Лаборатория геномных и пост-геномных технологий в животноводстве
Laboratory of Livestock Functional Genomics
Заведующий лабораторией:
Гусев Олег Александрович
Профессор Университета Джунтендо (Juntendo University), Токио, Япония
2010 г. – медаль им. Зельдовича РАН и Международной космической ассоциации COSPAR за генетические исследования ангидробиоза и открытия в областиустойчивости ДНК к радиации
2014 г. – Young Researcher Award (Japan Society of Cytoprotection and Cytology) за выдающиеся успехи в исследовании генетического контроля адаптаций к экстремальным условиям среды
Scopus AuthorID: 55289623600
Реализуемый проект:
Разработка эффективных инструментов для развития животноводства с использованием генетических технологий и анализа больших данных (№ 075-15-2024-666, 2024-2028 гг.)Цель проекта:
- Исследование генома и транскриптома племенных свиней пород ландрас, йоркшир и дюрок для идентификации новых генетических маркеров хозяйственно-ценных признаков животных и разработки эффективных постгеномных подходов направленной селекции, генетической паспортизации и получения линий с новыми характеристиками.
- Создание в Республике Башкортостан научной школы по геномным и пост-геномным исследованиям в области животноводства
Задачи проекта:
– Создание биобанка ДНК и РНК тканей племенных животных с целевыми признаками.
– Поиск информативных биомаркеров, ассоциированных с устойчивостью и подверженностью экономически значимым заболеваниям и хозяйственно-ценными признакам, с использованием методов GWAS, секвенирования генома и транскриптома.
– Выявление генов, задействованных в формировании хозяйственно-ценных признаков животных, с использованием комбинированных полногеномных и транскриптомных исследований.
– Разработка подходов к усовершенствованию хозяйственных признаков животных с применением методов генной инженерии и геномного редактирования.
– Разработка комплементарных классической геномной селекции подходов отбора животных по пост-геномным данным, включая биохимические, протеомные и транскриптомные маркеры и аллели, напрямую связанные с контролем генетической экспрессии.
– Развитие новой цифровой платформы SwineTSS_Russia, представляющей собой совокупность мультиомиксных данных: генетических цифровых атласов экспрессии генов, аллель-специфичной экспрессии и активности регуляторных элементов генома, связанных с полезными признаками свиней.
– Ретроспективный анализ баз метаданных по фенотипам и другим характеристикам свиней для выделения и последующего геномного и постгеномного анализа наиболее контрастных по признакам животных для выделения генетических основ фенотипических проявлений.
– Подготовка образовательных программ и проведение стажировок для обучения молодых специалистов современным методам направленной селекции, транскриптомного анализа и геномного редактирования.
Планируемые результаты:
В результате реализации данного проекта будет собрана коллекция ДНК и тканеспецифичной РНК свиней пород Ландрас, Йоркшир и Дюрок (DanBred) с изучаемыми признаками, на основе анализа которой будут разработаны генетические технологии, позволяющие повысить эффективность животноводства в Республике Башкортостан и Российской Федерации:
– способы отбора животных по изучаемым признакам (отсутствие заболеваний, высокая мясная продуктивность и др.) для проведения геномной селекции;
– способы определения экономически значимых заболеваний и особенностей животных, таких как хромота и склонность к каннибализму, и предрасположенности к ним;
– технологии генетического усовершенствования животных для придания им новых признаков;
– системно пополняемые цифровые генетические ресурсы, отражающие мультиомиксные данные свиней с различными контрастными фенотипами.
Индустриальные партнеры:
ГК ТАВРОС
https://tavros.ru/
