0000-0001-8900-2480). Contact Information: e-mail: t-vict@mail.ru

Состав лаборатории в алфавитном порядке

• Ахмадишина Лейсан Зинуровна

  

  Ахмадишина Лейсан Зинуровна к.б.н., н.с. работает в ИБГ с 2005 г. научные интересы связаны с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности профессиональных бронхитов у рабочих и рака мочевого пузыря,   также механизмов адаптации человека к факторам окружающей среды на основе изучения популяционных частот вариантов генов биотрансформации ксенобиотиков, антиоксидантной защиты и репарации ДНК. (Recearcher ID A-2362-2014 Scopus ID – 13409244200 https://orcid.org/0000-0003-0043-5090)

  Контакты:  E-mail:   leys82@mail.ru  т. +7347 2356088, вн-тел.2-32  кабинет №211.

  Akhmadishina Leysan Zinurovna, Candidate of Biological Sciences, Researcher. Has been working at IBG since 2005. Research interests are related to the study of the genetics of multifactorial diseases, in particular, occupational bronchitis in workers and bladder cancer, as well as the mechanisms of human adaptation to environmental factors based on the study of population frequencies of variants in genes involved in biotransformation of xenobiotics, antioxidant defense and DNA repair. (Recearcher ID A-2362-2014 Scopus ID – 13409244200 https://orcid.org/0000-0003-0043-5090)

  Contact Information: E-mail:   leys82@mail.ru +7347 2356088 (2-32), laboratory room  №211

  Continue reading →

• Ахметкиреева Тансулпан Тимерхановна

  Ахметкиреева Тансулпан Тимерхановна, м.н.с. закончила аспирантуру ИБГ в 2018 г. в настоящее время работает над изучением популяционно-генетических и физиолого-биохимических аспектов адаптациогенеза и развития стресс-реакции у насекомых. (AuthorID: 703213, WoS ResearcherID,  Scopus AuthorID).

  Контакты: E-mail:  tansulpan.ufa@gmail.com Тел.: +73472356088 (4-26), Кабинет № 224а.

  Akhmetkireeva Tansulpan Timerhanovna, junior researcher. Has completed her postgraduate studies at IBG in 2018 and is currently conducting the research of population-genetic and physiological-biochemical aspects of adaptationogenesis and the development of stress responses in insects. (AuthorID: 703213, WoS ResearcherID,  Scopus AuthorID).

  Contact Information:  E-mail:  tansulpan.ufa@gmail.com tel: +73472356088 (4-26), laboratory room   № 224а

  Continue reading →

• Беньковская Галина Васильевна

  Беньковская Галина Васильевна, д.б.н., доцент, в.н.с. С 1978 работает в БФАН СССР: ст.-иссл. ИХ (1978-1981), мл.н.с. ОБЦ (1982-1989), н.с. ИОХ (1989-1991), с.н.с. (1992-1993), с.н.с ОБЦ (1993-1999), в.н.с ИБГ (2012 по н.в). Научные интересы связаны с изучением популяционно-генетических и физиолого-биохимических аспектов адаптациогенеза и развития стресс-реакции у насекомых. Среди учеников 5 кандидатов наук. Автор более 100 научных работ: из них 4 монографии (WoS ResearcherID: C-2416-2017 Scopus AuthorID: 707329).  Контакты: E-mail:  bengal2@yandex.ru,  Тел.: +73472356088 (4-26), Кабинет № 224а

  Benkovskaya Galina Vasilievna, Doctor of Biological Sciences, Associate Professor, Leading Researcher. Has been working at BFAN USSR since 1978: junior researcher at the Institute of Chemistry (1978-1981), junior researcher at OBT (1982-1989), researcher at the Institute of Organic Chemistry (1989-1991), senior researcher (1992-1993), senior researcher at OBT (1993-1999), senior researcher at IBG (2012 to the present). Research interests are related to the study of population genetics and physiological and biochemical aspects of adaptation genesis and the development of stress responses in insects. Has supervised 5 PhD dissertations. Author of over 100 research works, including 4 monographs. WoS ResearcherID: C-2416-2017 Scopus AuthorID: 707329).

  Contact Information: E-mail: bengal2@yandex.ru, tel: +73472356088 (4-26), laboratory room   № 224а

  Continue reading →

• Викторова Татьяна Викторовна

  

  Викторова Татьяна Викторовна, д.м.н., проф., гл.н.с (до 2018 г). Заслуженный деятель науки РБ (2014). С 1988 в ОБЦ БНЦ РАН: аспирант (1988-1992), м.н.с. (1992-1993), н.с. (1993-1995), с.н.с. (1995-2000), зав. лаб. экологической генетики человека (2000-2010), гл.н.с. 2010-2018. С 2003 г. работает в БГМУ – зав. кафедрой биологии. Научная деятельность посвящена изучению молекулярно-генетических основ формирования экологически-обусловленной многофакторной патологии человека. Под ее руководством подготовлено и защищено 23 кандидатских и 2 докторские диссертации. Автор более 300 научных работ (Recearcher ID J-4802-2014, Scopus ID (Viktorova T.V.)  7004732165 and   (Victorova T.V.) 6506939042,  ORCID http://orcid.org/0000-0001-8900-2480).

  Контакты:   e-mail: t-vict@mail.ru

  Viktorova Tatyana Viktorovna, Doctor of Medical Sciences, Prof., Chief Scientist at the IBG UFRC RAS (until 2018). Honored Scientist of the Republic of Belarus (2014). Had worked at the BSC RAS since 1988: post-graduate student (1988-1992), junior researcher (1992-1993), researcher (1993-1995), senior researcher (1995-2000), head of the Laboratory ecological human genetics (2000-2010), chief researcher 2010-2018. Since 2003 he has been a head of the Department of Biology at Bashkir State Medical University. Scientific activity is devoted to the study of the molecular-genetic foundations of the formation of ecologically-conditioned multifactorial human pathology. T. V. Viktorova has supervised 23 PhD and 2 doctoral dissertations. Author of over 300 scientific papers. (Recearcher ID J-4802-2014, Scopus ID (Viktorova T.V.)  7004732165 and   (Victorova T.V.) 6506939042,  ORCID http://orcid.org/0000-0001-8900-2480). Contact Information: e-mail: t-vict@mail.ru

   

  Continue reading →

• Каримов Денис Дмитриевич

  Каримов Денис Дмитриевич, к.б.н., м.н.с. закончил аспирантуру ИБГ, в 2021 году успшно защитил кандидатскую диссертацию на тему «Исследование роли Alu-повторов в старении и долголетии человека» на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07 – генетика.

  Контакты:  E-mail:  lich-tsar@mail.ru Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room  № 215.

  Karimov Denis Dmitrievich, Candidate of Biological Sciences, junior researcher. Has completed his postgraduate studies at IBG and in 2021 has successfully defended his Ph.D. thesis on the topic “Research of the role of Alu repeats in human aging and longevity” for the degree of candidate of biological sciences in specialty 03.02.07 – genetics.

  Contact Information:  E-mail:  lich-tsar@mail.ru  Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

  Continue reading →

• Корытина Гульназ Фаритовна

  

  Корытина Гульназ Фаритовна – д.б.н., доцент. С 2002 работает в Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН: аспирант (1997-2002), науч. сотр. (2002–2004), ст. науч. сотр. (2004–2019), зав. лаб. (2019 – по н.в.),  с 2019 года также  является профессором кафедры биологии БГМУ. Научные интересы связаны, главным образом, с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности, хронических заболеваний дыхательной системы и молекулярных основ адаптации человека к условиям хронического антропогенного загрязнения. Актуальная коллекция биоматериалов  больных с хронической обструктивной болезнью легких, детей с хроническими заболеваниями органов дыхания, рабочих с профессиональными заболеваниями органов дыхания и здоровых индивидов содержит более 2000 образцов ДНК и 200 образцов  РНК, принадлежащих к основным этническим группам, проживающим на территории Республики Башкортостан. В настоящее время ведутся работы по изучению закономерностей формирования патологического фенотипа в связи с экспрессией, полиморфизмом генов, эпигенетическими процессами.  Автор более 150 науч. работ. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, РИНЦ AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, Recearcher ID WOS A-1688-2014).

  Контакты: e-mail: guly_kory@mail.ru, т. +7347 2356088, вн-тел. 4-04,2-32  кабинет №211 и 404.

  Gulnaz F. Korytina, PhD, Prof., Head of the Laboratory of Physiological Genetics of Institute of Biochemistry and Genetics – Subdivision of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences, Professor of Department of Biology, Bashkir State Medical University

  Research interests are related to the study of the genetics of complex diseases, in particular, chronic respiratory diseases (chronic obstructive pulmonary disease, childhood lung diseases, occupation asthma and chronic bronchitis), metabolic disorders (type 2 diabetes mellitus, obesity), cardiovascular diseases and the molecular basis of human adaptation to the conditions of chronic anthropogenic pollution, as well as molecular patterns of aging.  The current collection of biomaterials of patients with chronic obstructive pulmonary disease, children with chronic respiratory diseases, workers with professional diseases of respiratory and healthy individuals contains more than 2000 DNA samples and 200 RNA samples belonging to the main ethnic groups living in the Republic of Bashkortostan. At present, our laboratory work on the study of the patterns of formation of a pathological phenotype in connection with expression, gene polymorphism, and epigenetic processes. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, RSI AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, WOS Recearcher ID A-1688-2014). tel. +7347 2356088).

  Contact Information:  e-mail: guly_kory@mail.ru,  +7347 2356088, 4-04, 2-32, laboratory room  №211, 404

   

  Continue reading →

• Кочетова Ольга Владимировна

  

  Кочетова Ольга Владимировна, к.б.н., н.с. работает в ИБГ с 2001 г., научные интересы О.В. Кочетовой связаны, главным образом, с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности профессиональных и производственно-обусловленных заболеваний у рабочих. В настоящее время О.В. Кочетова занимается исследованием генетических основ сахарного диабета 2 типа, ожирения и метаболического синдрома, нарушений пищевого поведения  в различных возрастных  группах.   Актуальная коллекция биоматериалов  больных и здоровых индивидов содержит более 2000 образцов ДНК и 200 образцов  РНК, принадлежащих к основным этническим группам, проживающим на территории Республики Башкортостан. Автор более 100 научных работ. (Recearcher ID A-2035-2014, Scopus ID 24280457500, ORCID http://orcid.org/0000-0002-2944-4428)

  Контакты: e-mail: olga_mk78@mail.ru, т. +7347 2356088, вн-тел.2-32  кабинет №211.

  Kochetova Olga Vladimirovna, Candidate of Biological Sciences, Researcher. Has been working in IBG since 2001, main scientific interests are focused on the study of the genetics of multifactorial diseases, in particular occupational and work-related diseases in workers. Currently, O.V. Kochetova is researching the genetic basis of type 2 diabetes, obesity and metabolic syndrome, eating addiction disorders   in adults and children. The actual collection of biomaterials of patients and healthy individuals contains more than 2000 DNA samples and 200 RNA samples belonging to the main ethnic groups living in the Republic of Bashkortostan.  Author of over 100 scientific papers. (Recearcher ID A-2035-2014, Scopus ID 24280457500, ORCID http://orcid.org/0000-0002-2944-4428).

  Contact Information:  e-mail: olga_mk78@mail.ru,  +7347 2356088 (2-32), laboratory room  №211

  Continue reading →

• Мустафина Ольга Евгеньевна

  

  Мустафина Ольга Евгеньевна – заведующий лабораторией с 2000-2019 г.г. 28.08.1955-01.04.2020, д.б.н., проф. заслуженный деятель науки. Под непосредственным руководством Мустафиной О.Е. или при её научном консультировании подготовлено 14 кандидатов наук и один доктор наук. Автор более 200 научных работ.

  Olga Evgenievna Mustafina (28.08.1955-01.04.2020) – head of the laboratory in 2000-2019, professor, doctor of biological sciences, Honored Scientist. O.E. Mustafina has supervised 14 candidates of sciences (PhD) and one doctor of sciences (DS). Author of over 200 research papers.

   

  Continue reading →

• Насибуллин Тимур Русланович

  

  Насибуллин Тимур Русланович, к.м.н., с.н.с. работает в ИБГ с 2002 года после окончания аспирантуры. Ведет активную научную работу в области генетики многофакторных признаков – артериальной гипертензии, ишемической болезни сердца, рассеянного склероза, долголетия и старения. Является соавтором более 100 научных работ. (http://orcid.org/0000-0001-8823-8678,   РИНЦ AuthorID: 130011,  Scopus: 7801655112, WOS C-2432-2017).  Контакты: E-mail: nasibullintr@yandex.ru Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

  Nasibullin Timur Ruslanovich, Candidate of Medical Sciences, Senior Researcher. Has been working at IBG since 2002 after completing his postgraduate studies. Performs active research in the field of genetics of complex traits (arterial hypertension, coronary heart disease, multiple sclerosis, longevity and aging). Authored over 100 scientific papers. (http://orcid.org/0000-0001-8823-8678,   РИНЦ AuthorID: 130011,  Scopus: 7801655112, WOS C-2432-2017).

  Contact Information: E-mail: nasibullintr@yandex.ru Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room  № 215

  Continue reading →

• Тимашева Янина Римовна

  

  Тимашева Янина Римовна, к.м.н, c.н.с., доцент, почетный научный сотрудник Имперского колледжа Лондона (Лондон, Великобритания) с 2017 года; приглашенный научный сотрудник в Университете Суррея (Гилфорд, Великобритания) с 2019 года; приглашенный научный сотрудник в Университете Лозанны (Лозанна, Швейцария) с 2021 года. Обучалась в аспирантуре в ИБГ в 2004-2008 годах; после защиты кандидатской диссертации в 2008 году работала постдоком в Институте молекулярной и клеточной биологии в Тартуском университете (Тарту, Эстония). Работает в ИБГ с 2011 года. В 2017 году выиграла грант Фулбайта для выполнения исследований в Медицинском колледже Альберта Эйнштейна (Нью-Йорк, США). С 2017 года является доцентом и заведующей учебной частью кафедры медицинской генетики и фундаментальной медицины Башкирского государственного медицинского университета. Основная область научных интересов – генетика многофакторных признаков, в частности, сердечно-сосудистых и возраст-ассоциированных заболеваний. Автор 92 научных работ. (https://orcid.org/0000-0002-9918-6962, РИНЦ AuthorID: 172138, Scopus 23098588000, WoS M-9665-2014).

  Контакты:  E-mail:  ianina_t@mail.ru Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

   Timasheva Yanina Rimovna, PhD in Cardiology and Genetics, Senior Researcher, Associate Professor, Honorary Research Associate at Imperial College London (London, UK) since 2017; Visiting Researcher at the University of Surrey (Guildford, UK) since 2019; Visiting Researcher at the University of Lausanne (Lausanne, Switzerland) since 2021. Has conducted her postgraduate studies at the IBG UFRC RAS in 2004-2007; after defending her PhD in 2008, has been a postdoc at the Institute of Molecular and Cell Biology of Tartu University (Tartu, Estonia). Has been working at the IBG UFRC RAS since 2011. In 2017, has won a Fulbright grant to conduct a research project in Albert Einstein College of Medicine (New York, USA). Since 2017 has been working as an Associate Professor and Head of Curriculum at the Department of Medical Genetics and Fundamental Medicine at Bashkir State Medical University. Main area of research interest – genetics of complex diseases, particularly cardiovascular and other aging-associated traits. Author of 92 scientific papers. (https://orcid.org/0000-0002-9918-6962, РИНЦ AuthorID: 172138, Scopus 23098588000, WoS M-9665-2014).

  Contact Information: E-mail:  ianina_t@mail.ru  Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room  № 215

  Continue reading →

• Туктарова Ильсияр Авхатовна

  

  Туктарова Ильсияр Авхатовна, к.б.н., с.н.с. начала работать в ИБГ с 1989 года в должности старшего лаборанта. Ведет активную научную работу по проблеме наследственной предрасположенности к рассеянному склерозу. Участвует в формировании коллекции образцов ДНК лиц пожилого, старческого возрастов и долгожителей, имеет более 70 научных публикаций в центральной и международной печати.  (WoS ResearcherID I-4448—2018 Scopus AuthorID: 6701446967). Контакты:  E-mail:  iltuk@mail.ru. Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

  Tuktarova Ilsiyar Avkhatovna, Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher. Has started working at IBG in 1989 as a senior laboratory assistant. Conducts active scientific work on hereditary predisposition to multiple sclerosis. Participates in the formation of a collection of DNA samples from elderly people, seniors and long-livers, has more than 70 scientific publications in the central and international press. (WoS ResearcherID : I-4448—2018 Scopus AuthorID: 6701446967).

  Contact Information: E-mail:  iltuk@mail.ru Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room  № 215

   

  Continue reading →

• Эрдман Вера Викторовна

  

  Эрдман Вера Викторовна, к.б.н., с.н.с., начала работать в ИБГ с  2002 года, ведет активную научную работу в области генетики долголетия и старения человека. Научные интересы Эрдман В.В. связаны, главным образом, с изучением роли структурных и функциональных особенностей генов клеточных процессов в формировании статуса долгожительства и в развитии многофакторных социально-значимых заболеваний и старения.  С 2003 года Эрдман В.В. проводит популяционно-генетическое исследование долголетия в Республике Башкортостан. Актуальная коллекция содержит более 3000 образцов ДНК и РНК, собранных с привлечением неродственных между собой мужчин и женщин в возрасте от рождения до 113 лет, принадлежащих к основным этническим группам, проживающим на территории Республики Башкортостан.  Эрдман В.В. имеет 87 научных работ, посвященных, в частности, исследованию влияния генетической нестабильности на продолжительность жизни поиску ассоциаций с долголетием полиморфных SNP-локусов ряда генов транскрипционных факторов и белков, вовлеченных в процессы фармакологического ответа, антиоксидантной защиты, липидного и воспалительного ответа. В настоящее время проводится поиск ключевых генов и генных сетей, участвующих в формировании этноспецифического и универсального стабильного высокоадаптивного фенотипа долгожителя.  (http://orcid.org/0000-0002-1219-3458, РИНЦ AuthorID: 661583, Scopus: 54953889900, WOS I-5040-2018). Контакты: E-mail: danivera@mail.ru, Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

  Erdman Vera V., PhD, Senior Researcher, Laboratory of Physiological Genetics of Institute of Biochemistry and Genetics – Subdivision of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences. Research interests are related to the study of the role of structural and functional characteristics of genes, encode cellular processes, for longevity and the development of multifactorial socially significant diseases and aging.  Erdman V.V. conducts the population-based study of genetic predictors of longevity in the Republic of Bashkortostan since 2003. The current collection contains more than 3000 DNA and RNA samples collected with the involvement of unrelated men and women aged from birth to 113 years old, belonging to the largest ethnic groups living in the Republic of Bashkortostan. Erdman V.V. has 87 scientific papers concerned, in particular, to the study of the influence of genetic instability on lifespan to the search of the associations of longevity with polymorphic SNP-loci of the genes encoded transcription factors and proteins involved in pharmacological response, antioxidant protection, lipid metabolism, inflammatory response, have been established. At present, the scientific research focused on the study of the key genes and gene networks involved in the development of an ethnic and universal stable highly adaptive phenotype of the longevity. (http://orcid.org/0000-0002-1219-3458, РИНЦ AuthorID: 661583, Scopus: 54953889900, WOS I-5040-2018). Contact Information е-mail: danivera@mail.ru,  Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room  № 215

   

Основные достижения

За период 2018-2023 гг. в лаборатории выполнялись НИР в рамках государственных заданий (2 темы), грантов РФФИ (4 проекта) и РНФ (1 проект).

Ключевые научные достижения:

1. Подробно изучено протекание полимеразной цепной реакции со сближенными праймерами. Показано, что при использовании праймеров «встык» можно устанавливать короткий режим термоциклирования, что сокращает продолжительность анализа в 3-4 раза, и обеспечивается абсолютная специфичность ПЦР. ПЦР со сближенными праймерами обеспечивает амплификацию ДНК в присутствии таких количеств ПЦР-ингибирующих агентов, при которых ПЦР с “традиционно” расположенными праймерами не протекает.
2. Исследовано протекание ПЦР в режиме термоконвекции в стандартных реакционных пробирках. Показано, что для успешного протекания ПЦР необходимо обеспечение наклонного градиента температуры.
3. Изучена зависимость фрагментации ДНК под действием ультразвука от первичной структуры, состава среды и статуса метилирования динуклеотидов CpG. Предложен новый способ оценки метилирования ДНК, названный УФА – Ультразвуковая Фрагментация и Амплификация, основанный на количественной ПЦР-амплификации образцов ДНК, подвергнутых фрагментации ультразвуком.
4. Детально изучена мультимеризация ДНК, протекающая под действием ДНК-полимераз с цепь-вытесняющей активностью. Раскрыт механизм мультимеризации, предложено несколько способов ее устранения, в том числе с использованием модифицированных праймеров.
5. Исследовано влияние кофактора (катионы двухвалентных металлов), осмолитов, наночастиц золота на полимеразную и ревертазную активности ряда коммерческих ДНК-полимераз.
6. Изучено протекание ПЦР в присутствии углеводов. Наиболее эффективным ПЦР-энхансером оказалась сахароза, которая обеспечивает повышение скорости, эффективности и специфичности амплификации в широком диапазоне концентраций по сравнению с другими углеводами и ДМСО.
7. Предложен новый метод определения специфических микроРНК, основанный на мультимеризации. Метод не требует проведения этапа обратной транскрипции и использования флуорогенных зондов. В реакцию вовлекаются только зрелые микроРНК, что обеспечивает высокую точность анализа. Разработан также способ обнаружения вирусных РНК, обеспечивающий уверенную детекцию генетического материала патогена даже в препаратах, подвергнувшихся многократному замораживанию.

За период с 2018 по 2023 г. опубликовано: 1 монография, свыше 70 статей в рецензируемых журналах, получено 7 патентов на изобретения и свидетельств о регистрации программ для ЭВМ.

Подготовка кадров

кандидатская диссертация: Галимова Айзиля Айтугановна, 2017 г. (“Фрагментация ДНК ультразвуком и ее ПЦР-амплификация с помощью сближенных праймеров”)

магистерские диссертации: 5

выпускные работы студентов: 6

Премии и другие научные награды:

– Гарафутдинов Р.Р. с соавторами награжден дипломом редколлегии журнала «Биоорганическая химия» за лучшую методическую статью 2009 г. (Гарафутдинов Р.Р., Никоноров Ю.М., Чемерис Д.А., Постригань Б.Н., Чубукова О.В., Талипов Р.Ф., Вахитов В.А., Чемерис А.В. Новые способы генерации сигнала флуоресценции при анализе однонуклеотидных замен с помощью химерных гибридизационных зондов в реальном времени // Биоорган. химия. 2009. т. 35. № 5. с. 665-673);

– Гарафутдинов Р.Р. награжден в 2012 и 2017 гг. почетной грамотой Уфимского научного центра РАН  за вклад в развитие исследований в области физико-химической биологии;

– Гарафутдинов Р.Р. награжден в 2022 г. Почетной грамотой Академии наук Республики Башкортостан;

– Гарафутдинов Р.Р. является финалистом 2021 года конкурса «Лидеры России. Трек Наука»;

– Сахабутдинова А.Р. награждена дипломом Благотворительного фонда содействия отечественной науке с присуждением гранта в области естественных и гуманитарных наук по номинации «Кандидаты наук РАН»;

– Сахабутдинова А.Р. отмечена благодарственным письмом от Уфимского научного центра РАН «За многолетнюю плодотворную работу» в связи с 55-летием ИБГ УНЦ РАН (2017 г.).

Лаборатория образована 10 февраля 2007 года как Лаборатория физико-химических методов анализа биополимеров. Целями создания лаборатории явились организация в ИБГ УФИЦ РАН совершенно нового для региона научного направления, относящегося к области биоорганической химии (химия нуклеиновых кислот) и структурной биологии. В 2022 г. переименована в Лабораторию структуры и функций биополимеров.

• Гарафутдинов Равиль Ринатович
  

 Ученая степень: кандидат биологических наук

Должность: старший научный сотрудник, заведующий лабораторией 

• Купова Ольга Юрьевна
  

 Ученая степень: кандидат химических наук

Должность: научный сотрудник 

• Сахабутдинова Ассоль Рафиковна
  

Ученая степень: кандидат биологических наук

Должность: научный сотрудник