Федеральное государственное бюджетное научное учреждение Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук
Меню
Институт биохимии и генетики

Институт биохимии и генетики — обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук

Директор ИБГ УФИЦ РАН
КАРУНАС АЛЕКСАНДРА СТАНИСЛАВОВНА

доктор биологических наук, кандидат медицинских наук, доцент, профессор РАО

Контакты

Почтовый адрес: проспект Октября, 71, г. Уфа, Республика Башкортостан, Российская Федерация, 450054
Телефон/факс: +7 347 235-60-88
E-mail: molgen@anrb.ru
Сайт: http://ibg.anrb.ru/

Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (далее Институт) был создан как Отдел биохимии и цитохимии Башкирского филиала Академии наук СССР (БФ АН СССР) (постановление Президиума Академии наук СССР от 5 марта 1962 г. № 5).Постановлением Президиума РАН от 16 ноября 1999 г. № 288 Отдел биохимии и цитохимии Уфимского научного центра РАН переименован в Институт биохимии и генетики УНЦ РАН. Постановлением Президиума РАН от 18 декабря 2007 г. № 274 переименован в Учреждение Российской академии наук Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН.Постановлением Президиума РАН от 13 декабря 2011 г. № 262 изменено наименование Института с Учреждения Российской академии наук Институт биохимии и генетики Уфимского научного центраРАН на Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук. Согласно Федеральному закону от 27 сентября 2013 г. № 253-ФЗ «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» и распоряжению Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2013 г. № 2591-р Институт передан в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО) России.

В соответствии с приказом ФАНО России от 26 июля 2017 г. № 456 Институт реорганизован в форме присоединения к Федеральному государственному бюджетному учреждению Уфимскому научному центру Российской академии наук (УНЦ РАН).В 2018 г. Институт приобрел статус обособленного структурного подразделения Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук.

***

История создания Института биохимии и генетики неразрывно связана с именем талантливого ученика академика Николая Ивановича Вавилова, профессора Василия Григорьевича Конарева, Заслуженного деятеля науки Башкирской АССР (1965), академика РАСХН, почетного академика АН РБ (1991). Весной 1956 г. он был переведен руководством Академии наук СССР из Оренбурга в Уфу и назначен новым директором Агробиологического института Башкирского филиала Академии наук (БФАН) СССР.

В.Г.Конарев внес весомые изменения в стратегию дальнейшего развития института, в стиль и планы работ, став основоположником нового для того времени академического подхода к изучению растений. Благодаря интенсивному развитию фундаментального направления Агробиологический Институт был вскоре переименован в Институт биологии (1957). В Институте были организованы новые сектора и подразделения, в частности, лаборатория биохимии и цитохимии (1957), переименованная позднее в лабораторию нуклеинового обмена.

В марте 1962 г. было принято решение о преобразовании лаборатории нуклеинового обмена в Отдел биохимии и цитохимии (ОБЦ), и именно эта дата считается официальной датой организации Отдела как самостоятельной структурной единицы.

В 1963 г. в Академии наук СССР произошли кардинальные структурные изменения: была проведена масштабная ликвидация ее региональных филиалов, а их подразделения переданы различным ведомствам. Отдел биохимии и цитохимии под руководством В.Г.Конарева вошел в состав Башкирского государственного университета (БашГУ). Два года спустя на биологическом факультете им была организована и соответствующая кафедра. В.Г.Конаревым были разработаны авторские лекционные и лабораторные программы; написан учебник «Цитохимия и гистохимия растений», выпущенный в 1966 г. издательством «Высшая школа», который быстро стал весьма популярным. Позднее эта книга была переведена на английский язык, издана за рубежом и вошла в фонды ведущих библиотек мира.

В 1967 году Академия наук СССР восстановила свои региональные филиалы, и Отдел биохимии и цитохимии был возвращен в структуру БФАН СССР в качестве самостоятельной административной единицы.

В 1968 г. В.Г.Конарев принял предложение вернуться в Ленинград, во Всесоюзный институт растениеводства, где он начинал свою научную деятельность еще будучи аспирантом Н.И.Вавилова.

***

Новым заведующим Отделом биохимии и цитохимии стал ученик В.Г.Конарева к.б.н. Радик Рахимьянович Ахметов – талантливый организатор науки, прекрасный ученый и педагог. Можно без преувеличения сказать, что практически все успехи Отдела этого периода были достигнуты благодаря деятельности Ахметова Радика Рахимьяновича, сумевшего после отъезда В.Г.Конарева в ВИР с группой хорошо подготовленных специалистов заложить новый фундамент и определить стратегию его развития, создать условия для роста нового поколения молодых ученых, успешно воспринявших лучшие традиции конаревской научной школы.

С 1968 года в Отделе начал функционировать Ученый Совет. Были определены новые темы прежнего и заложены основы других научных направлений. В Отдел были приглашены специалисты в области популяционной генетики человека (к.м.н. Х.С.Рафиков), генетики растений (к.б.н. В.В.Хангильдин), медицинской биотехнологии (к.м.н. Ю.А.Хавкин).

В 1972 г. в составе ОБЦ впервые официально были организованы 3 лаборатории: цитохимии (заведующий – к.б.н. Р.Р.Ахметов), биохимии (к.б.н. Ш.Я.Гилязетдинов) и иммунохимии (д.м.н. Ю.А.Хавкин). В последующие несколько лет дополнительно были созданы две новые лаборатории – биохимии и физиологии древесных растений (зав. д.б.н. Л.И.Сергеев) и лаборатория генетики (к.м.н. Х.С.Рафиков), которая впервые сконцентрировалась на изучении генетики человека, в частности, в то время одной из задач стали популяционно-генетические исследования башкир и других народов республики.

 

***

В июле 1981 г. произошла очередная смена руководства Отдела биохимии и цитохимии в связи с переводом Р.Р. Ахметова на должность директора Института биологии БФАН СССР. Отдел биохимии и цитохимии возглавил к.б.н. Шамиль Ямилович Гилязетдинов. Благодаря его личным качествам, энергии, энтузиазму, умению вести диалог с руководством БФАН и с кураторами отделений Академии наук СССР, грамотному выбору перспективных направлений исследований, Отдел биохимии и цитохимии не только сохранился, но и стал интенсивно развиваться.

 

В эти годы активно проводились исследования функциональной активности геномов растений в связи с вопросами гомеостаза и гетерозиса силами сотрудников Лаборатории биохимии и цитохимии (зав. к.б.н. Ш.Я.Гилязетдинов) и Лаборатории генетики лесных древесных растений (зав. д.б.н. Наталья Владимировна Старова). Эти исследования были включены в задания важнейших правительственных программ, в связи с чем были оперативно укреплены рабочие группы Отдела по регуляторам роста растений (к.б.н. М.И.Еркеев, к.б.н. Ф.М.Шакирова, к.б.н. Г.Р.Кудоярова), иммунитету растений (к.б.н. А.М.Ямалеев), защите растений (к.б.н. Д.В.Амирханов). В дальнейшем эти группы были преобразованы в лаборатории.

Лаборатория генетики (к.м.н. Х.С.Рафиков) сосредоточила свои усилия на исследованиях модификации генетических процессов в популяциях человека в условиях интенсивного промышленного развития. В лаборатории иммунохимии (д.м.н. Ю.А.Хавкин) продолжалось изучение множественности антител в связи с их функцией и регуляцией иммунного ответа.

В 80-е годы в Отделе стали более интенсивно развиваться молекулярно-биологические методы исследований растений, в связи с чем была создана новая Лаборатория молекулярной биологии, которую возглавил к.б.н. В.А.Вахитов.

В еще одной новой Лаборатории математической и молекулярной генетики, которую возглавил к.б.н. Р.Н.Чураев, приглашенный в ОБЦ из Института цитологии и генетики СО АН СССР (Новосибирск), разрабатывались методы математического моделирования и изучались молекулярно-генетические системы управления экспрессией генов.

 

***

В 1990 г. Отдел биохимии и цитохимии возглавил талантливый ученик В.Г.Конарева, д.б.н. Венер Абсатарович Вахитов. Новое руководство Отдела поставило во главу угла решение следующих первоочередных задач: изменение статуса ОБЦ, т.е. преобразование его в Институт, решение проблемы с переездом из старого корпуса Института органической химии в другое здание, корректировка научных направлений с учетом современных достижений биологической науки, подготовка высококвалифицированных научных кадров, существенное улучшение материально-технической базы.

В 1999 г. Отдел получил статус Института, и эта дата стала важной отправной точкой для его дальнейшего развития и становления, как одного из признанных в России региональных центров молекулярной биологии и генетики. Практически полностью обновились структура института, его администрация и состав руководителей лабораторий.

В 2005 году произошло еще одно весьма долгожданное событие – коллектив ИБГ УФИЦ РАН получил в свое распоряжение помещения на 4-х этажах нового лабораторного корпуса. Его строительство было завершено благодаря усилиям Председателя Президиума УНЦ РАН академика Роберта Искандровича Нигматулина. Переезд в новый корпус способствовал ускоренному обновлению приборного парка Института, приобретению современного дорогостоящего оборудования для проведения исследований.

Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН является ведущим академическим институтом в Волго-Уральском регионе по проблемам молекулярной биологии, генетики, физиологии и биохимии растений, молекулярной фармакологии, иммунологии и биотехнологии. Тематика научных исследовании ИБГ УФИЦ РАН соответствует основным директивным документам: Стратегии научно-технологического развития РФ («переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения…» и «переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству»), Государственной программе РФ “Научно-технологическое развитие Российской Федерации”, Приоритетным направлениям развития науки, технологий и техники РФ, Плану фундаментальных исследований Российской академии наук на период до 2025 г., Программе фундаментальных научных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период (2021-2030 годы).

Основные научные направления исследований Института связаны с изучением генетической структуры популяций народов Евразии; молекулярно-генетической природы заболеваний и комплексных признаков человека, вариабельности продолжительности жизни, механизмов взаимодействия нервной и иммунной систем человека; молекулярных механизмов действия фармакологических препаратов; популяционной генетики и механизмов адаптаций насекомых;молекулярной биологии, биотехнологии и генетической инженерии растений и микроорганизмов; физиологии и биохимии растений; механизмов симбиотрофного, ассоциативного и антагонистического взаимодействия растенийс фитомикробиомом;взаимодействие растений с другими организмами; сигнальной регуляции устойчивости растений к стрессовым факторамбиотической и абиотической природы;молекулярных маркеров хозяйственно-ценных признаков растений, разработкой новых методов и технологий анализа специфических ДНК и РНК, развитием высокопроизводительных методов анализа геномов, транскриптомов, протеомов и метаболомов.

В настоящее время в Институте работает квалифицированный коллектив исследователей из 98 научных работников (2 член-корр. РАН, 1 член-корр. РАО, 19 докторов наук и 50 кандидатов наук), обладающий высоким научным потенциалом.Исследования Института ежегодно поддерживаются грантами Российского научного фонда, Президента РФ, Министерства науки и образования РФ, Министерства образования РБ, Главы РБ. Институт имеет большой опыт российского и международного сотрудничества в рамках совместных научных проектов, консорциумов, грантов.

Институт принимает участие в нескольких Федеральных проектах (ФП) национального проекта России «Наука и университеты». В рамках реализации ФП «Развитие инфраструктуры для научных исследований и подготовки кадров» в 2019 г. в Институте создана новая молодежная лаборатория “Геномики растений”. В соответствии с данным ФП Институт также участвует в программе создания и развития Селекционно-семеноводческого центра по кормовым культурам УФИЦ РАН и в Программе обновления приборной базы. В рамках ФП «Развитие человеческого капитала в интересах регионов, отраслей и сектора исследований и разработок» в Институте проводятся исследования по Мегагранту Правительства РФ под руководством ведущего ученого, член-корр. РАН Макеева В.Ю. по теме «Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины» (2021-2023 гг.). В 2023 г. в рамках данного Мегагранта в Институте создана лаборатория “Cтатистическоймультиомики и биоинформатики”.

С 2020 г. Институт участвует в реализации двух технологических проектов Евразийского НОЦ Республики Башкортостан: «Геномика и цифровые системы предиктивной аналитики для персонализированной медицины» (руководитель – Хуснутдинова Э.К., основной исполнитель – ИБГ УФИЦ РАН), «Селекционно-генетические и молекулярно-клеточные технологии в животноводстве и растениеводстве» (ИБГ УФИЦ РАН – соисполнитель). Для обеспечения научных коллективов молодыми перспективными кадрами в рамках Соглашения с Евразийским НОЦ в декабре 2023 г. в Институте создана молодежная лаборатория “Структурной и функциональной геномики человека”, научные исследования которой направлены на идентификацию биомаркеров онкологических заболеваний для выявления факторов риска их развития, проведения ранней диагностики и своевременной терапии.

Научные сотрудники Института принимают непосредственное участие в реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2030 годы в рамках крупного междисциплинарного проекта Минобрнауки РФ «Хлеба России» (2021-2023 гг.) и других проектов, выполняемых с использованием генетических технологий.

В рамках договора о научно-практическом сотрудничестве с ООО «Биотехнологический кампус» (2023-2025 гг.) Институт принимает участие в уникальном российском проекте «Национальная генетическая инициатива «100 000+Я», направленном на улучшение методов диагностики и лечения наследственных заболеваний и изучение геномов россиян из различных географических регионов и популяций.

В ИБГ УФИЦ РАН большое внимание уделяется подготовке высококвалифицированных кадров. В Институте функционирует аккредитованная аспирантура, в которой ведется подготовка по направлению 06.06.01 – Биологические науки по 4 профилям: генетика, молекулярная биология, биохимия, физиология и биохимия растений. В Институте с 2002 г. работает Диссертационный совет по защите кандидатских и докторских диссертаций по 3 специальностям: 1.5.3. Молекулярная биология, 1.5.4. Биохимия, 1.5.7. Генетика.

В Институте созданы базовые кафедры в УУНиТ (кафедра генетики и фундаментальной медицины), в УГНТУ (Школа молекулярных технологий» и «Центр генетических исследований проблем питания». Совместно с вузами РБ реализуются 2 сетевые образовательные программы магистратуры, организовано прохождение производственных и преддипломных практик бакалавров и магистров УУНиТ, УГНТУ.

Сотрудники Института активно занимаются научно-просветительской работой. Регулярно проводятся “Дни науки, «Дни ДНК, “Фестивали науки”, “Всероссийские лабораторные”, «Балы ученых», научно-популярные лекции и экскурсии для студентов и школьников. Институт сотрудничает с ведущими отечественными и зарубежными научными центрами в рамках совместных научных проектов, консорциумов, грантов и научных форумов. Институт является организатором и участником крупных научных мероприятий международного, всероссийского и регионального ранга.

История ИБГ_Биомика_юбилейный номер_2012

Научные направления лаборатории биохимии адаптивности насекомых

Лаборатория биохимии адаптивности насекомых

Заведующая лабораторией – Салтыкова Елена Станиславовна,

доктор биологических наук

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: saltykova-e@yandex.ru

Основные направления научной деятельности лаборатории

  • изучение популяционной генетики насекомых и оценка состояния племенных ресурсов пчеловодства РФ;
  • поиск селекционных маркеров, ассоциированных с устойчивостью и хозяйственно-полезными признаками насекомых;
  • мониторинг инфекционных заболеваний медоносной пчелы на территории РФ;
  • изучение механизмов формирования адаптации насекомых;
  • изучение биологически активных свойств продуктов пчеловодства.

Исследование геномики, популяционной генетики и биохимии адаптивности насекомых; структурно-функциональная организация геномов насекомых, механизмы адаптации к окружающей среде, поиск биологически активных в отношении насекомых веществ, онтогенетические и эволюционные закономерности формирования иммунитета насекомых, экспериментальная эволюция. Исследования направлены на понимание молекулярных, физиологических и поведенческих механизмов возникновения и распространения адаптивности насекомых при воздействии разных абиотических и биотических стресс-факторов среды для эффективного и целенаправленного их использования в целях повышения продуктивности и качества важнейших полезных сельскохозяйственных насекомых без нанесения вреда окружающей среде и насекомых вредителей.

Краткая история лаборатории

Лаборатория биохимии адаптивности насекомых была создана в 1984 г.

Первый состав лаборатории – Д.В.Амирханов, д.б.н., проф.; Н.Т.Идрисова, к.б.н., м.н.с.; М.Г.Мигранов, д.б.н., проф.; А.В. Поскряков, к.б.н., с.н.с, Г.В. Беньковская, д.б.н., проф., А.Г. Николенко, д.б.н., г.н.с.; Е.С. Салтыкова (д.б.н., зав. лаб. с 2021г); Л.Р. Гайфуллина, к.б.н., н.с.; М.Д. Каскинова, к.б.н., с.н.с.; Р.А. Ильясов, д.б.н. с.н.с, ; У.Б. Юнусбаев, к.б.н, с.н.с.

Заведующие лаборатории – Д.В. Амирханов, д.б.н., проф. (с 1984 по 1993 гг), А.Г. Николенко, д.б.н., проф.(с 1994 по 2020 гг), Е.С. Салтыкова, д.б.н., с.н.с. (с 2021 г по наст. время).

Состав лаборатории

Салтыкова Елена Станиславовна

д.б.н., с.н.с.

Гайфуллина Луиза Римовна

к.б.н., н.с.

Каскинова Миляуша Дамировна

к.б.н., с.н.с.

Соколянская Марина Павловна

к.б.н., н.с.

Кинзикеев Артур Камилевич, м.н.с.

Салихова Альфия Мунировна, м.н.с.

Гладких Александр Николаевич

м.н.с.

 

Основные результаты, полученные за последние 5 лет

Разработан комплекс молекулярно-генетических методов, работающий в условиях интенсивной внутривидовой гибридизации и необходимый для идентификации и сохранения генофонда аборигенной для России пчелы (подвид Apis mellifera mellifera). Выявлено четыре генетических резервата медоносной пчелы Apis mellifera mellifera наУрале. Предложена новая схема внутривидовой филогенетики пчел рода Apis. Показаны различия в характере иммунного ответа и степени адаптированности к природным условиям лесной зоны России для аборигенной пчелы A.m.mellifera и пчел южных рас. Разработаны новые экспресс показатели устойчивости для селекции в пчеловодстве.Установлено, что хитоолигосахариды влияют на скорость морфогенетических процессов, стимулируют иммунные реакции, имитируя компоненты клеточных стенок бактерий, повышают общую устойчивость насекомых.Доказана возможность иммунизации насекомых (MuscadomesticaL, LeptinotarsadecemlineataSay) нелетальными дозами патогена: стимулируется иммунный ответ, формируется долговременная иммунная память, возрастает общая выживаемость.Выявлены онтогенетические различия в иммунном ответе насекомых: преобладание механизмов неспецифической резистентности на стадии личинки и более специфичных иммунных механизмов у имаго.Показана роль критических периодов онтогенеза насекомых, связанных с этапами линьки в формировании долговременной иммунной памяти.Выявлено, что индуцированная в критические периоды онтогенеза активность факторов иммунитета у личинок воспроизводится в последующих двух поколениях на той же стадии развития насекомого без повторного действия патогена. На примере северной башкирской популяции тёмной лесной пчелы показана возможность сохранения генофонда медоносной пчелы в популяции открытого типа, что опровергает действующую в России парадигму о возможности этого процесса исключительно в популяциях закрытого типа. Этот результат может существенно упростить технологические проблемы, связанные с искусственной изоляцией и процессом инбридинга. Проведён геногеографический анализ естественной бурзянской популяции тёмной лесной пчелы A.m.mellifera, определены границы ареала, выделены центральная, периферическая и гибридная зоны, а также направления интрогрессии генов южных подвидов. Выдвинута гипотеза о наличии двойной генетической границы у естественной популяции медоносной пчелы. Проведен анализ нуклеотидных последовательностей локуса COI-COII в бурзянской популяции медоносной пчелы A.m.mellifera. Предварительные данные позволяют предположить наличие неизвестной ранее делеции, которая может стать перспективным генетическим маркёром.Разработан метод молекулярно-генетической диагностики патогенного гриба A. apis,. Показан высокий процент встречаемости гриба (более 50%) у рабочих пчёл в условно здоровых семьях на Урале. Проанализирован механизм фунгистатического действия хитозана на Ascosphaeraapis, который проявляется в формировании однополого мицелия и в аномальном развитии гифов, что нарушает их способность к образованию споровых асков и созреванию полноценных споровых шаров.

Показано, что высокомолекулярный хитозан в качестве элиситора инициирует у имаго медоносной пчелы транскрипционную активность генов дефензина и абецина, а также стимулирует клеточную реакцию гемолимфы.

Экспериментально показано, что хитозан индуцирует у насекомых факторы иммунораспознавания, клеточные реакции гемолимфы и запускает фенолоксидазонезависимые механизмы опсонизации патогенов. Сукцинирование молекулы хитозана усиливает его воздействие на фенолоксидазозависимые механизмы, индуцирует образование гемагглютининов с широким спектром углеводной специфичности и увеличивает морфофункциональное разнообразие гемоцитов.Выявлено, что дробная селекция энтомопатогенным бактериальным препаратом битоксибациллином в течение 15 поколений линии комнатной мухи Muscadomestica сублетальными дозами в сочетании с селектирующей дозой способствует быстрому росту показателя резистентности. Селекция сублетальными дозами битоксибациллина индуцирует широкий спектр защитных реакций у личинок комнатной мухи, способствуя быстрому формированию высокой устойчивости.

Основные научные публикации лаборатории

  1. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Николенко А.Г. Действие имидаклоприда на индивидуальную устойчивость медоносной пчелы (Apis mellifera L. // Агрохимия. №2. С. 40-47.
  1. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Николенко А.Г., Ишмуратова Н.М., Яковлева М.П., Ишмуратов Г.Ю. Адаптивное действие 10-ГДК и 9-ОДК на пчелу при нейроинтоксикации имидаклопридом // Пчеловодство. 2017. №2. С. 20-21.
  2. Gaifullina L.R., Saltykova E.S., Nikolenko A.G. Honey as a synbiotic food product  // Биомика. 2017. Т. 9. № 1. С. 12-23.
  3. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Николенко А.Г. Молочнокислые пробиотические бактерии в меде // Пчеловодство. 2017. №7. С. 46-48.
  4. Салтыкова Е. С., Гайфуллина Л. Р., Каскинова М. Д., Гатауллин А. Р., Матниязов Р. Т., Поскряков А. В., Николенко А. Г. Действие хитозана на развитие Nosema apis в медоносных пчелах // Микробиология. 2018. Т.87. №5. 624-630.
  5. Ильясов Р. А., Хан Г. Ю., Сонг Д. Х., Лим С. Х., Гайфуллина Л. Р., Салтыкова Е. С., Николенко А. Г., Квон Х. В. Нейропептиды медоносной пчелы. Часть 1 // Пчеловодство, №6, 2018. С. 16-19.
  6. Ильясов Р. А., Хан Г. Ю., Сонг Д. Х., Лим С. Х., Гайфуллина Л. Р., Салтыкова Е. С., Николенко А. Г., Квон Х. В. Нейропептиды медоносной пчелы. Часть 2 // Пчеловодство, №7, 2018. С. 24-26.
  7. Каскинова М.Д., Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Поскряков А.В., Шунк А.А., Николенко А.Г. Генетическое состояние алтайской популяции темной лесной пчелы Apis mellifera mellifera L. Биомика. 2018. Т.10(3). С. 281-285
  8. Каскинова М. Д., Гатауллин А. Р., Салтыкова Е. С., Гайфуллина Л. Р., Поскряков А. В., Николенко А. Г. Полиморфизм гипервариабельного участка гена csd в популяции Apis mellifera L. на Южном Урале // Генетика. 2019. №2. С.239-242.
  9. Юнусбаев У. Б., Каскинова М. Д., Ильясов Р. А., Гайфуллина Л. Р., Салтыкова Е. С., Николенко А. Г. Роль полногеномных исследований в изучении биологии медоносной пчелы // Генетика. 2019. №7. С.778-787.
  10. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Каскинова М.Д., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Выделение молочнокислых бактерий из медового зобика темной лесной пчелы (Apis mellifera mellifera L.) // Биомика. 2019. Т.11(2). С. 190 – 197.
  11. Каскинова М.Д., Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Гаплодиплоидность и пол-определяющий каскад генов у перепончатокрылых насекомых // Биомика. 2019. Т.11(2). С. 108 – 119.
  12. Каскинова М.Д., Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Л.Р., Поскряков А.Г., Николенко А.Г. Генетические маркеры резистентности медоносной пчелы к Varroa destructor / Вавиловский журнал генетики и селекции.  2020.- №24(8). – С.853-860.
  13. Каскинова М.Д., Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Л.Р., Поскряков А.Г., Николенко А.Г. Методы оценки резистентности медоносной пчелы к заболеваниям расплода / Пчеловодство. 2020. №5. С. 18-20 (2).
  14. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Каскинова М.Д., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Влияние различных сортов мёда на культивирование молочно-кислых бактерий // Актуальная биотехнология. №3(34). 2020. С.95-97.
  15. Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Каскинова М.Д., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Экологическая опасность низких доз неоникотиноидов и критерий их токсичности для медоносной пчелы // Актуальная биотехнология. №3(34). 2020. С. 500-502.
  16. Каскинова М.Д., Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Поскряков А.Г., Николенко А.Г. Маркер-опосредованная селекция медоносной пчелы Apis mellifera L. // Актуальная биотехнология. №3(34). 2020. С.189-190.
  17. Kaskinova, M.; Saltykova, E.; Poskryakov, A.; Nikolenko, A.; Gaifullina, L. The Current State of the Protected Apis mellifera mellifera Population in Russia: Hybridization and Nosematosis // Animals 2021, 11, 2892. https://doi.org/10.3390/ani11102892 Q1 JCR
  18. Ильясов Р.А., Марсова М.В., Ковтун А.С., Ватлин А.А., Юнес Р.А., Гайфуллина Л.Р., Каскинова М.Д., Салтыкова Е.С., Николенко А.Г., Квон Х.В., Даниленко В.Н. Роль микробиома кишечника медоносных пчел. Пчеловодство. 2021. №7. С.18-20.
  19. М.Д. Каскинова, Л.Р. Гайфуллина, Е.С. Салтыкова, У.Б. Юнусбаев, А.Г. Николенко. Картирование геномных сборок азиатской пчелы Apis cerana // Актуальная биотехнология. 2021. №1 (35). С. 248-249.
  20. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Николенко А.Г., Ишмуратова Н.М., Яковлева М.П., Ишмуратов Г.Ю. Адаптивное действие компонентов «маточного вещества» и «маточного молочка» на пчелу при нейроинтоксикации имидаклопридом // Современные проблемы пчеловодства: Материалы первой Международной научно-практической конференции по пчеловодству в Чеченской Республике. Россия, Чеченская Республика, Грозный, 15-18 мая, 2017г. С.47-49.
  21. Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Каримова А.А., Гатауллин А.Р., Николенко А.Г. Роль гена вителлогенина в регуляции продолжительности жизни темной лесной пчелы // XV Съезд Русского энтомологического общества. Россия, Новосибирск,  31 июля – 7 августа 2017г. Материалы съезда.  С.434-435.
  22. Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Николенко А.Г. Функциональная экология и физиолого-биохимические механизмы темной лесной пчелы в климатических условиях Урала // В сборнике: Состояние и перспективы развития среднерусской породы пчел. Материалы Всероссийской научно-практической конференции. 2018. Казань, 1-2 мрата, 2018. С. 21-28.
  23. Салтыкова Е. С., Гайфуллина Л. Р., Каскинова М. Д., Поскряков А. В., Николенко А. Г. Иммуностимулирующее действие хитозана при нозематозе медоносной пчелы (Apis mellifera L.) / Тезисы докладов XXII Международного конгресса Апиславия-2018. Москва, 9-13 сентября 2018 г. М: ООО «Компания «Лабиринт», 2018. 137 с. С.92-94.
  24. Николенко А. Г., Каскинова М. Д., Гайфуллина Л. Р., Салтыкова Е. С. Система контроля племенной ценности медоносной пчелы для создания новых породных линий // Тезисы докладов VII съезда ВОГиС, 18-22 июня, 2019 г., Санкт-Петербург.
  25. Gaifullina L., Saltykova E., Kaskinova M., Poskryakov A. Effect of chitosan on the development of Nosema infection in Apis mellifera L. colony // 46th APIMONDIA – International Apicultural Congress, 8-12 september, 2019, Quebek, Canada. P. 218.
  26. Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Влияние имидаклоприда на иммунитет медоносной пчелы (Apis mellifera L.) // Концептуальные и прикладные аспекты научных исследований и образования в области зоологии беспозвоночных: сборник статей V Международной конференции. Томск 26–28 октября 2020 г. – Томск: Издательство Томского государственного университета, 2020.C. 227-230.
  27. Гайфуллина Л. Р., Каскинова М. Д., Салтыкова Е. С., Поскряков А. В., Николенко А. Г. Оценка пробиотического потенциала Bacillus licheniformis в повышении общей устойчивости пчелиных семей // XXIII Конгресс Федерации пчеловодческих организаций «Апиславия» и Международная научно-практическая конференция, проводимой под эгидой Федерации пчеловодческих организаций «Апиславия», 20-22 мая 2021 г. Минск.
  28. Булатова А.Ф., Каскинова М.Д., Гайфуллина Л.Р., Гарипова М.И., Поскряков А.В., Салтыкова Е.С. Обнаружение Nosema sp. в заповедной зоне на Южном Урале / Современные достижения в области апидологии: сборник статей I Международной научно-практической конференции. 24 июня 2021 г. – Уфа: ФГБОУ ВО «БГПУ им. М. Акмуллы», 2021. – С.4.
  29.  Гайфуллина Л.Р., Е.С. Салтыкова, М.Д. Каскинова, А.В.Поскряков. Адаптивное действие Bacillus licheniformis на медоносную пчелу при поражении Nosema apis. Материалы V-й международной научнопрактической конференции “Пчеловодство холодного и умеренного климата”. 19-20 октября 2021 г. – Москва-Псков. С.125-129.
  30. Салтыкова Е.С., Гайфуллина Л.Р., Каскинова М.Д., Поскряков А.В.. Нозематоз пчел: диагностика и методы борьбы. Материалы V-й международной научнопрактической конференции “Пчеловодство холодного и умеренного климата”. 19-20 октября 2021 г. – Москва-Псков. С.130-134.
  31. Каскинова М.Д., Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Соколянская М.П., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Анализ межгенного локуса COI-COII митохондриальной ДНК как экспресс-метод мониторинга популяций Apis mellifera mellifera. Общественные насекомые. Современные проблемы пчеловодства: материалы Всероссийской научно-практической конференции, посвященной 20-летию АПИ-лаборатории биологического факультета Кубанского государственного университета. Краснодар: Кубанский гос.ун-т, 2021.  С.56-59.
  32. Гайфуллина Л.Р., Салтыкова Е.С., Каскинова М.Д., Поскряков А.В., Николенко А.Г. Адаптивное действие Bacillus licheniformis на медоносную пчелу (Apis mellifera) в условиях иммунодефицита. Общественные насекомые. Современные проблемы пчеловодства: материалы Всероссийской научно-практической конференции, посвященной 20-летию АПИ-лаборатории биологического факультета Кубанского государственного университета. Краснодар: Кубанский гос.ун-т, 2021. С.37-41.

Гранты фондов

Грант РФФИ 17-44-020648 р_а “Создание методологической основы для ускоренной селекция новых породных линий медоносной пчелы на основе молекулярно-генетической системы контроля их племенной ценности”, 2017-2019.

Грант РФФИ 19-54-70002 е-Азия_т “Эволюция генов и таксономические взаимоотношения популяций (подвидов) пчел Apis cerana России, Кореи, Вьетнама и Индонезии”, 2020-2022.

Грант РНФ № 22-74-00004 “Установление гаплотипического разнообразия межгенного локуса tRNAleu-COII митохондриальной ДНК в популяциях Apis mellifera на территории России” по Конкурсу 2022 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.  (2022-2024 гг.)

Награды

Сотрудники лаборатории награждены почетными грамотами УФИЦ РАН “За добросовестный труд, достижение высоких результатов в профессиональной деятельности и в связи с празднованием Дня Российской науки” а также отмечены благодарственными письмами и почетными грамотами в связи с активной научной деятельностью на благо народного хозяйства от Министерства сельского хозяйства Республики Башкортостан.

Заведующий лабораторией –

Максимов Игорь Владимирович,

Доктор биологических наук, профессор, заслуженный деятель науки Республики Башкортостан

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: maksimov@ufaras.ru

https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=90368

Основные направления научной деятельности лаборатории:

Устойчивость растений к фитопатогенам и вредителям;

Сигнальная регуляция взаимоотношений растений с возбудителями грибных болезней;

Модельные системы растительных тканей и клеток с патогенами и вредителями;

Экологически безопасные методы повышения устойчивости растений к биотическому стрессу.

Исследования направлены на понимание механизмов регуляторного действия разных природных регуляторов роста и микроорганизмов на растения при воздействии разных абиотических стресс-факторов среды для эффективного и целенаправленного их использования в целях повышения продуктивности и качества важнейших сельскохозяйственных культур без нанесения вреда окружающей среде.

Краткая история лаборатории

Лаборатория биохимии иммунитета растений создана в 1984 году и основной целью ее работы в начальный период был анализ адаптивного потенциала образцов полиплоидного ряда пшеницы и эгилопса из мировой коллекции ВИР к условиям Южного Урала и определение их устойчивости к патогенным грибам, распространенным в Поволжье и на Урале. Результаты проведенной работы были опубликованы совместно с сотрудниками ВНИИ растениеводства им Н.И. Вавилова в виде каталогов и используются многими селекционными институтами и станциями России в качестве справочного материала для подбора родительских пар для отдаленной гибридизации.

Другим направлением работ является поиск наиболее удобных биохимических и молекулярно-биологических маркеров устойчивости растений и вирулентности патогенов и возможности коррекции иммунного потенциала растений с помощью природных и искусственно созданных соединений. Впервые изучено изменение гормонального статуса растений под влиянием фитопатогенных грибов с различным типом питания. Показано, что наиболее эффективным способом защиты растительной клетки от фитопатогенов является формирование зоны сверхчувствительной некротизации инфицированных клеток, подобной апоптозу у клеток животных и человека и где активное и непосредственное участие принимают оксидоредуктазы.

Одним из важных достижений лаборатории является обнаружение у растений оксидоредуктаз, сорбирующихся на поверхность инфекционного мицелия фитопатогенных грибов и хитин, что позволяет растениям многократно повышать уровень активных форм кислорода в непосредственной близости от патогена.

При проведении работ с биотрофными грибами существует проблема их плохого роста и развития в культурах, что не позволяло адекватно оценить ранние реакции, происходящие в растительных клетках при их инфицировании. Решению этой проблемы помогли работы по созданию совместной культуры каллусов с биотрофными грибами, которая оказалась удобной не только для изучения биохимических особенностей взаимоотношения хозяин – патоген и популяционных особенностей патогенов, но также и для скрининга новых соединений, кандидатов на средства защиты растений с иммуномодулирующими свойствами

Полученные в лаборатории результаты способствовали разработке способов индуцирования устойчивости растений с использованием не только иммуномодулирующих соединений, но также внедрением в растениеводство препаратов, на основе живых бактерий, сосуществующих в тканях растений. В лаборатории впервые проведен скрининговый анализ различных штаммов бактерий B. subtilis  и B. thuringiensis эндофитно существовать в тканях растений и проявлять посредством этого свойство праймировать (делать чувствительным и быстро реагирующим) геном хозяина на формирование защитных реакций растений. Выделенные эндофитные штаммы бактерий хранятся в лаборатории (тут ссылка на каталог). Нами создан композиционный биопрепарат, состоящий из 3-х эндофитных штаммов бактерий для защиты растений от патогенов и вредителей, а также уникальный рекомбинантный штамм бактерии B. subtilis 26ДCry, обладающий комплексной антифунгальной и инсектицидной активностью. Созданные в лаборатории биопрепараты показали улучшение таких хозяйственно-значимых показателей как урожайность, содержание белка, устойчивость к стрессам биотической и абиотической природы в условиях поля на пшенице и картофеле. Так, урожайность клубней картофеля под влиянием биопрепарата в условиях поля увеличилась на 17%. Их эффективность в качестве биофунгицида против фитофтороза на растениях картофеля составила 90%, а при использовании в качестве инсектицида против колорадского жука показал эффективность 75% относительно контроля. Под влиянием предпосевной обработки наблюдалось повышение полевой всхожести семян яровой пшеницы до 19,7%. Показана прибавка урожая зерна на 2,6 ц/га, что на 35% выше уровня контроля. Биопрепарат уменьшал поражение растений пшеницы корневыми гнилями в 1,5 раза, ржавчиной в 2,5 раза, септориозом – в 3 раза, пиренофорозом – в 6 раз и оказался эффективней других препаратов на 44% против листогрызущих насекомых.

Заведующие лаборатории:

д.б.н., проф. Ямалеев Альберт Магсумович,

с 1984 по 1995 гг.

д.б.н., проф. Хайруллин Рамиль Магзинурович,

с 1995 по 2002 г.

д.б.н., проф. Максимов Игорь Владимирович

с 2002 по наст время

 

Состав лаборатории

Максимов Игорь Владимирович

д.б.н., проф., г.н.с.

заслуженный деятель науки Республики Башкортостан

Хайруллин Рамиль Магзинурович

д.б.н., проф., г.н.с.

заслуженный деятель науки Республики Башкортостан

Яруллина Любовь Георгеевна

д.б.н., проф., г.н.с.

заслуженный деятель науки Республики Башкортостан

Веселова Светлана Викторовна,

к.б.н., с.н.с.

Сорокань Антонина Вячеславовна

к.б.н., с.н.с.

Бурханова Гузель Фанилевна

к.б.н., с.н.с.

Черепанова Екатерина Александровна

к.б.н., н.с.

Благова Дарья Константиновна

к.б.н., н.с.

Нужная Татьяна Владимировна

к.б.н., н.с.

Габдрахманова Венера Фанисовна

аспирант

Фаткуллин Ильдус Ямилович

 аспирант

Гордеев Андрей Александрович

аспирант

Кутлубаев Артур Афзалович

Аспирант

 

 

 

 

Сотрудники лаборатории биохимии иммунитета растений ИБГ УФИЦ РАН (2022 год)

 Основные результаты, полученные за последние 5 лет

  1. Установлены пути регуляции устойчивости/восприимчивости растений пшеницы к септориозу эффектором SnTox3 гриба Stagonospora nodorum и фитогормонами

SnTox3 снижал содержание цитокининов, как за счет их активированного гликозилирования этилен-зависимым образом, так и за счет активации их окислительной деградации по этилен-зависимому и -независимому пути, что приводило к подавлению окислительного взрыва и развитию восприимчивости.

  1. Устойчивость пшеницы к грибу Stagonospora nodorum связана с увеличением содержания цитокининов, способных активировать гены салицилат-зависимых защитных реакций

Зеатин и салициловая кислота (СК) вызывают окислительный взрыв и уменьшают зоны повреждения листьев пшеницы при поражении патогеном S. nodorum: (A) Фотографии листьев пораженных септориозом через 8 дней после инфцирования и (Б) площадь их повреждения в процентах. (В) Влияние фитогормонов на продукцию H2O2 у восприимчивого (Казахстанская 10) и устойчивого (Омская 35) сортов пшеницы в динамике.

  1. С использованием генетических конструкций, отключающих синтез сурфактина в бактериальных клетках эндофитного штамма subtilis 26Д обоснована его роль в формировании устойчивости пшеницы к возбудителю септориоза

Генетическая конструкция для отключения синтеза сурфактина у клеток штамма B. subtilis 26Д

Изменения в площади инфицирования листьев пшеницы грибом S. nodorum в зависимости от прединокуляции растений линиями B. subtilis 26Д (7 суток после инфицирования)

Вариант

Контроль (А)

B. subtilis 26Д (Б)

B. subtilis 26Д sfp– (В)

Площадь инфицирования, % от общей площади листа

30±3

13±2 

24±3 

 
  1. Выявлен механизм активации защитных систем растений картофеля под влиянием эндофитного штамма бактерии subtilis 26Д и сигнальных молекул – салициловой и жасмоновой кислот, опосредованный накоплением Н2О2

 Влияние обработки растений картофеля бактериями B. subtilis 26Д  и сигнальными молекулами  на пораженность  возбудителем фитофтороза (а), содержание Н2О2 (б) и транскрипционную активность генов PR-белков. 1.  – контроль (заражение Phytophthora infestans ); 2 – B. subtilis + P. infestans; 3 – B. subtilis + СК + P. infestans; 4 – B. subtilis + ЖК + P. infestans; 5 – B. subtilis + СК + ЖК + P. infestans. I -– растения не инфицированы, I I– инфицированные растения

В протеоме листьев картофеля выявлены различия в активации 19 полипептидов в диапазоне рI 4,0 – 9,0 с м.м. от 30 до 125 кДа.  Показано, что бактерии B. subtilis 26Д изменяют спектр индивидуальных белков растений. Наиболее значимым фактором, определяющим изменение протеома картофеля (повышение содержания белков, вовлеченных в реакции окислительного взрыва, энергетического обмена, синтеза вторичных метаболитов и защитных белков) при инфицировании P. infestans является сочетание обработки растений бактериями B. subtilis совместно с жасмоновой кислотой.

  1. Бактериальная рибонуклеаза bsn B. subtilis 26Д формирует устойчивость растений картофеля к вирусам

Рис. Получена линия B. subtilis 26Д Δbsn с подавленной экспрессией рибонуклеазы bsn

Рис. Влияние обработки растений картофеля биопрепаратами на концентрацию PVY в тканях

Контроль                              B.subtilis 26Д         B.subtilis 26∆bsn

Накопление вируса PVX с геном флуоресцирующего белка gfp в листьях растений табака

  1. Обнаружена способность патогенного гриба Stagonospora nodorum синтезировать цитокинины, абсцизовую кислоту и ауксины. Оценено экзогенное влияние фитогормонов на рост, спорообразование (Рис ) и экспрессию генов некротрофных эффекторов (NE) и факторов транскрипции (TF) в мицелии разных по вирулентности к пшенице штаммов патогена. Показано, что фитогормоны наряду с воздействием на рост и спорообразование изолятов nodorum активно вовлекались в регуляцию экспрессии генов TF и NE у грибов. Это исследование вносит вклад в понимание роли гормонов в биологии гриба S. nodorum. Результаты могут быть использованы для изучения биологии других некротрофных патогенов растений, что будет иметь большое значение для маркер-ориентированной селекции сельскохозяйственных культур к патогенам грибной природы.

Влияние абсцизовой кислоты (0.1 мкМ) и зеатина (0.1 мкМ) на морфологию изолятов S. nodorum SnB (A), Sn9MN-3A (B) и Sn4VD (C) в течение 5 (1) и 14 (2, 3) дней культивирования на среде PGA и на спорообразование после 14 дней роста (D). Варианты в таблице, отмеченные одинаковыми буквами, не отличаются существенно по критерию Дункана (n = 9, p ≤ 0.05).

Рис. Влияние абсцизовой кислоты и зеатина на транскрипционную активность генов неротрофных эффекторов SnTox1 (A) и SnTox3 (В) в мицелии гриба S. nodorum SnB

Основные научные публикации лаборатории:

Статьи в научных журналах (за 2022-2024 гг):

Веселова С.В., Сорокань А.В., Бурханова Г.Ф., Румянцев С.Д., Алексеев В.Ю., Черепанова Е.А., Максимов И.В. Бактерии рода Bacillus как перспективный источник для создания биопрепаратов от патогенов и вредителей сельскохозяйственных культур // Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2022. – №4(97). – С. 40-45. doi: 10.21515/1999-1703-97-40-45.

Максимов И.В., Шеин М.Ю., Бурханова Г.Ф. РНК-интерференция в защите растений от грибной и оомицетной инфекции // Прикладная биохимия и микробиология. – 2023. – Том 59. – № 3. – С. 219-234. doi: 10.31857/S0555109923030133. Перевод: Maksimov I.V., Shein M.Yu., Burkhanova G.F. RNA Interference in Plant Protection from Fungal and Oomycete Infection // Applied Biochemistry and Microbiology. – 2022. – Vol. 58. Suppl. 1. – P. S16–S31. doi: 10.1134/S0003683822100106.

Максимов И.В., Шеин М.Ю., Веселова С.В., Хайруллин Р.М. Эндофиты и защита растений от биотического стресса: перспективы создания биопрепаратов нового поколения // Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2022. – №5. – C. 98-104. doi: 10.21515/1999-1703-98-98-104

Абдракова Г.И., Смирнова Ю.В., Хайруллин Р.М. «Влияние препарата «нанокремний» на активность пероксидазы и интенсивность перекисного окисления липидов в тканях горчицы сарептской // Научное обозрение. Биологические науки. – 2022. №2. – С. 24-28. doi: 10.17513/srbs.1268.

Алексеев В.Ю., Веселова С.В., Черепанова Е.А., Румянцев С.Д., Максимов И.В. Поиск штаммов липопептидпродуцирующих эндофитных бактерий рода Bacillus с ростстимулирующими и иммуностимулирующими свойствами, способных модулировать устойчивость растений пшеницы к злаковой тле Schizaphis graminum // Экобиотех. – 2022. – Том 5. – № 3. – С. 118-129. doi: 10.31163/2618-964X-2022-5-3-118-129

Veselova S.V., Sorokan A.V., Burkhanova G.F., Rumyantsev S.D., Cherepanova E.A., Alekseev V.Y., Sarvarova E.R., Kasimova A.R., Maksimov I.V. By Modulating the Hormonal Balance and Ribonuclease Activity of Tomato Plants Bacillus subtilis Induces Defense Response against Potato Virus X and Potato Virus Y // Biomolecules. – 2022. – Vol. 12. – Art. 288. doi: 10.3390/biom12020288.

Румянцев С.Д., Алексеев В.Ю., Веселова С.В., Бурханова Г.Ф., Максимов И.В. Роль эндофитных бактерий рода Bacillus в регуляции экспрессии генов транскрипционных факторов, вовлеченных в защитный ответ пшеницы против тли Schizaphis graminum (Rond.) // Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2022. – №4(97). – С. 112 – 118. doi: 10.21515/1999-1703-97-124-130

Нужная Т.В., Миннигалиева А.Ф., Тырышкин Л.Г., Веселова С.В., Максимов И.В. Влияние эффектора патогенного гриба Stagonospora nodorum (Berk.) SnTox1 на компоненты про-/антиоксидантной системы пшеницы // Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2022. – №4(97). – С. 105-111. doi: 10.21515/1999-1703-97-117-123

Сорокань А.В., Алексеев В.Ю. Продуцирующие CRY-токсины эндофитные бактерии как альтернатива трансгенным растениям для защиты картофеля от колорадского жука // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2022. – Том 40. – № 1. – С. 46-48. doi: 10.17116/molgen20224001146.

Яруллина Л.Г., Бурханова Г.Ф., Заикина Е.А., Черепанова Е.А., Сорокань А.В., Цветков В.О., Марданшин И.С., Калацкая Ж.Н. Штаммы бактерий Bacillus subtilis Cohn и Bacillus thuringiensis Berliner – индукторы устойчивости растений картофеля к возбудителю фитофтороза // Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2022. – Вып. № 94. – С. 176-180. doi: 10.21515/1999-1703-94-176-180.

Яруллина Л.Г., Бурханова Г.Ф., Цветков В.О., Черепанова Е.А., Заикина Е.А., Сорокань А.В., Максутова В.О., Калацкая Ж.Н., Максимов И.В. Стимулирование защитных механизмов Solanum tuberosum бактериями Вacillus subtilis и хитоолигосахаридами при инфицировании Phytophthora infestans // Прикладная биохимия и микробиология. – 2022. – Том 58. – № 2. – С. 185-194. doi: 10.31857/S0555109922020179. Перевод: Yarullina L.G., Burkhanova G.F., Tsvetkov V.O., Cherepanova E.A., Zaikina E.A., Sorokan A.V., Maksutova V.O., Kalatskaya Zh.N., Maksimov I. Stimulation of the defense mechanisms of Solanum tuberosum by Bacillus subtilis bacteria and chitooligosaccharides during Phytophthora infestans infection. // Applied biochemistry and microbiology. – 2022. – Vol. 58. – N. 2. – P. 185-194. doi: 10.31857/S0555109922020179.

Яруллина Л.Г., Цветков B.O., Хабибуллина В.О., Черепанова Е.А., Бурханова Г.Ф.,  Заикина Е.А., Калацкая Ж.Н. Влияние бактерий Bacillus subtilis в сочетании с салициловой и жасмоновой кислотами на изменение протеома листьев картофеля при инфицировании Phytophthora infestans (Mont.) de Bary и недостатке влаги // Физиология растений. – 2022. – Том 69. – № 4. – С. 438-448. doi: 10.31857/S0015330322040212. Перевод. Yarullina L.G., Tsvetkov B.O., Khabibullina B.O., Cherepanova E.A., Burkhanova G.F., Zaikina E.A., Kalatskaya J.N. Effect of Bacillus subtilis bacteria in combination with salicylic and jasmonic acids on changes in the proteome of potato leaves under infection with Phytophthora infestans (Mont.) de Bary and lack of moisture // Russian J. of Plant Physiology. – 2022. – Vol. 69. – № 4. – P. 438-448. doi: 10.31857/S0015330322040212.

Kiseleva S.V., Cherepanova E.A., Nasibullina E.R., Khalimova L.K., Maksimov I.V. A Novel Laccase from Basidiomycete Fomes fomentarius VKPM F-1531. In: Intelligent Biotechnologies of Natural and Synthetic Biologically Active Substances. ICAETT 2021. Lecture Notes in Networks and Systems, Kurchenko, V., Lodygin, A., Machado da Costa, R.M., Samoylenko, I. (eds) «Springer Nature» – 2022. – Vol. 408. – P. 99-105. doi: 10.1007/978-3-030-96641-6_12

Lastochkina O., Pusenkova L., Garshina D., Kasnak C., Palamutoglu R., Shpirnaya I., Mardanshin I., Maksimov I. Improving the biocontrol potential of endophytic bacteria Bacillus subtilis with salicylic acid against Phytophthora infestans-caused postharvest potato tuber late blight and impact on stored tubers quality // Horticulturae. – 2022. – Vol. 8. – N. 2. – Art. 117. doi: 10.3390/horticulturae8020117

Хайруллин Р.М. Об истории уфимской научной школы эндофитологов. // Биомика. 2023. – Том.15. – № 4. – С. 224-252. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2023-21.

Курамшина З.М., Саттарова Л.Р., Максимов И.В. Повышение устойчивости пшеницы к нефтяному загрязнению с помощью эндофитных бактерий Bacillus subtilis // Физиология растений. 2023. – Том 70. – № 6. – С. 679–687. doi: 10.31857/S0015330323600286. Перевод: Kuramshina Z.M., Sattarova L.R., Maksimov I.V. Increasing the Resistance of Wheat to Oil Pollution Using Endophytic Bacteria Bacillus subtilis // Russian J. of Plant Physiology. – 2023. – Vol. 70. – Art. 124. doi: 10.1134/S1021443723700188.

Курамшина З.М., Хайруллин Р.М. Повышение толерантности Triticum aestivum L. к солевому стрессу с помощью эндофитных штаммов Bacillus subtilis // Физиология растений. – 2023. – Том 70. – № 3. – С. 293-300. doi: 10.31857/S001533032260070X. Перевод: Kuramshina Z.M., Khairullin R.M. Improving Salt Stress Tolerance of Triticum aestivum L. with Endophytic Strains of Bacillus subtilis // Russ. J. Plant Physiol. – 2023. – Vol. 70. – Art. 53. doi: 10.1134/S1021443722603068.

Курамшина З.М., Хайруллин Р.М. Повышение устойчивости растений к засухе с помощью эндофитных штаммов Bacillus subtilis // Физиология растений. – 2023. – Том 70. – № 3. – С. 259-268. doi: 10.31857/S0015330322600760. Перевод: Kuramshina Z.M., Khairullin R.M. Endophytic Strains of Bacillus subtilis Promote Drought Resistance of Plants // Russ. J. Plant Physiol. – 2023. – Vol. 70. – Art. 45. doi: 10.1134/S1021443722603172.

Нужная Т.В., Бурханова Г.Ф., Веселова С.В., Шеин М.Ю., Максимов И.В. Изучение экспрессии микроРНК пшеницы на ранних этапах инфицирования патогенным грибом Stagonospora nodorum (Вerk.) // Труды Кубанского Гоc. аграрного университета. – 2023. – №4 (106). – С. 284-291. doi: 10.21515/1999-1703-106-284-291.

Нужная Т.В., Сорокань А.В. Веселова С.В., Максимов И.В. // Влияние малых интерферирующих РНК, синтезированных in vitro, на рост и споруляцию патогенного гриба Stagonospora nodorum // Biomics. – 2024. – Том 16. – № 1. – С. 48-55. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2024-5.

Нужная Т.В., Сорокань А.В., Веселова С.В., Максимов И.В. Влияние фитогормонов на рост колоний и степень споруляции различных изолятов патогена Stagonospora nodorum // Экобиотех. – 2023. – Том 6. – № 1. – С. 1-13. doi: 10.31163/2618-964X-2023-6-1-1-13.

Нужная Т.В., Сорокань А.В., Веселова С.В., Шеин М.Ю., Максимов И.В. Роль фитогормонов в регуляции экспрессии генов эффекторов и специфических факторов транскрипции патогена Stagonospora nodorum в культуре // Biomics. – 2023. – Том 15. – № 2. – С. 60-72. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2023-9

Tsvetkov V., Yarullina L., Sorokan A., Khabibullina V., Mardanshin I. Activity of Hydrolases and Their Inhibitors in Potato Plants Treated with Bacillus subtilis, Salicylic, and Jasmonic Acids and Affected by the Combined Effect of the Late Blight and the Lack of Moisture. // Int. J. of Plant Biology. – 2023. – Vol. 14. – N. 2. – P. 329-338. doi: 10.3390/ijpb14020027.

Tsvetkov V.O., Yarullina L.G., Burkhanova G.F., Cherepanova E.A., Sorokan A.V., Zaikina E.A., Khabibullina V.O., Kalatskaja J.N., Balyuk N.V. Statistical Analysis of the Relationship Between Parameters, Related to Potato Resistance to Biotic and Abiotic Stress: the State of the Pro-/Antioxidant System and the Level of PR-Proteins Gene Expression // Rus. J. of Plant Physiology, 2023. – Vol. 70. – N. 8. – Art. 191. doi: 10.1134/S1021443723602203.

Yarullina L., Cherepanova E.A., Burkhanova G.F., Sorokan A.V., Zaikina E.A., Tsvetkov V.O., Mardanshin I.S., Fatkullin I.Y., Kalatskaja J.N., Yalouskaya N.A., Nikalaichuk V.A. Stimulation of the Defense Mechanisms of Potatoes to a Late Blight Causative Agent WhenTreated with Bacillus subtilis Bacteria and Chitosan Composites with Hydroxycinnamic Acids // Microorganisms. – 2023. – Vol. 11. – Art. 1993. doi: 10.3390/microorganisms11081993.

Румянцев С.Д., Алексеев В.Ю., Веселова С.В., Максимов И.В. Роль этефона и 1-метилциклопропена в развитии устойчивости растений пшеницы к обыкновенной злаковой тле Schizaphis graminum // Biomics. – 2024. – Том. 16. – № 1. – С. 33-47. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2024-4

Румянцев С.Д., Алексеев В.Ю., Сорокань А.В., Бурханова Г. Ф., Черепанова Е. А., Максимов И. В., Веселова С. В. Поиск перспективных эндофитных липопептид-синтезирующих бактерий Bacillus spp. для защиты растений пшеницы от обыкновенной злаковой тли (Schizaphis graminum). // Вавиловский журнал. – 2024. – Том. 28(3). – С. 24-32. Перевод: Rumyantsev S.D., Alekseev V.Y., Sorokan A.V., Burkhanova G.F., Cherepanova E.A., Maksimov I.V., Veselova S.V. Search for biocontrol agents among endophytic lipopeptide-synthesizing bacteria Bacillus spp. to protectwheat plants against Greenbug aphid (Schizaphis graminum). // Vavilov J. of Genetics and Breeding. – 2024. – Vol. 28(3). P. 276-287. doi: 10.18699/vjgb-24-32.

Румянцев С.Д., Алексеев В.Ю., Шеин М.Ю., Веселова С.В., Бурханова Г.Ф., Максимов И.В. Роль бактерий Bacillus spp. в индукции гормональных сигнальных путей и механизма РНК-интерференции при формировании защитного ответа растений пшеницы к обыкновенной черемуховой тле Rhopalosiphum padi (L.) // Таврический вестник аграрной науки. – 2023. – №3(35). – С. 199-214. doi: 10.5281/zenodo.10141759 EDN WZPPHV.

Румянцев С.Д., Благова Д.К., Алексеев В.Ю., Веселова С.В., Максимов И.В. Сурфактин бактериального штамма Bacillus subtilis 26Д индуцирует системную устойчивость растений пшеницы к обыкновенной злаковой тле Schizaphis graminum (Rond.) // Труды Кубанского Гос. аграрного университета. – 2023. – №4 (106). – С. 323-328. doi: 10.21515/1999-1703-106-323-328.

Сорокань А.В., Беньковская Г.В., Марданшин И.С., Алексеев В.Ю., Румянцев С.Д., Максимов И.В. Эндофитные штаммы Bacillus thuringiensis для разработки средств контроля численности колорадского жука в посадках картофеля // Агрохимия. – 2023. – № 7. – С. 55-63. doi: 10.31857/S0002188123050083. Перевод: Sorokan A.V., Benkovskaya G.V., Mardanshin I.S., Alekseev V.Yu., Rumyantsev S.D., Maksimov I.V. Endophytic Strains of Bacillus thuringiensis for the Development of Means to Control the Number of the Colorado Potato Beetle in Potato Crops // Russian Agricultural Sciences. – 2023. – Vol. 49. – Suppl. 1. – P. S126–S133. doi: 10.3103/S1068367423070200.

Сорокань А.В., Бурханова Г.Ф., Алексеев В.Ю., Гордеев А.А., Марданшин И.С., Максимов И.В. Совместное влияние Bacillus thuringiensis B-5351 и салициловой кислоты на устойчивость растений картофеля к Phytophthora infestans и урожайность в полевых условиях // Biomics. – 2023. – Том 15. – № 1. – С. 1-6. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2023-1.

Sorokan A., Burkhanova G., Gordeev A., Maksimov I. Exploring the Role of Salicylic Acid in Regulating the Colonization Ability of Bacillus subtilis 26Д in Potato Plants and Defense against Phytophthora infestans. // Int. J. of Plant Biology. – 2023. – V. 14(1). – P. 242-253. doi: 10.3390/ijpb14010020.

Sorokan A., Gabdrakhmanova V., Kuramshina Z., Khairullin R., Maksimov I. Plant-Associated Bacillus thuringiensis and Bacillus cereus: Inside Agents for Biocontrol and Genetic Recombination in Phytomicrobiome // Plants. – 2023. – V. 12. – Art. 4037. doi: 10.3390/plants12234037.

Kuramshina Z. M., Khairullin R. M., Maksimov I. V. Endophytic Bacteria Bacillus spp. in the Formation of Adaptive Potential of Plants // Russian J. of Plant Physiology. – 2023. – Vol. 70. – Art. 186. doi: 10.1134/S1021443723602021

Maslennikova D., Ivanov S., Petrova S., Burkhanova G., Maksimov I., Lastochkina O. Components of the Phenylpropanoid Pathway in the Implementation of the Protective Effect of Sodium Nitroprusside on Wheat under Salinity // Plants. – 2023. – Vol. 12. – Art. 2123. doi: 10.3390/plants12112123.

Nuzhnaya T., Veselova S., Burkhanova G., Maksimov I. Virulence Factors of the Fungal Pathogen Stagonospora nodorum Manipulate Hormonal Signaling Pathways in Triticum aestivum L. by Regulating Host Plant MicroRNA Expressions // Front. Biosci. (Elite Ed). – 2023. – Vol. 15. – N. 4. – Art. 22. doi: 10.31083/j.fbe1504022.

Nuzhnaya T., Veselova S., Burkhanova G., Rumyantsev S., Shoeva O., Shein M., Maksimov I. Novel Sources of Resistance to Stagonospora nodorum and Role of Effector-Susceptibility Gene Interactions in Wheat of Russian Breeding // Int. J. Plant Biol. – 2023. – Vol. 14. – P. 377–396. doi: 10.3390/ijpb14020031.

Яруллина Л.Г., Калацкая Ж.Н., Черепанова Е.А., Еловская Н.А., Цветков В.О., Овчинников И.А., Бурханова Г.Ф., Рыбинская Е.И., Сорокань А.В., Герасимович К.М., Заикина Е.А., Николайчук В.В., Гилевская К.С., Марданшин И.С. Перспективы повышения биологической активности биопрепаратов на основе бактерий рода Bacillus и нанокомпозитов хитозана (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. – 2023. – Том 59. № 5. – С. 427-439. doi: 10.31857/S0555109923050185. Перевод: Yarullina, L.G., Kalatskaja J.N., Cherepanova E.A. Yalouskaya N.A., Tsvetkov V.O., Ovchinnikov I.A., Burkhanova G.F., Rybinskaya K.I., Sorokan A.V., Herasimovich K.M., Zaikina E.A., Nikolaichuk V.V., Hileuskaya K.S., Mardanshin I.S. Approaches to Improving the Biological Activity of Agricultural Formulations Based on Bacteria of the Genus Bacillus and Chitosan Nanocomposites (Review) // Appl. Biochem. Microbiol. – 2023. – Vol. 59. – P. 549–560. doi: 10.1134/S0003683823050186.

Garafutdinov R.R., Burkhanova G.F., Maksimov I.V., Sakhabutdinova A.R. New method for microRNA detection based on multimerization // Analytical Biochemistry. – 2023. – Vol. 664. – Art. 115049. doi: 10.1016/j.ab.2023.115049.

Хайруллин Р.М., Сорокань А.В., Габдрахманова В.Ф., Максимов И.В. Перспективные свойства Bacillus thuringiensis и направления их использования для защиты растений // Прикладная биохимия и микробиология. – 2023. – Том 59. – № 4. – С. 337-354. doi: 10.31857/S0555109923040074. Перевод Khairullin R.M., Sorokan A.V., Gabdrakhmanova V.F., Maksimov I.V. The Perspective Properties and Directions of Bacillus thuringiensis Use for Plant Protection // Applied Biochemistry and Microbiology. – 2023. – Vol. 59. – N. 4. – P. 408–424. doi: 10.1134/S0003683823040075.

Шеин М.Ю., Бурханова Г.Ф., Максимов И.В. Влияние салициловой и жасмоновой кислот на активность генов SnAGO гриба Stagonospora nodorum Berk. в культуре и при инфицировании растений пшеницы // Вавиловский журнал генетики и селекции 2023. – Tом 27. – № 8. – C. 1000-1009 DOI 10.18699/VJGB-23-115. Перевод: Shein M.Yu., Burkhanova G.F., Maksimov I.V. The effect of salicylic and jasmonic acids on the activity of SnAGO genes in the fungus Stagonospora nodorum Berk. in vitro culture and during infection of wheat plants // Vavilov J. of Genetics and Breeding. – 2023. – Vol. 27(8). – P. 1000-1009. doi: 10.18699/VJGB-23-115.

Сорокань А.В., Габдрахманова В.Ф., Марданшин И.С., Максимов И.В. Влияние эндофитных бактерий Bacillus velezensis M66 на транскрипционную активность генов системы РНК-интерференции при развитии защитных реакций против возбудителя фитофтороза Phytophthora infestans (Mont.) De Bary). // Физиология растений. – 2024. – Том 71. – № 4. – С. 409-417. doi: 10.31857/S0015330324040039. Перевод: Sorokan A.V., Gabdrakhmanova V.F., Mardanshin I.S., Maksimov I.V. Effect of endophytic bacteria Bacillus velezensis М66 on transcriptional activity of the genes of the rna interference system upon development of defense responses against the late blight pathogen Phytophthora infestans (Мont.) de Bary // Russian J. of Plant Physiology. – 2024. – Vol. 71. – Art. 139. doi: 10.1134/S1021443724607407

Сорокань А.В., Габдрахманова Г.Ф., Благова Д.К., Максимов И. В. Эндофитные бактерии рода Bacillus для защиты растений картофеля и томатов от альтернариоза // Таврический вестник аграрной науки. – 2024. – № 3(39). – С. 205-216. doi: 10.5281/zenodo.13788887.

Хайруллин Р.М. Максимов И.В.Участие оксалатов в физиологических процессах у растений: потенциальная роль эндофитных бактерий – оксалотрофов // Физиология растений. – 2024. – Том 71. – № 6. – С. 649–657. doi: 10.31857/S0015330324060011. Перевод: Khairullin R.M., Maksimov I.V. Participation of Oxalates in Physiological Processes in Plants: Potential Role of Endophytic Bacteria–Oxalotrophs // Russian J. of Plant Physiology. – 2024. – Vol. 71. – Art. 168. – doi: 10.1134/S1021443724607894.

Яруллина Л.Г., Бурханова Г.Ф., Цветков В.О., Черепанова Е.А., Сорокань А.В., Заикина Е.А., Марданшин И.С., Фаткуллин И.Я., Максимов И.В., Калацкая Ж.Н., Еловская Н.А., Рыбинская Е.И. Влияние конъюгатов хитозана с оксикоричными кислотами и бактерий Bacillus subtilis на активность защитных белков и устойчивость растений картофеля к Phytophthora infestans // Прикладная биохимия и микробиология. – 2024. – Том 60. – № 2. – С. 183. doi: 19210.31857/S0555109924020088. Перевод: Yarullina L.G., Burkhanova G.F., Tsvetkov V.O., Cherepanova E.A., Sorokan A.V., Zaikina E.A., Mardanshin I.S., Fatkullin I.Y., Maksimov I.V., Kalatskaja J. N., Yalouskaya N.A., Rybinskaya E.I. The Effect of Chitosan Conjugates with Hydroxycinnamic Acids and Bacillus subtilis Bacteria on the Activity of Protective Proteins and Resistance of Potato Plants to Phytophthora infestans // Appl Biochem Microbiol. – 2024. – Vol. 60. – P. 231–240. doi: 10.1134/S0003683824020194

Kalatskaja J.N., Yarullina L.G., Yalouskaya N.A., Burkhanova G.F., Rybinskaya E. I., Zaikina E.A., Ovchinnikov I.A., Tsvetkov V.O., Herasimovich K.M., Cherepanova E.A., Ivanov O.A., Hileuskaya K.S., Nikalaichuk V.V. Effect of Chitosan–Caffeic Acid Conjugate and Bacillus Subtilis Bacteria on the Protective Reactions in PVY-Infected Plants under Soil Water Deficit // Applied Biochemistry and Microbiology. – 2024. – Vol. 60. – N. 6. – P. 1328–1337. doi: 10.1134/S0003683824605560.

Nuzhnaya T.V., Sorokan A.V., Burkhanova G.F., Maksimov I.V., Veselova S.V. The Role of Cytokinins and Abscisic Acid in the Growth, Development and Virulence of the Pathogenic Fungus Stagonospora nodorum (Berk.) // Biomolecules. – 2024. – Vol. 14. – Art. 517. doi: 10.3390/biom14050517.

Rumyantsev S.D., Alekseev V.Y., Sorokan A.V., Burkhanova G.F., Cherepanova E.A., Garafutdinov R.R., Maksimov I.V., Veselova S.V. Additive effect of the composition of endophytic bacteria Bacillus subtilis on systemic resistance of wheat against greenbug aphid Schizaphis graminum due to lipopeptides // Life. – 2023. – Vol. 13. – Art. 214. – doi: 10.3390/life13010214.

Rumyantsev S.D., Veselova S.V., Burkhanova G.F., Alekseev V.Y., Maksimov I.V. Bacillus subtilis 26Д Triggers Induced Systemic Resistance against Rhopalosiphum padi L. by Regulating the Expression of Genes AGO, DCL and microRNA in Bread Spring Wheat // Microorganisms. – 2023. – Vol. 11. – Art. 2983. doi: 10.3390/microorganisms11122983.

Sorokan A.V., Gabdrakhmanova V.F., Mardanshin I.S., Maksimov I.V. Effect of Endophytic Bacteria Bacillus subtilis 26Д and Bacillus velezensis M66 on Resistance of Potato Plants to the Causative Agent of Early Blight Alternaria solani // Applied Biochemistry and Microbiology. – 2024. – Vol. 60. – No. 6. – P. 1313–1320. doi: 10.1134/S0003683824605080.

Yarullina L.G., Kalatskaja J.N., Tsvetkov V.O., Burkhanova G.F., Yalouskaya N.A., Rybinskaya E.I., Zaikina E.A., Cherepanova E.A., Hileuskaya K.S., Nikalaichuk V.V. The Influence of Chitosan Derivatives in Combination with Bacillus subtilis Bacteria on the Development of Systemic Resistance in Potato Plants with Viral Infection and Drought // Plants. – 2024. – V. 13. – N. 16. – Art. 2210. doi: 10.3390/plants13162210.

Веселова С. В., Нужная Т. В., Максимов И. В. Влияние эффектора SnTox1 патогена Stagonospora nodorum (Berk.) на гормональные сигнальные пути растений пшеницы // Таврический вестник аграрной науки. – 2024. – №4(40). – С 19-37. doi: 10.5281/zenodo.14184282.

Курамшина З.М., Хайруллин Р.М., Ямалеева А.А Влияние эндофитных штаммов Bacillus subtilis на микоризацию корней пшеницы при солевом стрессе. // Агрохимия. – 2024. – №1. – С. 76-81. doi: 10.31857/S0002188124010103

Veselova S., Nuzhnaya T., Maksimov I. The Role of Salicylic, Jasmonic Acid and Ethylene in the Development of the Resistance/Susceptibility of Wheat to the SnTox1-Producing Isolate of the Pathogenic Fungus Stagonospora nodorum (Berk.) // Plants. – 2024. – Vol. 13. – Art. 2546. DOI: 10.3390/plants13182546.

Книги, главы в книгах

Sorokan A.V., Burkhanova G.F., Veselova S.V., Singh B.P., Khairullin R.M., Maksimov I.V. Endophytic bacteria to control plant viruses: An overview. In Book: Microbial Endophytes and Plant Growth. Ed’s Drs. M.K. Solanki, K.M. Yadav, B.P. Singh, V.K. Gupta – Elsevier, Academic press. – 2023. – Chapter 4. – P. 51-66. Paperback ISBN: 9780323906203. doi: 10.1016/B978-0-323-90620-3.00018-0

Патенты

Марданшин И. С., Савченко Р. Г., Сорокань А. В., Беньковская Г. В. // Патент на изобретение 2751116 C1, 08.07.2021. Заявка № 2020122572 от 02.07.2020.

Гранты фондов

2024-2025 г.г. Грант РНФ 24-26-00025 «Перспектива применения выделенных на территории Южного Урала эндофитных штаммов бактерий рода Bacillus для повышения устойчивости сельскохозяйственных растений к комплексу биотических факторов среды». руководитель А.В. Сорокань;

2024-2025 г.г. Грант РНФ 24-26-00266 «Роль бактерий рода Bacillus в регуляции РНК-интерференции и активности микроРНК в растениях пшеницы при развитии устойчивости к патогенному грибу Stagonospora nodorum». руководитель Г.Ф. Бурханова;

2023-2025 г.г. Грант РНФ 23-16-00139 «Биосовместимые нанокомпозиты хитозана в комплексе с бактериями рода Bacillus – основа новых биопестицидов и стимуляторов фитоиммунитета широкого спектра действия». руководитель Л.Г. Яруллина;

2020-2022 г.г. РНФ № 20-76-00003 «Физиологические основы формирования симбиотических взаимоотношений растений картофеля с эндофитными бактериями рода Bacillus» Руководитель  Сорокань А.В.

2020 – 2022 г.г. РФФИ-БФФИ № 20-516-0005 «Бактерии рода Bacillus и медиаторы сигнальных систем в индуцировании комплексной устойчивости растений к патогенам и абиотическим стрессам» Руководитель Яруллина Л.Г.

2020-2021 г.г. РФФИ – аспиранты 20-34-90004 «Роль РНК-интерференции в формировании защитных систем растения пшеницы против возбудителя септориоза Stagonospora nodorum Berk» Руководитель Максимов И.В.. Асп. Шеин М.Ю.

2020-2021 г.г. РФФИ – аспиранты 20-316-90021 “Роль эндофитных микроорганизмов рода Bacillus, синтезирующих метаболиты с инсектицидными свойствами, в устойчивости растений пшеницы к обыкновенной злаковой тле Schizaphis graminum” Руководитель Веселова С.В.. Асп. Алексеев В.Ю.

2019 – 2021 г.г. РНФ 19-46-02004 «Бактериальные эндофиты как потенциальные вирициды для биоконтроля распространенных вирусов картофеля и томатов» руководитель Максимов И.В.;

2022-2023 г.г. РНФ 22-76-00055 «Роль основных и дополнительных функций некротрофного эффектора Stagonospora nodorum (Berk.) SnTox1в развитии инфекции у различных генотипов пшеницы» руководитель Нужная Т.В.

2017-2021 г.г. Грант РФФИ-офи_м 17-29-08014 «Липопептиды эндофитных бактерий Bacillus spp. – модуляторы защитных систем растений от вредных организмов» руководитель Максимов И.В.

Участие в международных конференциях

XI межд. симп. «Фенольные соединения: фундаментальные и прикладные аспекты 11–15 апреля 2022 г, Москва

III-я Межд. науч.  конф. «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» PLAMIC2022, 3-8 октября 2022 года Санкт- Петербург

5-й Съезд микологов России «Современная микология в России», 12-14 октября 2022 года, Москва

V (ХIII) Межд. ботаническая конф. молодых учёных в Санкт-Петербурге. Санкт-Петербург, 2022. 25–29 апреля 2022 года.

Клеточная биология и биотехнология растений. III Межд. научно-практическая конф. Минск, 2022.

Всероссийская научная конф. с межд. участием «Физиология растений и феномика как основа современных фитобиотехнологий». Годичное собрание Общества физиологов растений России. Нижний Новгород, 27-30 сентября 2022 г.

ICE 2022 XXVI International Congress of Entomology · Helsinki, Finland, July 17-22, 2022 ·

VIII всероссийская научно-практическая конф. «Методологические и теоретические основы селекции, семеноводства, размножения и защиты сельско-хозяйственных, садовых и лесных древесных растений» ФГБУН «НБС-ННЦ» Ялта, 5-10 сентября 2022 г.

V Всероссийский конгресс по защите растений и Школа молодых учёных «Биологические исследования в защите растений: реновация концепций, подходов и методов» С.-Пб, 16-19 апреля 2024 г.

77-й Межд. школа-конф. молодых ученых Биосистемы: организация, поведение, управление Н. Новгород, 15–19 апреля 2024 г.

Всероссийская научная конф. с межд. участием Фундаментальные и прикладные аспекты адаптации живых организмов к изменяющимся условиям окружающей среды севера: Петрозаводск 09-13 сентября 2024 «Биология будущего», Уфа 14.06.24

IV Международной научной конф. Растения и микроорга-низмы: био-технология будущего. PLAMIC2024. Байкальск, 15–22 сентября 2024 г.

IV Межд. симп. и школа молодых ученых Роль активных форм кислорода и азота в жизни растений». Республика Беларусь, Минск, 25–28 августа 2024г.

IV Всероссийская научная конф. с международным участием Современные проблемы физиологии, биохимии и биотехнологии растений 17-18 октября 2024 г., Уфа,

IV Междуна-родный конгресс The Int. Congress on Plant Molecular Biology (IPMB) Cairns, Australia 24th – 28th June 2024

Международный биотехнологический форум «BIOAsia–Altai 2024» Барнаул, Алтайский край, Россия 23–28 сентября 2024 г.

Х Международная научная конф Регуляция роста, развития и продуктивности растений, 23-25 октября 2024 г, Минск, Беларусь

IV Всеросс. конф.Фундаментальные и прикладные исследования: естественные науки 7 мая 2024 г.

Защита диссертаций

Гарипова Светлана Равилевна (2020). Защита дисс. д.б.н. «Формирование продуктивности и стрессоустойчивости бобовых растений в ассоциации с эндофитными бактериями» Хайруллин Р.М. научный консультант

Сарварова Елена Рафисовна (2021) Дисс. канд наук «Поиск новых свойств эндофитных бактрий Bacillus subtilis Cohn.» Хайруллин Р.М. научный руководитель

Алексеев Валентин Юрьевич (2024) Дисс. канд наук «Роль эндофитных микроорганизмов рода Bacillus, синтезирующих метаболиты с инсектицидными свойствами, в устойчивости растений пшеницы к обыкновенной злаковой тле Schizaphis graminum» Веселова С.В. научный руководитель

Шеин Михаил Юрьевич (2024) Дисс. канд наук «Роль РНК-интерференции в формировании защитных систем растения пшеницы против возбудителя септориоза Stagonospora nodorum Berk.» Максимов И.В. научный руководитель

 

Заведующий лабораторией – Баймиев Алексей Ханифович,

доктор биологических наук

Тел.: +7 (927) 233 78 08

e-mail: alexey.baymiev@ufaras.ru

              baymiev@mail.ru

 Основные направления научной деятельности лаборатории

  • Исследование свойств природных и искусственно созданных симбиозов ризосферных бактерий с растениями
  • Исследование генетических ресурсов симбиотических микроорганизмов
  • Создание и изучение свойств генетически модифицированных растений с уникальными хозяйственно-полезными признаками

 Лаборатория занимается исследованием молекулярных механизмов реализации биологического потенциала растений, микроорганизмов и их сообществ (симбиозов), приводящих к повышению урожайности сельхозкультур. С этой целью у сельхозкультур с применением методов генной инженерии и геномного редактирования проводится модификация генов, отвечающих за продуктивность и защиту растений. Например, генов, придающих устойчивость к засухе, поражению мучнистой росой и действию тяжелых металлов. Создаются рекомбинантные штаммы почвенных микроорганизмов с улучшенными характеристиками стимуляции роста сельхозкультур. Например, штаммы бактерий с улучшенной способностью фиксировать азот атмосферы. Кроме этого, ведутся работы по созданию искусственных симбиозов между полезными почвенными бактериями и растениями. Для этого проводится модификация генов растений и микроорганизмов, участвующих в формировании симбиоза. Например, генов, отвечающих за прикрепление полезных бактерий к корням растений.

Краткая история лаборатории

Лаборатория биоинженерии растений и микроорганизмов была создана в 1982 г.

Первый состав лаборатории – В.А. Вахитов, д.б.н., проф. (зав. лаб.); А.В. Чемерис д.б.н., проф.; Ф.Р. Гималов, д.б.н.; А., к.б.н.; Ю.М. Никоноров, к.б.н.; С.М. Бикбулатова к.б.н.

Заведующие лаборатории – В.А. Вахитов, д.б.н., проф. (с 1982 по 1995 гг), А.В. Чемерис д.б.н., проф. (с 1995 по 2015 гг), Ал.Х. Баймиев, д.б.н. (с 2015 г по наст. время).

Состав лаборатории

Чемерис Алексей Викторович

д.б.н., проф. г.н.с.

Баймиев Андрей Ханифович

д.б.н., в.н.с.

Никоноров Юрий Михайлович

к.б.н., с.н.с.

Геращенков Григорий Алексеевич

к.б.н., с.н.с.

Вершинина Зиля Рифовна

к.б.н., с.н.с.

 Михайлова Елена Владимировна

к.б.н., с.н.с.

Чубукова Ольга Вячеславовна

к.б.н., н.с. 

Матниязов Рустам Тахирович

к.б.н., н.с.

Акимова Екатерина Сергеевна

к.б.н., н.с. 

Хакимова Лилия Ралисовна

к.б.н., н.с. 

Лавина Анна Михайловна

к.б.н., н.с. 

Владимирова Анастасия Андреевна

к.б.н., н.с. 

 

Сотрудники лаборатории биоинженерии растений и микроорганизмов ИБГ УФИЦ РАН

Основные результаты, полученные за последние 5 лет

Обнаружены особенности взаимодействия бобовых и ризобий в зависимости от сезона (Baymiev et al., 2022; Baymiev et al., 2023). Показано влияние бобового растения на формирование новых штаммов и активацию горизонтального переноса генов у клубеньковых бактерий (Baymiev et al., 2024). Созданы рекомбинантные штаммы клубеньковых бактерий родов Mesorhizobium, Ensifer (Sinorhizobium) и Rhizobium с генно-инженерными конструкциями, содержащими разные варианты гена nifA, запускающего фиксацию азота атмосферы. Показано, что у свободноживущих рекомбинантных клеток всех трех родов бактерий включение гена nifA приводит к появлению детектируемой нитрогеназной активности с фиксацией азота (Vladimirova et al., 2021).

Получены генно-инженерные конструкции с генами модуляции симбиоза Dyp, DarA и DarB бактерий Pseudomonas spp., стимулирующих рост растений. Показано положительное влияние экспрессии гена Dyp в рекомбинантных штаммах Pseudomonas spp. на симбиоз с растениями гороха (Chubukova et al., 2024; Khakimova et al., 2024).).. Разработан метод ступенчатого молекулярно-генетического скрининга PGPR-штаммов Pseudomonas spp. пригодных для рекультивации земель, загрязненных тяжелыми металлами (Vershinina et al., 2023).

Подобраны гидовые РНК, созданы модульные конструкции для нокаут-нарушения функции генов-негативных регуляторов устойчивости растений к грибным заболеваниям (mlo), насекомым-вредителям (STS2) и абиотическим стрессам (MYB60 и HAT) Пасленовых и Капустных с использованием системы CRISPR/Cas9. С помощью геномного редактирования получены устойчивые к засухе «нокаут-растения» Arabidopsis thaliana с наследуемой гетерозиготной делецией в гене MYB60 (Khusnutdinov et al., 2022; Mikhaylova et al., 2024).

Основные научные публикации лаборатории

Статьи в научных журналах (за 2020-2024 гг):

Баймиев Ан. Х., Баймиев Ал. Х., Кулуев Б. Р., Швец К. Ю., Ямиданов Р. С., Матниязов Р. Т., Чемерис Д. А., Зубов В. В., Алексеев Я. И., Мавзютов А. Р., Иваненков Я. А., Чемерис А. В. Современные подходы к дифференциации живых и мертвых бактерий с помощью избирательной амплификации нуклеиновых кислот // Микробиология, 2020, Т. 89, № 1, с. 17–33.

Баймиев Ан.Х., Владимирова А.А., Акимова Е.С., Гуменко Р.С., Мулдашев А.А., Чемерис А.В., Баймиев Ал.Х. Филогенетическая характеристика клубеньковых бактерий эндемичных для Южного Урала видов рода Oxytropis (fabaceae) // Экологическая генетика. 2020;18(2):157-167.

Геращенков Г.А., Рожнова Н.А., Кулуев Б.Р., Кирьянова О.Ю., Гумерова Г.Р., Князев А.В., Вершинина З.Р., Михайлова Е.В., Чемерис Д.А., Матниязов Р.Т., Баймиев Ан.Х., Губайдуллин И.М., Баймиев Ал.Х., Чемерис А.В. Дизайн РНК-гидов для CRISPR/CAS/ редактирования геномов растений. Молекулярная биология, 2020, том 54, No 1, с. 1–22

Khusnutdinov E., Sukhareva A., Panfilova M., Mikhaylova E. Anthocyanin Biosynthesis Genes as Model Genes for Genome Editing in Plants // International Journal of Molecular Sciences. 2021; 22(16):8752.

Vershinina Z.R., Chubukova O.V., Maslennikova D.R. Glutathione Status in the Roots of Tomato Plants Transgenic by Genes psl and rapA1 in the Presence of Rhizobium leguminosarum // Russian Journal of Plant Physiology. 2021. V. 68 (5). P. 923-930.

Vershinina Z.R., Chubukova O.V., Nikonorov Y.M., Khakimova L.R., Lavina A.M., Karimova L.R., Baymiev An.K., Baymiev Al.K. Effect of rosR Gene Overexpression on Biofilm Formation by Rhizobium leguminosarum // Microbiology (Russian Federation). 2021. V. 90 (2). P. 198-209.

Chubukova O.V., Vershinina Z.R., Matnyazov R.T., Baymiev An.K., Baymiev Al.K.  Creation of an inducible vector system based on the rhizobia nodA gene promoter // Ecological genetics. 2021. V. 19(1). P. 13-21.

Khakimova L., Chubukova O., Vershinina Z. Tomato transgenic plants for phytoremediation // FEBS OPEN BIO. 2021. V. 11. P. 295.

Vladimirova A.A., Gumenko R.S., Akimova E.S., Baymiev Al.K., Baymiev An.K. Functional Specificity of the nifA Gene Product within the Group of Root Nodule Bacteria // Microbiology 2021, 90:481–488.

Musin Kh.G., Gumerova G.R., Gorte E., Baimukhametova E.A., Mikhaylova E.V., Kuluev B.R. Using stress factors for storage of Withania somnifera L. hairy roots without passages // Russian Journal of Plant Physiology. 2021. V. 68. P. 536–544.

Баймиев Ан.Х., Акимова Е.С., Коряков И.С., Владимирова А.А., Баймиев Ал.Х. Зависимость состава клубеньковых бактерий лядвенца рогатого (Lotus corniculatus) от стадии вегетации растения-хозяина // Микробиология. 2022. 91(5):586–596.

Чубукова О.В., Хакимова Л.Р., Акимова Е.С., Вершинина З.Р. Филогения и свойства новых штаммов Pseudomonas sp. из ризосферы бобовых растений Южного Урала // Микробиология. 2022. Том 91. № 5. С. 537-546.

Вершинина З.Р., Масленникова Д.Р., Чубукова О.В., Хакимова Л.Р., Федяев В.В. Вклад искусственно синтезированного фитохелатина, кодируемого геном PPH6HIS, в повышение фиторемедиативных качеств растений табака // Физиология растений. 2022. 69(4): 398-407.

Mikhaylova E.V., Khusnutdinov E.A., Chemeris A.V., Kuluev B.R. Available Toolkits for CRISPR/CAS Genome Editing in Plants // Russ J Plant Physiol 69, 3. 2022. 10.1134/S1021443722010137

Khusnutdinov E.; Artyukhin A.; Sharifyanova Y.; Mikhaylova E.V. A Mutation in the MYBL2-1 Gene Is Associated with Purple Pigmentation in Brassica oleracea // Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 11865.

Кулуев Б.Р., Михайлова Е.В., Кулуев А.Р., Галимова А.А., Заикина Е.А., Хлесткина Е.К. Редактирование геномов представителей трибы пшеницевые с использованием системы CRISPR/Cas // Молекулярная биология. 2022. 56(6):949-968.

Baymiev Al.Kh., Vladimirova A.A., Matniyazov R.T., Lavina A.M., Filyaeva K.Yu., Akimova E S., Baymiev An.Kh. Occurrence of the ability to suppress the growth of related strains in rhizobia // Microbiology, 2023, Vol. 92, No. 6, pp. 854–859.

Baymiev Al.Kh. Chuvatkina A.K., Vladimirova A.A., Matniyazov R.T., Mavzyutov A.R., Baymiev An.Kh. Analysis of antibacterial action mechanisms of medicinal plant extracts using dual reporter system Dualrep2 // Antibiotics and Chemotherapy. 2023; 68: 7–8: 11–16.

Баймиев Ан.Х., Коряков И.С., Акимова Е.С.,Владимирова А.А., Матниязов Р.Т., Баймиев Ал.Х. Оптимизация поиска высокоэффективных штаммов клубеньковых бактерий для инокуляции бобовых растений. Сельскохозяйственная биология, 2023, 58 (5): 864-874.

Baymiev AnK, Koryakov IS, Akimova ES, Vladimirova AA, Matniyazov RT, Baymiev AlK. Comparison of the variability and nitrogen-fixing activity of rhizobia strains isolated from Trifolium Hybridum L. and Galega orientalis Lam. nodules at different stages of plant vegetation. Ecological genetics. 2023; 21(3):207–217.

Khakimova L., Chubukova O., Vershinina Z., Maslennikova D. Effects of Pseudomonas sp. OBA 2.4.1 on Growth and Tolerance to Cadmium Stress in Pisum sativum L. // BioTech. 2023. 12 (5).

Vershinina Z.R., Maslennikova D.R., Chubukova O.V., Khakimova L.R., Mikhaylova E.V. Synthetic pph6his gene confers resistance to cadmium stress in transgenic tobacco // Russian Journal of Plant Physiology. 2023. V. 70 (4). Р. 83.

Artyukhin A., Sharifyanova Y., Krivosheev M.M., Mikhaylova E.V.  Larches of Kuzhanovo Have a Unique Mutation in the atpF–atpH Intergenic Spacer. // International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24(4), 3939.

Mikhaylova E.V., Kuluev B.R., Gerashchenkov G.A., Chemeris D.A., Garafutdinov R.R., Kuluev A.R., Baymiev An.K., Baymiev Al.K., Chemeris A.V. Prime-Editing Methods and pegRNA Design Programs. Mol Biol 2024. 58, 17–32.

Baymiev An.Kh., Koryakov I.S., Akimova E.S. Vladimirova A.A., Baymiev Al. Kh. Effect of Environmental Factors on Recombinant Activity of Root Nodule Bacteria // Microbiology 2024, №93, p. 444–449.

Chubukova O.V., Khakimova L.R., Matnyazov R.T., Vershinina Z.R. Heavy Metal-Resistant PGPR Strains of Pseudomonas sp. Stimulating the Growth of Alfalfa under Cadmium Stress // Biology Bulletin. 2024. V. 51. N. 5. P. 1291-1300

Khakimova L.R., Chubukova O.V., Vershinina Z.R. Use of the Pseudomonas sp. OBA 2.4. 1 Strain for Presowing Treatment of Pea Seeds (Pisum Sativum L.) in the Presence of Heavy Metals and Glyphosate //Applied Biochemistry and Microbiology. 2024. V. 60. N. 4. P. 722-729.

Kuluel, A., Kuluev, B., Mikhaylova, E., Chemeris, A. Sequencing and analysis of complete chloroplast genomes of einkorn wheats Triticum sinskajae and Triticum monococcum accession k-20970. Genetic Resources and Crop Evolution, 1-14. 2024.

Khusnutdinov, E.A., Panfilova, M.A., Terekhov, M.P., Mikhaylova, E.V. CRISPR/Cas editing of a CPC gene in Arabidopsis thaliana. Ecological genetics, 2024. 22(1), 13-22.

Книги, главы в книгах

Чемерис А.В., Аминев Ф.Г., Гарафутдинов Р.Р., Анисимов В.А., Сагитов А.М., Хуснутдинова Э.К., Сахабутдинова А.Р., Чемерис Д.А., Михайленко К.И. ДНК-криминалистика. М., Наука. 2022. 466 стр.

Патенты

Кирьянова О.Ю., Кирьянов И.И., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В., Гарафутдинов Р.Р., Губайдуллин И.М. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2020610703 ABCDNA_GS (Amplified Bar-Coded DNA Genome/Specimen) от 17.01.2020 г.

Ахметзянова Л.У., Давлеткулов Т.М., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Губайдуллин И.М. LAMPRIMERS IQ (Loop-Mediated isothermal AMplification PRIMERS IQ) // Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ 2022617417, 20.04.2022. Заявка № 2022616139 от 06.04.2022.

Кирьянова О.Ю., Кирьянов И.И., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В., Губайдуллин И.М. Barcode DNA ANALYZER (BDANALYZER) // Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ 2022663254, 13.07.2022. Заявка № 2022662699 от 30.06.2022.

Гранты фондов

«Новый рациональный подход к разработке антибактериальных и противоопухолевых лекарственных молекул с применением технологии ВПС» (Государственный контракт РНФ №17-74-30012, научный руководитель Иваненков Я.А.)

«Комплексное исследование водяного ореха Trapa L. с целью возрождения его аквакультуры» (Государственный контракт РНФ №18-74-00056, научный руководитель Михайлова Е.В.)

«Исследование регуляции биосинтеза антоцианов в растениях семейства Капустных с использованием технологии геномного редактирования» (Государственный контракт РНФ № 20-74-10053, научный руководитель Михайлова Е.В.)

«Роль бобового растения в формировании генетического разнообразия клубеньковых бактерий» (Государственный контракт РНФ №22-24-00207, научный руководитель Баймиев Ан.Х.)

«Антибактериальные соединения в регуляции микробных сообществ ризобий» (Государственный контракт РНФ №22-24-00193, научный руководитель Баймиев Ал.Х.)

«Филогенетические взаимоотношения отдельных видов пшенично-эгилопсного комплекса разных уровней плоидности через призму их полных хлоропластных геномов с прицелом на происхождение B- и G-субгеномов полиплоидных форм пшениц линий turgidum-aestivum и timopheevii-zhukovskyi» (Государственный контракт РНФ 23-24-00275, научный руководитель Матниязов Р.Т.)

«Технологии бесследного геномного редактирования сельскохозяйственных культур» (Государственный контракт РНФ 24-76-10065, научный руководитель Михайлова Е.В.)

«Получение штаммов рекомбинантных бактерий с усиленной азотфиксирующей активностью для биопрепаратов» (Государственный контракт РНФ №25-14-20013, научный руководитель Баймиев Ан.Х.)

РФФИ

«Новый способ однозначной цифровой ДНК-паспортизации (каталогизации) / ДНК-идентификации сортов сельскохозяйственных растений» (РФФИ-Поволжье – № 17-44-020120 р_поволжье_а, научный руководитель Чемерис А.В.).

«Влияние микробиома почв на ареал распространения эндемичных бобовых растений Республики Башкортостан» (РФФИ № 17-44-020201 -р_поволжье_а, научный руководитель Баймиев Ан. Х.)

«Ризосферные микроорганизмы с регулируемым синтезом ростостимулирующих веществ» (РФФИ № 18-34-20004 мол_а_вед, научный руководитель Вершинина З.Р.).

«Универсальная система «псевдофитохелатин – бактериальный адгезин» в фиторемедиации» (РФФИ № 18-34-00033 мол_а, научный руководитель Хакимова Л.Р.).

«Специфичность активации генов нитрогеназного комплекса продуктами генов nifА у клубеньковых бактерий» (РФФИ № 18-34-00034-мол_а, научный руководитель Гуменко Р.С.).

«Ризосферные микроорганизмы с регулируемым синтезом ростостимулирующих веществ» (РФФИ № 18-34-20004 мол_а_вед, научный руководитель Вершинина З.Р.).

«Синтетическая ДНК как носитель для долговременного хранения в ней небиологических данных, включая создание прообраза олиготеки из NYRN-олигонуклеотидов» (РФФИ № 20-07-00222, научный руководитель Чемерис А.В.).

«Глутатион-S-трансферазы для повышения стрессоустойчивости рапса» (грант Президента РФ № МК-1146.2020.11, научный руководитель Михайлова Е.В.)

Защита диссертаций

Кандидатские

Гуменко Р.С. «Получение штаммов клубеньковых бактерий с изменённой регуляцией генов нитрогеназного комплекса». Научный руководитель: Баймиев Ан.Х. 2020 г.

Кулуев А.Р. «Молекулярно-генетическое исследование Triticum sinskajae A.Filat. et Kurk и филогения диплоидных пшениц». Научный руководитель: Чемерис А.В. 2021 г.

Владимирова А.А. «Исследование функциональной специфичности продукта гена nifA внутри группы клубеньковых бактерий». Научный руководитель: Баймиев Ан.Х. 2022 г.

Лавина А.М. «Гены-регуляторы синтеза экзополисахаридов в формировании биопленок Rhizobium lеgumiпоsаrum». Научный руководитель: Баймиев Ал.Х. 2022 г.

Заведующий лабораторией – Кулуев Булат Разяпович,

доктор биологических наук

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: kuluev@bk.ru

Основные направления научной деятельности лаборатории

  • Молекулярные маркеры хозяйственно-ценных признаков культурных растений.
  • Генотипирование и оценка генетического полиморфизма культурных и дикорастущих растений.
  • Мутагенез, генетическая трансформация и геномное редактирование растений.
  • Биотехнология растений.

Лаборатория геномики растений организована в 2019 году в рамках Национального проекта «Наука». В составе лаборатории 7 кандидатов биологических наук, 2 младших научных сотрудника и 3 аспиранта. Заведующий лабораторией – доктор биологических наук Кулуев Булат Разяпович. Основные научные направления исследований: молекулярные маркеры хозяйственно-ценных признаков культурных растений; генетическая паспортизация сортов и линий сельскохозяйственных культур, оценка генетического полиморфизма дикорастущих растений, мутагенез, генетическая трансформация и геномное редактирование растений. В лаборатории также ведутся фундаментальные исследования генетических основ роста и стрессоустойчивости растений с использованием в качестве модельных объектов трансгенных и редактированных растений, а также генетически трансформированных волосовидных корней.

Лаборатория геномики растений участник мегагранта «Хлеба России» в рамках ФНТП развития генетических технологий; исполнитель гранта Минобрнауки РФ на создание и развитие Селекционно-семеноводческого центра по кормовым культурам УФИЦ РАН в 2022-2024 гг. и 2025-2027 гг.; а также исполнитель технологического проекта программы деятельности Евразийского НОЦ – ТП 9. «Селекционно-генетические и молекулярно-клеточные технологии в животноводстве и растениеводстве».

Сотрудники лаборатории геномики растений ИБГ УФИЦ РАН

 

Состав лаборатории

Гайнуллина Карина Петровна

к.б.н., с.н.с.

Заикина Евгения Александровна

к.б.н., н.с.

Галимова Айзиля Айтугановна

к.б.н., н.с.

Кулуев Азат Разяпович,

к.б.н., н.с.

Мусин Халит Галеевич

к.б.н., н.с.

Гумерова Гульнар Рафиловна

к.б.н., н.с.

Румянцев Сергей Дмитриевич к.б.н., н.с.

Бережнева Зоя Александровна

к.б.н., н.с.

Асянова Эльвина Ануровна

м.н.с.

 

Рахматуллина Ирина Фердинатовна

м.н.с.

Минеев Яков Павлович

Аспирант

 

Швец Дарья Юрьевна

Аспирант

 

Ибрагимова Зарина Азадовна

Аспирант

 

 Основные результаты, полученные за последние 5 лет

У яровых и озимых сортов мягкой пшеницы, районированных для Средней полосы России, Урала, Поволжья и Западной Сибири, проведены генотипирование, анализ уровня экспрессии, секвенирование генов, ассоциированных с такими хозяйственно-ценными признаками, как хлебопекарные качества, засухоустойчивость и зимостойкость: Glu-1, Waxy, Amy, NAC69, DREB1, bZIP60, WRKY19 и др. Обнаружены новые SNPs, ассоциированные с хозяйственно-ценными признаками. Идентифицированы и описаны ранее неизвестные нуклеотидные последовательности гена высокомолекулярных субъединиц глютенина х-типа – Glu-B1-1, которые были обнаружены в ходе генотипирования аллелей генов Glu-1 у сортов мягкой пшеницы Авеста, Ленинградка крупнозерная и линии С-75094. Выявленные мутации могут быть использованы при генотипировании сортов и линий мягкой пшеницы по генам Glu-B1-1. У изученных генотипов предсказаны изменения в количестве три-, гекса- и нонапептидных повторов центрального домена белка, а также выявлены изменения в количестве остатков глутамина и глицина.

Анализ нуклеотидных последовательностей гена гликозилтрансферазы GT47 в выборках высокопентозановых и низкопентозановых сортов ржи показал наличие однонуклеотидных замен в семи локусах, по которым различались исследуемые сорта. Из них наибольшее число различий выявлялось по трем нуклеотидным заменам 159 (G/A), 204 (C/T), 327 (G/A). Предполагается, что данные SNPs могут быть использованы при генотипировании сортов ржи на содержание водорастворимых пентозанов в зерне.

Коллективом авторов также проводятся работы по полногеномным исследованиям. Всего секвенированы полные хлоропластные геномы 25 образцов 12 видов пшеницевых. К примеру, секвенированы полные хлоропластные геномы у T. militinae (3 образца), T. aethiopicum, T. persicum, T. polonicum, T. timonovum, T. turanicum, T. turgidum var. lusitanicum, T. vavilovii, Ae. aucheri (8 образцов разного географического происхождения), Amblyopyrum muticum (2 образца). Помимо хлоропластного генома, у пшеницы Синской с помощью флуоресцентного секвенирования по технологии Illumina проведено секвенирование полного ядерного генома этого вида, имеющего довольно большой размер – около 5 млрд.п.н. В результате проведенной сборки программами-сборщиками геномов Soapdenovo и ABySS 2.0 удалось собрать черновой геном пшеницы Синской (Q20) размером немногим более 5 млрд.п.н. в виде 160540 контигов разной протяженности (N50 – 6843 п.н).

В результате сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей кодирующих участков генов ABI3, FUS3, LEC1, LEC2 у сортов и линий гороха с различным содержанием белка в семенах был выявлен ряд однонуклеотидных полиморфизмов, среди которых наиболее значимой является замена аденина на тимин в позиции 1334 п.о. гена ABI3, которая приводит к замене тирозина на фенилаланин в предсказанной белковой молекуле. Уровни экспрессии генов ABI3 и FUS3 на всех стадиях развития семян зависели от генотипа изученных сортообразцов и в целом были выше на средней и поздней стадиях развития семян. По результатам оценки коллекционного материала гороха посевного были выделены лучшие сортообразцы для молекулярно-генетической оценки по микросателлитным локусам. Использованные для анализа SSR-маркеры локализованы в I-VI группах сцепления гороха и имели размеры от 138 до 377 п.н. Была показана высокая эффективность данных маркеров для исследования генетического полиморфизма гороха посевного. В результате генотипирования 40 сортообразцов гороха была получена база данных по аллельным состояниям исследованных SSR-маркеров, которая может быть использована для расчета уровня внутривидовой изменчивости и генетической паспортизации. Установлено, что для идентификации изученных сортов и линий достаточно использовать набор из пяти высокополиморфных микросателлитных локусов. На основе полученных данных был проведен анализ частот встречаемости аллелей и выявлены наиболее редкие аллели, позволяющие проводить экспресс-идентификацию отдельных сортообразцов. В ходе исследований были установлены достоверные связи некоторых качественных признаков (окраска и осыпаемость семян, морфотип) с частотами аллелей изученных микросателлитных локусов. Кластерный анализ данных, полученных в результате микросателлитного анализа показал, что исследованные сорта и линии сгруппировались в соответствии с их происхождением, географией распространения, особенностями морфобиологических и селекционно-важных признаков. Методом индуцированного мутагенеза из сорта гороха селекции Башкирского НИИСХ УФИЦ РАН Памяти Попова с использованием химического мутагена азида натрия создано 16 мутантных популяций гороха, у 10 из которых было обнаружено изменение морфотипа. Анализ элементов продуктивности выявил достоверное превосходство (p<0,05) над исходным сортом мутантных популяций по количеству семян в бобе, по массе 1000 семян, по массе семян с растения. Полученные мутантные популяции используются в селекции как источники высокой озерненности бобов, семенной продуктивности, массы семян с растения и крупности семян, лучшие из них включены в коллекцию генетических ресурсов зернобобовых культур ВИР.

На примере каучуконосных видов и форм одуванчиков кок-сагыза (Taraxacum kok-saghyz) и одуванчика осеннего (Taraxacum hybernum) были подобраны лучшие RAPD-, ISSR- и SSR-маркеры для их однозначной идентификации. Показано, что RAPD-праймеры OPD-07 и FS-10 лучше всего подходят для обнаружения межвидового полиморфизма, в то время как RAPD-праймеры FS-10, OPC-05 и OPC-08 могут использоваться для обнаружения внутривидового полиморфизма каучуконосных одуванчиков. ISSR-праймеры ISSR HB10, ISSR17 и ISSR36 оказались наиболее эффективными для выявления межвидового полиморфизма. Для идентификации форм T. hybernum с бурыми и розовыми семенами можно использовать праймеры HB10 и ISSR38. Праймеры HB10 и ISSR14 лучше всего подходят для идентификации трех изученных линий кок-сагыза. SSR-праймеры TKS0091, TKS0097, TKS0107 и TKS0110 подходят для SSR-идентификации розовосемянных и буросемянных форм T. hybernum. Также нами была изучена морфология и урожайность корней, содержание каучука и инулина, а также определена молярная масса каучука у кок-сагыза, буро- и розовосемянного T. hybernum. Наибольшую массу корней набирала розовосемянная форма Т. hybernum. Содержание каучука составило около 6% у T. kok-saghyz, 3% у обеих форм T. hybernum. Лидерами по содержанию инулина оказались T. kok-saghyz и розовосемянная форма Т. hybernum. Из всех изученных форм и видов одуванчиков молярная масса каучука превышала 1 млн г/моль только у T. kok-saghyz и розовосемянной формы Т. hybernum, то есть именно эти одуванчики продуцируют каучук наивысшего качества.

Объектами исследования также являются кормовые культуры: житняк ширококолосый, тимофеевка луговая, ежа сборная, люцерна гибридная и вика посевная. Для данных культур были подобраны наиболее эффективные SSR-маркеры, которые стали основой разрабатываемых тест-систем для оценки генетического полиморфизма и генетической паспортизации. Получен патент на тест-систему для идентификации, оценки генетического полиморфизма и генетической паспортизации сортов и линий тимофеевки луговой. Для житняка ширококолосого, ежи сборной и люцерны гибридной разработаны технологии и созданы лабораторные образцы тест-систем для оценки генетического полиморфизма.

Проводятся работы по созданию волосовидных корней растений-продуцентов ценных метаболитов (цикорий, большеголовник серпуховидный, сапожниковия растопыренная), а также получены и изучаются совместные культуры волосовидных корней моркови с микоризными грибами Rhizophagus irregularis.

Публикации

Статьи в научных журналах (за 2020-2024 гг):

  1. Баймухаметова Э.А., Кулуев Б.Р. Потемнение растительных тканей при культивировании in vitro и способы его предотвращения // Биотехнология. 2020. Т. 36. №2. С. 26-42
  2. Гайнуллина К.П., Кулуев Б.Р., Давлетов Ф.А. Оценка генетического разнообразия сортов и линий гороха с помощью SSR-анализа // Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2020. Т. 181. № 3. С. 70-80.
  3. Давлетов Ф.А., Нигматуллина Г.М., Гайнуллина К.П., Плешков А.В., Сафин Ф.Ф. Новый сорт зернового гороха Памяти Попова // Зерновое хозяйство России. № 2(68). С. 61-65.
  4. Musin K.G., Gumerova G.R., Gorte E., Kuluev B.R. Using stress factors for storage of Withania somnifera L. hairy roots without passages. Russian Journal of Plant Physiology. 2021. V. 68. P. 536–544. DOI: 10.1134/S1021443721030146
  5. Кулуев Б.Р., Мусин Х.Г., Якупова А.Б. Ген экспансина NtEXPA5 повышает стрессоустойчивость волосовидных корней табака через влияние на антиоксидантную систему // Экологическая генетика. 2021. Т. 19. №1. C. 5-12. DOI: 10.17816/ecogen44618
  6. Musin Kh.G., Fedyaev V.V., Kuluev B.R. State of antioxidant system and long-term storage of tobacco hairy roots with constitutive expression of glutathione-S-transferase gene ATGSTF11. Russian Journal of Plant Physiology. 2021. V. 68. P. 641–651. DOI: 10.1134/S1021443721040105
  7. Галимова А.А., Кулуев Б.Р. Генетические детерминанты хлебопекарных качеств зерна и аллельное состояние waxy-генов мягкой пшеницы. Успехи современной биологии. 2021. Т. 141. № 6. С. 1-11. DOI: 10.31857/S004213242106003X
  8. Bari G., Gainullina K., Gumerova G., Uteulin K., Golovanov Y., Chemeris A., Kuluev B. Multilocus DNA polymorphism of some rubber-bearing dandelions (Taraxacum spp.) of Russia and Kazakhstan // Genetic Resources and Crop Evolution. 2021. P. 1-14. DOI: 10.1007/s10722-021-01233-1
  9. Mikhaylova E., Artyukhin A., Musin Kh., Panfilova M., Gumerova G., Kuluev B. The first report on the induction of hairy roots in Trapa natans, a unique aquatic plant with photosynthesizing roots // Plant Cell, Tissue and Organ Culture. 2021. V. 144. P. 485-490. DOI: 10.1007/s11240-020-01963-7
  10. Заикина Е.А., Мусин Х.Г., Кулуев А.Р., Никонов В.И., Дмитриев А.М., Кулуев Б.Р. Изменение активности генов транскрипционных факторов TANAC69, TADREB1, TABZIP60 у растений мягкой пшеницы при водном дефиците и гипотермии. Физиология растений. 2022. Т. 69. №3. С. 327–336. DOI: 10.31857/S0015330322030186
  11. Мусин Х.Г., Гумерова Г.Р., Баймухаметова Э.А., Кулуев Б.Р. Рост и стрессоустойчивость волосовидных корней табака с конститутивной экспрессией гена ARGOS-LIKE. Физиология растений. 2022. Т. 69. №5. С. 490-500. DOI: 10.31857/S0015330322050153
  12. Бережнева З.А., Мусин Х.Г., Кулуев Б.Р. Рост корней трансгенных растений табака со сверхэкспрессией генов экспансинов и ксилоглюканэндотрансгликозилаз в условиях кадмиевого стресса. Физиология растений. 2022. Т. 69. №5. С. 522-530. DOI: 10.31857/S0015330322050037
  13. Кулуев Б.Р., Михайлова Е.В., Кулуев А.Р., Галимова А.А., Заикина Е.А., Хлесткина Е.К. Редактирование геномов представителей трибы пшеницевые с использованием системы CRISPR/Cas. Молекулярная биология. 2022. Т. 56. №6. С. 949-968. DOI: 10.31857/S0026898422060155
  14. Гайнуллина К.П., Кулуев Б.Р., Давлетов Ф.А. Создание исходного материала для селекции гороха методом химического мутагенеза и оценка его генетического разнообразия с использованием SSR-маркеров. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2022. Т. 183(3). С. 111-122. DOI: 10.30901/2227-8834-2022-3-111-122
  15. Заикина Е.А., Исмагилов К.Р., Кулуев Б.Р. Поиск SNP-маркеров стрессоустойчивости в генах TaDREB1 и TaWRKY19 мягкой пшеницы в условиях Предуральской степной зоны. Экологическая генетика. 2022. Т. 20. №3. С. 183–192. DOI: 10.17816/ecogen106945
  16. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П., Каримов И.К. Создание исходного материала для селекции гороха с использованием методов гибридизации и физического мутагенеза. Зерновое хозяйство России. 2022. Т. 14. №2. С. 29-35. DOI: 10.31367/2079-8725-2022-80-2-29-35
  17. Баймухаметова Э.А., Бережнева З.А., Мусин Х.Г., Швец Д.Ю., Князев А.В., Кулуев Б.Р. Индукция прямой регенерации побегов при генетической трансформации табака штаммом К599 Agrobacterium rhizogenes. Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. 2022. Т. 164. С. 249–262. DOI: 10.26907/2542-064X.2022.2.249-262
  18. Таипова Р.М., Нестеров В.Н., Розенцвет О.А., Кулуев Б.Р. Изменения в содержании белков, липидов и состоянии антиоксидантной системы у мутантных форм амаранта Amaranthus cruentus L. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2022. Т. 183.№1. С. 76-85. DOI: 10.30901/2227-8834-2022-1-76-85
  19. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П., Сафин Ф.Ф. Применение гербицидов и боронования для борьбы с сорняками на посевах гороха в условиях Республики Башкортостан. Зерновое хозяйство России. 2022. № 1 (79). С. 77-82. DOI: 10.31367/2079-8725-2022-79-1-77-82
  20. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П. Получение исходного материала для селекции сои методом физического мутагенеза. Аграрная наука. 2022. № 5. С. 73-77. DOI: 10.32634/0869-8155-2022-359-5-73-77
  21. Галимова А.А., Кулуев А.Р., Исмагилов К.Р., Кулуев Б.Р. Генетический полиморфизм локусов высокомолекулярных субъединиц глютенина у сортообразцов мягкой пшеницы предуральской степной зоны. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. №4. С. 297-305. DOI: 10.18699/VJGB-23-36
  22. Галимова А.А., Кулуев Б.Р. Идентификация новых нуклеотидных последовательностей гена glu-b1-1, кодирующего глютенины х-типа у мягкой пшеницы. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. №5. С. 433-439. DOI: 10.18699/VJGB-23-52
  23. Гумерова Г.Р., Галимова А.А., Кулуев Б.Р. Каллусообразование и органогенез мягкой пшеницы с использованием зрелых зародышей в качестве эксплантов. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2023. Т. 184. № 2. С. 19-28. DOI: 10.30901/2227-8834-2023-2-19-28
  24. Швец Д.Ю., Бережнева З.А., Мусин Х.Г., Баймухаметова Э.А., Кулуев Б.Р. rol-гены агробактерий: возможные биологические функции. Успехи современной биологии. 2023. Т. 143. № 5. С. 487-505. DOI: 10.31857/S004213242305006X
  25. Баймухаметова Э.А., Швец Д.Ю., Мусин Х.Г., Кулуев Б.Р. Количественное определение содержания инулина в волосовидных корнях цикория обыкновенного Cichorium intybus L. Журнал Сибирского федерального университета. Биология. 2023. Т. 16. №2. С. 218-231.
  26. Заикина Е.А., Каюмова Р.Р., Кулуев А.Р., Исмагилов Р.Р., Кулуев Б.Р. Анализ нуклеотидных последовательностей гена гликозилтрансферазы GT47 у сортов ржи, различающихся по содержанию водорастворимых пентозанов в зерне. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2023. Т. 184. №2. С. 112-119. DOI: 10.30901/2227-8834-2023-2-112-119
  27. Kuluev B.R., Ermoshin A.A., Mikhaylova E.V. Overexpression of the glutathione S-transferase ATGSTF11 gene improves growth and abiotic stress tolerance of tobacco transgenic plants. Russian Journal of Plant Physiology. 2023. 69(1):148. DOI: 10.1134/S1021443722601653
  28. Kuluev B., Uteulin K., Bari G., Baimukhametova E., Musin K., Chemeris A. Molecular genetic research and genetic engineering of Taraxacum kok-saghyz L.E. Rodin. Plants 2023, 12, 1621. DOI: 10.3390/plants12081621
  29. Кулуев А.Р., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В. Проблема происхождения субгеномов B, A, D пшеницы мягкой Triticum aestivum L.: старые факты и новые доказательства. Успехи современной биологии. 2023. Т. 143.№1. С. 77-90. DOI: 10.31857/S0042132423010040
  30. Гайнуллина К.П., Румянцев С.Д., Давлетов Ф.А., Кулуев Б.Р. Анализ нуклеотидных последовательностей кодирующего участка гена ABI3 у сортообразцов гороха с различным содержанием запасных белков семян. Зерновое хозяйство России. 2023. Т. 15, № 2. С. 34–40. DOI: 10.31367/2079-8725-2023-85-2-34-40
  31. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П., Дмитриев А.М., Бадамшина Е.В. Особенности наследования признаков продуктивности у гибридов гороха F1 и F2. Зерновое хозяйство России. 2023. Т. 15. №3. С. 21-28. doi: 10.31367/2079-8725-2023-86-3-21-28
  32. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П. Влияние норм высева семян на урожайность зерна гороха в условиях Предуральской степи Республики Башкортостан. Аграрная наука. 2023. №5. С. 72-77. DOI: 10.32634/0869-8155-2023-370-5-72-77
  33. Kuluev A.R., Kuluev B.R., Mikhaylova E.V., Chemeris A.V. Sequencing and analysis of complete chloroplast genomes of einkorn wheats Triticum sinskajae and Triticum monococcum accession k-20970. Genetic Resources and Crop Evolution. 2024. V. 71. P. 3347–3360. DOI: 10.1007/s10722-023-01843-x
  34. Musin Kh., Mikhaylova E., Galimova A., Baimukhametova E.A., Zaikina E.A., Kuluev A.R., Ibragimova Z.A., Rakhmatullina I.F., Berezhneva Z.A., Kuluev B.R. Knockout of the bread wheat CER9/SUD1 gene using CRISPR/Cas technology. Plant Molecular Biology Reporter. 2024. DOI: 10.1007/s11105-024-01495-w
  35. Gainullina K., Zaikina E., Kuluev A., Davletov F., Kuluev B. Analysis of nucleotide sequences and expression levels of the ABI3 and FUS3 genes in Pisum sativum L. varieties and lines differing in content of seed storage protein. Genetic Resources and Crop Evolution. 2024. DOI: 10.1007/s10722-024-02129-6
  36. Кирьянова О.Ю., Кулуев А.Р., Губайдуллин И.М., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В. Виртуальнаяin silicoПЦР в двумерном формате как инструмент для выяснения филогенетического родства у аллополиплоидных форм на примере пшениц и их диких сородичей эгилопсов. Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Биология. 2024. Т. 17. № 1. С. 45-63.
  37. Цветкова А.Д., Швец Д.Ю., Мусин Х.Г., Кулуев Б.Р. Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками. Математическая биология и биоинформатика. 2024. V. 19. № 2. DOI: 10.17537/2024.19.322
  38. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П., Мустафин И.Г., Юлдыбаев И.Р. Результаты изучения сортов яровой вики (Vicia sativa L.) в условиях Республики Башкортостан // Зерновое хозяйство России. 2024. Т. 16, № 3. С. 27-32. DOI: 10.31367/2079-8725-2024-92-3-27-32
  39. Юлдыбаев И.Р., Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П. Сравнительная оценка урожайности зерна и зеленой массы зернобобовых культур в условиях южной лесостепи Республики Башкортостан // Зерновое хозяйство России. 2024. Т. 16, № 2. С. 13-20. DOI: 10.31367/2079-8725-2024-91-2-13-20
  40. Fateryga V.V., Kuluev B.R., Svirin S.A., Fateryga A.V. Lectotypification and comments on the taxonomic status of Taraxacum pobedimovae schischk. (Asteraceae: Crepidinae). Turczaninowia. 2024. Т. 27. № 1. С. 32-38. DOI: 10.14258/turczaninowia.27.1.4
  41. Александрова В.М., Гумерова Г.Р., Мусин Х.Г., Бережнева З.А., А. А. Галимова, Кулуев Б.Р. Изолированные культуры зеленых корней Triticum aestivum L способны к неограниченному росту на безгормональных питательных средах. Физиология растений. 2024. Т. 71. № 3. С. 288–299. DOI: 10.1134/S1021443724606050
  42. Ибрагимова З.А., Галимова А.А., Мусин Х.Г., Ямалеева А.А., Заикина Е.А., Кулуев Б.Р. Рост и солеустойчивость волосовидных корней табака с конститутивной экспрессией гена TaNAC69. Физиология растений. 2024. Т. 71. № 5. С. 580-590. DOI: 10.31857/S0015330324050073
  43. Швец Д.Ю., Бережнева З.А., Мусин Х.Г., Кулуев Б.Р. Влияние rol-генов Agrobacterium rhizogenes штаммов А4, 15834 и К599 на рост корней трансгенных растений табака и состояние антиоксидантной системы в условиях абиотического стресса. Физиология растений. 2024. Т. 71. № 5. С. 632-646. DOI: 10.31857/S0015330324050111
  44. Кулуев А.Р., Матниязов Р.Т., Кулуев Б.Р., Привалов Л.Ю., Чемерис А.В. Секвенирование и аннотация хлоропластного генома Triticum timonovum Heslot et Ferrary. Генетика. 2024. Т. 60. №7. С. 118-122. DOI: 10.31857/S0016675824070124
  45. Кулуев А.Р., Матниязов Р.Т., Кулуев Б.Р., Привалов Л.Ю., Чемерис А.В. Секвенирование и аннотация хлоропластного генома Triticum militinae – «естественного мутанта» тетраплоидной пшеницы Triticum timopheevii Zhuk. Генетика. 2024. Т.60. С. 118-121. DOI: 10.1134/S1022795424700601

Патенты

  1. Патент РФ на полезную модель RU 198397 U1, 03.07.2020. (Заявка № 2019145756 от 31.12.2019). Универсальная опора для растений (патентообладатель УУНиТ).
  2. Патент РФ на полезную модель RU 225996 U1, 16.05.2024. (Заявка от 26.03.2024). Устройство для выращивания растений (патентообладатель УУНиТ).
  3. Программа для ЭВМ RU 2020610703, 17.01.2020. (Заявка№2019667752 от 30.12.2019). ABCDNA_GS (Amplified Bar-Coded DNA Genome/Specimen) (патентообладатель УФИЦ РАН)
  4. Программа для ЭВМ RU 2022663254, 13.07.2022. (Заявка № 2022662699 от 30.06.2022). Barcode DNA Analyzer (BDANALYZER) (патентообладатель УФИЦ РАН)
  5. Патент на изобретение RU 2830866 C1, 26.11.2024 (Заявка № 2023134534 от 22.12.2023). Тест-система для идентификации, оценки генетического полиморфизма и генетической паспортизации сортов и линий тимофеевки луговой Phleum pratense L. (патентообладатель УФИЦ РАН).

Гранты

2018-2020 гг. Грант РФФИ, проект № 18-04-00118_а. «Роль экспансинов и ксилоглюканэндотрансгликозилаз в регуляции роста растений при изменяющихся условиях среды». Руководитель – Кулуев Б.Р.

2020-2021 гг. Грант Президента РФ, проект МД-2304.2020.4. «Комплексное исследование генетической регуляции роста корней при дефиците влаги». Руководитель – Кулуев Б.Р.

2019-2020 гг. Грант УМНИК-ЭФКО 0049771, договор № 14794ГУ/2019 от 29.10.2019 г. «Разработка технологии выращивания культур корней моркови, продуцирующих сладкий термостабильный пищевой белок браззеин». Руководитель – Кулуев А.Р.

2021-2022 гг. Грант УМНИК. договор 16845ГУ/2021 от 07.06.2021. «Разработка культур волосовидных корней родиолы иремельской, накапливающих ценные биологически активные вещества». Руководитель – Баймухаметова Э.А.

2021-2023 гг. Мегагрант Минобрнауки России, проект «Хлеба России» по соглашению № 075-15-2021-1066 от 28.09.2021 г. Руководитель исследовательской группы – Кулуев Б.Р.

2022-2024 гг. Грант Минобрнауки РБ № 22-14-20049 по соглашению №1 от 06.06.2022 г. «Поиск ДНК-маркеров для селекции гороха на высокое содержание протеина в семенах и разработка тест-системы для идентификации высокобелковых генотипов». Основной исполнитель – Гайнуллина К.П.

2022-2024 гг. Грант УМНИК 18031ГУ/2022от 07.06.2022. «Создание протокола совместной культивации микоризного гриба Glomus intraradices на бородатых корнях». Руководитель – Минеев Я.П.

2022-2024 гг. Грант Минобрнауки России № 075-15-2021-549 (внутренний № 09.ССЦ.21.0016) «Создание, поддержка и развитие селекционно-семеноводческих и селекционно-племенных центров» для реализации проекта «Реализация направлений, соответствующих программе создания и развития Селекционно-семеноводческого центра по кормовым культурам УФИЦ РАН» по соглашению от 31.05.2021 г. Основные исполнители – Гайнуллина К.П., Бережнева З.А., Кулуев А.Р.

2022-2023 гг. Грант Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых МК-2543.2022.1.4. Руководитель – Румянцев С.Д.

2022-2024 гг. Грант РНФ № 22-76-00056 (2022-2024) «Изучение регуляторных механизмов индукции РНК-интерференции и роли малых РНК при взаимодействии пшеница – злаковые тли на примере Triticum spр. – Rhopalosiphum padi». Руководитель – Румянцев С.Д.

Государственные задания

2019-2021 гг. Государственное задание AAAA-A19-119021190011-0 «Поиск и идентификация молекулярных маркеров стрессоустойчивости растений и разработка подходов генетической паспортизации сельскохозяйственных культур».

2022-2024 гг. Государственное задание №122030200143-8 «Поиск новых функциональных ДНК-маркеров хозяйственно-ценных признаков культурных растений».

2025-2027 гг. Государственное задание №1022040500031-4 «ДНК-маркеры хозяйственно-ценных признаков для генотипирования и геномного редактирования растений»

Защиты диссертаций

  1. Гумерова Гульнар Рафиловна Кандидатская диссертация «Физиологические характеристики трансформированных различными способами культур корней». 2019 г. Научный руководитель: Кулуев Б.Р.
  2. Кулуев Азат Разяпович. Кандидатская диссертация «Молекулярно-генетическое исследование Triticum sinskajae A.Filat. et Kurk. и филогения диплоидных пшениц». 2021 г. Научный руководитель: Чемерис А.В.
  3. Мусин Халит Галеевич. Кандидатская диссертация «Физиологические основы культивирования, повышения стрессоустойчивости и хранения волосовидных корней». 2021 г. Научный руководитель: Кулуев Б.Р.
  4. Таипова Рагида Мухтаровна. Кандидатская диссертация «Физиолого-биохимическая характеристика генетически трансформированных и мутантных форм Amaranthus spp». 2023 г. Научный руководитель: Кулуев Б.Р.
  5. Бережнева Зоя Александровна. Кандидатская диссертация «Роль генов экспансинов и ксилоглюканэндотрансгликозилаз в регуляции роста корней при абиотическом стрессе». 2024 г. Научный руководитель: Кулуев Б.Р.

HUMAN MOLECULAR GENETICS LABORATORY IBG UFRC RAS

Заведующая лабораторией –

Хидиятова Ирина Михайловна

доктор биологических наук, профессор,

заслуженный деятель науки РБ

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: imkhid@mail.ru

 

Основные направления научной деятельности лаборатории

  • Анализ структурных особенностей генов наследственных заболеваний
  • Поиск молекулярно-генетических маркеров предрасположенности к многофакторным заболеваниям
  • Исследование генофонда и филогеографии народов Евразии

 Краткая история лаборатории

Лаборатория молекулярной генетики человека (ЛМГЧ) была создана в 1994 г. на базе лаборатории популяционной генетики Отдела биохимии и цитохимии Башкирского филиала АН СССР, возглавляемой тогда доктором медицинских наук Рафиковым Халимом Сунагатовичем. Идейным организатором развития в Республике Башкортостан научного направления – молекулярной генетики человека, – и первым руководителем лаборатории молекулярной генетики человека стала кандидат биологических наук, старший научный сотрудник Хуснутдинова Эльза Камилевна. В 2000 г. Отдел биохимии и цитохимии был преобразован в Институт биохимии и генетики УНЦ РАН, а из лаборатории молекулярной генетики человека выделились еще две самостоятельные лаборатории – экологической генетики (зав. лаб. – д.м.н. Викторова Т.В.) и биохимической генетики (зав. лаб. – д.б.н. Мустафина О.Е.), и был образован Отдел геномики (под руководством д.б.н., профессора Хуснутдиновой Э.К.), в который вошли эти три лаборатории, занимающиеся исследованиями генома человека. В 2017 г. ИБГ УНЦ РАН был преобразован в ИБГ УФИЦ РАН, его директором стала Хуснутдинова Э.К., а заведующей лаборатории молекулярной генетики человека была назначена д.б.н., профессор Хидиятова И.М.

The Laboratory of Human Molecular Genetics was created in 1994 on the basis of the Laboratory of Population Genetics of the Department of Biochemistry and Cytochemistry of the Bashkir Branch of the USSR Academy of Sciences, then headed by Doctor of Medical Sciences Khalim Sunagatovich Rafikov. The ideological organizer of the development of the scientific direction of human molecular genetics in the Republic of Bashkortostan and the first head of the Laboratory of Human Molecular Genetics was Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher Elza Kamilevna Khusnutdinova. In 2000 The Department of Biochemistry and Cytochemistry was transformed into the Institute of Biochemistry and Genetics of the Ufa Scientific Center of the Russian Academy of Sciences, and two more independent laboratories were separated from the Laboratory of Human Molecular Genetics – environmental genetics (head of the laboratory – Doctor of Medical Sciences Viktorova TV) and biochemical genetics (head of the laboratory – Doctor of Biological Sciences Mustafina OE), and the Department of Genomics was formed (also under the leadership of Doctor of Biological Sciences, Professor Khusnutdinova E.K.), which included these three laboratories engaged in human genome research. In 2017, the IBG Ufa Scientific Center of the Russian Academy of Sciences was transformed into the IBG Ufa Federal Research Center of the Russian Academy of Sciences, E.K. Khusnutdinova became its director, and Doctor of Biological Sciences, Professor Khidiyatova I.M. was appointed head of the Laboratory of Human Molecular Genetics.

Состав лаборатории на 2025 год

Хуснутдинова Эльза Камилевна, д.б.н., профессор, член-корр. РАО, гл. н.с. ЛМГЧ и научный руководитель ИБГ УФИЦ РАН

Хуснутдинова Эльза Камилевна, д.б.н., профессор, член-корр. РАО,  гл. н.с. лаборатории молекулярной генетики человека и научный руководитель ИБГ УФИЦ РАН. В Институте – с 1976 г.: стажер- исследователь, аспирант, м.н.с., с.н.с; 1994 – 2017 гг – зав.лаб. молекулярной генетики человека, с 2000г – зав. Отделом геномики; 2017-2024 г – директор ИБГ УФИЦ РАН.

Профессор Хуснутдинова Эльза Камилевна является одним из ведущих специалистов Российской Федерации в области популяционной и медицинской генетики. Ею разработано новое направление в генетике человека – этногенетика. Весомый вклад сделан ею в изучение структуры генофонда и генетической истории народов Волго-Уральского региона, Средней Азии и Кавказа на основе геномных данных.

Хуснутдинова Э.К. внесла большой вклад в изучение структурно-функциональной организации генома человека и молекулярно-генетической структуры наследственной патологии в популяциях Волго-Уральского региона. Под ее руководством проведено изучение генов                32 наследственных заболеваний, разработаны и внедрены алгоритмы молекулярной диагностики в практику медико-генетической консультации Перинатального центра Республики Башкортостан. Большой вклад Хуснутдиновой Э.К. внесен и в изучение генетических механизмов формирования свойств личности и темперамента, что имеет большое значение для профилактики развития личностных расстройств и для психического здоровья населения в целом. В 2016 году Хуснутдинова Э.К. избрана членом-корреспондентом Российской академии образования.

            Под руководством Эльзы Камилевны подготовлено 105 кандидатов наук и 14 докторов наук. За период научной работы ею опубликовано 850 трудов, в том числе 30 монографий, 20 патентов, индекс Хирша составляет 56. Под ее руководством проводятся исследования, финансируемые российскими и международными научными фондами. Научную деятельность она успешно совмещает с педагогической работой в вузах республики, является организатором и заведующей кафедрой медицинской генетики и фундаментальной медицины в Уфимском университете науки и технологии.

Хуснутдинова Э.К. являлась членом Совета при Президенте Российской Федерации по науке и образованию (2012-2013 гг.), членом Научного Совета Российской программы «Геном человека», членом бюро международной организации «Геном человека», членом экспертных советов российских и международных научных фондов. В настоящее время является членом бюро научного Совета Российской академии наук по генетике и селекции, членом бюро Российского общества медицинских генетиков и председателем Башкирского отделения общества. Она являлась научным консультантом Отдела молекулярной генетики Якутского научного центра и Республиканского Медико-генетического центра.

В настоящее время является членом редакционных советов 8 российских и международных научных журналов, главным редактором журнала «Биомика», председателем диссертационного совета 24.1.218.01 при Уфимском федеральном исследовательском центре Российской академии наук.

Во время руководства Институтом биохимии и генетики Хуснутдинова Э.К. внесла большой вклад в его развитие. В рамках федеральных проектов «Развитие инфраструктуры для научных исследований и подготовки кадров» и «Развитие человеческого капитала в интересах регионов, отраслей и сектора исследований и разработок» в Институт приобретено дорогостоящее оборудование, созданы 2 новые молодежные лаборатории. Получены более 60 грантов российских научных фондов, а также Мегагрант Министерства науки и высшего образования Российской Федерации.

За многолетнюю и безупречную работу Хуснутдинова Э.К. награждена почетными грамотами Российской академии наук (1999), Академии наук Республики Башкортостан (2009, 2021), памятной медалью академика Давиденкова С.Н. за выдающий вклад в развитие медицинской генетики в России (2005), удостоена звания Лауреата Государственной премии Республики Башкортостан в области науки и техники (2015). Награждена юбилейной медалью Всероссийского общества генетиков и селекционеров (2016), золотой медалью и дипломом Медико-генетического научного центра Российской академии наук «За выдающийся вклад в развитие медицинской генетики» (2019), юбилейной медалью «100 лет образования Республики Башкортостан», медалью имени Л.С. Выготского и нагрудным знаком «Наставник в науке» Российской академии образования (2023).

Хидиятова Ирина Михайловна, д.б.н., профессор, гл.н.с. и зав. ЛМГЧ

Хидиятова Ирина Михайловна,  д.б.н., профессор. В ИБГ УФИЦ РАН – с 1986г.: асп., м.н.с., н.с., снс. в.н.с., с 2017г – гл.н.с., зав. лабораторией. Сфера ее научных интересов включает фундаментальные и прикладные аспекты молекулярной и медицинской генетики человека. Наиболее существенный вклад Хидиятова И.М. внесла в исследование генетической структуры популяций народов Волго-Уральского региона, а также в изучение эпидемиологии и молекулярно-генетических основ наследственных и многофакторных заболеваний нервной системы (миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, миодистрофии Дюшенна-Беккера, наследственных моторно-сенсорных нейропатий, спиноцеребеллярных атаксий, наследственной спастической параплегии, нейросенсорной глухоты, болезни Паркинсона, миастении Гравис) в Республике Башкортостан. На основе результатов этих исследований оптимизированы подходы к ДНК-диагностике и медико-генетическому консультированию данных заболеваний в регионе. В 2008 г. защитила докторскую диссертацию на тему: «Эпидемиология и молекулярно-генетические основы наследственных заболеваний нервной системы в Республике Башкортостан» по специальности 03.00.15 – Генетика.

Хидиятова И.М. – автор более 300 научных работ, в том числе многочисленных статей в ведущих российских и зарубежных журналах, глав в 6-и монографиях, 3-х учебно-методических пособий, 3 патентов на изобретения РФ. Под ее руководством защищены 1 докторская, 8 кандидатских и 6 магистерских диссертаций.

Хидиятова И.М. – член Всероссийского общества генетиков и селекционеров, Российского общества медицинских генетиков; член диссертационного совета Д002.133.01 и Ученого совета ИБГ УФИЦ РАН; руководитель ЦКП «Коллекция биологических материалов человека ИБГ УФИЦ РАН»

С 2010г. по настоящее время Хидиятова И.М. работает по совместительству в Башкирском государственном университете (ныне УУНиТ) в должности профессора кафедры генетики и фундаментальной медицины биологического факультета, где читает лекции и ведет практические занятия по предметам «Популяционная генетика» (2010-2012гг), «Нейрогенетика» (2011-2013гг), «Антропология» (2011-2016гг), «Молекулярная генетика» (2012-2024гг).

Хидиятова И.М. награждена Почетной грамотой Президиума РАН (2011г.), Почетной грамотой УФИЦ РАН (2019г.). В 2014 г. была удостоена звания «Заслуженный деятель науки Республики Башкортостан», в 2015г. – «Лауреат государственной премии Республики Башкортостан в области науки и техники» за работу «Разработка подходов ДНК-диагностики наследственных и многофакторных заболеваний в Республике Башкортостан»; в 2025 г. награждена медалью Республики Башкортостан «За трудовую доблесть».

(https://publons.com/researcher/2119715/irina-m-khidiyatova/; orcid.org/0000-0002-96-5468, РИНЦ AuthorID: 93113, Scopus 6603270123, WoS G-5896-2017).

Контакты: E-mail: imkhid@mail.ru Тел.: +7(347)235 60 88 (2-33), Кабинет № 403

Бермишева Марина Алексеевна, д.б.н., в.н.с.

Бермишева Марина Алексеевна – ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук (2001 г.), доктор биологических наук (2021 г.). В Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН работает с 2001 года после окончания аспирантуры.

В рамках руководимых Бермишевой М.А. проектов проводится изучение молекулярно-генетических основ онкологических заболеваний, а также генетической структуры популяций Волго-Уральского региона.

Бермишева М.А. является соавтором многочисленных публикаций в научных журналах с высоким импакт-фактором, входящих в системы цитирования Web of Science, Scopus, РИНЦ (Nature, Nature Genetics, Nature Communicatio, Br J Cancer, Am J Hum Genet, N Engl J Med, Sci Rep, Breast Cancer Res и др.), монографий, учебных пособий. Индекс Хирша составляет 32.

Бермишева М.А. входит в состав Диссертационного совета при Федеральном государственном бюджетном научном учреждении Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук 24.1.218.01 (Д002.198.01) по специальности генетика.

Научно-педагогическая деятельность: доцент кафедры Биологии БГМУ (г. Уфа).

Контакты: E-mail: molgen@anrb.ru, Тел.: +7(347)235 60 88

Гареева Анна Эмировна, к.м.н., д.б.н., в.н.с.

Гареева Анна Эмировна – ведущий научный сотрудник, кандидат медицинских наук (2002 г.), доктор биологических наук (2016 г.), доцент по специальности «Психиатрия и наркология» (2023 г.). В 1999 году окончила Башкирский государственный медицинский университет по специальности «Педиатрия». В Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН работает с 2002 года после окончания аспирантуры.

Гареева А.Э. проводит исследования в области генетики психических заболеваний и фармакогеномики психотропных препаратов. Является автором более 100 научных трудов, 5 монографий, 2 учебных пособий для студентов медицинских вузов, патента на изобретение РФ. В 2004 году удостоена Гранта Президента РФ для поддержки молодых российских ученых «Исследование и поиск молекулярно-генетических маркеров предрасположенности к развитию опийной наркомании среди населения Республики Башкортостан». Руководитель гранта РФФИ 2014-2016 г. «Поиск молекулярно-генетических маркеров риска развития шизофрении и эффективности терапии галоперидолом в популяциях Волго-Уральского региона России» и РНФ 2024–2026 г. «Разработка персонализированного подхода повышения эффективности и безопасности фармакотерапии сертралином у больных c тревожно-депрессивными расстройствами: фармакогеномные и фармакометаболомные биомаркеры».

Член Международного консорциума по психиатрической генетике PGC, Российского Национального Консорциума по психиатрической генетике, Член секции «Молекулярная психиатрия» Российского общества психиатров.

За многолетний добросовестный труд, большой вклад в развитие науки и подготовку кадров высшей квалификации награждена медалью Республики Башкортостан «За трудовую доблесть» в 2024 году.

Информация о наукометрических показателях: уникальный идентификатор в Elibrary: https://www.elibrary.ru/author_profile.asp?id=136116, http://orcid.org/0000-0003-0254-3917. Ссылки на профиль в социальных сетях: https://www.researchgate.net/profile/Anna-Gareeva/research

Full name: Anna Emirovna Gareeva

Degree: Doctor of Biological Sciences, Associate Professor

Position: Leading Researcher

Anna Emirovna Gareeva is a leading researcher, Candidate of Medical Sciences (2002), Doctor of Biological Sciences (2016), Associate Professor in the specialty “Psychiatry and Narcology” (2023). In 1999, she graduated from the Bashkir State Medical University with a degree in Pediatrics. She has been working at the Institute of Biochemistry and Genetics of the Ufa Federal Research Center of the Russian Academy of Sciences since 2002 after completing her postgraduate studies.

Gareeva A.E. conducts research in the field of genetics of mental illnesses and pharmacogenomics of psychotropic drugs. She is the author of more than 100 scientific papers, 5 monographs, 2 textbooks for students of medical universities, and a patent for an invention of the Russian Federation. In 2004, she was awarded the Grant of the President of the Russian Federation to support young Russian scientists “Research and search for molecular genetic markers of predisposition to the development of opium addiction among the population of the Republic of Bashkortostan”. Head of the grant of the Russian Foundation for Basic Research 2014-2016 “Search for molecular genetic markers of the risk of developing schizophrenia and the effectiveness of haloperidol therapy in the populations of the Volga-Ural region of Russia” and the Russian Science Foundation 2024-2026 “Development of a personalized approach to increasing the effectiveness and safety of sertraline pharmacotherapy in patients with anxiety-depressive disorders: pharmacogenomic and pharmacometabolomic biomarkers”. Member of the International Consortium on Psychiatric Genetics PGC, Russian National Consortium on Psychiatric Genetics, Member of the Molecular Psychiatry Section of the Russian Society of Psychiatrists. For many years of conscientious work, great contribution to the development of science and training of highly qualified personnel, she was awarded the Medal of the Republic of Bashkortostan “For Labor Valor” in 2024.

Information on scientometric indicators: unique identifier in Elibrary: https://www.elibrary.ru/author_profile.asp?id=136116, http://orcid.org/0000-0003-0254-3917. Links to the profile in social networks: https://www.researchgate.net/profile/Anna-Gareeva/research

Гилязова Ирина Ришатовна, к.б.н., с.н.с.

Гилязова Ирина Ришатовна, к.б.н, c.н.с., доцент. С 2000 по 2004 гг проходила обучение в очной аспирантуре Института биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН. В 2004 году успешно защитила диссертацию на соискание учёной степени кандидата биологических наук по теме «Молекулярно-генетическое изучение болезни Паркинсона в Башкортостане» по специальности «Генетика». После защиты кандидатской диссертации в 2006 году работала постдокторантом в Институте молекулярной и митохондриальной медицины Калифорнийского университета (Ирвайн, Калифорния). С 2017 года по настоящее время является старшим научным сотрудником лаборатории молекулярной генетики человека. Основные научные интересы связаны с генетикой онкологических заболеваний. Автор 170 научных публикаций. (https://orcid.org/0000-0001-9499-5632, РИНЦ AuthorID: 130260, Scopus 15848327000, WoS E-5798-2014).

Контакты: E-mail: gilyasova_irina@mail.ru Тел.: +7(347)235 60 88 (2-33), Кабинет № 210

Казанцева Анастасия Валерьевна, к.б.н., с.н.с.

Казанцева Анастасия Валерьевна, к.б.н, c.н.с. Проходила обучение в аспирантуре ИБГ УНЦ РАН в 2004-2008 годах, защитила кандидатскую диссертацию «Молекулярно-генетические основы черт темперамента и личности» в 2008 г. Работает в Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН: мл. науч. сотр. (2008–2010), науч. сотр. (2010–2019), ст. науч. сотр. (2019–по н.в.). Проходила стажировку в Медицинской школе Массачусетского Университета (Brudnick Neuropsychiatric Research Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, США) в 2005-2006 гг., по результатам которой была опубликована научная статья в журнале Science (2006). Стажировалась в Институте биомедицины и трансляционной медицины Тартуского Университета (Тарту, Эстония) в 2009, 2010 гг. Основные научные интересы Казанцевой А.В. сфокусированы на изучении генетики многофакторных признаков, включая взаимодействие молекулярно-генетических и социальных факторов, отражающихся в развитии поведенческих и когнитивных особенностей человека. Сотрудниками научной группы направления «Психогенетика» под руководством Казанцевой А.В. проводятся исследования по выявлению молекулярно-генетических предикторов формирования свойств личности, когнитивного потенциала, антисоциального и аддиктивного поведения, депрессии, постковидных когнитивных нарушений. Научно-педагогическая деятельность: и.о. заведующего кафедрой (2021) и доцент кафедры «Школа молекулярных технологий» ФГБОУ ВО УГНТУ и кафедры генетики и фундаментальной медицины ФГБОУ ВО УУНиТ (2022 – по н.в.).

Автор более 140 научных публикаций (Индекс Хирша 13; https://orcid.org/0000-0002-3744-8058, РИНЦ AuthorID: 171783, Scopus 24597675900, WoS E-7351-2014).

Контакты: E-mail: kazantsa@mail.ru Тел.: +7(347)235 60 88 (2-28), Кабинет № 227

Kazantseva Anastasiya V., PhD, Senior Researcher. She has conducted postgraduate course at the Institute of Biochemistry and Genetics Biology USC RAS in 2004–2008 followed by defending a PhD (Molecular-genetic basis of personality traits) in 2008. Kazantseva A.V. has been working at the IBG UFRC RAS as Research Associate (2008–2010), Researcher (2010–2019), and Senior Researcher (2019 – present). She completed an internship at the Brudnick Neuropsychiatric Research Institute, University of Massachusetts Medical School (Worcester, USA) in 2005–2006, which resulted in a publication of conducted research in Science (2006). In addition, she worked at the Institute of Biomedicine and Translational Medicine of the University of Tartu (Tartu, Estonia) in 2009–2010. Scientific interests of Kazantseva A.V. are focused on the study of the genetic basis of multifactorial traits, including the interaction of molecular-genetic and social factors that affect the development of behavioral and cognitive traits in humans. Researchers of the scientific group “Behavioral genetics” under the leadership of Kazantseva A.V. are conducting research to identify molecular-genetic predictors of individual differences in personality and cognitive traits, antisocial and addictive behavior, depression, and post-covid cognitive decline. Scientific and pedagogical activity: Head (2021) and Associate Professor of the Department “School of Molecular Technologies” of Ufa State Oil Technological University and the Department of Genetics and Fundamental Medicine of Ufa University of Science and Technology (2022 – present).

The author of more than 140 scientific publications. (The Hirsch index 13; https://orcid.org/0000-0002-3744-8058, RSCI AuthorID: 171783, Scopus 24597675900, WoS E-7351-2014).

Contact Information: E-mail: kazantsa@mail.ru Tel: 007(347)2356088 (add. 2-28), room 227

Еникеева Рената Фануровна, к.б.н., н.с.

Еникеева Рената Фануровна, к.б.н., н.с.

Работает в Институте биохимии и генетики с 2017 года после завершения аспирантуры. Область научных интересов охватывает исследование генетических и средовых факторов, воздействующих на индивидуальные различия в личностных характеристиках, агрессивном поведении, депрессивных состояниях и когнитивных функциях, включая феномен математической тревожности. Является соавтором более 50 научных работ. (http://orcid.org/ 0000-0002-4301-5283, РИНЦ AuthorID: 992495,  Scopus: 57204110450, WOS C-9345-2018).

Контакты: enikeevarf@gmail.com, +73472356088 (2-28), каб. 227

Савельева Ольга Николаевна, к.б.н., н.с.

Савельева Ольга Николаевна, к.б.н., н.с. С 2018 года работает в Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН: ст. лаборант (2018-2019), м.н.с. (2021-2022), н.с. (2022 – по настоящее время). Научные интересы связаны с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности, аллергических заболеваний, таких как бронхиальная астма, аллергический ринит, атопический дерматит. Автор более 35 научных работ (http://orcid.org/ 0000-0002-9690-1481, РИНЦ AuthorID: 1041810, Scopus: 57214231200, Recearcher ID WOS AAO-4021-2020).

Контакты: e-mail: olyasavelie@yandex.ru, т. +________________, вн-тел. ______, кабинет №213.

Savelieva Olga Nikolaevna, PhD in Biology, Researcher. Saveileva O.N. has been working at the Institute of Biochemistry and Genetics, UFIC RAS since 2018: Senior laboratory assistant (2018-2019), Junior researcher (2021-2022), Researcher (2022-present). Scientific interests are related to study of genetics of multifactorial diseases, in particular, allergic diseases such as bronchial asthma, allergic rhinitis, and atopic dermatitis. Author of more than 35 scientific papers (http://orcid.org/ 0000-0002-9690-1481, RINC AuthorID: 1041810, Scopus: 57214231200, Recearcher ID WOS AAO-4021-2020).

Contact information: e-mail: olyasavelie@yandex.ru, tel. +________________, ext. ______, laboratory room 213.

Хуснутдинова Наталья Николаевна, к.б.н., н.с.

Хуснутдинова Наталья Николаевна, к.б.н., н.с., начала работать в ИБГ с 1981 года в должности старшего лаборанта. С 2011 г. и по настоящее время  – в должности научного сотрудника. Научные интересы связаны с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности,  гемохроматоза,  остеопороза, а также хронических заболеваний дыхательной системы. Участвует в формировании коллекции образцов ДНК.

(https://orcid.org/0000-0003-4127-078X,   РИНЦ   AuthorID: 152725,    Scopus ID: 13905636700).

Контакты: е-mail: natalia.smirnova17@mail.ru т. +7347 2356088, вн-тел.2-33  кабинет №213.

Давыдова Юлия Дмитриевна,

к.б.н., н.с.

Давыдова Юлия Дмитриевна, к.б.н., н.с. Работает в ИБГ УФИЦ РАН с 2018 года: аспирант (2017-2021), старший лаборант (2018), м.н.с. (2020-2022), н.с. (2023-по н.в.). Научные интересы связаны с изучением генетики поведения человека, в частности, агрессии и депрессивных расстройств. Автор более 70 научных работ. (http://orcid.org/0000-0003-3508-4710, РИНЦ AuthorID: 990230, Scopus: 57205270745, WOS: N-1971-2018). Контакты: E-mail: julia.dmitrievna@list.ru, Тел.: +73472356088, Кабинет № 214

Davydova Yuliya Dmitrievna, Candidate of Biological Sciences, Researcher. Has been working at the IBG UFRC RAS since 2018: post-graduate student (2017-2021), senior laboratory assistant (2018), junior researcher (2020-2022), researcher (2023-present). Research interests are related to the study of the genetics of human behavior, in particular, aggression and depressive disorders. Author of over 70 scientific papers. (http://orcid.org/0000-0003-3508-4710, RSI AuthorID: 990230, Scopus: 57205270745, WOS: N-1971-2018). Contact Information: E-mail: julia.dmitrievna@list.ru, Tel.: +73472356088, laboratory room № 214

Яковлева Диана, м.н.с.

Яковлева Диана Валерьевна, младший научный сотрудник, аспирант  Уфимского университета науки и технологий.

Основные компетенции: выделение ДНК из крови. ПЦР анализ. ПДРФ анализ. Биоинформационный анализ и статистическая обработка данных ассоциативных исследований.

Контакты: e-mail: diana-1998v@mail.ru; Тел: 79991327631; Каб 227.

(ORCID 0000-0002-1395-014X)

Yakovleva Diana Valerievna, junior researcher, postgraduate student of Ufa University of Science and Technology.

Core competences: DNA isolation from blood, PCR analysis, RFLP analysis. Bioinformatics analysis and statistical processing of  association studies data.

Contacts: e-mail: diana-1998v@mail.ru;  Tel: 79991327631; Room 227.

(ORCID 0000-0002-1395-014X)

Власова Ангелина Олеговна, аспирант

Власова Ангелина Олеговна , аспирант

С 2016 по 2022 гг проходила обучение по очным программам бакалавриата и магистратуры Башкирского государственного университета по специальности «Биология». С 2022 по 2023 работала младшим научным сотрудником лаборатории молекулярной генетики человека Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. С 2024 года по настоящее время работает в лаборатории геномных и пост-геномных технологий в животноводстве Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. С 2022 года проходит обучение в очной аспирантуре Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. Тема диссертационной работы – «Исследование эпигенетических факторов развития аллергических заболеваний» (научный руководитель д.б.н.,профессор Карунас А.С.)

Контакты: e-mail: angvlon@mail.ru

Федеряев Клим Александрович, аспирант

Федеряев Клим Александрович, аспирант ИБГ УФИЦ РАН по специальности 1.5.7 –Генетика. Тема диссертации «Молекулярно-генетическое изучение торсионной дистонии в Республике Башкортостан» (научный руководитель –д.б.н., проф. Хидиятова И.М.)

Чумакова Анна Константиновна, аспирант

Чумакова Анна Константиновна, аспирант С 2017 по 2023 гг проходила обучение по очным программам бакалавриата и магистратуры Уфимского государственного нефтяного технического университета по специальности «Биотехнология». С 2023 по 2024 гг работала химиком хроматографической лаборатории отдела контроля качества ОАО «Фармстандарт-УфаВИТА». С 2024 года проходит обучение в очной аспирантуре Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. Тема диссертационной работы – «Анализ экспрессии и генетической вариабельности генов длинных некодирующих РНК при светлоклеточной почечно-клеточной карциноме» (научный руководитель к.б.н.,доцент Гилязова И.Р.).

Контакты: e-mail: NettaChak@yandex.ru

 

Основные научные результаты ЛМГЧ ИБГ УФИЦ РАН

  1. Изучен генофонд 54 популяций Евразии (Волго-Уральского региона, Восточной Европы, Средней Азии, Северного Кавказа и Сибири) на основании анализа полиморфизма мтДНК, Y-хромосомы, полногеномного анализа 650000 SNPs и полногеномного секвенирования. Установлена степень их внутри- и межпопуляционной дифференциации, положение их генофондов в ряду генофондов других популяций Евразии. На основе полногеномного секвенирования 483 геномов установлены миграционные события при заселении Евразии. Показано существование отчетливого потока генов из популяций Восточной Европы в популяции Кавказа, при этом доказана барьерная роль Кавказа для миграции популяций современного человека.

            На основе анализа полногеномного секвенирования 31 палеоантропологического образца с территории древней Западной (Понто-Каспийской) и Восточной степи установлено различие в генетической составляющей у скифов понто-каспийского региона раннего железного века, у которых наблюдалось увеличение алтайского компонента, и представителей черняховской культуры с территории современной Украины, у которых выявлено увеличение ближневосточного компонента, а также подтвердились демические процессы в период скифского господства. (Yunusbayev B. et al. 2011; Pagani L. 2016.)

  1. В популяциях Волго-Уральского региона  проводится молекулярно-генетическое изучение  20 наследственных заболеваний: фенилкетонурии,  муковисцидоза, адреногенитального синдрома, болезни Вильсона-Коновалова, наследственных моторно-сенсорных нейропатий, наследственной спастической параплегии, спиноцеребеллярной атаксии, торсионной дистонии, миодистрофии Дюшенна, миотонической дистрофии, хореи Гентингтона, синдрома ломкой хромосомы Х, несиндромальной аутосомно-рецессивной глухоты, наследственной катаракты, гемохроматоза, несовершенного остеогенеза, синдрома Марфана, тапеторетинальной абиотрофии сетчатки, врожденного гипотиреоза, нейрофиброматоза.

В результате исследований в генах заболеваний определены спектр и частота мутаций, выявлены ассоциированные с мутациями аллели и гаплотипы сцепленных с генами полиморфных ДНК-локусов.  Для некоторых из данных заболеваний выявлены мутации, не описанные ранее в литературе, и определено их происхождение. По спектру и частоте выявленных мутаций установлены достоверные статистические различия между различными этническими группами больных. На основании полученных данных для ряда популяций Волго-Уральского региона разработаны и успешно применяются алгоритмы ДНК-диагностики перечисленных моногенных заболеваний.

  1. Изучение многофакторной патологии в регионе включает анализ полиморфизма более 200 генов-кандидатов для ряда социально значимых заболеваний: параноидной шизофрении, болезни Паркинсона, остеопороза, бронхиальной астмы, аллергического ринита, дерматина, туберкулеза легких, онкологических заболеваний – рака молочной железы, рака почки, простаты, мелкокллеточного рака легких, а также депрессивного и агрессивного поведения и ряда когнитивных функций.

Генетическая предрасположенность к бронхиальной астме, раку молочной железы, параноидной шизофрении и остеопорозу исследована методом полногеномного анализа 650000 SNPs. Для всех указанных заболеваний установлены генетические факторы повышенного и пониженного риска их развития, представляющие собой сочетания тех или иных аллелей и генотипов и достоверно отличающиеся в различных этнических группах, проживающих в Башкортостане. По ряду заболеваний начаты исследования роли эпигенетических факторов в их развитии.

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ, ПОЛУЧЕННЫЕ ЗА ПОСЛЕДНИЕ 5 ЛЕТ

  1. В рамках изучения молекулярно-генетических основ наследственных заболеваний – болезни Вильсона-Коновалова, незавершенного остеогенеза, наследственных спастических параплегий и наследственных форм торсионной дистонии, – методами массового параллельного секвенирования проведен анализ структурных особенностей генов у пациентов из Республики Башкортостан. Выявлен ряд новых, ранее неописанных патогенных вариантов, установлены этнические особенности спектров и частот мутаций, обусловливающих развитие данных патологий, определены клинико-генетические корреляции; разработаны оптимальные для региона подходы их ДНК-диагностики.
  2. Проведен поиск и выявлен ряд новых, характерных для жителей Волго-Уральского региона, молекулярно-генетических и эпигенетических маркеров предрасположенности к многофакторной патологии – остеопорозу, бронхиальной астме, раку молочной железы, раку почки, мелкоклеточному раку легкого, параноидной шизофрении, к депрессивному и агрессивному поведению, а также формированию ряда когнитивных функций. Полученные данные представляют существенные возможности для решения основных вопросов их патогенеза и лечения, молекулярной эпидемиологии, и способствуют разработке новых эффективных подходов персонализированной медицины.
  3. На основе углубленного изучения У-хромосомы образцов древней ДНК с территории Северного Кавказа получены новые сведения о генофонде древнего населения данного региона, что вносит важный вклад в общее познание этногенеза народов Евразии.

Основные публикации лаборатории за 2020- 2024гг:

2020 год

  1. Escala-Garcia M., Abraham J., Andrulis I.L., … Bermisheva M., … et al. A network analysis to identify mediators of germline-driven differences in breast cancer prognosis // Nat Commun. – 2020. – 11(1): 312. doi: 10.1038/s41467-019-14100-6 Q1 IF WOS 12.12
  2. Fachal L., Aschard H., Beesley J., …. Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … et al. Fine-mapping of 150 breast cancer risk regions identifies 191 likely target genes // Nat Genet. – 2020. – 52(1). P. 56-73. doi: 10.1038/s41588-019-0537-1 Q1 IF WOS 27.6
  3. Feng H., Gusev A., Pasaniuc B., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., et al. Transcriptome-wide association study of breast cancer risk by estrogen-receptor status // Genet Epidemiol. – 2020 – 44(5). – P. 442-468. doi: 10.1002/gepi.22288 Q2 IF WOS 1.95
  4. Kuligina E.S., Sokolenko A.P., Bizin I.V., Romanko A.A., Zagorodnev K.A., Anisimova M.O., Krylova D.D., Anisimova E.I., Mantseva M.A., Varma A.K., Hasan S.K., Ni V.I., Koloskov A.V., Suspitsin E.N., Venina A.R., Aleksakhina S.N., Sokolova T.N., Milanović A.M., Schürmann P., Prokofyeva D.S., Bermisheva M.A., Khusnutdinova E.K., Bogdanova N., Dörk T., Imyanitov E.N. Exome sequencing study of Russian breast cancer patients suggests a predisposing role for USP39 // Breast Cancer Res Treat. – 2020. – 179(3). – P. 731-742. doi: 10.1007/s10549-019-05492-6. Q2 IF WOS 3.831
  5. Liu J., Prager-van der Smissen WJC., Collée JM., … Bermisheva M., … Khusnutdinova, … et al. Germline HOXB13 mutations p.G84E and p.R217C do not confer an increased breast cancer risk // Scientific Reports. – 2020. – 10(1): 9688. doi: 10.1038/s41598-020-65665-y Q1 IF WOS 3.998
  6. Nagy P.L., Olasz J., Neparáczki E., Rouse N., Kapuria K., Cano S., Chen H., Di Cristofaro J., Runfeldt G., Ekomasova N., Maróti Z., Jeney J., Litvinov S., Dzhaubermezov M., Gabidullina L., Szentirmay Z., Szabados G., Zgonjanin D., Chiaroni J., Behar D.M., Khusnutdinova E., Underhill P.A., Kásler M. Determination of the phylogenetic origins of the Árpád Dynasty based on Y chromosome sequencing of Béla the Third // Eur J Hum Genet. — 2020. doi: 10.1038/s41431-020-0683-z. Q2 IF WOS 3.657
  7. Zarubin A., Stepanov V., Markov A., Kolesnikov N., Marusin A., Khitrinskaya I., Swarovskaya M., Litvinov S., Ekomasova N., Dzhaubermezov M., Maksimova N., Sukhomyasova A., Shtygasheva O., Khusnutdinova E., Radjabov M., Kharkov V. Structural variability, expression profile and pharmacogenetics properties of TMPRSS2 gene as a potential target for COVID-19 therapy // Biorxiv. — 2020. doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.20.156224
  8. Zhang H., Ahearn T.U., Lecarpentier J., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … et al. Genome-wide association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall and subtype-specific analyses // Nat Genet. – 2020. – 52(6). – P. 572-581 doi: 10.1038/s41588-020-0609-2 Q1 IF WOS 27.603
  9. Бермишева М.А., Гилязова И.Р., Зиннатуллина Г.Ф., Хуснутдинова Э.К. Анализ редкого варианта c.2395C>T (p.Arg799Trp) гена ERCC4 у больных раком молочной железы в Башкортостане // Генетика. – 2020. – T.56. – №5. 602-608. DOI: 10.31857/S0016675820050021 Q4 IF WOS 0.466
  10. Бермишева М.А., Гилязова И.Р., Зиннатуллина Г.Ф., Богданова А.А., Хуснутдинова Э.К. Анализ ассоциации полиморфных локусов, расположенных в сайтах связывания микроРНК, с развитием рака молочной железы // Медицинская генетика. – 2020. – Т.19. – №6 (215). – С. 12-14. doi:10.25557/2073-7998.2020.06.12-13 ИФ РИНЦ 0.366
  11. Гареева А.Э., Хуснутдинова Э.К. Роль межгенных взаимодействий генов нейротрофической и нейромедиаторной системы в развитии предрасположенности к параноидной шизофрении // Генетика. – 2020. – Т.56. – №1. – С. 89-97. doi:10.31857/S0016675820010051 Q4 IF WOS466.
  12. Гареева А.Э., Шарафиев Р.Р., Ахметова Э.А., Насибуллин Т.Р., Фахуртдинова З.Р., Юлдашев В.Л., Асадуллин А.Р. Сочетанное влияние генетических факторов и синдрома дефицита внимания с гиперактивностью на развитие зависимости от синтетических каннабиноидов // Журнал Неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. – 2020. – Т.120. – №2. – С. 15-21. doi:10.17116/jnevro202012002115 IF SJR 0.137.
  13. Давыдова Ю.Д., Казанцева А.В., Еникеева Р.Ф., Мустафин Р.Н., Лобаскова М.М., Малых С.Б., Гилязова И.Р., Хуснутдинова Э.К. Роль полиморфных локусов гена рецептора окситоцина (OXTR)в развитии агрессивного поведения у здоровых индивидов // Генетика. – 2020 – Т.56. – №9. – С. 1087-1097. doi:10.31857/S0016675820090052 Q4 IF WOS466.
  14. Давыдова Ю.Д., Казанцева А.В., Еникеева Р.Ф., Мустафин Р.Н., Лобаскова М.М., Малых С.Б., Гилязова И.Р., Хуснутдинова Э.К. Роль генов пресинаптического цитоматриксного белка PICCOLO и медиаторов воспаления в развитии депрессивного поведения // Медицинская генетика. – 2020. – Т.19. – №4 (213). – С.36-38. doi: 10.25557/2073-7998.2020.04.36-38 ИФ РИНЦ 0.366
  15. Еникеева Р.Ф., Казанцева А.В., Давыдова Ю.Д., Малых С.Б., Хуснутдинова Э.К. Роль генетических и средовых факторов в формировании математической тревожности // Вестник интегративной психологии. – 2020. – № 20. – С. 42-45.
  16. Еникеева Р.Ф., Казанцева А.В., Давыдова Ю.Д., Малых С.Б., Хуснутдтнова Э.К. Изучение основного эффекта и эффекта ген-ген взаимодействий в формировании индивидуальных различий в уровне когнитивного функционирования // Медицинская генетика. – 2020 – Т. 19 – № 4 (213). – С. 39-40. doi: 10.25557/2073-7998.2020.04.39-40 ИФ РИНЦ 0.366.
  17. Зарипова А.Р., Хусаинова Р.И. Современная классификация и молекулярно-генетические аспекты незавершенного остеогенеза // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2020. – Т.24. – № 2. – С. 219-227. DOI: 10.18699/VJ20.614 Q4 IF SJR 0.181.
  18. Казанцева А.В., Давыдова Ю.Д., Еникеева Р.Ф., Малых С.Б., Лобаскова М.М., Хуснутдинова Э.К. Вовлеченность генов гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы в формирование индивидуальных различий в уровне стрессовой неустойчивости // Медицинская генетика. – 2020 – Т.19 – №4 (213). – С. 33-35. doi: 10.25557/2073-7998.2020.04.33-35 ИФ РИНЦ 0.366.
  19. Климентова Е.А., Гилязова И.Р., Измайлов А.А., Султанов И.Р., Искакова Г.М., Виноградов Я., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К. Анализ экспрессии семейства микроРНК-29 у пациентов со светлоклеточным раком почки // Медицинская генетика. – 2020. – Т.19. – №6 (215). – С.66-67. doi: 10.25557/2073-7998.2020.06.66-67 ИФ РИНЦ 0.366.
  20. Малых С.Б., Хуснутдинова Э.К., Казанцева А.В., Еникеева Р.Ф., Давыдова Ю.Д., Лобаскова М.М. Формирование межличностных различий в уровне эмоциональной неустойчивости с учетом средового и генетического компонента // Psyxologiya. – 2020. – №1. – С. 36-45.
  21. Мустафин Р.Н., Казанцева А.В., Еникеева Р.Ф., Малых С.Б., Хуснутдинова Э.К. Лонгитюдные генетические исследования когнитивных характеристик // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2020 – Т. 24 – № 1 – С. 87-95. doi:10.18699/VJ599 Q4 IF SJR 0.181.
  22. Мустафин Р.Н., Казанцева А.В., Малых С.Б., Хуснутдинова Э.К. Генетические механизмы когнитивного развития // Генетика. – 2020 – Т.56. – №8. – С.865-877. doi:10.31857/S0016675820070115 Q4 IF WOS466.
  23. Мустафин Р.Н., Хуснутдинова Э.К. Участие мобильных элементов в нейрогенезе // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2020. – Т. 24. – № 2. – С. 209-218. https://doi.org/10.18699/VJ20.613 Q4 IF SJR181.
  24. Мустафин Р.Н., Хуснутдинова Э.К. Постнатальный нейрогенез в головном мозге человека // Морфология. – 2020. – Т. 158 – № 6. ИФ РИНЦ 0.631.
  25. Савельева О.Н., Карунас А.С, Федоова Ю.Ю., Мурзина Р.Р., Савельева А.Н., Гатиятуллин Р.Ф., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К. Роль полиморфных вариантов генов аргиназ (ARG1, ARG2), участвующих в метаболизме бета-2-агонистов, в развитии и течении бронхиальной астмы // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2020 – №4. – С. 391-398. doi: 10.18699/VJ631 Q4 IF SJR 0.181.
  26. Ялаев Б.И., Тюрин А.В., Нурлыгаянов Р.З., Хусаинова Р.И. Фармакогенетические основы терапии бисфосфонатами // Молекулярная медицина. -2020. – Т.18. – №3. – С. 3-10. doi: 10.29296/24999490-2020-03-01 ИФ РИНЦ 0.268.
  27. Ялаев Б.И., Тюрин А.В., Нурлыгаянов Р.З., Хусаинова Р.И. Роль микроРНК при многофакторных заболеваниях соединительной ткани // Терапия. – 2020. – Т.6. – №6. – С. 35-39. https://dx.doi.org/10.18565/therapy.2020.6.35-39 ИФ РИНЦ 0.379.
  28. Kazantseva A., Davydova Yu., Enikeeva R., Lobaskova M., Mustafin R., Malykh S., Takhirova Z., Khusnutdinova E. AVPR1A main effect and OXTR-by-environment interplay in individual differences in depression level // Heliyon. – 2020. – V. 6(10):e05240. DOI 10.1016/j.heliyon.2020.e05240 (WoS Q1).
  29. Kazantseva A.V., Enikeeva R.F., Romanova A.R., Malykh S.B., Galyautdinova S.I., Khusnutdinova E.K. Stress-Associated Cognitive Functioning Is Controlled by Variations in Synaptic Plasticity Genes// Russian Journal of Genetics. – 2020. V. 56. № 1, P. 98–106. DOI: 10.31857/S0016675820010063 (WoS Q4).
  30. Enikeeva RF, Kazantseva AV, Davydova JD, et al. The role of polymorphic variants of the contactin-associated-like protein-2 (CNTNAP2) gene in the formation of differences in anxiety levels // Research Results in Biomedicine. – 2020. – V. 6(1). – P. 20-36. (In Russian) DOI: 10.18413/2658-6533-2020-6-1-0-3(Scopus Q2)

2021 год

  1. Karunas A.S., Fedorova Y.Y., Gimalova G.F., Etkina E.I., Khusnutdinova E.K. Association of Gasdermin B Gene GSDMB Polymorphisms with Risk of Allergic Diseases // Biochem Genet. – 2021. – V. 59. – P. 1527–1543. https://doi.org/10.1007/s10528-021-10073-8.
  2. Nagy P.L., Olasz J., Neparáczki E., Rouse N., Kapuria K., Cano S., Chen H., Di Cristofaro J., Runfeldt G., Ekomasova N., Maróti Z., Jeney J., Litvinov S., Dzhaubermezov M., Gabidullina L., Szentirmay Z., Szabados G., Zgonjanin D., Chiaroni J., Behar D.M., Khusnutdinova E., Underhill P.A., Kásler M. Determination of the phylogenetic origins of the Árpád Dynasty based on Y chromosome sequencing of Béla the Third // Eur J Hum Genet. – 2021. – V. 29 (1). – P. 164-172. doi: 10.1038/s41431-020-0683-z. Epub 2020 Jul 7. Erratum in: Eur J Hum Genet. 2021 Jan 14: PMID: 32636469; PMCID: PMC7809292.
  3. Gilyazova I., Ivanova E., Gilyazova G., Sultanov I., Izmailov A., Safiullin R., Pavlov V., Khusnutdinova E. Methylation and expression levels of microRNA-23b/-24-1/-27b, microRNA-30c-1/-30e, microRNA-301a and let-7g are dysregulated in clear cell renal cell carcinoma // Mol Biol Rep. – 2021. – V. 48 (7). – P. 5561-5569. doi: 10.1007/s11033-021-06573-w.
  4. Gilyazova I.R., Beeraka N.M., Klimentova E.A., Bulygin K.V., Nikolenko V.N., Izmailov A.A., Gilyazova G.R., Pavlov V.N., Khusnutdinova E.K., Somasundaram S.G., Kirkland C.E. and Aliev G.*. Novel MicroRNA Binding Site SNPs and the Risk of Clear Cell Renal Cell Carcinoma (ccRCC): A Case-Control Study // Current Cancer Drug Targets. – 2021. – V. 21 (3). – P. 203-212. https://doi.org/10.2174/1568009620666201120151226.
  5. Sahakyan H., Margaryan A., Saag L., Karmin M., Flores R., Haber M., Kushniarevich A., Khachatryan Z., Bahmanimehr A., Parik J., Karafet T., Yunusbayev B., Reisberg T., Solnik A., Metspalu E., Hovhannisyan A., Khusnutdinova E.K., Behar D.M., Metspalu M., Yepiskoposyan L., Rootsi S., Villems R. Origin and diffusion of human Y chromosome haplogroup J1-M267 // Sci Rep. – 2021. – V. 11 (1). – P. 6659. doi: 10.1038/s41598-021-85883-2. PMID: 33758277; PMCID: PMC7987999.
  6. Johnson N., Maguire S., Morra A., … R., Keeman R., Khusnutdinova E., … Fletcher O. CYP3A7*1C allele: linking premenopausal oestrone and progesterone levels with risk of hormone receptor-positive breast cancers // British Journal of Cancer. – 2021. – V. 124 (4). – P. 842-854. https://doi.org/10.1038/s41416-020-01185-w.
  7. Breast Cancer Association Consortium, Dorling L., … Bermisheva M., …, Khusnutdinova E… Easton D.F. Breast Cancer Risk Genes – Association Analysis in More than 113,000 Women // N Engl J Med. – 2021. – V. 384 (5). – P. 428-439. doi: 10.1056/NEJMoa1913948.
  8. Coignard J., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … Antoniou A.C. A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers // Nat Commun. – 2021. – V. 12 (1). – P. 1078. doi: 10.1038/s41467-020-20496-3.
  9. Escala-Garcia M., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … Schmidt M.K. Germline variants and breast cancer survival in patients with distant metastases at primary breast cancer diagnosis // Sci Rep. – –  V. 11 (1). – P. 19787. doi: 10.1038/s41598-021-99409-3. PMID: 34611289; PMCID: PMC8492709.
  10. Kar SP, Considine DPC, Tyrer JP, … , Khusnutdinova E, et al. Pleiotropy-guided transcriptome imputation from normal and tumor tissues identifies candidate susceptibility genes for breast and ovarian cancer // Human Genetics and Genomics Advances. – 2021 V.2(3):100042. doi: 10.1016/j.xhgg.2021.100042. Epub 2021 Jun 16. PMID: 34317694; PMCID: PMC8312632.
  11. Park H.A., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … Chang-Claude J. Mendelian randomisation study of smoking exposure in relation to breast cancer risk // Br J Cancer. – – V. 125 (8). – P. 1135-1145. doi: 10.1038/s41416-021-01432-8.
  12. Baxter J.S., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … Fletcher O. Functional annotation of the 2q35 breast cancer risk locus implicates a structural variant in influencing activity of a long-range enhancer element // Am J Hum Genet. – 2021. – 108 (7). – P. 1190-1203. doi: 10.1016/j.ajhg.2021.05.013.
  13. Glubb D.M., … Bermisheva M., … Khusnutdinova E., … O’Mara T.A. Cross-Cancer Genome-Wide Association Study of Endometrial Cancer and Epithelial Ovarian Cancer Identifies Genetic Risk Regions Associated with Risk of Both Cancers // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. – 2021. – V. 30 (1). – P. 217-228. doi: 10.1158/1055-9965.EPI-20-0739.
  14. Ахмадеева Г.Н., Хидиятова И.М., Насибуллин Т.Р., Гилязова И.Р., Умутбаев С.В., Таюпова Г.Н., Байтимеров А.Р., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Исследование ассоциации полиморфных вариантов генов серотонинергической системы (5-HTT, HTR1B, HTR2A, HTR2C и TPH1) с болезнью Паркинсона и ее клиническими особенностями у татар // Якутский медицинский журнал. – 2021. –№4. – С.14-20.
  15. Боринская С.А., Рубанович А.В., Ларин А.К., Казанцева А.В., Давыдова Ю.Д., Генерозов Э.В., Хуснутдинова Э.К., Янковский Н.К. Полногеномное исследование связи метилирования CPG-сайтов с агрессивным поведением // Генетика. 2021. Т. 57. № 12. С. 1450-1457. DOI31857/S0016675821120043
  16. Мустафин Р.Н., Бермишева М.А., Валиев Р.Р., Хуснутдинова Э.К. Нейрофиброматоз 1 го типа: результаты собственного исследования (Республика Башкортостан) // Успехи молекулярной онкологии. – 2021. – Т. 8. – С. 17-25. DOI: 10.17650/2313-805X-2021-8-1-17-25.
  17. Kazantseva A.V., Davydova Y.D., Enikeeva R.F., Valinurov R.G., Gareeva A.E., Khusnutdinova N.N., Khusnutdinova E.K. The association study of polymorphic variants of hypothalamic-pituitary-adrenal system genes (AVPR1B, OXTR) and aggressive behavior manifestation: a focus on social environment // Research Results in Biomedicine. – 2021. – V. 7. – № 3. – P. 232-244. DOI: 10.18413/2658-6533-2021-7-3-0-3.
  18. Тахирова З.Р., Казанцева А.В., Еникеева Р.Ф., Вартанян Г.А., Солдатова Е.Л., Завьялова И.Ю., Малых А.С., Давыдова Ю.Д., Валиев Р.Р., Нургалиева А.Х., Хамета Я.А., Хуснутдинова Э.К., Малых С.Б. Психогенетика пространственных способностей человека // Российский психологический журнал. – 2021. – Т. 18. – №2. – С. 67-93. DOI: 10.21702/rpj.2021.2.5.
  19. Савельева О.Н., Карунас А.С., Федорова Ю.Ю., Гатиятуллин Р.Ф., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов гистаминовых рецепторов (HRH1, HRH2, HRH3, HRH4) с развитием бронхиальной астмы у детей // Пульмонология. – 2021. – Т. 31. – № 6.
  20. Гилязова И.Р., Иванова Е.А., Измайлов А.А., Султанов И.Р., Сафиуллин Р.И., Гилязова Г.Р., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К. Частота гетерозиготного носительства мутаций в генах Notch-сигнального пути у пациентов со светлоклеточным раком почки и в популяциях Волго-Уральского региона // Якутский медицинский журнал. – 2021. – №1 (73). – C. 5-7. DOI25789/YMJ.2021.73.01.
  21. Gareev I.F., Beylerli O.A., Pavlov V.N., Izmailov A.A., Khusnutdinova E.K., Khasanova G.M., Gilyazova I.R., Khasanova A.N., Wang G., Huang H., Pan J., Shao T., Yao H., Wang W., Khasanov D.N. The potential role of mirnas in the pathogenesis of hemorrhagic fever with renal syndrome // Urologiia. – 2021. – №1. – P. 112-119. DOI: https://dx.doi.org/10.18565/urology.2021.1.112-119. PMID: 33818946.
  22. Yalaev B.I., Tyurin A.V., Mirgalieva R.I., Khusnutdinova E.K., Khusainova R.I. Investigating the role of osteoprotegerin gene polymorphic variants in osteoporosis // Russian Open Medical Journal. – 2021. – V. 10 (1). – P. 1-4. DOI: 10.15275/rusomj.2021.0101.
  23. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Литвинов С.С., Токарева Е.А., Габидуллина Л.Р., Валиев Р.Р., Нургалиева А.Х., Хуснутдинова Э.К. Разнообразие гаплогруппы r1a-z2122 в субпопуляциях балкарцев и карачаевцев по данным микросателлитного разнообразия // Гены и Клетки. – 2021. – Т. 16. – № 1. – С. 49-52. DOI: 10.23868/202104007.
  24. Kazantseva A.V., Enikeeva R.F., Davydova Yu.D., Mustafin R.N., Takhirova Z.R., Malykh S.B., Lobaskova M.M., Tikhomirova T.N., Khusnutdinova E.K. The role of the KIBRA and APOE genes in developing spatial abilities in humans // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. –2021. – V. 25(8). – P. 839-846. DOI 10.18699/VJ21.097

2022 год

  1. Ahearn TU, Zhang H, Michailidou K, …, Bermisheva M, … Khusnutdinova E, … Chatterjee N. Common variants in breast cancer risk loci predispose to distinct tumor subtypes // Breast Cancer Res. – 2022. – Vol. 24. – P. 2. doi: 10.1186/s13058-021-01484-x.
  2. Balinova N., Khomyakova I., Ayyzhi E., Dzhaubermezov M.A., Litvinov S.S., Khusnutdinova E.K., El’chinova G., Zinchenko R.A., Spitsyna N.Kh., Parik J., Reidla M., Rootsi S. Analysis of polymorphism of uniparental markers in reindeer-herding populations: the Tozhu Tuvans of Russia and the Tsaatans of Mongolia// Collegium Antropologicum. Vol 46, No 2 (2022) P. 79-86. Scopus.
  3. Dareng E, Tyrer J, Barnes D, … Bermisheva M, … Khusnutdinova E, …, Pharoah P. Polygenic risk modeling for prediction of epithelial ovarian cancer risk // Eur J Hum Genet. – 2022. – Vol. 30. – P. 349-362. doi: 10.1038/s41431-021-00987-7.
  4. Dennis J, Tyrer J, Walker L, …, Bermisheva M, …, Khusnutdinova E, …, Easton D. Rare germline copy number variants (CNVs) and breast cancer risk // Commun Biol. – 2022. – Vol. 5. – P. 65. doi: 10.1038/s42003-021-02990-6.
  5. Breast Cancer Association Consortium, Mavaddat N, Dorling L, Carvalho S, Allen J, …, Bermisheva M, … Khusnutdinova EK, …, Easton DF. Pathology of Tumors Associated With Pathogenic Germline Variants in 9 Breast Cancer Susceptibility Genes // JAMA Oncol. – 2022. Vol. 8. – e216744. doi: 10.1001/jamaoncol.2021.6744.
  6. Dorling L, Carvalho S, Allen J, … Bermisheva M, Khusnutdinova E, et al. Breast cancer risks associated with missense variants in breast cancer susceptibility genes // Genome Med. – 2022. – Vol. 14. – P. 51. doi: 10.1186/s13073-022-01052-8.
  7. Dixon-Suen S., Lewis S., Martin R. … Bermisheva et al. Physical activity, sedentary time and breast cancer risk: a Mendelian randomisation study // Br J Sports Med. – 2022. – Vol. 56. – P. 1157-1170. doi: 10.1136/bjsports-2021-105132.
  8. Enikeeva, R.F., Kazantseva, A.V., Davydova, Yu., Mustafin, R.N., Takhirova, Z.R., Malykh, S.B., Kovas, Y.V., Khusnutdinova, E.K. The role of inflammatory system genes in individual differences in nonverbal intelligence // Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. – 2022. – Vol. 26. – № 2. – P. 179-187. DOI 10.18699/VJGB-22-22
  9. Ivanova E, Asadullina D, Rakhimov R, Izmailov A, Izmailov A, Gilyazova G, Galimov S, Pavlov V, Khusnutdinova E, Gilyazova I. Exosomal miRNA-146a is downregulated in clear cell renal cell carcinoma patients with severe immune-related adverse events// Noncoding RNA Res. – 2022. – Vol.7., N3. – P.159-163 doi: 10.1016/j.ncrna.2022.06.004. eCollection 2022 Sep.
  10. Ivanova E, Gilyazova I, Pavlov V, Izmailov A, Gimalova G, Karunas A, Prokopenko I, Khusnutdinova E. MicroRNA Processing Pathway-Based Polygenic Score for Clear Cell Renal Cell Carcinoma in the Volga-Ural Region Populations of Eurasian Continent.// Genes (Basel) – 2022. – Vol.13, N7. –P.1281. doi: 10.3390/genes13071281.
  11. Gilyazova I, Ivanova E, Sinelnikov M, Pavlov V, Khusnutdinova E, Gareev I, Beilerli A, Mikhaleva L, Liang Y. The potential of miR-153 as aggressive prostate cancer biomarker // Noncoding RNA Res. – 2022. – Vol.8, N1. – P.53-59. doi: 10.1016/j.ncrna.2022.10.002
  12. Nadyrshina D., Zaripova A., Tyurin A., Minniakhmetov I., Zakharova E., Khusainova R. Osteogenesis imperfecta: search for mutations in patients from the Republic of Bashkortostan (Russia) // Genes. — 2022. — Vol. 13. — № 1. doi:10.3390/genes13010124
  13. Trubetskoy V, Pardiñas AF, Qi T, Panagiotaropoulou G, …, Gareeva A, …, Khusnutdinova E, … O’Donovan MC. Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium. Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia. Nature. – 2022. Vol. 604, N7906). – P.502-508. doi: 10.1038/s41586-022-04434-5. Epub 2022 Apr 8. PMID: 35396580.
  14. Tyurin A., Merkuryeva E., Zaripova A., Markova T., Nagornova T., Dantsev I., Nadyrshina D., Zakharova E., Khusainova R. Does the c.-14C>T Mutation in the IFITM5 Gene Provide Identical Phenotypes for Osteogenesis Imperfecta Type V? Data from Russia and a Literature Review // Biomedicines. – 2022, Vol.10, N10. – P. 2363; https://doi.org/10.3390/biomedicines10102363
  15. Yalaev,, Tyurin, A., Prokopenko, I., Karunas, A., Khusnutdinova, E., Khusainova, R. Using a polygenic score to predict the risk of developing primary osteoporosis. International Journal of Molecular Sciences. 2022. 23. P. 10021.
  16. Давыдова, Ю.Д., Казанцева, А.В., Еникеева, Р.Ф., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К. Связь метилирования ДНК и полиморфных локусов генов гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы с фенотипическими вариациями уровня депрессивности // Медицинская генетика. – 2022. – Т.21, – № 12.
  17. Еникеева, Р.Ф., Казанцева, А.В., Давыдова, Ю.Д., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Ковас, Ю.В., Хуснутдинова, Э.К. Индивидуальные различия числа копий митохондриальной ДНК: роль социально-демографических параметров // Якутский медицинский журнал. 2022. – Том 77. – № 2. – С. 13–16. – DOI 10.25789/YMJ.2022.78.03
  18. Еникеева Р. Ф., Казанцева А. В., Давыдова Ю. Д., Мустафин Р. Н., Лобаскова М. М., Малых С. Б., Хуснутдинова Э. К. Роль генов регуляции глутаматергических и ГАМКергических нейромедиаторов в формировании различий в объеме рабочей памяти // Медицинская генетика –2022. – Т.21, – № 12.
  19. Казанцева, А.В., Давыдова, Ю.Д., Еникеева, Р.Ф., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К. Индивидуальные вариации длины теломер у здоровых индивидов: эффект полиморфного варианта гена TERT и урбанизации // Генетика. – 2022. – Т. 58. – №9. – С. 1074-1108. DOI 10.31857/S0016675822090107
  20. Казанцева, А.В., Давыдова, Ю.Д., Фасхутдинова, Г.Г., Еникеева, Р.Ф., Гареева, А.Э., Асадуллин, А.Р., Хуснутдинова, Э.К. Относительная длина теломерных повторов у лиц с хроническим алкоголизмом в зависимости от клинико-анамнестических характеристик // Якутский медицинский журнал. – 2022. – Том 77. – № 4.
  21. Мустафин, Р.Н., Казанцева, А.В., Ковас, Ю.В., Хуснутдинова, Э.К. Роль ретроэлементов в развитии неврологических последствий COVID-19 // Russian Open Medical Journal. – 2022. – V. 11(3). – P. 313.
  22. Гилязова И. Р., Иванова Е. А., Бермишева М. А., Логинова М. В., Асадуллина Д. Д., Ишемгулов Р. Р., Мустафин А. Т., Павлов В. Н., Хуснутдинова Э. К. Роль полиморфных вариантов генов – компонентов сигнального пути PTEN/PI3K/AKT в развитии рака предстательной железы // Генетика. – 2022. – Т. 58, № 7. – С.831–837.
  23. Гилязова И.Р., Асадуллина Д.Д., Иванова Е.А., Рахимов Р.Р., Измайлов А.А., Бермишева М.А., +Гилязова Г.Р., Шарифгалеев И.А., Урманцев М.Ф., Попова Е.В., Сафиханов Р.Я., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К. Герминальные мутации как возможные биомаркеры эффективности терапии ингибиторами контрольных точек иммунитета у пациентов с почечно-клеточной карциномой (мини-обзор) // Научные результаты биомедицинских исследований. – 2022. –Т.8, №2. – С.164-179.
  24. Гилязова И.Р., Хасанова Г.М., Иванова Е.А., Асадуллина Д.Д.,Хасанова А.Н., Измайлов А.А., Гилязова Г.Р., Гоцин Ван, Хунлин Хуан, Цзяхуэй Пан, Тун Шао, Хаочен Яо, Вэньфан Ван, Хуснутдинова Э.К. Исследование профилей экспрессии экзосомальных микроРНК-126 и микроРНК-218 у пациентов с геморрагической лихорадкой с почечным синдромом (ГЛПС)// Научные результаты биомедицинских исследований. – 2022 . – Т.8. – №4. – С.424-438.
  25. Савельева О.Н., Карунас А.С., Федорова Ю.Ю., Гатиятуллин Р.Ф., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К. Исследование роли полиморфных вариантов генов, участвующих в метаболизме глюкокортикостероидов, в развитии и течении бронхиальной астмы у индивидов из Республики Башкортостан // Медицинская генетика -2022. – Том 21, №8. – С. 40-43.
  26. Хидиятова И.М., Сайфуллина Е.В., Карунас А.С., Ахметгалеева А.Ф., Кутлубаева Р.Ф., Смакова Л.А., Лобов С.Л., Поляков А.В., Щагина О.А., Кадникова В.А., Рыжкова О.П., Магжанов Р.В., Хуснутдинова Э.К. Анализ мутаций гена ATL1 и клинических особенностей течения заболевания у пациентов с наследственной спастической параплегией // Генетика. – 2022. – Т. 58, № 9. – С. 1085-1093.
  27. Хидиятова И.М., Хидиятова И.И., Азнабаев М.Т., Карунас А.С., Хуснутдинова Э.К. Новая мутация p.Glu48Gly в гене GJA8 в компаунд-гетерозиготном состоянии у пациента со спорадической врожденной зонулярной катарактой // Медицинская генетика. – 2022. –Т.21,№10. – С. 56-59.
  28. Ялаев Б.И., Тюрин А.В., Хусаинова Р.И. Мультиомиксные подходы к поиску молекулярно-генетических предикторов остеопороза // Гены и клетки. – 2022. – Т.17,№1. – С. 13-18.

2023 год

  1. Figlioli G., Billaud A., Ahearn T., … Bermisheva M. et al. FANCM missense variants and breast cancer risk: a case-control association study of 75,156 European women // Eur J Hum Genet. – 2023. – 31(5). P. 578-587. doi: 10.1038/s41431-022-01257-w.
  2. Figlioli G, Billaud A, Wang Q,… Bermisheva M. et al. Spectrum and Frequency of Germline FANCM Protein-Truncating Variants in 44,803 European Female Breast Cancer Cases // Cancers (Basel). – 2023. – 15(13): 3313. doi: 10.3390/cancers15133313
  3. Gilyazova I., Ivanova E., Izmailov A., Karunas A., Pudova E., Kobelyatskaya A., Pavlov V., Khusnutdinova E. MicroRNA expression signatures in clear cell renal cell carcinoma: high-throughput searching for key miRNA markers in patients from the Volga-Ural region of Eurasian continent // International Journal of Molecular Sciences. 2023. – Т. 24. – № 8. – С. 6909. doi: 10.3390/ijms24086909
  4. Gilyazova I., Asadullina D., Kagirova E., Sikka R., Mustafin A., Ivanova E., Bakhtiyarova K., Gilyazova G., Gupta S., Khusnutdinova E., Gupta H., Pavlov V. MiRNA-146a- a Key Player in Immunity and Diseases// International Journal of Molecular Sciences. 2023. – Т. 24. – № 16. – С.12767-12790. doi: 10.3390/ijms241612767
  5. Gilyazova I., Ivanova E., Gupta H., Mustafin A., Ishemgulov R., Izmailov A., Gilyazova G., Pudova E., Pavlov V., Khusnutdinova E. miRNA expression patterns in early- and late-stage prostate cancer patients: high-throughput analysis// Biomedicines. – 2023. – Т. 11. – № 11. – С. 3073. doi: 10.3390/biomedicines11113073
  6. Ivanova E., Asadullina D., Gilyazova G., Rakhimov R., Izmailov A., Pavlov V., Khusnutdinova E., Gilyazova I. Exosomal microRNA levels associated with immune checkpoint inhibitor therapy in clear cell renal cell carcinoma // Biomedicines. – 2023. – Т. 11. – № 3. – С. 801. doi: 10.3390/biomedicines11030801
  7. Kazantseva A, Enikeeva R, Takhirova Z, Davydova Y, Mustafin R, Malykh S, Karunas A, Kanapin A, Khusnutdinova E. Host Genetic Variants Linked to COVID-19 Neurological Complications and Susceptibility in Young Adults-A Preliminary Analysis // J. Pers. Med. – 2023. – Vol.13. – I.1. – P.123. doi: 10.3390/jpm13010123.
  8. Kazantseva A., Davydova Y., Enikeeva R., Mustafin R., Malykh S., Lobaskova M., Kanapin A., Prokopenko I., Khusnutdinova E. A combined effect of polygenic scores and environmental factors on individual differences in depression level // Genes. – 2023. – Vol. 14. – P. 1355. https://doi.org/10.3390/genes14071355.
  1. Kazantseva AV, Enikeeva RF, Toropova AV, Zakharov IM, Ismatullina VI, Khusnutdinova EK, Malykh SB. A replication study of genetic variants associated with high-level musical aptitude // Research Results in Biomedicine. 2023. V. 9. I. 2.P. 181-190. DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-2-0-3.
  2. Kazantseva A., Yakovleva D., Davydova Y., Kosareva A., Valinurov R., Khusnutdinova E. Antisocial behavior: nature vs. nurture // Opera Med et Physiol. 2023. V. 10. I. 3. P. 83-94. doi: 10.24412/2500-2295-2023-3-83-94.
  3. Kazantseva A. V., Davydova Yu. D., Enikeeva R. F., Yakovleva D. V., Mustafin R. N., Lobaskova M. M., Malykh S. B., and Khusnutdinova E. K. Individual variance in human aggression: a combined effect of polygenic score and social/lifestyle factors // Russian Journal of Genetics. – 2023. – Vol. 59. – I. 12.
  • Khidiyatova I.M., Khidiyatova I.I. , Zinchenko R. A., Marakhonov A.V., Karunas A.S., Avkhadeeva S.R., Aznzbaev M.T., Khusnutdinova E.K. Study of The Molecular Nature of Congenital Cataracts in Patients from The Volga–Ural Region. Current issues in molecular biology. 2023, 45, 5145–5163. https://doi.org/10.3390/cimb45060327
  1. Levi H, Carmi S, Rosset S, … Bermisheva M. et al. Evaluation of European-based polygenic risk score for breast cancer in Ashkenazi Jewish women in Israel // J Med Genet. – 2023. jmg-2023-109185. doi: 10.1136/jmg-2023-109185
  2. Lopes Cardozo JMN, Andrulis IL, Bojesen SE , … Bermisheva M. et al. Associations of a Breast Cancer Polygenic Risk Score With Tumor Characteristics and Survival // J Clin Oncol. – 2023. – 41(10). – Р. 1849-1863. doi: 10.1200/JCO.22.01978.
  3. Merkuryeva E., Markova T., Tyurin A., Valeeva D., Kenis V., Sumina M., Sorokin I., Shchagina O., Skoblov M., Nefedova M., Khusainova R., Zakharova E., Dadali E., Kutsev S. Clinical and genetic characteristics of calvarial doughnut lesions with bone fragility in three families with a reccurent SGMS2 gene variant // International Journal of Molecular Sciences. 2023. Т. 24. № 9. С. 8021. doi: 10.3390/ijms24098021
  4. Mueller S, Lai A, Valkovskaya M, … Bermisheva M. et al. Aggregation tests identify new gene associations with breast cancer in populations with diverse ancestry // Genome Med. 2023. – 15(1):7. doi: 10.1186/s13073-022-01152-5.
  5. Mustafin R.N., Khusnutdinova E.K. Perspective for studying the relationship of miRNAs with transposable elements // Current issues in molecular biology. 2023. V. 45. P.3122-3145. https://doi.org/ 10.3390 / cimb45040204
  6. Nurgalieva A., Galliamova L., Ekomasova N., Yankina M., Sakaeva D., Valiev R., Prokofyeva D., Dzhaubermezov M., Fedorova Yu., Khusnutdinov Sh., Khusnutdinova E. Whole exome sequencing study suggests an impact of FANCA, CDH1 and VEGFA genes on diffuse gastric cancer development.Genes. 2023. Т. 14. № 2. С. 280. DOI: 10.3390/genes14020280
  7. Prokofyeva, D.S., Mingazheva, E.T., Valova, Y.V., Sakaeva D.D., Faishanova R.R., Nurgalieva A.Kh., Valiev R.R., Bogdanova N., Dörk T., Khusnutdinova E.K. Targeted next-generation sequencing of 21 candidate genes in hereditary ovarian cancer patients from the Republic of Bashkortostan // Journal of Ovarian Research, 16, 66 (2023) DOI : https://0-doi-org.brum.beds.ac.uk/10.1186/s13048-023-01119-z
  1. Rafikova G., Gilyazova I., Enikeeva K., Pavlov V., Kzhyshkowska J. Prostate Cancer: Genetics, Epigenetics and the Need for Immunological Biomarkers // International Journal of Molecular Sciences. 2023. – Т. 24. – № 16. – С.12797-12834. doi: 10.3390/ijms241612797
  2. Гареева А. Э., Хуснутдинова Э.К. Генетическая структура выборки русских, татар и башкир по данным полногеномного исследования. Известия Уфимского научного центра РАН. 2023. № 2. С. 34–37. DOI: 10.31040/2222-8349-2023-0-2-34-37.
  3. Гареева А.Э. Полногеномное ассоциативное исследование риска развития шизофрении в Республике Башкортостан // Генетика. – 2023. – Т. 59. – № 8. С. 954-963. DOI 10.31857/S0016675823080076
  4. Гареева А.Э. Полногеномное ассоциативное исследование: анализ ассоциации параноидной шизофрении с полиморфными локусами, локализованными в хромосомных областях 4p15.2 и 20q13.31 // Генетика. – 2023. – Т. 59. – № 10. – С. 1179-1190. DOI: 10.31857/S0016675823100053
  5. Гилязова И.Р., Асадуллина Д.Д., Иванова Е.А., Измайлов А.А., Кудлай Д.А., Гилязова Г.Р., Галимова Э.Ф., Ермаков И.Б., Рахимов Р.Р., Попова Е.В., Насретдинов А.Ф., Султанбаев А.В., Хуснутдинова Э.К., Павлов В.Н. Экзосомальные микроРНК как возможные предикторы противоопухолевой эффективности ингибиторов контрольных точек иммунного ответа при светлоклеточной почечно-клеточной карциноме // Молекулярная медицина. – 2023. – Т. 21. – № 4. – С. 40-48. DOI: https://doi.org/10.29296/24999490-2023-04-06
  6. Казанцева А. В., Давыдова Ю. Д., Фасхутдинова Г. Г., Еникеева Р. Ф., Федорова Ю. Ю., Гареева А.Э., Асадуллин А.Р., Михайлова А.В., Валинуров Р.Г., Хуснутдинова Э.К. Относительная длина теломерных повторов у лиц с хроническим алкоголизмом в зависимости от клинико-анамнестических характеристик // Якутский медицинский журнал. – 2023. – Т. 81. – №1. – С. 10–13. doi: 10.25789/YMJ.2023.81.01.
  7. Казанцева А. В., Давыдова Ю. Д., Еникеева Р. Ф., Тахирова З. Р., Мустафин Р.Н., Лобаскова М.М., Малых С. Б., Хуснутдинова Э.К. Репликативное исследование ассоциации GWAS-значимых полиморфных локусов генов TUFM, SH2B1, ZNF638, NEGR1, ATP2A1, EXOC4, CSE1L с когнитивными способностями // Генетика. – 2023. – Т. 59. – № 9. – С. 1059-1069. DOI: 10.31857/S0016675823090060.
  8. Кутлубаева Р.Ф., Кутлубаев М.А, Магжанов Р.В., Сайфуллина Е.В., Хидиятова И.М. Наследственные спастические параплегии (обзор) // Нервно-мышечные болезни –2023. – №4. https://doi.org/10.17650/2222‑8721‑2023‑13‑4‑74‑82
  9. Ленкова К.В., Хусаинова Р.И., Минниахметов И.Р. Молекулярно-генетические основы рака шейки матки // Молекулярная медицина. 2023. Т. 21. № 4. С. 25-33. DOI: https://doi.org/10.29296/24999490-2023-04-04
  10. Мустафин Р. Н., Казанцева А. В., Хуснутдинова Э. К. Влияние COVID-19 на изменение когнитивных функций // Якутский медицинский журнал. – 2023. – Т. 81. – №1. – С. 100–105. doi: 10.25789/YMJ.2023.81.01.
  11. Надыршина Д.Д., Хусаинова Р.И. Клинико-генетические аспекты и молекулярный патогенез остеопетроза/ Д.Д. Надыршина, Р.И.  Хусаинова // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023;27(4):383-392. DOI: https://doi.org/10.18699/VJGB-23-46
  12. Низамова А. Р., Гималова Г. Ф., Хуснутдинова Э. К. Роль метилирования ДНК при раке легкого (обзор) // Научные результаты биомедицинских исследований. 2023. Т. 9. №. 3. С. 293-311.DOI: 10.18413/2658-6533-2023-9-3-0-1
  13. Савельева О.Н., Карунас А.С., Федорова Ю.Ю., Власова А.О., Бикташева А.Р., Гатиятуллин Р.Ф., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К. Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов ALDH7A1, AOC1, PSAP, ADCYAP1, участвующих в метаболизме гистамина, с развитием бронхиальной астмы у индивидов из Республики Башкортостан // Якутский медицинский журнал. 2023, №1. С. 10-13. DOI 10.25789/YMJ.2023.81.02
  14. K. Khusnutdinova, N.V. Ekomasova, M.A. Dzhaubermezov, L.R. Gabidullina, Z.R. Sufianova, I.M. Khidiyatova, A.V. Kazantseva, S.S. Litvinov, A.Kh. Nurgalieva, D.S. Prokofieva. Distribution of haplogroup G-P15 of the Y-chromosome among representatives of ancient cultures and modern populations of Northern Eurasia//Opera Med Physiol. – 2023.- Vol. 10, №4. –Р.57-72. doi: 10.24412/2500-2295-2023-4-57-72

2024 год

  1. Dareng E. O., Coetzee S. G., Tyrer J. P. …Khusnutdinova E.K. et al. Integrative multi-omics analyses to identify the genetic and functional mechanisms underlying ovarian cancer risk regions / E. O. Dareng, S. G. Coetzee, J. P. Tyrer [et al.] // American Journal of Human Genetics. – 2024. – Vol. 111, No. 6. – P. 1061-1083. https://www.cell.com/ajhg/abstract/S0002-9297(24)00126-5
  2. Davidson A. L., Michailidou K., Parsons M. T… Bermisheva M. et al. Co-observation of germline pathogenic variants in breast cancer predisposition genes: Results from analysis of the BRIDGES sequencing dataset // Am J Hum Genet. 2024. 111(9): 2059-2069. doi: 10.1016/j.ajhg.2024.07.004.
  3. Gilyazova I, Gimalova G, Nizamova A, Galimova E, Ishbulatova E, Pavlov V, Khusnutdinova E. Non-Coding RNAs as Key Regulators in Lung Cancer // International Journal of Molecular Sciences. – 2024. – V. 25(1). – P. 560. https://doi.org/10.3390/ijms25010560
  4. Kentistou KA, Kaisinger LR, Stankovic S… Khusnutdinova E.K. et al. Understanding the genetic complexity of puberty timing across the allele frequency spectrum / K. A. Kentistou, L. R. Kaisinger, S. Stankovic [et al.] // Nature Genetics. – 2024. – Vol. 56, No. 7. – P. 1397-1411.
  5. Lenkova, K.; Khusainova, R.; Minyazeva, R.; Zaripova, A.;Gilyazova, I.; Mokrysheva, N.; Minniakhmetov, I. Germline Variants in Proto-Oncogenes and Tumor Suppressor Genes in Women with Cervical Cancer. Biomedicines 2024, 12, 2454. https://doi.org/10.3390/ biomedicines12112454
  6. Kaiyrzhanov, R. A… biobank for Parkinson’s disease and atypical parkinsonism in central Asian and Transcaucasian regions / R. Kaiyrzhanov, N. Zharkinbekova, S. Abdraimova… Gilyazova, I. Khidiyatova, E. Khusnutdinova, G. Akhmadeeva, A. Gareeva, [et al.] // The Lancet Neurology. – 2024. – Vol. 23, No. 9. – P. 859-860.
  7. Savelieva O.N., Karunas A.S., Vlasova A.O., Ahmetshin A.A., Khidiyatova I.M., Khusnutdinova E.K. Epigenetic markers of asthma: a study of methylation patterns of genes involved in drug metabolism// Opera Medica et Physiologica. 11 (4). P. 93-103. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39152022/
  8. Sufyanova Zemfira Railovna, Ekomasova Natalia Vadimovna, Dzhaubermezov Murat Alievich, Petrova Sabina Grigorievna, Kazantseva Anastasia Valerievna, Prokofyeva Daria Simonovna, Gabidullina Liliya Rafisovna, Khidiyatova Irina Mikhailovna, Nurgalieva Alfiya Khamatyanovna, Fedorova Yulia Yuryevna, Khusnutdinova Elsa Kamilevna. Study of the Distribution of Frequencies of Alleles and Genotypes of Polymorphic Variants rs1800795 of the IL6 Gene, rs1800629 of the TNFA Gene and rs10490770 of the LZTFL1 Gene Associated with COVID-19 in Populations of the Volga-Ural Region // Opera Medica et Physiologica. 2024. Т. 11. № 3. С.118-135. https://operamedphys.org/content/study-distribution-frequencies-alleles-and-genotypes-polymorphic-variants-rs1800795-il6-ge-0
  9. Асадуллина Д.Д, Гилязова И.Р., Иванова Е.А. и др. Экзосомальные микроРНК-146A и микроРНК-424 как возможные предикторы ответа на терапию ингибиторами иммунных контрольных точек при светлоклеточной почечно-клеточной карциноме //Генетика. -2024. – T.60, N – C.94-103.             https://elibrary.ru/item.asp?id=68576467    
  10. Гареева, А. Э. Полногеномный анализ ассоциации риска развития параноидной шизофрении у русских: поиск генетических маркеров в хромосомной области 1q43 // Генетика. – 2024. – Т. 60, № 1. – С. 100-105. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=67861423
  11. Гареева, А. Э. Новый генетический маркер риска параноидной шизофрении в хромосомной области 9q21.13 у татар: полногеномный анализ ассоциации / А. Э. Гареева // Генетика. – 2024. – Т. 60, № 1. – С. 106-111. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=67861424
  12. Гареева, А. Э. Поиск этноспецифических маркеров риска развития параноидной шизофрении у башкир по результатам полногеномного анализа ассоциации / А. Э. Гареева // Генетика. – 2024. – Т. 60, № 2. – С. 94-99. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=67905325
  13. Гареева, А.Э. Фармакогеномные и фармакометаболомные биомаркеры эффективности и безопасности антидепрессантов: фокус на селективные ингибиторы обратного захвата серотонина / А. Э. Гареева, Л. С. Бородина, С. А. Поздняков, И. Ф. Тимербулатов // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. – 2024. – Т. 124, № 6. – С. 26-35. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=68502652
  14. Давыдова Ю.Д., Казанцева А.В., Хуснутдинова Э.К. Перспективы использования системы геномного редактирования CRIPR/Cas9 для изучения молекулярно-генетических основ психических расстройств // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2024. Т. 124. № 3. С. 27-33. https://www.mediasphera.ru/issues/zhurnal-nevrologii-i-psikhiatrii-im-s-s-korsakova/2024/3/1199772982024031027
  15. Джаубермезов М. А., Екомасова Н.В.…, Хидиятова И. М., Хуснутдинова Э. К. Антропология финно-угорских народов: вопрос пигментации в аспекте применения // Oriental Studies. 2024. Т. 17. № 3. С. 632-643.
  16. Мамадалиева, Л. И., Иванова E. А., Нургалиева, А. Х., Хуснутдинова, Э. К., & Бермишева, М. А. Мутация сайта сплайсинга c.290+1G>A в гене STK11 в семье с синдромом Пейтца-Егерса. Вопросы онкологии. – 2024. – Т. 70(1). – С. 127–131. https://doi.org/10.37469/0507-3758-2024-70-1-127-131
  17. Мустафин, Р. Н., Хуснутдинова, Э. К. Ретроэлементы как мишени таргетной терапии опухолей (обзор) / Р. Н. Мустафин, Э. К. Хуснутдинова // Научные результаты биомедицинских исследований. – 2024. – Т. 10, № 1. – С. 5-22. https://rrmedicine.ru/journal/article/3332/
  18. Мустафин, Р. Н., Хуснутдинова Э. К. Роль мобильных генетических элементов в формировании долговременной памяти / Р. Н. Мустафин, Э. К. Хуснутдинова // Генетика. – 2024. – Т. 60, № 4. – С. 3-19. http://www.vigg.ru/genetika/html/annot/2024/24.04.html
  19. Мустафин, Р. Н., Хуснутдинова Э. К. Влияние транспозонов на развитие болезни Альцгеймера / Р. Н. Мустафин, Э. К. Хуснутдинова // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2024. – Т. 28, № 2. – С. 228-238. https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/4093
  20. Nakhodkin S.S., Barashkov N.A., Kazantseva A.V., Pshennikova V.G., Nikanorova A.A., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. Associations of the AVPR1A RS1 microsatellite locus with the level of hormones of the anterior pituitary gland and personality traits // Biochemical Genetics. 2024. https://link.springer.com/article/10.1007/s10528-024-10933-z
  21. Находкин С.С., Барашков Н.А., Казанцева А.В., Пшенникова В.Г., Никанорова А.А., Хуснутдинова Э.К., Малых С.Б., Федорова С.А. Анализ ассоциаций черт темперамента и характера личности с уровнем кортизола в сыворотке крови мужчин Саха (якутов) учетом перенесенного в детстве стресса //Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова. 2024. Т. 74. № 4. С. 426-436. https://elibrary.ru/item.asp?id=73884570
  22. Первушина Е.В., Кутлубаев М.А., Сайфуллина Е.В., Гайсина Е.В., Смакова Л.А., Хидиятова И.М. Клинический случай бокового амиотрофического склероза с новой мутацией в гене ERBB4//Ж. неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова 2024;124(7):165‑ https://doi.org/10.17116/jnevro2024124071165
  23. Савельева О.Н., Карунас А.С., Бикташева А.Р., Власова А.О., Хидиятова И.М., Эткина Э.И., Хуснутдинова Э.К. Исследование роли генов, участвующих в метаболизме гистамина, в развитии аллергических заболеваний дыхательных путей// Генетика. 2024. №4. С.76-85. http://www.vigg.ru/genetika/

Монографии

  1. Мустафин Р.И., Хуснутдинова Э.К. Мобильные генетические элементы и эволюция. Уфа. РИЦ БашГУ. 2020. С.178.
  2. Ахтямова Е.В., Белая О.В., Беляков В.И., Минниахметов И.Р., Пестрикова А.А., Поваров Ю.С., Рузанова В.Д., Серова О.А., Сушкова О.В., Хусаинова Р.И. Формирование концепции правового регулирования геномных исследований в Российской Федерации // Москва. — 2022. – 108 c. ISBN:978-5-4365-9467-5
  3. Федорова С.А., Илумае А.-М., Хуснутдинова Э.К. Происхождение народа саха (якутов) по данным генетической археологии // Популяционно-генетические исследования населения Республики Саха (Якутия) / под ред. Федоровой С.А., Барашкова Н.А. Новосибирск.  – 2022. Гл.1. – С.17-41.
  4. Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Терютин Ф.М., …, Хуснутдинова Э.К. [и др.] Происхождение и пути мирового распространения мутации с.-23+1G>A гена GJB2 // Популяционно-генетические исследования населения Республики Саха (Якутия) / под ред. Федоровой С.А., Барашкова Н.А. – Новосибирск. – 2022. Гл.3.  – С.133-145.
  5. ДНК-криминалистика / А.В. Чемерис, Ф.Г. Аминев, Р.Р. Гарафутдинов, В.А. Анисимов, А.М. Сагитов, Э.К. Хуснутдинова, А.Р. Сахабутдинова, Д.А. Чемерис, К.И. Михайленко / Под ред. Ф.Г. Аминева, А.В. Чемериса. – М.: Наука, 2022. – 466 с. ISBN 978-5-02-040915-6 (в пер.).
  6. Казанцева, А. В. Психогенетические и нейробиологические исследования субъективного благополучия [статья в монографии «Междисциплинарный подход к изучению благополучия человека»] / А.В. Казанцева, Р.Н. Мустафин, Р.Ф. Еникеева, Ю.Д. Давыдова, Э.К. Хуснутдинова / Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2023. – 272 с.: ил. – ISBN 978-5-7996-. – Текст: электронный.
  7. Тахирова, З.Р. Психосоматика болевого синдрома у детей: биологические и психологические аспекты благополучия личности в условиях болевых ощущений [статья в монографии «Междисциплинарный подход к изучению благополучия человека»] / З. Р. Тахирова, Ю. Ю. Федорова, Р. Р. Мурзина, А. Х. Нургалиева, А. М. Тазетдинов, Э. Э. Сыманюк, Э. К. Хуснутдинова. / – Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2023. – 272 с.: ил. – ISBN 978-5-7996-. – Текст: электронный.
  8. Миронова Ж.А., Трофимов В.И., Карунас Александра Станиславовна, Бабаджанова Г.Ю., Хуснутдинова Эльза.Камилевна. Генетика бронхиальной астмы. Респираторная медицина: руководство: в 4 т. / под ред. А. Г. Чучалина. – 3-е изд., доп. и перераб. Москва, 2024. – Т. 2. – 734 с.    Г. Москва            ПульмоМедиа
  9. Султанбаев Александр Валерьевич, Колядина Ирина Владимировна, Меньшиков Константин Викторович, Мусин Шамиль Исмагилович, Гилязова Ирина Ришатовна, Султанбаева Надежда Ивановна, Меньшикова Ирина Асхатовна, Липатов Олег Николаевич, Хуснутдинова Эльза Камилевна, Насретдинов Айнур Фанутович, Измайлов Адель Альбертович, Коновалов Дмитрий Юрьевич Герминальные мутации и злокачественные новообразования            Москва, 2024 ООО «Издательство «Медицинское информационное агентство»

Учебные пособия

  1. Н.В. Екомасова, М.А. Джаубермезов, Л.Р. Габидуллина, З.Р. Суфьянова, Д.Д. Надыршина, А.Х. Нургалиева, Ю.Ю. Федорова, Э.Т. Мингажева, А.С. Карунас, И.М. Хидиятова, Д.С. Прокофьева, Э.К. Хуснутдинова.             Этногеномика: учебное пособие // Уфа: РИЦ УУНиТ, 2024. — 116 с.
  2. Тимашева Я.Р., Авзалетдинова Д.Ш., Гилязова И.Р., Карунас А.С., Хуснутдинова Э.К. Учебное пособие. Генетические основы многофакторых заболеваний. Уфа, 2024. 124 с.

Заявки об открытии или изобретении и положительные решения по ним.

  1. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Валиев Р.Р., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в субпопуляции холамцев» №2021622270 от 25.10.2021
  2. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Валиев Р.Р., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в субпопуляции малкарцев» №2021622238 от 21.10.2021
  3. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Валиев Р.Р., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в субпопуляции баксанцев» №2021622283 от 26.10.2021
  4. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Габидуллина Л.Р., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции кабардинцев» №2022622994 от 21.11.2022
  5. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Габидуллина Л.Р., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции башкир Стерлибашевского района Республики Башкортостан» №2022623014 от 22.11.2022
  6. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Габидуллина Л.Р., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции башкир Абзелиловского района Республики Башкортостан» №2022623022 от 22.11.2022
  7. Джаубермезов М.А., Екомасова Н.В., Габидуллина Л.Р., Хидиятова И.М., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции татар Туймазинского района Республики Башкортостан» №2022623008 от 21.11.2022
  8. Тахирова З.Р., Казанцева А.В., Тазетдинов А.М., Малых С.Б., Хуснутдинова Э.К. Свидетельство о государтсвенной регистрации базы данных «Анализ полиморфного варианта rs12720208 гена FGF20 в развитии пространственного мышления человека» №2022623007 от 21.11.2022
  9. Тюрин А.В., Надыршина Д.Д., Зарипова А.Р., Валеева Д.И., Хусаинова Р.И. Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2023623485. Регистр пациентов с синдромом Элерса-Данло в Республике Башкортостан: эпидемиологические данные, клиническая картина, результаты молекулярно-генетических исследований. Дата регистрации 17.10.2023 г.
  10. Тюрин А.В., Надыршина Д.Д., Зарипова А.Р., Валеева Д.И., Хусаинова Р.И. Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2023623484. Регистр пациентов с несовершенным остеогенезом в Республике Башкортостан: эпидемиологические данные, клиническая картина, результаты молекулярно-генетических исследований. Дата регистрации 17.10.2023 г.
  1. .Екомасова Н.В., Джаубермезов М.А., Габидуллина Л.Р., Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Литвинов С.С., Суфьянова З.Р. Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции чувашей. Св-во № 2023624481 от12.2023.
  2. Екомасова Н.В., Джаубермезов М.А., Габидуллина Л.Р., Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Литвинов С.С., Суфьянова З.Р. Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции удмуртов. Св-во № 2023624694 от 18.12.2023.
  3. Екомасова Н.В., Джаубермезов М.А., Габидуллина Л.Р., Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М., Литвинов С.С., Суфьянова З.Р. Частоты гаплогрупп мтДНК и Y-хромосомы в популяции бесермян. Св-во № 2023624944 от 25.12.2023.
  4. Джаубермезов Мурат Алиевич, Екомасова Наталья Вадимовна, Суфьянова Земфира Раиловна, Габидуллина Лилия Рафисовна, Хидиятова Ирина Михайловна, Чагаров Онгар Салихович, Хуснутдинова Эльза Камилевна. «Анализ распространения полиморфных вариантов rs3892097 и rs4986774 гена CYP2D6 в финно-пермских популяциях России» Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2024624390 от 14.10.2024г.
  5. Джаубермезов Мурат Алиевич, Екомасова Наталья Вадимовна, Суфьянова Земфира Раиловна, Габидуллина Лилия Рафисовна, Хидиятова Ирина Михайловна, Чагаров Онгар Салихович, Хуснутдинова Эльза Камилевна. «Анализ распространения полиморфных вариантов rs1048943 гена CYP1A1 и rs1065852 гена CYP2D6 в финно-пермских популяциях России» Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2024624389 от 14.10.2024г.
  6. Джаубермезов Мурат Алиевич, Екомасова Наталья Вадимовна, Суфьянова Земфира Раиловна, Габидуллина Лилия Рафисовна, Хидиятова Ирина Михайловна, Чагаров Онгар Салихович, Хуснутдинова Эльза Камилевна. «Анализ распространения полиморфных вариантов rs1048943 гена CYP1A1 и rs1065852 гена CYP2D6 в финно-пермских популяциях России» Свидетельство о государственной регистрации базы данных №2024624389 от 14.10.2024г.

Гранты фондов и НИР (2020-2024)

  1. РФФИ №18-29-14083_мк «Комплексное исследование проблемы правового регулирования вопросов пресимптоматической, пренатальной и преимплантационной ДНК-диагностики наследственных заболеваний человека» (2018 -2020гг), руководитель – Хусаинова Р.И.
  2. РФФИ № 19-015-00331 «Фармакогенетическое исследование болезни Паркинсона: поиск генетических маркеров риска развития леводопа-индуцированных дискинезий» (2019-2021гг), руководитель – Ахмадеева Г.Н.
  3. РФФИ №19-04-01195 А «Генетическая характеристика кочевников железного века и их влияние на генофонды раннесредневековых и современных популяций Северной Евразии» (2019-2021гг), руководитель – Екомасова Н.В.
  4. РФФИ №19-315-90083_аспиранты «Исследование роли генетических и эпигенетических факторов в формировании остеопороза». (2019-2021 гг.), руководитель – Хусаинова Р.И.
  5. РФФИ №20-315-90063 Аспиранты «Изучение молекулярно-генетической архитектуры незавершенного остеогенеза», руководитель – Хусаинова Р.И.
  6. Грант правительства Республики Башкортостан под руководством ведущих ученых «Исследование молекулярно-генетических основ когнитивных и психоневрологических особенностей и последствий пандемии COVID-19» на 2021-2023 гг., руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  7. РНФ № 21-74-00104 «Анализ распространенности COVID-19 – ассоциированных вариантов генов в популяциях Северной Евразии», руководитель – Екомасова Н.В.
  8. РНФ №23-25-00392 «Экзосомальные микроРНК как возможные предикторы противоопухолевой эффективности ингибиторов контрольных точек иммунного ответа», руководитель – Гилязова И.Р.
  9. Мегагрант Правительства Российской Федерации (2021-2023) (2020-220-08-2197, соглашение№ 075-15-2021-595). «Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины», Руководитель – проф. Прокопенко И.А. (Университет Суррея, г. Гилфорд, (Великобритания), проф. Макеев В.Ю., (Россия)
  10. Технологический проект создания научно-образовательного центра (НОЦ) «Геномика и цифровые системы предиктивной аналитики для персонализированной медицины»; руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  11. ДОГОВОР №_021-05-1818/CГ в рамках мероприятия 4-5 «Разработка методики определения статуса генетических локусов и прижизненной модификации участков ДНК, влияющих на психоэмоциональный статус человека» научно-технической программы Союзного государства «Разработка инновационных геногеографических и геномных технологий идентификации личности и индивидуальных особенностей человека на основе изучения генофондов регионов Союзного государства», руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  12. РНФ № 22-24-00681 «Генетическая структура народов Северного Кавказа с III века и до наших дней», руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  13. РНФ №22-75-00087 «Поиск молекулярных маркеров для диагностики и оценки эффективности применения иммунотерапии при светлоклеточной почечно-клеточной карциноме на основе аанлиза экзосомальных микроРНК», руководитель – Иванова Е.А.
  14. ДОГОВОР №_1141-08/23 от 7.08.2023 на выполнение научно-исследовательских работ по теме: «Комплексный анализ связи генов с гормональным статусом индивида в якутской популяции» с ФГАОУ ВО “Северо-Восточный федеральный университет им. М.К.Аммосова”, руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  15. Договор № 68/223-ЕП от 20 октября 2023 г. с ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» (Томский НИМЦ) НИМЦ на выполнение НИР по теме: «Формирование коллекции образцов ДНК больных с наследственными заболеваниями», руководитель – Хуснутдинова Э.К.
  16. РНФ № 24-25-00378 «Разработка персонализированного подхода повышения эффективности и безопасности фармакотерапии сертралином у больных c тревожно-депрессивными расстройствами: фармакогеномные и фармакометаболомные биомаркеры», руководитель – Гареева А.Э.
  17. Госзадание НИР ИБГ УФИЦ РАН (2021-2024) Тема: “Молекулярная организация генома человека, технологии его исследований и механизмы фармакологической регуляции функционирования в норме и при патологии”, № гос. регистрации: № 122041400169-2; руководитель – Хидиятова И.М.
  18. Госзадание НИР ИБГ УФИЦ РАН (2025-2028) «Геном человека: молекулярная организация, технологии исследований и механизмы фармакологической регуляции функционирования в норме и при патологии» № гос. регистрации: № 1022040500074-9, руководитель – Хидиятова И.М.

Диссертации

Докторские диссертации:

  1. Бермишева Марина Алексеевна «Генетическая структура и популяционные аспекты онкопатологии молочных желез и яичников», диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности 03.02.07. – генетика (Научный консультант: д.б.н., проф., член-корр.РАО Хуснутдинова Э.К.; дата защиты: 02.06.2021 г).
  2. Сайфуллина Елена Владимировна «эпидемиологические и клинико-генетические характеристики наследственных моторно-сенсорных нейропатий и миотонической дистрофии 1 типа в Республике Башкортостан», диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук по специальностям 01.11 – Нервные болезни и 03.02.07. – генетика (Научные консультанты: д.м.н., проф. Магжанов Р.В., д.б.н., проф., Хидиятова И.М.; дата защиты: 09.11.2021 г).
  3. Тюрин А.В. «Клинико-генетическое исследование моногенных и многофакторных заболеваний соединительной ткани», диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук по специальностям    1.18 – Внутренние болезни и 1.5.7. — Генетика (науч. консультант   –          д.б.н., доцент Хусаинова Рита Игоревна; 2024 г)                      

Кандидатские диссертации:

  1. Шаповалова Дарья Алексеевна «Изучение молекулярно-генетических основ остеоартрита у женщин с недифференцированной дисплазией соединительной ткани»,диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07. – генетика (Научный руководитель: д.б.н., Хусаинова Р.И.; дата защиты: 19.02.2020 г).
  2. Галлямова Лилия Фанилевна “Молекулярно-генетическое исследование рака желудка», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07. – генетика (Научный руководитель: д.б.н., проф. Хуснутдинова Э.К.; дата защиты: 02.12.2020 г.).
  3. Мингажева Эльвира Тагировна «Молекулярно-генетический анализ рака яичников», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07. – генетика (Научный руководитель: д.б.н., проф. Хуснутдинова Э.К.; дата защиты: 02.12.2020 г.).
  4. Еникеева Рамзиля Рамилевна «Молекулярно-генетическое изучение наследственных форм кератоконуса и глаукомы», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.07. – генетика (Научный консультант: д.б.н., проф., член-корр.РАО Хуснутдинова Э.К.; дата защиты: 03.06.2021 г).
  5. Фаисханова Рания Разяповна «Особенности клинического течения и молекулярно-генетическая характеристика наследственного рака яичников», диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальностям 1.5. 7. – генетика и 3.1.6. – онкология, лучевая терапия (Научный консультант: д.б.н., проф., член-корр. РАО Хуснутдинова Э.К.; дата защиты: 22.11.2021 г).
  6. Давыдова Ю.Д. «Генетические и эпигенетические факторы развития агрессивного и депрессивного поведения человека», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.77. – генетика (Научный консультант: д.б.н., проф., член-корр.РАО Хуснутдинова Э.К.; 2022 г).
  7. Савельева О.Н. «Исследование молекулярно-генетических основ индивидуальной чувствительности к терапии бронхиальной астмы», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.7. – генетика (Научный руководитель д.б.н., доцент А.С. Карунас; 2022 г.)
  8. Ялаев Б.И. «Исследование генетических и эпигенетических факторов формирования остеопороза», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.77. – генетика (Научный       руководитель д.б.н., доцент Р.И. Хусаинова; 2022 г).
  9. Валова Я. В. «Исследование молекулярно-генетических основ наследственного и спорадического рака яичников»,       диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.77. – генетика (Научный консультант: д.б.н., проф., член-корр.РАО Хуснутдинова Э.К.; 2023 г).
  10. Зарипова А.Р. «Генетическая архитектура незавершенного остеогенеза», диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.77. – генетика (Научный руководитель д.б.н., доцент Р.И. Хусаинова; 2022 г).

Лаборатория молекулярных механизмов устойчивости растений к стрессам

Заведующий лабораторией – Авальбаев Азамат Мэлсович,

кандидат биологических наук

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: azamat.avalbaev@ufaras.ru

             avalbaev@yahoo.com

Основные направления научной деятельности лаборатории

  • Исследование механизмов сигнальной регуляции адаптации растений к стрессам, вызывающим нарушение водного режима.
  • Функциональная геномика и протеомика устойчивости растений.
  • Роль растительно-микробных взаимодействий в повышении устойчивости растений к абиотическим стрессовым факторам среды.

Исследования направлены на изучение механизмов физиологического действия разных природных регуляторов роста и агрополезных микроорганизмов на растения при воздействии абиотических стрессовых факторов для эффективного и целенаправленного их использования в целях повышения продуктивности важнейших сельскохозяйственных культур без нанесения вреда окружающей среде. Проводится изучение различных генетических систем растений, связанных с устойчивостью и адаптацией к стрессам, а также связи особенностей генотипа растений со специфичностью действия регуляторов роста и агрополезных микроорганизмов в норме и в неблагоприятных условиях.

Заведующие лаборатории – д.б.н., проф. Ф.М. Шакирова, (с 1997 по 2020 гг), к.б.н. О.В. Ласточкина, (с 2020 по 2024 гг), к.б.н. А.М. Авальбаев, (с 2024 г по наст. время).

Краткая история лаборатории

Лаборатория молекулярных механизмов устойчивости растений к стрессам создана в Отделе биохимии и цитохимии УНЦ РАН (ныне ИБГ УФИЦ РАН) в октябре 1997 г. в результате слияния тематических групп, занимавшихся проблемами физиологии и биохимии растений. Заведующей лаборатории с 1997 по 2020 гг являлась доктор биологических наук, профессор, заслуженный деятель науки Республики Башкортостан Фарида Миннихановна Шакирова (1953-2024). Под ее руководством были заложены основные направления научной деятельности лаборатории: молекулярные механизмы адаптации растений к стрессам, вызывающим нарушение водного режима, механизмы гормональной регуляции устойчивости растений, гормональные интермедиаты в реализации рост-стимулирующего, предадаптирующего и защитного эффектов природных регуляторов роста на растения пшеницы. В состав лаборатории в разные годы входили сотрудники: к.б.н. Ш.Я. Гилязетдинов (1935-2016), д.б.н. М.В. Безрукова (1963-2022), к.б.н. И.А. Яхин (1947-2025), к.б.н. Р.А. Фатхутдинова, к.б.н. Г.А. Геращенков, к.б.н. Н.А. Рожнова, к.б.н. Сахабутдинова А.Р., к.б.н. Е.Н. Балахонцев, к.б.н. М.С. Юмагужин, к.б.н. Ф.Ф. Исхаков.

В 2020-2024 гг лабораторию возглавляла кандидат биологических наук Оксана Владимировна Ласточкина, с приходом которой в лаборатории стало активно развиваться направление по исследованию роли растительно-микробных взаимодействий в повышении устойчивости растений к неблагоприятным факторам среды.

С 2024 г. заведующий лабораторией – кандидат биологических наук Азамат Мэлсович Авальбаев, под руководством которого лаборатория продолжает исследования по традиционным для нее направлениям, а также начаты работы по изучению молекулярно-генетических маркеров адаптационного потенциала растений.

Сотрудники лаборатории молекулярных механизмов устойчивости растений к стрессам

ИБГ УФИЦ РАН (2022 г.)

Состав лаборатории

Ласточкина
Оксана Владимировна

к.б.н., с.н.с.

Масленникова Дилара Ринатовна

к.б.н., н.с.

Юлдашев
Руслан Адикович

к.б.н., н.с.

Лубянова
Алсу Ринатовна,

к.б.н., н.с.

Яхин
Олег Ильдусович

к.б.н., с.н.с.

Аллагулова
Чулпан Рифовна

к.б.н., н.с.

Коряков
Игорь Сергеевич

м.н.с.

Плотников
Антон Александрович

ст. лаборант

 Основные результаты, полученные за последние 5 лет

Выявлен разный ответ к предобработке 24-эпибрассинолидом (ЭБ) различающихся по стратегии адаптации к засухе экотипов пшеницы на начальном этапе онтогенеза. ЭБ повышал устойчивость растений степного волжского экотипа к дефициту влаги, в основе чего лежит нивелирование ЭБ резких стресс-индуцированных сдвигов в уровне эндогенных фитогормонов и накопление защитного белка агглютинина зародыша пшеницы (АЗП). Отсутствие защитного эффекта ЭБ на растения лесостепного западно-сибирского экотипа связано с их нечувствительностью к предпосевной обработке ЭБ, что отразилось в сохранении индуцированного засухой существенного дисбаланса в эндогенной гормональной системе и небольшого уровня накопления АЗП (Avalbaev et al. 2025).

Впервые выявлено, что важный вклад в реализацию протекторного эффекта ЭБ на растения пшеницы в условиях засухи вносит предотвращение стресс-индуцируемого усиления суммарного дыхания и доли цианидрезистентного альтернативного пути дыхания, а также снижении интенсивности гликолиза (Avalbaev et al., 2024).

Выявлен пролонгированный защитный эффект салициловой кислоты (СК) на растения пшеницы к дефициту влаги, существенный вклад в реализацию которого вносит регуляция фитогормоном компонентов аскорбат-глутатионового цикла – повышения содержания неферментативных антиоксидантов глутатиона и аскорбата с параллельной активацией глутатионредуктазы и аскорбатпероксидазы. Наряду с этим, была выявлена способность салициловой кислоты повышать элементы структуры урожая (масса 1000 зерен, длина колоса) и увеличивать содержание заменимых (валин, лейцин + изолейцин, метионин, триптофан, фенилаланин, лизин, треонин, гистидин) и незаменимых (аргинин, серин, пролин, глицин, аланин, цистеин) аминокислот в зерне (Maslennikova et al., 2024).

Выявлен протекторный эффект оксида азота (NO) на растения пшеницы в условиях засухи, в основе чего лежит снижение NO дисбаланса эндогенной гормональной системы и повышение транскриптов TADHN гена дегидрина (Allagulova et al., 2023). Впервые выявлено, что важный вклад в проявление предадаптирующего и защитного действия NO на растения пшеницы при засолении вносит активация в норме метаболизма фенилпропаноидов, включая повышение активности фенилаланин-аммиак-лиазы, тирозин-аммиак-лиазы, пероксидазы, уровня экспрессии генов TaPAL, TaPRX и усиление лигнификации корней (Maslennikova et al., 2023).

Выявлена способность эндофитных Bacillus subtilis при дефиците влаги положительно регулировать водный баланс (интенсивность транспирации, осмотический потенциал, относительное содержание воды) проростков яровой и озимой пшеницы, тем самым повышая их устойчивость на клеточном и организменном уровнях (Lubyanova et al., 2023).

Впервые с использованием ингибитора биосинтеза салициловой кислоты 1-аминобензотриазола выявлена важная роль эндогенной СК как гормонального интермедиата в реализации защитного действия бактерий-эндофитов Bacillus subtilis на контрастные по засухоустойчивости растения пшеницы в условиях обезвоживания (Lastochkina et al., 2022).

Обнаружено, что оксид азота повышает устойчивость растений пшеницы к солевому стрессу через регуляцию компонентов аскорбат-глутатионового цикла, содержания хлорофиллов и стабилизацию клеточных мембран (Maslennikova et al., 2022).

Выявлено ростстимулирующее действие 24-эпибрассинолида на растения пшеницы, в основе которого лежит повышение содержания фотосинтетических белков и активация их фосфорилирования по тирозину (Avalbaev et al., 2021a). Выявлен сходный защитный эффект метилжасмоната (МеЖ) и цитокинина 6-бензиламинопурина (БАП) на растения пшеницы в условиях засоления, в основе которого лежит активация под их влиянием системы антиоксидантной защиты (Avalbaev et al., 2021b).

Получены приоритетные данные о способности бактерий-эндофитов Bacillus subtilis штамм-специфически улучшать рост растений фасоли при засолении и оказывать антистрессовый эффект посредством усиления отложения лигнина в корнях и снижения окислительных и осмотических повреждений клеток (Lastochkina et al., 2021). Обнаружено, что в условиях дефицита влаги важную роль в Bacillus-индуцированное снижение окислительных повреждений засухоустойчивых и засухочувствительных растений пшеницы играют аскорбат и глутатион, соответственно (Maslennikova, Lastochkina 2021).

Получены приоритетные данные о важной роли AЗП и дегидринов в проявление защитного эффекта 24-эпибрассинолида и метилжасмоната, соответственно, на растения пшеницы в условиях засухи. Выявлено, что ЭБ повышает уровень AЗП в корнях пшеницы и усиливает его экскрецию во внешнюю среду, что приводит к предотвращению стресс-индуцированного торможения деления клеток апикальной меристемы корней (Avalbaev еt al., 2020). Продемонстрировано, что МеЖ усиливает транскрипцию TADHN гена и накопление белков дегидринов в растениях пшеницы в норме и при засухе, что отражается в меньшей степени повреждающего действия стрессора на уровне клеточных структур и целого растения (Allagulova et al., 2020).

Основные научные публикации лаборатории

Статьи в научных журналах (за 2020-2025 гг):

Avalbaev, A.; Yuldashev, R.; Plotnikov, A.; Allagulova, C. A comparative analysis of the effect of 24-epibrassinolide on the tolerance of wheat cultivars with different drought adaptation strategies under water deficit conditions // Plants 2025, 14, 869. https://doi.org/10.3390/plants14060869 (WoS Q1)

Avalbaev A, Fedyaev V, Lubyanova A, Yuldashev R, Allagulova C. 24-Epibrassinolide reduces drought-induced oxidative stress by modulating the antioxidant system and respiration in wheat seedlings // Plants 2024, 13(2):148. https://doi.org/10.3390/plants13020148 (WoS Q1)

Maslennikova D, Knyazeva I, Vershinina O, Titenkov A, Lastochkina O. Contribution of antioxidant system components to the long-term physiological and protective effect of salicylic acid on wheat under salinity conditions // Plants 2024, 13(11):1569. https://doi.org/10.3390/plants13111569 (WoS Q1)

Lubyanova A, Allagulova C. Exogenous sodium nitroprusside affects the redox system of wheat roots differentially regulating the activity of antioxidant enzymes under short-time osmotic stress // Plants 2024, 13(14):1895. https://doi.org/10.3390/plants13141895 (WoS Q1)

Vatankhah A., Reezi S., Izadi Z., Ghasemi‑Varnamkhasti M., Torkaman Z., Moosavi‑Nezhad M., Lastochkina O., Aliniaeifard S. Impact of Rhizobium radiobacter inoculation on physiological stresses and nutrients of grafted rose (Rosa hybrida L.) cultivars // Journal of Plant Growth Regulation 2024. V. 43. P. 1247–1259. https://doi.org/10.1007/s00344-023-11180-z (WoS Q1)

Markova O, Garipova S, Chistoedova A, Matyunina V, Lubyanova A, Lastochkina O, Garipov A, Shpirnaya I, Pusenkova L. Predicting field effectiveness of endophytic bacillus subtilis inoculants for common bean using morphometric and biochemical markers // Plants 2024, 13(13):1769. https://doi.org/10.3390/plants13131769 (WoS Q1)

Yurkov A.P., Kryukov A.A., Gorbunova A.O., Kudriashova T.R., Kovalchuk A.I., Gorenkova A.I., Bogdanova E.M., Laktionov Y.V., Zhurbenko P.M., Mikhaylova Y.V., Puzanskiy R.K., Bagrova T.N., Yakhin O.I., Rodionov A.V., Shishova M.F. Diversity of arbuscular mycorrhizal fungi in distinct ecosystems of the north caucasus, a temperate biodiversity hotspot // Journal of Fungi 2024, 10:11. https://doi.org/10.3390/jof10010011 (WoS Q1)

Reut A., Biglova A., Allayarova I., Aliniaeifard S., Gruda N.S., Lastochkina O. Alteration of growth, phenology, and yield of lily flowers through the synergetic effect of light spectra and endophytic bacterial priming // South African Journal of Botany 2024. V. 167, P. 597-611. https://doi.org/10.1016/j.sajb.2024.03.001 (WoS Q2)

Pusenkova L.I., Lastochkina O.V. Enhancing disease resistance in plants and stored potato tubers through inoculation of seed tubers with the endophyte Bacillus subtilis 10-4 and genomic analysis of its antimicrobial properties // Applied Biochemistry and Microbiology 2024. V. 60, No. 6. P. 1338–1350. 10.1134/S0003683824605304 (WoS Q4)

Авальбаев А.М., Юлдашев Р.А., Аллагулова Ч.Р., Плотников А.А., Ласточкина О.В. Анализ засухоустойчивости различающихся по стратегии адаптации к засухе растений пшеницы Triticum aestivum L. на начальном этапе онтогенеза // Сельскохозяйственная биология 2024. Т. 59, № 1. С. 131-141. 10.15389/agrobiology.2024.1.131rus (WoS)

Maslennikova D.R., Ivanov S.P., Petrova S.F., Lastochkina O. Components of the ascorbate-glutathione complex and phenylpropanoid pathway in the implementation of the protective effect of salicylic acid on wheat plants under salinity // Russian Journal of Plant Physiology 2024, 71:8. https://doi.org/10.1134/S1021443723603658 (WoS Q3)

Allagulova CR, Lubyanova AR, Avalbaev AM. Multiple ways of nitric oxide production in plants and its functional activity under abiotic stress conditions // International Journal of Molecular Sciences. 2023, 24(14):11637. doi: 10.3390/ijms241411637 (WoS Q1)

Maslennikova, D.; Knyazeva, I.; Vershinina, O.; Titenkov, A.; Lastochkina, O. Seed treatment with sodium nitroprusside ensures a long-term physiological and protective effect on wheat under salinity // Life 2023, 13, 1499. https://doi.org/10.3390/life13071499 (WoS Q1)

Maslennikova, D.; Ivanov, S.; Petrova, S.; Burkhanova, G.; Maksimov, I.; Lastochkina, O. Components of the phenylpropanoid pathway in the implementation of the protective effect of sodium nitroprusside on wheat under salinity // Plants 2023, 12, 2123. https://doi.org/10.3390/plants12112123 (WoS Q1)

Lastochkina O., Bosacchi M. Potential roles of PGPMs in wheat adaptation and tolerance under herbicide and drought stresses combination // Turkish Journal of Agriculture and Forestry 2023, 47(5): 688-712.  doi:10.55730/1300-011X.3121 (WoS Q1)

Pusenkova L., Lastochkina O., Ercişli, S. The potential of hydroponic seed minituber enrichment with the endophyte Bacillus subtilis for improving the yield components and quality of potato (Solanum tuberosum L.) // Agriculture 2023, 13(8), 1626. https://doi.org/10.3390/agriculture13081626 (WoS Q1)

Lastochkina O., Yakupova A., Avtushenko I., Lastochkin A., Yuldashev R. Effect of seed priming with endophytic Bacillus subtilis on some physio-biochemical parameters of two wheat varieties exposed to drought after selective herbicide application // Plants 2023, 12(8):1724. https://doi.org/10.3390/plants12081724 (WoS Q1)

Lubyanova A.R.; Allagulova C.R.; Lastochkina O.V. The effects of seed pretreatment with endophytic bacteria Bacillus subtilis on the water balance of spring and winter wheat seedlings under short-time water deficit // Plants. 2023, 12, 2684. https://doi.org/10.3390/plants12142684 (WoS Q1)

Maslennikova D, Koryakov I, Yuldashev R, Avtushenko I, Yakupova A, Lastochkina O. Endophytic plant growth-promoting bacterium Bacillus subtilis reduces the toxic effect of cadmium on wheat plants // Microorganisms 2023, 11(7):1653. https://doi.org/10.3390/microorganisms11071653 (WoS Q2)

Аллагулова Ч.Р., Юлдашев Р.А., Авальбаев А.М. Участие оксида азота в регуляции развития растений и их устойчивости к дефициту влаги // Физиология растений. 2023. Т. 70. № 2. С. 115-132. DOI: 10.31857/S0015330322600437 (WoS Q3)

Ласточкина О.В., Гарипова С.Р., Пусенкова Л.И., Гаршина Д.Ю., Баймиев Ан.Х., Коряков И.С. Влияние эндофитных бактерий Bacillus subtilis на рост проростков и лигнификацию корней Pisum sativum L. в норме и в условиях натрий-хлоридного засоления // Физиология растений. 2023, Т. 70, №5, С. 514-525. DOI: 10.31857/S0015330322600838 (WoS Q3)

Ласточкина О.В., Аллагулова Ч.Р. Механизмы рост-стимулирующего и защитного действия эндофитных PGP-бактерий в растениях пшеницы при воздействии засухи (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2023, T. 59, №1. С. 17-37. DOI: 1 0.31857/S0555109923010038 (WoS Q4)

Lastochkina O., Aliniaeifard S., SeifiKalhor M., Bosacchi M., Maslennikova D., Lubyanova A. Novel approaches for sustainable horticultural crop production: advances and prospects // Horticulturae. 2022. V. 8(10). P. 910. https://doi.org/10.3390/horticulturae8100910 (WoS Q1)

Lastochkina O., Pusenkova L., Garshina D., Kasnak C., Palamutoglu R., Shpirnaya I., Mardanshin I., Maksimov I. Improving the biocontrol potential of endophytic bacteria Bacillus subtilis with salicylic acid against Phytophthora infestans-caused postharvest potato tuber late blight and impact on stored tubers quality // Horticulturae. 2022. V. 8(2). P. 117. https://doi.org/10.3390/horticulturae8020117 (WoS Q1)

Garipova S.R., Markova O.V., Fedorova K.A., Dedova M.A., Iksanova M.A., Kamaletdinova A.A., Lastochkina O.V., Pusenkova L.I. Malondialdehyde and proline content in bean cultivars following the inoculation with endophytic bacteria // Acta Physiologiae Plantarum. 2022. V. 44 (89). https://doi.org/10.1007/s11738-022-03427-1 (WoS Q2)

Maslennikova D.R., Lastochkina O.V., Shakirova F.M. Exogenous sodium nitroprusside improves salt stress tolerance of wheat (Triticum aestivum L.) via regulating the components of ascorbate-glutathione cycle, chlorophyll content and stabilization of cell membranes state // Russian Journal of Plant Physiology, 2022, Vol. 69:130. № 6. P. 1-12. DOI: 10.1134/S102144372206019X (WoS Q3)

Аллагулова Ч.Р., Авальбаев А.М., Лубянова А.Р., Ласточкина О.В., Шакирова Ф.М. Современные представления о механизмах образования оксида азота в растениях // Физиология растений. 2022. T. 69. № 4. С. 339-351. 10.31857/S0015330322030034 (WoS Q3)

Avalbaev A., Yuldashev R., Fedorova K., Petrova N., Fedina E., Gilmanova R., Karimova F., Shakirova F. 24-epibrassinolide-induced growth promotion of wheatseedlings is associated with the changes in proteome and tyrosine phosphoproteome // Plant Biology. 2021a. 23: 456-463. https://doi.org/10.1111/plb.13233 (WoS Q1)

Avalbaev A., Allagulova Ch., Maslennikova D., Fedorova K., Shakirova F. Methyl jasmonate and cytokinin mitigate the salinity-induced oxidative injury in wheat seedlings // Journal of Plant Growth Regulation. 2021b. 40: 1741–1752. https://doi.org/10.1007/s00344-020-10221-1 (WoS Q1)

Lastochkina O., Aliniaeifard S., Garshina D., Garipova S., Pusenkova L., Allagulova Ch., Fedorova K., Baymiev A., Koryakov I., Sobhani M. Seed priming with endophytic Bacillus subtilis strain-specifically improves growth of Phaseolus vulgaris plants under normal and salinity conditions and exerts anti-stress effect through induced lignin deposition in roots and decreased oxidative and osmotic damages // Journal of Plant Physiology. 2021. 263:153462. https://doi.org/10.1016/j.jplph.2021.153462 (WOS Q1)

Maslennikova D., Lastochkina O. Contribution of ascorbate and glutathione in endobacteria Bacillus subtilis-mediated drought tolerance in two Triticum aestivum L. genotypes contrasting in drought sensitivity // Plants. 2021. 10(12):2557. https://doi.org/10.3390/plants10122557 (WoS Q1)

Безрукова М.В., Кудоярова Г.Р., Лубянова А.Р., Масленникова Д.Р., Шакирова Ф.М. Влияние 24-эпибрассинолида на водный обмен отличающихся по засухоустойчивости сортов пшеницы при осмотическом стрессе // Физиология растений. 2021. 68(2):161-169. doi: 10.31857/S0015330321010048 (WoS Q3)

Лубянова А.Р., Безрукова М.В., Шакирова Ф.М. Взаимодействие сигнальных путей при формировании защитных реакций растений в ответ на стрессовые факторы окружающей среды // Физиология растений. 2021. 68(6):563-578. doi: 10.31857/S0015330321060129 (WoS Q3)

Ласточкина О.В. Адаптация и устойчивость растений пшеницы к засухе, опосредованная природными регуляторами роста Bacillus spp.: механизмы реализации и практическая значимость (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2021. 56(5):843-867. doi: 10.15389/agrobiology.2021.5.843rus (WoS)

Avalbaev A., Bezrukova M., Allagulova Ch., Lubyanova A., Kudoyarova G., Fedorova K., Maslennikova D., Yuldashev R., Shakirova F. Wheat germ agglutinin is involved in the protective action of 24-epibrassinolide on the roots of wheat seedlings under drought conditions // Plant Physiology and Biochemistry. 2020. 146:420-427. doi.org/10.1016/j.plaphy.2019.11.038 (WoS Q1)

Lastochkina O., Garshina D., Ivanov S., Yuldashev R., Khafizova R., Allagulova Ch., Fedorova K., Avalbaev A., Maslennikova D., Bosacchi M. Seed priming with endophytic Bacillus subtilis modulates physiological responses of two different Triticum aestivum L. cultivars under drought stress // Plants. 2020. 9(12):1810. doi.org/10.3390/plants9121810 (WoS Q1)

Lastochkina O.; Pusenkova L.; Garshina D.; Yuldashev R.; Shpirnaya I.; Kasnak C.; Palamutoglu R.; Mardanshin I.; Garipova S.; Sobhani M.; Aliniaeifard S. The effect of endophytic bacteria Bacillus subtilis and salicylic acid on some resistance and quality traits of stored Solanum tuberosum L. tubers infected with fusarium dry rot // Plants. 2020. 9(6):738. https://doi.org/10.3390/plants9060738 (WoS Q1)

Lastochkina O., Baymiev, A., Shayahmetova A., Garshina D., Koryakov I., Shpirnaya I., Pusenkova L., Mardanshin I., Kasnak C., Palamutoglu R. Effects of endophytic Bacillus subtilis and salicylic acid on postharvest diseases (Phytophthora infestans, Fusarium oxysporum) development in stored potato tubers // Plants. 2020. 9:76. https://doi.org/10.3390/plants9010076 (WoS Q1)

Lastochkina O., Garshina D., Allagulova C., Fedorova K., Koryakov I., Vladimirova A. Application of endophytic Bacillus subtilis and salicylic acid to improve wheat growth and tolerance under combined drought and Fusarium root rot stresses // Agronomy. 2020. 10:1343. https://doi.org/10.3390/agronomy10091343 (WoS Q1)

Allagulova Ch., Avalbaev A., Fedorova K., Shakirova F.M. Methyl jasmonate alleviates water stress-induced damages by promoting dehydrins accumulation in wheat plants // Plant Physiology and Biochemistry. 2020. 155:676-682. doi.org/10.1016/j.plaphy.2020.07.012 (WoS Q1)

 

Книги, главы в книгах (2020-2025)

Lastochkina O. (2020). Bacillus subtilis-mediated abiotic stress tolerance in plants. (Eds: Islam, M.T ., Rahman, M.M., Pandey, P., Jha, C.K., Aeron, A.) In book: Bacilli and Agrobiotechnology. Springer Nature, Switzerland AG. Chapter 13. pp.97-133. https://www.springer.com/gp/book/9783030151744 (WOS)

Aliniaeifard S., Shomali A., Seifikalhor M., Lastochkina O. Calcium signaling in plants under drought // Глава в монографии: Salt and Drought Stress Tolerance in Plants. Signaling and Communication in Plants. Hasanuzzaman M., Tanveer M. (eds.). Springer, Cham. 2020. P. 259-298. https://doi.org/10.1007/978-3-030-40277-8_10

Патенты

Ласточкина О.В., Пусенкова Л.И. (2025) Патент RU 2 833 076 С1. Способ выращивания обогащенного антоцианами листового салата. (Патентообладатель УФИЦ РАН).

Наиболее значимые публикации за предыдущие годы:

  1. Шакирова Ф.М. Неспецифическая устойчивость растений к стрессовым факторам и ее регуляция. Уфа: Гилем, 2001. – 160 с.
  2. Авальбаев А.М., Безрукова М.В., Шакирова Ф.М. Множественная гормональная регуляция содержания лектина в корнях проростков пшеницы // Физиология растений. 2001. Т. 48. № 5. С. 718-722.
  3. Shakirova F. M., Avalbaev A.M., Bezrukova M.V., Gimalov F.R. Induction of wheat germ agglutinin synthesis by abscisic and gibberellic acids in roots of wheat seedlings // Plant Growth Regulation. 2001. V. 33. P. 111-115.
  4. Авальбаев А.М., Безрукова М.В., Шакирова Ф.М. Влияние брассиностероидов на гормональный баланс в проростках пшеницы // Доклады Академии Наук. 2003. Т. 39. № 3. С. 1-3.
  5. Shakirova F., Sakhabutdinova A., Bezrukova M., Fatkhutdinova D., Fatkhutdinova R. Changes in the hormonal status of wheat seedlings induced by salicylic acid and salinity // Plant Science. 2003. V. 164. P. 317-322.
  6. Аллагулова Ч.Р., Гималов Ф.Р., Шакирова Ф.М., Вахитов В.А. Дегидрины растений: их структура и предполагаемые функции // Биохимия. 2003. Т. 68. С. 1157-1165.
  7. Shakirova F.M., Kildibekova A.R., Bezrukova M.V., Avalbaev A.M. Wheat germ agglutinin regulates cell division in wheat seedling roots // Plant Growth Regulation. 2004. V. 42. P. 175-180.
  8. Авальбаев А.М., Юлдашев Р.А., Высоцкая Л.Б., Шакирова Ф.М. Регуляция 24-эпибрассинолидом экспрессии гена и активности цитокининоксидазы в корнях проростков пшеницы // Доклады академии наук. 2006. Т. 410. № 6. С. 825-827.
  9. Аллагулова Ч.Р., Гималов Ф.Р., Авальбаев А.М., Сахабутдинова А.Р., Юлдашев Р.А., Шакирова Ф.М. Структура дегидрин-подобного гена TADHN пшеницы и активация его экспрессии АБК и 24-эпибрассинолидом // Физиология растений. 2007. Т. 54, №1. С. 131-136.
  10. Bezrukova M., Kildibekova A., Shakirova F. WGA reduces the level of oxidative stress in wheat seedlings under salinity // Plant Growth Regulation. 2008. V. 54. P. 195-201.
  11. Zubo Y.O., Yamburenko M.V., Selivankina S.Y., Shakirova F.M., Avalbaev A.M., Kudryakova N.V., Zubkova N.K., Liere K., Kulaeva O.N., Kusnetsov V.V., Borner T. Cytokinin stimulates chloroplast transcription in detached barley leaves // Plant Physiology. 2008. V. 148. P. 1082–1093.
  12. Yuldashev R., Avalbaev A., Bezrukova M., Vysotskaya L., Khripach V., Shakirova F. Cytokinin oxidase is involved in the regulation of cytokinin content by 24-epibrassinolide in wheat seedlings // Plant Physiology and Biochemistry. 2012. V. 55. P. 1-6.
  13. Shakirova F., Avalbaev A., Bezrukova M., Fatkhutdinova R., Maslennikova D., Yuldashev R., Allagulova C., Lastochkina O. Hormonal intermediates in the protective action of exogenous phytohormones in wheat plants under salinity. Chapter 9. In book “Phytohormones and abiotic stress tolerance in plants”. Eds. Khan N., Nazar R., Iqbal N., Anjum N. Springer. 2012. P. 185-228.
  14. Avalbaev A., Yuldashev R., Fedorova K., Somov K., Vysotskaya L., Allagulova Ch., Shakirova F. Exogenous methyl jasmonate regulates cytokinin content by modulating cytokinin oxidase activity in wheat seedlings under salinity // Journal of Plant Physiology. 2016. V. 191. P. 101-110.
  15. Shakirova F.M., Allagulova Ch.R., Maslennikova D.R., Klyuchnikova E.O., Avalbaev A.M., Bezrukova M.V. Salicylic acid-induced protection against cadmium toxicity in wheat plants // Environmental and Experimental Botany. 2016. V. 122. P. 19-28.

Гранты фондов

2025-2027 гг. Грант РНФ № 25-16-00188. «Молекулярная регуляция эндофитами устойчивости пшеницы к множественным абиотическим стрессам: роль метаболических и метагеномных перестроек». Руководитель – Ласточкина О.В.

2025-2026 гг. Грант РНФ №25-26-00324 «Микробиом семян сортов яровой мягкой пшеницы лесостепной урало-сибирской агроэкологической группы как источник эндофитных бактерий – биоиндукторов защитных систем для повышения адаптивного потенциала и устойчивости растений». Руководитель – Юлдашев Р.А.

2023-2024 гг. Грант РНФ №23-26-00246 «Механизмы засухоустойчивости и модуляция этого процесса брассиностероидами у различающихся по стратегии адаптации к засухе экотипов мягкой пшеницы». Руководитель – Авальбаев А.М.

2022-2023 гг. Грант РНФ №22-26-00076 «Бактерии-эндофиты Bacillus subtilis как биомодуляторы адаптивных реакций пшеницы к комбинированному воздействию засухи и гербицидов». Руководитель – Ласточкина О.В.

2022-2023 гг. Грант РНФ 22-24-000196 «Вклад дегидринов в реализацию протекторных эффектов оксида азота на растения двух различающихся по засухоустойчивости сортов пшеницы при воздействии водного стресса». Руководитель – Аллагулова Ч.Р.

2021 г. Грант РФФИ №20-145-0236 «Взаимодействий сигнальных путей при формировании защитных реакций растений в ответ на стрессовые факторы окружающей среды». Руководитель – Лубянова А.Р.

2021 г. Грант РФФИ №20-116-50151 «Адаптация и устойчивость растений пшеницы к засухе, опосредованная природными регуляторами роста Bacillus spp.: механизмы реализации и практическая значимость». Руководитель – Ласточкина О.В.

2020-2022 гг. Грант РФФИ №20-04-00904 «Молекулярные механизмы протекторного действия оксида азота на проростки пшеницы в условиях обезвоживания». Руководитель – Шакирова Ф.М.

2019-2021 гг. Грант РФФИ №19-016-00035 «Роль эндогенной салициловой кислоты в формировании индуцируемой эндофитными бактериями Bacillus subtilis засухоустойчивости Triticum aestivum L. разныхcагроэкологических групп (лесостепного западносибирского и степного волжского)». Руководитель – Ласточкина О.В.

2019-2020 гг. Грант Президента РФ № МК-643.2019.11 «Эндофитные бактерии Bacillus subtilis и сигнальная молекула салициловая кислота как модуляторы защитных систем Triticum aestivum L. к множественным (биотическим/абиотическим) стрессам». Руководитель – Ласточкина О.В.

2017-2019 гг. Грант РФФИ №17-04-01853 «Молекулярные механизмы защитного действия метилжасмоната на растения пшеницы в условиях нарушения водного режима». Руководитель – Шакирова Ф.М.

2014 г. Грант Президента РБ (договор от 25.02. 2014 г.) «Салициловая кислота как индуктор устойчивости пшеницы к токсическому действию кадмия». Руководитель – Масленникова Д.Р.

2014-2016 гг. Грант РФФИ №14-04-00731 «Гормональная регуляция устойчивости пшеницы к обезвоживанию: вклад протеомных перестроек в этот процесс». Руководитель – Шакирова Ф.М.

 

              Заведующая лабораторией – Вахитова Юлия Венеровна,

              доктор биологических наук, чл.-корр. РАН

             Тел: +7 (347) 235-60-88

              e-mail: juvv73@gmail. com

 

Основные направления научной деятельности

– механизмы миграции и адгезии Т-клеток в норме и при рассеянном склерозе: роль глутамата и глутаматных рецепторов

-скрининг биологически активных веществ с использованием тест-систем in vitro и in vivo для поиска природных и синтетических соединений, обладающих противоопухолевой, кардиотропной, нейротропной, иммуномодулирующей и другими видами активности и анализ механизмов их действия

Краткая история лаборатории

Лаборатория молекулярной фармакологии и иммунологии была образована в 2008 году на базе тематической группы фармакогеномики

Первый состав лаборатории: Антипина (Фарафонтова) Е,  Зайнуллина Л.Ф, Зилеева  З.Р., Салимгареева М.Х., Садовников С.В., Ямиданов  Р.А.,  Фаткуллина (Кузьмина ) У.Ш., Хасанова (Ишметова) Д.В. Максимова (Литвинова)  М.А.

Действующий состав лаборатории: Вахитов В.А., Зилеева З.Р. , Шеин М.Ю, Алексеев В.Ю., Тухватуллин А.В., Ишметова Д.В. (совместитель), стажеры  Баишева А.Р.,  Муртазина Л.С., Юлдашева А.А.

Заведующая лабораторией – доктор биологических наук, чл.-корр. РАН Ю.В.Вахитова (с 2008 г. по настоящее время)

Состав лаборатории

 

Вахитов Венер Абсатарович, гнс, дбн, профессор, академик АН РБ

Зилеева Зульфия Рустамовна, мнс

Алексеев Валентин Юрьевич, мнс, кбн

Шеин Михаил Юрьевич, мнс, кбн

Ишметова Диана Валеевна, мнс

Тухватуллин Артур Вадимович, мнс

Баишева Адель Рафаилевна, стажер

Муртазина Лейсан Салаватовна, стажер

Юлдашева Айсылу Айратовна, стажер

 

 

Основные результаты, полученные за последние 5 лет

Впервые показано участие коагониста NMDA рецепторов глицина и антагониста этого типа рецепторов глутамата кинуреновой кислоты в регуляции адгезии иммунокомпетентных клеток к эндотелиоцитам.

Впервые показано участие глутаматных рецепторов в регуляции активности компонентов путей внутриклеточной сигнализации, опосредующих адгезию и миграцию иммунных клеток к эндотелию.

Впервые исследовано влияние агонистов и антагонистов ионотропных рецепторов глутамата на адгезию антиген-стимулированных Т-лимфоцитов, полученных от здоровых лиц и больных РС, к эндотелиальным клеткам HUVEC в модели воспаления in vitro. Установлено, что селективная стимуляция ионотропных NMDA- и AMPA-рецепторов глутамата приводит к снижению адгезии неактивированных и активированных Т-лимфоцитов к клеткам HUVEC во всех исследуемых группах. Показано, что Т-лимфоциты больных РС в стадии обострения являются наиболее чувствительными к действию лигандов глутаматных рецепторов

Изучено влияние агонистов и антагонистов ионотропных рецепторов глутамата на экспрессию молекулы адгезии VLA-4 в эффекторных субпопуляциях Т-лимфоцитов больных рассеянным склерозом в разных стадиях заболевания. Показано, что глутамат снижает экспрессию VLA-4 в группе больных РС в стадии обострения, при этом, не оказывая влияния на экспрессию VLA-4 Т-клетками у здоровых доноров и больных РС в стадии ремиссии. Блокатор AMPA-рецепторов глутамата NBQX снижает экспрессию VLA-4 среди Т-клеток 1, 17, 17.1 типа у здоровых доноров, в то время как у больных в зависимости от стадии заболевания наблюдается разнонаправленный ответ. Наибольшая выраженность действия лигандов рецепторов наблюдается среди Т-клеток в группе больных РС в стадии обострения.

С целью поиска биологически активных соединений с потенциальными противоопухолевыми свойствами исследовано более ста производных разных классов химических соединений. Выявлены соединения, проявляюшие высокую цитотоксическую активность по отношению к культивируемым опухолевым клеточным линиям колоректальной карциномы человека, аденокарциномы молочной железы человека, карциномы легкого человека,гепатоцеллюлярной карцином человека, нейробластомы и др. Установлено, что основным механизмом проявления их цитотоксического эффекта  является нарушение ими цикла клеточного деления.  Данные исследования проводятся совместно с сотрудниками УФИХ УНЦ РАН, ИНК УФИЦ РАН, УУНИТ и УГНТУ.

 

Основные научные публикации лаборатории

Synthesis of conjugates of (−)-cytisine derivatives with ferrocene-1-carbaldehyde and their cytotoxicity against HEK293, Jurkat, A549, MCF-7 and SH-SY5Y cells. Inna P. Tsypysheva; Alena V. Koval’skaya; Polina R. Petrova; Alexander N. Lobov; Alexey S. Erastov; Zulfia R. Zileeva; Vener А. Vakhitov; Yulia V. Vakhitova.  // Tetrahedron, 2020, V.76, № 7, p. 130902; DOI: 10.1016/j.tet.2019.130902

Synthesis of (1S*,2R*,3R*)- and (1S*,2R*,3S*)-N-arylsulfonyl-2-(1-halogenethyl)-3-methylindolines and their selective toxicity against SH-SY5Y cell line. Rail R. Gataullin, Zulfia R. Zileeva, Marina A. Maksimova, Liana F. Zainullina, and Yuliya V. Vakhitova // Journal of Heterocyclic Chemistry, 2020, DOI: 10.1002/jhet.3861

Synthesis of conjugates of (−)-cytisine derivatives with ferrocene-1-carbaldehyde and their cytotoxicity against hek293, jurkat, a549, mcf-7 and sh-sy5y cells Tsypysheva I.P., Koval’skaya A.V., Petrova P.R., Lobov A.N., Erastov A.S., Zileeva Z.R., Vakhitov V.А., Vakhitova Y.V. Tetrahedron. 2020. Т. 76. № 7. С. 130902.

Синтез и цитотоксическая активность ряда функционализированных 2,3-алленоатов Р.Н. Маликова, И.М. Сахаутдинов, М.А. Максимова, У.Ш. Кузьмина, Ю.В. Вахитова, М.С. Юнусов // Биоорганическая химия, 2020. Т. 46. № 1. С. 101-105

The role of glutamate in the pathogenesis of multiple sclerosis
Kuzmina U.S., Zainullina L.F., Vakhitov V.A., Vakhitova Y.V., Bakhtiyarova K.Z.
Neuroscience and Behavioral Physiology. 2020. Т. 50. № 6. С. 669-675.

Эпигенетические механизмы патогенеза рассеянного склероза
Вахитов В.А., Кузьмина У.Ш., Бахтиярова К.З., Зайнуллина Л.Ф., Максимова М.А., Зилеева З.Р., Вахитова Ю.В. Физиология человека. 2020. Т. 46. № 1. С. 123-132.

Synthesis of new 1,3-thiazol derivatives of maleopimaric acid as anticancer, antibacterial and antifungal agents
Sultanova R.M., Lobov A.N., Shumadalova A.V., Meshcheryakova S.A., Zileeva Z.R., Khusnutdinova N.S., Vakhitov V.A., Vakhitova Y.V. Natural Product Research. 2021. Т. 35. № 8. С. 1340-1348.

Cytotoxicity of novel cross-conjugated arylated cyclopentene-1,3-diones Egorov V.A., Khasanova L.S., Gimalova F.A., Lobov A.N., Miftakhov M.S., Ishmetova D.V., Vakhitov V.A.
Mendeleev Communications. 2022. Т. 32. № 2. С. 183-185.

 Synthesis and cytotoxic activity of some (+)-salsolidine derivatives. Alena Koval’skaya, Arthur Gil’mutdinov, Alexander Lobov, Dmitry Tsypyshev, Vener Vakhitov, Inna Tsypysheva, Vladimir Dokichev & Yulia Vakhitova (24 Oct 2023):  Natural Product Research,  DOI: 10.1080/14786419.2023.2273924

Synthesis of fusidane triterpenoid Mannich bases as potential antibacterial and antitumor agents Salimova E.V., Parfenova L.V., Ishmetova D.V., Zainullina L.F., Vakhitova Yu.V.  // Natural Product Research. 2023. DOI: 10.1080/14786419.2022.2163483

Synthesis and cytotoxic activity of new hexaazadibenzotetracenes derived from trans-1,2-diaminocyclohexane Rakhimova E.B., Kirsanov V.Yu., Kuzmina U.Sh., Galyautdinov I.V.,Vakhitova  Yu.V.  // Mendeleev Commun. 2023. Т. 33. С. 112–114.  DOI: 10.1016/j.mencom.2023.01.035

Synthesis and comparative analysis of the cytotoxicity and mitochondrial effects of triphenylphosphonium and f16 maslinic and corosolic acid hybrid derivatives Spivak A.Yu., Kuzmina U.Sh., Nedopekina D.A., Dubinin M.V., Khalitova R.R., Davletshin E.V., Vakhitova Yu.Y., Belosludtsev K.N., Vakhitov V.A. Steroids. 2024. Т. 209. С. 109471.

Молекулярные комплексы тритерпеновых гликозидов с натриевой солью 5-фторурацила: спектральные характеристики и цитотоксическая активность Гибадуллина Н.Н., Яковишин Л.А., Гришковец В.И., Спирихин Л.В., Вахитов В.А., Ишметова Д.В., Докичев В.А. Известия Академии наук. Серия химическая. 2024. Т. 73. № 1. С. 179-188.

Синтез и цитотоксическая активность производных 1,5,6,7-тетрагидроиндол-4-она и его тиоаналога Сорокина В.А., Цыпышев Д.О., Ковальская А.В., Вахитов В.А., Цыпышева И.П. Журнал общей химии. 2024. Т. 94. № 5. С. 583-592.

Исследование биологической активности in silico и in vitro 5-замещенных производных n1-карбоксиметил-5-фторурацила – потенциальных пролекарств 5-фторурацила. Черникова И.Б., Нуриева Э.Р., Ишметова Д.В., Вахитов В.А.
Химико-фармацевтический журнал. 2024. Т. 58. № 7. С. 13-16.

Патенты

Хайруллина Р.Р., Галяутдинов И.В., Кузьмина У.Ш., Вахитова Ю.В. 4-{Бис[(гептилтио)метил]амино} бензамид и способ его
получения. Патент РФ No 2796755С1 от 29.05.2023.

Спивак А.Ю., Кузьмина У.Ш., Вахитова Ю.В., Вахитов В.А. 2-алкилтрифенилфосфониевые производные 10H-фенотиазина, способ получения и применение для противоопухолевой терапии. // Заявка на патент № 2024129919/04(065925)

Гранты

    • Грант РФФИ № 18-03-00153. «Лиганды сигма-1 рецептора на основе природных и синтетических 2-пиридонов, хинолизидинов и хинолинов» (УФИХ и ИБГ УФИЦ РАН)
    • – Грант РНФ №17-74-3001. «Новый рациональный подход к разработке антибактериальных и противоопухолевых лекарственных молекул с применением технологии ВПС» (соисполнитель).
    • – Грант РФФИ мол_эв_а (Эврика! Идея), № 19-33-80002. «Влияние эко- и суперэкотоксикантов на клеточные механизмы старения человека. Поиск новых антиоксидантов с целью управления процессом старения» (соисполнитель).
    • – Грант РФФИ_Поволжье No 17-43-020298 «Cинтез новых противоопухолевых агентов на основе хинолизидиновых алкалоидов растений семейства Fabaceae, произрастающих в Республике Башкортостан» (соисполнитель).
    • – Грант РФФИ No 18-53-41004 «Синтез и механизмы противоопухолевого действия природных соединений, содержащих алленовые и урацильные фрагменты» (соисполнитель).
    • – Грант Главы Республики Башкортостан для молодых ученых, Договор No 17 от12.03.2020. «Создание научной платформы для исследования химического состава и биологической активности башкирского меда, прополиса и воска – основа для продвижения на мировой рынок бренда «Башкирский мед».

 LABORATORY OF PHYSIOLOGICAL GENETICS IBG UFRC RAS

 

 

Заведующий лабораторией – Корытина Гульназ Фаритовна,

доктор биологических наук, доцент

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: guly_kory@mail.ru

 

Основные направления научной деятельности лаборатории

Исследование роли структурно-функциональной вариабельности и комплексного взаимодействия ядерного, митохондриального генома и некодирующих РНК в формировании сложно-наследуемых заболеваний, ограничивающих продолжительность жизни и высокоадаптивного фенотипа долгожителя.

 

В лаборатории физиологической генетики в течение более чем двадцати лет проводятся исследования фундаментальных основ сложно-наследуемых признаков, приводящих к ограничению продолжительности жизни, и молекулярно-генетических факторов долголетия.

 

Краткая история лаборатории

Лаборатория организована в 2000 г. как лаборатория биохимической генетики человека под руководством д.б.н, проф. Мустафиной Ольги Евгеньевны. В связи с расширением области исследований в 2008 г. лаборатория переименована в лабораторию физиологической генетики. В 2011 г. в состав лаборатории вошла лаборатория экологической генетики человека, зав. лаборатории д.м.н., проф. Викторова Татьяна Викторовна. С 2019 года руководителем лаборатории является доктор биологических наук, доцент Корытина Гульназ Фаритовна.

The laboratory was created in 2000 and initially was focused on human biochemical genetics, head of the laboratory in 2000-2019, professor, PhD, doctor of biological sciences, Olga Evgenievna Mustafina. Expansion of the research scope led to the transformation of the laboratory in 2008 into Laboratory of Physiological Genetics. In 2011, the laboratory was joined the Laboratory of Human Ecological Genetics (head of the laboratory – Prof. Viktorova TV, MD). Since 2019, the head of the laboratory has been Associate Professor Korytina Gulnaz Faritovna, PhD.

Состав лаборатории на 2025 год

 

Насибуллин Тимур Русланович,

 к.м.н., с.н.с.

 

Туктарова Ильсияр Авхатовна,

 к.б.н., с.н.с.

 

Эрдман Вера Викторовна,

 к.б.н., с.н.с.

 

Тимашева Янина Римовна,

к.м.н, c.н.с., доцент

 

 

Кочетова Ольга Владимировна,

к.б.н., с.н.с.

 

Ахмадишина

Лейсан

Зинуровна,

к.б.н., н.с.

 

Петинцева Анна Александровна,

м.н.с., аспирант

 

Маркелов Виталий Андреевич,

м.н.с., аспирант

 

Сотрудники лаборатории / Researchers:

 

Мустафина Ольга Евгеньевна – заведующий лабораторией с 2000-2019 г.г.

28.08.1955-01.04.2020, д.б.н., проф. заслуженный деятель науки. Под непосредственным руководством Мустафиной О.Е. или при её научном консультировании подготовлено 14 кандидатов наук и один доктор наук. Автор более 200 научных работ.

Olga Evgenievna Mustafina (28.08.1955-01.04.2020) – head of the laboratory in 2000-2019, professor, doctor of biological sciences, Honored Scientist. O.E. Mustafina has supervised 14 candidates of sciences (PhD) and one doctor of sciences (DS). Author of over 200 research papers.

 

Корытина Гульназ Фаритовна – д.б.н., доцент. С 2002 работает в Институте биохимии и генетики УФИЦ РАН: аспирантура (1997-2002), науч. сотр. (2002–2004), ст. науч. сотр. (2004–2019), зав. лаб. (2019 – по н.в.), с 2019 года также является профессором кафедры биологии БГМУ. Научные интересы связаны, главным образом, с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности, хронических заболеваний дыхательной системы и молекулярных основ адаптации человека к условиям хронического антропогенного загрязнения. В настоящее время ведутся работы по изучению закономерностей формирования патологического фенотипа в связи с экспрессией, полиморфизмом генов, эпигенетическими процессами.  Автор более 200 науч. работ. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, РИНЦ AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, Recearcher ID WOS A-1688-2014). 

Контакты: e-mail: guly_kory@mail.ru, т. +7347 2356088, вн-тел. 4-04, 2-32

кабинет №211, №404.

Gulnaz F. Korytina, PhD, Prof., Head of the Laboratory of Physiological Genetics of Institute of Biochemistry and Genetics – Subdivision of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences, Professor of Department of Biology, Bashkir State Medical University

Research interests are related to the study of the genetics of complex diseases, in particular, chronic respiratory diseases (chronic obstructive pulmonary disease, childhood lung diseases, occupation asthma and chronic bronchitis), metabolic disorders (type 2 diabetes mellitus, obesity), cardiovascular diseases and the molecular basis of human adaptation to the conditions of chronic anthropogenic pollution, as well as molecular patterns of aging. At present, our laboratory work on the study of the patterns of formation of a pathological phenotype in connection with expression, gene polymorphism, and epigenetic processes. (http://orcid.org/0000-0002-1695-5173, RSСI AuthorID: 124048, Scopus: 6602701462, WOS Recearcher ID A-1688-2014). tel. +7347 2356088).

Contact Information: e-mail: guly_kory@mail.ru, +7347 2356088, 4-04, 2-32,

laboratory room №211, №404.

 

Насибуллин Тимур Русланович, к.м.н., с.н.с. работает в ИБГ с 2002 года после окончания аспирантуры. Ведет активную научную работу в области генетики многофакторных признаков – артериальной гипертензии, ишемической болезни сердца, рассеянного склероза, долголетия и старения. Является соавтором более 120 научных работ. (http://orcid.org/0000-0001-8823-8678, РИНЦ AuthorID: 130011,  Scopus: 7801655112, WOS C-2432-2017).

Контакты: E-mail: nasibullintr@yandex.ru Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

Nasibullin Timur Ruslanovich, Candidate of Medical Sciences, Senior Researcher. Has been working at IBG since 2002 after completing his postgraduate studies. Performs active research in the field of genetics of complex traits (arterial hypertension, coronary heart disease, multiple sclerosis, longevity and aging). Authored over 120 scientific papers. (http://orcid.org/0000-0001-8823-8678, РИНЦ AuthorID: 130011, Scopus: 7801655112, WOS C-2432-2017).

Contact Information: E-mail: nasibullintr@yandex.ru Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room № 215

Туктарова Ильсияр Авхатовна, к.б.н., с.н.с. начала работать в ИБГ с 1989 года в должности старшего лаборанта. Ведет активную научную работу по проблеме наследственной предрасположенности к рассеянному склерозу. Участвует в формировании коллекции образцов ДНК лиц пожилого, старческого возрастов и долгожителей, имеет более 70 научных публикаций в центральной и международной печати. (WoS ResearcherID I-4448—2018 Scopus AuthorID: 6701446967).

Контакты: E-mail: iltuk@mail.ru. Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

Tuktarova Ilsiyar Avkhatovna, Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher. Has started working at IBG in 1989 as a senior laboratory assistant. Conducts active scientific work on hereditary predisposition to multiple sclerosis. Participates in the formation of a collection of DNA samples from elderly people, seniors and long-livers, has more than 70 scientific publications in the central and international press. (WoS Researcher ID: I-4448—2018 Scopus Author ID: 6701446967).

Contact Information: E-mail: iltuk@mail.ru Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room № 215

Эрдман Вера Викторовна, к.б.н., с.н.с., начала работать в ИБГ с 2002 года, ведет активную научную работу в области генетики долголетия и старения человека. Научные интересы Эрдман В.В. связаны, главным образом, с изучением роли структурных и функциональных особенностей генов клеточных процессов в формировании статуса долгожительства и в развитии многофакторных социально-значимых заболеваний и старения. С 2003 года Эрдман В.В. проводит популяционно-генетическое исследование долголетия в Республике Башкортостан. Актуальная коллекция содержит более 3000 образцов ДНК и РНК, собранных с привлечением неродственных между собой мужчин и женщин в возрасте от рождения до 113 лет, принадлежащих к основным этническим группам, проживающим на территории Республики Башкортостан.  Эрдман В.В. имеет более 90 научных работ, посвященных, в частности, исследованию влияния генетической нестабильности на продолжительность жизни поиску ассоциаций с долголетием полиморфных SNP-локусов ряда генов транскрипционных факторов и белков, вовлеченных в процессы фармакологического ответа, антиоксидантной защиты, липидного и воспалительного ответа. В настоящее время проводится поиск ключевых генов и генных сетей, участвующих в формировании этноспецифического и универсального стабильного высокоадаптивного фенотипа долгожителя.  (http://orcid.org/0000-0002-1219-3458, РИНЦ AuthorID: 661583, Scopus: 54953889900, WOS I-5040-2018).

Контакты: E-mail: danivera@mail.ru, Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

Erdman Vera V., PhD, Senior Researcher, Laboratory of Physiological Genetics of Institute of Biochemistry and Genetics – Subdivision of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences. Research interests are related to the study of the role of structural and functional characteristics of genes, encode cellular processes, for longevity and the development of multifactorial socially significant diseases and aging.  Erdman V.V. conducts the population-based study of genetic predictors of longevity in the Republic of Bashkortostan since 2003. The current collection contains more than 3000 DNA and RNA samples collected with the involvement of unrelated men and women aged from birth to 113 years old, belonging to the largest ethnic groups living in the Republic of Bashkortostan. Erdman V.V. has 90 scientific papers concerned, in particular, to the study of the influence of genetic instability on lifespan to the search of the associations of longevity with polymorphic SNP-loci of the genes encoded transcription factors and proteins involved in pharmacological response, antioxidant protection, lipid metabolism, inflammatory response have been established. At present, the scientific research focused on the study of the key genes and gene networks involved in the development of an ethnic and universal stable highly adaptive phenotype of the longevity. (http://orcid.org/0000-0002-1219-3458, РИНЦ AuthorID: 661583, Scopus: 54953889900, WOS I-5040-2018).

Contact Information е-mail: danivera@mail.ru, Tel: +73472356088 (2-36), laboratory room № 215

Тимашева Янина Римовна, к.м.н, c.н.с., доцент. Проходила обучение в аспирантуре ИБГ УНЦ РАН в 2004-2008 годах. После защиты кандидатской диссертации в 2008 году работала постдокторантом в Институте молекулярной и клеточной биологии Тартуского университета (Тарту, Эстония). С 2011 года работает в ИБГ. В 2017 году проходила стажировку в Медицинском колледже Альберта Эйнштейна (Нью-Йорк, США) в качестве приглашённого научного сотрудника по гранту программы Фулбрайта для учёных и деятелей искусств. В 2017–2022 годах была почётным научным сотрудником Имперского колледжа Лондона (Лондон, Великобритания). В 2019–2023 годах являлась приглашённым научным сотрудником Университета Суррея (Гилфорд, Великобритания). В 2021–2022 годах — приглашённый научный сотрудник Университета Лозанны (Лозанна, Швейцария). С 2017 года занимает должность доцента и заведующей учебной частью кафедры медицинской генетики и фундаментальной медицины Башкирского государственного медицинского университета. Основные научные интересы связаны с генетикой многофакторных признаков, в частности, сердечно-сосудистых и возраст-ассоциированных заболеваний. Автор 123 научных публикаций. (https://orcid.org/0000-0002-9918-6962, РИНЦ AuthorID: 172138, Scopus 23098588000, WoS M-9665-2014).

Контакты: E-mail: ianina_t@mail.ru Тел.: +7(347)235 60 88 (2-47), Кабинет № 106

Timasheva Yanina Rimovna, PhD, Senior Researcher, Associate Professor. Has conducted postgraduate studies at the Institute of Biochemistry and Genetics Biology USC RAS in 2004–2008. After defending a PhD in 2008, has worked as a postdoctoral researcher at the Institute of Molecular and Cell Biology, University of Tartu (Tartu, Estonia). Has been working at the IBG UFRC RAS since 2011. In 2017, has received a Fulbright grant to carry out a research project at the Albert Einstein College of Medicine (New York, USA). In 2017–2022, served as an Honorary Research Fellow at Imperial College London (London, UK); in 2019–2023, was a Visiting Research Fellow at the University of Surrey (Guildford, UK); and in 2021–2022, held a Visiting Research Fellowship at the University of Lausanne (Lausanne, Switzerland). Since 2017, has been working as an Associate Professor and Head of Curriculum at the Department of Medical Genetics and Fundamental Medicine, Bashkir State Medical University. Main area of research interest – genetics of complex traits, particularly cardiovascular and aging-associated diseases. Author of 123 scientific publications.

Contact Information: E-mail: ianina_t@mail.ru Tel: 007(347)235 60 88 (add. 2-47), room 106

Кочетова Ольга Владимировна, к.б.н., н.с. работает в ИБГ с 2001 г., научные интересы О.В. Кочетовой связаны, главным образом, с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности профессиональных и производственно-обусловленных заболеваний у рабочих. В настоящее время О.В. Кочетова занимается исследованием генетических основ сахарного диабета 2 типа, ожирения и метаболического синдрома, нарушений пищевого поведения в различных возрастных группах. Автор более 100 научных работ. (Recearcher ID A-2035-2014, Scopus ID 24280457500, ORCI.)

Контакты: e-mail: olga_mk78@mail.ru, т. +7347 2356088, вн-тел.2-32 кабинет №211.

Kochetova Olga Vladimirovna, Candidate of Biological Sciences, Researcher. Has been working in IBG since 2001, main scientific interests are focused on the study of the genetics of multifactorial diseases, in particular occupational and work-related diseases in workers. Currently, O.V. Kochetova is researching the genetic basis of type 2 diabetes, obesity and metabolic syndrome, eating addiction disorders   in adults and children. Author of over 100 scientific papers. (Recearcher ID A-2035-2014, Scopus ID 24280457500, ORCID http://orcid.org/0000-0002-2944-4428).

Contact Information:  e-mail: olga_mk78@mail.ru, +7347 2356088 (2-32), laboratory room №211

Ахмадишина Лейсан Зинуровна к.б.н., н.с. работает в ИБГ с 2005 г. научные интересы связаны с изучением генетики многофакторных заболеваний, в частности профессиональных бронхитов у рабочих и рака мочевого пузыря, также механизмов адаптации человека к факторам окружающей среды на основе изучения популяционных частот вариантов генов биотрансформации ксенобиотиков, антиоксидантной защиты и репарации ДНК. (Recearcher ID A-2362-2014 Scopus ID – 13409244200 https://orcid.org/0000-0003-0043-5090).

Контакты: е-mail: leys82@mail.ru  тел.: +7347 2356088, вн-тел.2-32, кабинет №211.

Akhmadishina Leysan Zinurovna, Candidate of Biological Sciences, Researcher. Has been working at IBG since 2005. Research interests are related the study of the genetics of multifactorial diseases, in particular, occupational bronchitis in workers and bladder cancer, as well as the mechanisms of human adaptation to environmental factors based on the study of population frequencies of variants in genes involved in biotransformation of xenobiotics, antioxidant defense and DNA repair. (Recearcher ID A-2362-2014 Scopus ID – 13409244200 https://orcid.org/0000-0003-0043-5090)

 Contact Information: E-mail:   leys82@mail.ru +7(347) 235 60 88 (2-32), laboratory room №211

Петинцева Анна Александровна, младший научный сотрудник, аспирант ИБГ УФИЦ РАН с 2024г, автор 10 публикаций в области молекулярной генетики многофакторных заболеваний, старения и долголетия. Основные компетенции: профилирование экспрессии мРНК, миРНК, днРНК. Выделение РНК, ДНК из различных типов тканей. Биоинформационный анализ данных ассоциативных исследований, функциональный анализ и подбор панели SNP. Статистическая обработка данных ассоциативных исследований, анализ выживаемости (Recearcher ID LWI-6723-2024, 0009-0003-3526-9691)/

Контакты: E-mail: anna_petinseva@mail.ru, Тел.: +73472356088 (2-36), Кабинет № 215

Petintseva Anna Alexandrovna, junior researcher, postgraduate student of IBG UFITC RAS since 2024, author of 10 publications in the field of molecular genetics of multifactorial diseases, aging and longevity. Core competences: mRNA, miRNA, dnRNA expression profiling.  RNA, DNA isolation from different tissue types. Bioinformatics analysis of association study data, functional analysis and SNP panel selection.    Statistical processing of association study data, survival analysis. (Receiver ID LWI-6723-2024, 0009-0003-3526-9691).

Contacts: E-mail: anna_petinseva@mail.ru, Tel: +7(347) 235 60 88 (2-36), Room No. 215.

Маркелов Виталий Андреевич, аспирант ИБГ УФИЦ РАН, младший научный сотрудник Института фундаментальной медицины ФГБОУ ВО БГМУ Минздрава, автор 32 публикаций в области молекулярной генетики многофакторных заболеваний, анализа экспрессии и клеточных технологий. Основные компетенции: биоинформационный анализ транскриптомных данных, работа с геномными базами KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) integrated database [https://www.kegg.jp/], TarBase v8.0, Lncrna2target V3.0, miRPath v.4 .0, ShinyGo (http://bioinformatics.sdstate.edu/go/) и STRING и др.  Профилирование экспрессии мРНК, миРНК, днРНК. Выделение РНК, ДНК из различных типов тканей, в том числе и клеточных культур. Работа с клеточными культурами, выделение и выращивание клеток, анализ жизнеспособности и профиля биологических метаболитов, транскриптов. (Recearcher ID HKM-4483–2023, ORCID – 0000-0002-0663-7219).

Контакты: E-mail: marckelow.vitalick2017@yandex.ru, Тел.: +73472356088, каб.211

Markelov Vitaly Andreyevich, postgraduate of IBG UFIC RAS, junior researcher at the Institute of Fundamental Medicine of  BSMU, author of 32 publications in the field of molecular genetics of multifactorial diseases, expression analysis and cell technologies. Main competences: bioinformatics analysis of transcriptomic data, work with KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) integrated database [https://www.kegg.jp/], TarBase v8.0, Lncrna2target V3.0, miRPath v.4 .0, ShinyGo (http://bioinformatics.sdstate.edu/go/) and STRING genomic databases and others.  Expression profiling of mRNA, miRNA, dnRNA.  Extraction of RNA, DNA from various types of tissues, including cell cultures. Working with cell cultures, isolation and cultivation of cells, analysing viability and profile of biological metabolites, transcripts. (Receiver ID HKM-4483-2023, ORCID – 0000-0002-0663-7219).

Contacts: E-mail:marckelow.vitalick2017@yandex.ru, Tel: +7(347) 235 60 88, Room No.  211

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ, ПОЛУЧЕННЫЕ ЗА ПОСЛЕДНИЕ 5 ЛЕТ

В лаборатории физиологической генетики проводятся исследования фундаментальных основ проблем старения, активного долголетия и формирования сложнонаследуемых заболеваний сердечно-сосудистой, нервной, эндокринной и дыхательной систем, ограничивающих продолжительность жизни. Исследования лаборатории подтверждают, что патогенез данных заболеваний включает механизмы ускоренного клеточного старения и нарушение регуляции стрессовых реакций, охватывающий широкий круг сигнальных каскадов, митохондриальную дисфункцию, связанную, в том числе и со структурно-функциональными особенностями ядерного и митохондриального геномов. Показан вклад нкРНК в регуляцию экспрессии генов, в контроль и координацию базовых биологических процессов развития многоклеточного организма, в осуществление его физиологических функций и в формирование предрасположенности к заболеваниям. В практическом плане, выявление новых молекулярных маркеров сложнонаследуемых заболеваний, ограничивающих продолжительность жизни и высокоадаптивного фенотипа долгожителя на основе анализа генома и эпигенома с учетом данных о мультиморбидности, особенностях клинического течения заболевания и воздействия факторов среды с целью усовершенствования диагностических критериев, разработки принципиально новых лекарственных препаратов для терапии, коррекции и персонализированных методов диагностики и прогнозирования заболевания.

Используемые методы: Биоинформационный анализ in silico для выбора генов, функциональный анализ, идентификация сети взаимодействующих генов ядерного, митохондриального и некодирующего генома и эпигенома, вовлеченных в ключевые сигнальные каскады, координирующих базовые пути сигнальной трансдукции, связанные с формированием возраст-зависимых физиологических и клинических фенотипов.   Исследование полиморфизма широкой панели генов на уровне ДНК, исследование профиля экспрессии белок-кодирующих РНК, микроРНК, длинных некодирующих РНК. Биоинформационный анализ комплекса полученных данных, с использованием метов лог-регрессионного анализа, оценки полигенного риска  (PRS), менделевской рандомизации, корреляционного анализа, анализа межгенных и ген-средовых взаимодействий, с  целью  подтверждения гипотезы  наличия   общих патогенетических молекулярных механизмов развития сложнонаследуемых заболеваний, ограничивающих продолжительность жизни  и их взаимосвязи с процессами старения  организма, выявление генов, имеющих потенциальную значимость как маркеры старения и мишени для геропротекторов.

Практическая реализация результатов исследований: Разработка тест-системы/панели «Здоровое долголетие» и генетических тест-систем/панелей для выявления лиц с повышенным риском развития сложнонаследуемых заболеваний (хронической обструктивной болезни легких, сахарного диабета второго типа, ишемической болезни сердца, эссенциальной гипертензии, рассеянного склероза), ограничивающих продолжительность жизни для населения Республики Башкортостан.

Публикации / Key Publications:

Сотрудниками лаборатории опубликовано более 800 научных работ, включая статьи в международных изданиях, монографии, патенты.

Наиболее важные публикации сотрудников лаборатории / Key publications of the members of the laboratory:

  1. Korytina G.F., Akhmadishina L.Z., Aznabaeva Yu.G., Kochetova O.V., Zagidullin N.Sh., Kzhyshkowska Ju.G., Zagidullin Sh.Z., Viktorova T.V. Associations of the nrf2/keap1 pathway and antioxidant defense gene polymorphisms with chronic obstructive pulmonary disease // Gene. 2019. Т. 692. С. 102-112.
  2. Timasheva Y.R., Balkhyarova Z.R., Nasibullin T.R., Avzaletdinova D.S., Morugova T.V., Mustafina O.E.,Prokopenko I. Multilocus associations of inflammatory genes with the risk of type 1 diabetes // Gene. 2019. T. 707. С. 1-8.
  3. Timasheva YR, Nasibullin TR, Tuktarova IA, Erdman VV, Mustafina OE. CXCL13 polymorphism is associated with essential hypertension in Tatars from Russia. // Molecular Biology Reports. 2018;45(5):1557-1564.
  4. Nasibullin TR, Timasheva YR, Sadikova RI, Tuktarova IA, Erdman VV, Nikolaeva IE, Sabo J, Kruzliak P, Mustafina OE. Genotype/allelic combinations as potential predictors of myocardial infarction. Mol Biol Rep. 2016;43(1):11-6. doi: 10.1007/s11033-015-3933-3. Epub 2015 Dec 12. PMID: 26662939.
  5. Korytina G. F., Akhmadishina L. Z., Kochetova O.V., Aznabaeva Y.G., Zagidullin Sh. Z. Viktorova V. Inflammatory and immune response genes are associated with susceptibility to chronic obstructive pulmonary disease in Tatars population from Russia // Biochemical genetics. 2016; 54(4):388-412.
  6. Barsova R., Lvovs D., Titov B., Matveeva N., Shakhnovich R., Sukhinina T., Kukava N., Ruda M., Kulakova O., Tsareva E., Nasibullin T., Mustafina O., Osmak G., Favorov A., Favorova O. Variants of the Coagulation and Inflammation Genes Are Replicably Associated with Myocardial Infarction and Epistatically Interact in Russians // PLOS ONE. 2015.10(12): e0144190.
  7. Timasheva YR, Nasibullin TR, Imaeva EB, Erdman VV, Kruzliak P, Tuktarova IA, Nikolaeva IE, Mustafina OE. Polymorphisms of inflammatory markers and risk of essential hypertension in Tatars from Russia. // Clinical and Experimental Hypertension. 2015;37(5):398-403.
  8. Korytina GF, Yanbaeva DG, Babenkova LI, Etkina EI, Victorova TV. Genetic polymorphisms in the cytochromes P-450 (1A1, 2E1), microsomal epoxide hydrolase and glutathione S-transferase M1, T1, and P1 genes, and their relationship with chronic bronchitis and relapsing pneumonia in children. J Mol Med (Berl). 2005;83(9):700-10. doi: 10.1007/s00109-005-0660-6. Epub 2005. PMID: 15928955.
  9. Korytina GF, Akhmadishina LZ, Viktorova EV, Kochetova OV, Viktorova TV. IREB2, CHRNA5, CHRNA3, FAM13A & hedgehog interacting protein genes polymorphisms & risk of chronic obstructive pulmonary disease in Tatar population from Russia. Indian J Med Res. 2016;144(6):865-876. doi: 10.4103/ijmr.IJMR_1233_14. PMID: 28474623; PMCID: PMC5433279.
  10. Korytina G, Kochetova O, Akhmadishina L, Viktorova E, Victorova T. Polymorphisms of cytochrome p450 genes in three ethnic groups from Russia. Balkan Med J. 2012;29(3):252-60. doi: 10.5152/balkanmedj.2012.039. Epub 2012 Sep 1. PMID: 25207010; PMCID: PMC4115825.
  11. Korytina GF, Akhmadishina LZ, Viktorova EV, Tselousova OS, Danilko KV, Kochetova OV, Viktorova TV. Extracellular matrix remodeling genes polymorphisms and risk of chronic bronchitis and recurrent pneumonia in children. J Hum Genet. 2013;58(7):467-74. doi: 10.1038/jhg.2013.24. Epub 2013 Apr 11. PMID: 23575435.
  12. Kochetova OV, Avzaletdinova DS, Morugova TV, Mustafina OE. Chemokine gene polymorphisms association with increased risk of type 2 diabetes mellitus in Tatar ethnic group, Russia. Mol Biol Rep. 2019;46(1):887-896. doi: 10.1007/s11033-018-4544-6. Epub 2018 Dec 10. PMID: 30536157.
  13. Kochetova OV, Avzaletdinova DS, Korytina GF, Morugova TV, Mustafina OE. The association between eating behavior and polymorphisms in GRIN2B, GRIK3, GRIA1 and GRIN1 genes in people with type 2 diabetes mellitus. Mol Biol Rep. 2020 Mar;47(3):2035-2046. doi: 10.1007/s11033-020-05304-x. Epub 2020. PMID: 32037472.
  14. Timasheva Y, Nasibullin TR, Tuktarova IA, Erdman VV, Galiullin TR, Zaplakhova OV, Bakhtiiarova KZ. Multilocus evaluation of genetic predictors of multiple sclerosis. Gene. 2022;809:146008. doi: 10.1016/j.gene.2021.146008. Epub 2021 Oct 14. PMID: 34656742.
  15. Erdman VV, Karimov DD, Tuktarova IA, Timasheva YR, Nasibullin TR, Korytina GF. Alu Deletions in LAMA2 and CDH4 Genes Are Key Components of Polygenic Predictors of Longevity. Int J Mol Sci. 2022;23(21):13492. doi: 10.3390/ijms232113492. PMID: 36362280; PMCID: PMC9657309.
  16. Timasheva YR, Nasibullin TR, Tuktarova IA, Erdman VV, Galiullin TR, Lyutov OV, Bakhtiiarova KZ. Multiple sclerosis in the Republic of Bashkortostan: population-specific genetic predictors and the results of a 20-year clinical follow-up study. Zh Nevrol Psikhiatr Im S S Korsakova. 2023;123:34-42. Russian. doi: 10.17116/jnevro202312307234. PMID: 37560832.
  17. Timasheva YR, Nasibullin TR, Imaeva EB, Erdman VV, Kruzliak P, Tuktarova IA, Nikolaeva IE, Mustafina OE. Polymorphisms of inflammatory markers and risk of essential hypertension in Tatars from Russia. Clin Exp Hypertens. 2015;37(5):398-403. doi: 10.3109/10641963.2014.987394. Epub 2015 May 6. PMID: 25945941.
  18. Nasibullin TR, Erdman VV, Timasheva YR, Tuktarova IA, Petinseva AA, Korytina GF. Polymorphic variants of the genes for enzymes of the antioxidant system, apoptosis and inflammation as potential predictors of myocardial infarction. Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. 2024;28(7):792-800. doi: 10.18699/vjgb-24-87. PMID: 39722671; PMCID: PMC11667575.
  19. Nasibullin TR, Yagafarova LF, Yagafarov IR, Timasheva YR, Erdman VV, Tuktarova IA, Mustafina OE. Combinations of Polymorphic Markers of Chemokine Genes, Their Receptors and Acute Phase Protein Genes As Potential Predictors of Coronary Heart Diseases. Acta Naturae. 2016;8(1):111-6. PMID: 27099791; PMCID: PMC4837578.
  20. Timasheva Y, Balkhiyarova Z, Avzaletdinova D, Morugova T, Korytina GF, Nouwen A, Prokopenko I, Kochetova O. Mendelian Randomization Analysis Identifies Inverse Causal Relationship between External Eating and Metabolic Phenotypes. Nutrients. 2024;16(8):1166. doi: 10.3390/nu16081166. PMID: 38674857; PMCID: PMC11054043.
  21. Gilyazova I, Timasheva Y, Karunas A, Kazantseva A, Sufianov A, Mashkin A, Korytina G, Wang Y, Gareev I, Khusnutdinova E. COVID-19: Mechanisms, risk factors, genetics, non-coding RNAs and neurologic impairments. Noncoding RNA Res. 2023;8(2):240-254. doi: 10.1016/j.ncrna.2023.02.007. Epub 2023 Feb 23. PMID: 36852336; PMCID: PMC9946734.
  22. Timasheva Y, Badykov M, Akhmadishina L, Nasibullin T, Badykova E, Pushkareva A, Plechev V, Sagitov I, Zagidullin N. Genetic predictors of sick sinus syndrome. Mol Biol Rep. 2021 Jun;48(6):5355-5362. doi: 10.1007/s11033-021-06517-4. Epub 2021. PMID: 34195885.
  23. Timasheva YR, Balkhiyarova ZR, Kochetova OV. Current state of the obesity research: genetic aspects, the role of microbiome, and susceptibility to COVID-19. Probl Endokrinol (Mosk). 2021;67(4):20-35. Russian. doi: 10.14341/probl12775. PMID: 34533011; PMCID: PMC9753850.
  24. Timasheva Y, Lepik K, Liska O, Papp B, Kutalik Z. Widespread natural selection on metabolite levels in humans. Genome Res. 2024;34(8):1121-1129. doi: 10.1101/gr.278756.123. PMID: 39152035; PMCID: PMC11444169.
  25. Timasheva Y, Kochetova O, Balkhiyarova Z, Korytina G, Prokopenko I, Nouwen A. Polygenic Score Approach to Predicting Risk of Metabolic Syndrome. Genes (Basel). 2024;16(1):22. doi: 10.3390/genes16010022. PMID: 39858569; PMCID: PMC11764775.
  26. Karimov D.D., Erdman V.V., Kudoyarov E.R., Valova Y.V., Smolyankin D.A., Repina E.F., Karimov D.O. Influence of occupational risk factors on human aging (literature review). Hygiene and Sanitation. 2022;101(4):375-381. (In Russ.) https://doi.org/10.47470/0016-9900-2022-101-4-375-381
  27. Erdman V, Tuktarova I, Nasibullin T, Timasheva Y, Petintseva A, Korytina G. Polygenic markers of survival and longevity in the antioxidant genes PON1, PON2, MTHFR, MSRA, SOD1, NQO1, and CAT in a 20-year follow-up study in the population from the Volga-Ural region. Gene. 2024;919:148510. doi: 10.1016/j.gene.2024.148510. Epub 2024 Apr 26. PMID: 38679184.
  28. Timasheva YR, Nasibullin TR, Zakirova AN, Mustafina OE. Association of interleukin-6, interleukin-12, and interleukin-10 gene polymorphisms with essential hypertension in Tatars from Russia. Biochem Genet. 2008;46(1-2):64-74. doi: 10.1007/s10528-007-9130-x. Epub 2007 Dec 28. PMID: 18163209.
  29. Erdman V, Petintseva A, Timasheva Y, Tuktarova I, Nasibullin T, Korytina G. Genetic predictors of longevity and survival in cellular homeostasis genes: A case-control study. Gene. 2025:149576. doi: 10.1016/j.gene.2025.149576. Epub ahead of print. PMID: 40398646.
  30. Korytina GF, Akhmadishina LZ, Markelov VA, Aznabaeva YG, Kochetova OV, Nasibullin TR, Larkina AP, Khusnutdinova NN, Zagidullin NS, Victorova TV. Role of PI3K/AKT/mTOR signaling pathway and sirtuin genes in chronic obstructive pulmonary disease development. Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. 2023;27(5):512-521. doi: 10.18699/VJGB-23-62. PMID: 37867611; PMCID: PMC10587010.
  31. Korytina GF, Aznabaeva YG, Akhmadishina LZ, Kochetova OV, Nasibullin TR, Zagidullin NS, Zagidullin SZ, Viktorova TV. The Relationship Between Chemokine and Chemokine Receptor Genes Polymorphisms and Chronic Obstructive Pulmonary Disease Susceptibility in Tatar Population from Russia: A Case Control Study. Biochem Genet. 2022;60(1):54-79. doi: 10.1007/s10528-021-10087-2. Epub 2021 Jun 6. PMID: 34091786.
  32. Markelov V. A., Akhmadishina L. Z., Solntsev V. A., Danilko K. V., and Korytina G. F. Non-Coding RNAs and Their Regulatory Systems: Evolutionary Origin and Putative Link with Ribozymes // Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology, 2025, Vol. 61, No. 2, pp. 460–485. DOI: 1134/S0022093025020073 https://link.springer.com/article/10.1134/S0022093025020073
  33. Kochetova, O. V., Avsaleydiniva, D. S., Kochetova, T. M., Akhmadishina, L. Z., Korytina, G. F. Analysis of polymorphic variants of cholinergic receptor genes in type 2 diabetes mellitus. Russian Journal of Genetics. 2025;61(4):444–452. DOI: 10.1134/S1022795424701849).
  34. Timasheva, Y.; Kochetova, O.; Balkhiyarova, Z.; Korytina, G.; Prokopenko, I.; Nouwen, A. Polygenic Score Approach to Predicting Risk of Metabolic Syndrome.Genes 2025;16: 22. https://doi.org/10.3390/ genes16010022.
  35. Markelov V. A., Akhmadishina L. Z., Kochetova O.V., Erdman V.V. and  Korytina G. F. The Role of Sirtuins in Cellular Senescence and the Development of Age-Associated Diseases // Russian Journal of Genetics, 2025;61(6): 613–633. DOI: 1134/S1022795425700152.
  36. Erdman, Petintseva A., Timasheva Y., Tuktarova I., Nasibullin T., Korytina G. Genetic predictors of longevity and survival in cellular homeostasis genes: A case-control study // Gene. 2025. V. 962, 20 August. P. 149576. https://doi.org/10.1016/j.gene.2025.149576
  37. Малиевская Р.И., Авзалетдинова Д.Ш., Малиевский О.А., Кочетова О.В. Ассоциация нуклеотидной последовательности rs3730089 гена PIK3R1 с дислипидемией при сахарном диабете 1 типа. DOI: 10.31550/1727-2378-OF2.25_A
  38. Erdman, V.V., Karimov, D.D., Tuktarova, I.A. et al. Alu Polymorphisms of Autophagy and Apoptosis Regulatory Genes as Human Lifespan Factors. Russ J Genet. 2025;61: 98–107. https://doi.org/10.1134/S1022795424701448)
  39. Erdman V., Karimov D., Nasibullin T., Timasheva I., Tuktarova I., Mustafina O. The role of Alu polymorphism of PLAT, PKHD1L1, STK38L and TEAD1 genes in development of a longevity trait // Advances in Gerontology, 2017;7(2):107–113 DOI: 10.1134/S2079057017020059
  40. Erdman, V. V., Nasibullin, T. R., Tuktarova, I. A., Somova, R. S., & Mustafina, O. E. (2019). Association Analysis of Polymorphic Gene Variants in the JAK/STAT Signaling Pathway with Aging and Longevity. Russian Journal of Genetics, 2019, 55(6), 728-737. DOI: 10.1134/S1022795419050077

Гранты фондов и НИР

РГНФ № 13-06-00633, «Исследование популяционно-генетической структуры населения для создания информационных ресурсов в области фармакогенетического тестирования».

РФФИ №14-04-01169, «Молекулярно-генетическое исследование старения и долголетия человека: анализ транскрипционной активности генов консервативных в эволюции сигнальных путей в клетках крови».

РФФИ №12-04-01450-а, «Роль компенсаторных реакций в реализации программы, определяющей продолжительность жизни: исследования на модельных популяциях насекомых (комнатной мухи и колорадского жука).

РФФИ 13-04-01561_а, «Молекулярные основы старения: роль геномных и эпигеномных изменений сердечно-сосудистой системы».

РГНФ № 13-06-00101, «Ожирение как социально важная проблема современности».

РФФИ №13-04-00287, «Поиск информативных прогностических биомаркеров, обуславливающих особенности развития различных фенотипов и тяжести течения хронической обструктивной болезни легких».

РФФИ 14-04-97094 р_поволжье, «Экспрессия, инсерционный полимофизм Alu- ретроэлементов и их влияние на транскрипционную активность генов-кандидатов старения и долголетия в разные периоды онтогенеза человека»

РФФИ 14-04-97006 р_поволжье, «Влияние генетических и эпигенетических факторов на формирование никотиновой зависимости».

РФФИ №14-06-97003 р_поволжье, «Психосоциальный статус, эпигенетические и генетические изменения при ожирении и метаболическом синдроме».

РФФИ № 17-44-020735 «Анализ достижений молекулярно-генетических исследований рассеянного склероза и валидация ассоциаций с заболеванием SNP-маркеров в разных этнических группах населения Республики Башкортостан»

РФФИ № 18-015-00050 (2018-2020) «Молекулярные механизмы фенотипической гетерогенности хронической обструктивной болезни легких: роль генов иммунного ответа и системного воспаления».

РФФИ № 19-54-40007 «Молекулярно-генетическое исследование долгожительства в Республике Башкортостан и Абхазии: сравнительный анализ в эколого-географическом и этническом аспектах».

РФФИ № 20-013-00261 А (2020-2022) «Ожирение у детей: психологические, социальные и генетические факторы развития»

РНФ № 22-25-00010 (2022-2023) Нарушение пищевого поведения – новый аспект патогенеза сахарного диабета 2-го типа и ожирения: комплексный анализ геномных, эпигеномных маркеров и данных психологического скрининга,

РНФ № 23-25-00019 (2023-2024) «Молекулярные механизмы развития хронической обструктивной болезни легких: роль длинных некодирующих РНК вовлеченных в регуляцию сигнальных путей, связанных с окислительным стрессом и клеточным старением»

РНФ № 24-25-00179 (2024-2025), Молекулярные механизмы долголетия человека: роль генов редокс-регуляции аутофагии в системе контакта мембран митохондрий и эндоплазматического ретикулума в физиологическом старении и возрастной патологии

 

Мегагрант Правительства Российской Федерации (2021-2023) (2020-220-08-2197, соглашение № 075-15-2021-595). Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины

Госзадание НИР ИБГ УФИЦ РАН (2021-2024) Тема: “Молекулярная организация генома человека, технологии его исследований и механизмы фармакологической регуляции функционирования в норме и при патологии”, № гос. регистрации: № 122041400169-2;

Госзадание НИР ИБГ УФИЦ РАН (2025-2028) «Геном человека: молекулярная организация, технологии исследований и механизмы фармакологической регуляции функционирования в норме и при патологии» № гос. регистрации: № 1022040500074-9

 

Заведующий лабораторией – Гарафутдинов Равиль Ринатович,

доктор химических наук, кандидат биологических наук

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: garafutdinovr@ufaras.ru

 

Основные направления научной деятельности лаборатории:

  • изучение структурно-функциональных свойств нуклеиновых кислот и ферментов нуклеинового обмена;
  • создание новых молекулярных инструментов на основе нуклеиновых кислот и их комплексов;
  • разработка новых методов и технологий анализа специфических ДНК и РНК.

Исследования направлены на изучение физико-химических основ “слабых” взаимодействий полинуклеотидных цепей с НК-процессирующими ферментами в различных средах и нетипичных видов их активности для последующего использования выявленных особенностей и закономерностей в целях разработки новых способов обнаружения специфических нуклеотидных последовательностей и создания диагностических тест-систем.

Краткая история лаборатории

Лаборатория структуры и функций биополимеров была создана в 2007 г. и до 2022 г. называлась лабораторией физико-химических методов анализа биополимеров.

В составе лаборатории ранее трудились: Р.З. Кантимиров, вед. инженер; Э.Г. Магданов, вед. инженер; О.И. Машков, к.б.н., н.с.; А.А. Галимова, к.б.н., н.с.; Мирсаева Л.Р, к.б.н., н.с.; Гильванов А.Р., асп., ст. лаб.; Гадельшина Н.Р., ст. лаб.; Хисамутдинова У.И., ст. лаб.; Газизов Р.Р., мл.н.с.

Заведующий лабораторией – Гарафутдинов Равиль Ринатович, д.х.н., к.б.н. (с 2007 г. по наст. время).

Состав лаборатории

 

Сахабутдинова Ассоль Рафиковна

к.б.н., н.с.

 

Купова Ольга Юрьевна

к.х.н., н.с.

 

Пасько Павел Александрович

к.х.н., н.с.

 

Азаматова Лиана Ильдаровна,

ст. лаб.

Ахметзянова Лиана Ульфатовна,

мл.н.с.

 

 

 

 

Сотрудники лаборатории структуры и функций биополимеров

ИБГ УФИЦ РАН

 

Основные результаты, полученные за последние 5 лет

  1. Показано, что цепь-вытесняющие ДНК-полимеразы с умеренной или высокой термостабильностью приводят к мультимеризации ДНК в условиях, способствующих “дыханию” цепей. Мультимеризация начинается с образования псевдоциклической ДНК-структуры за счет изгиба свободных 3′-концов цепей ДНК-дуплекса и их отжига на противоположной цепи. Она ингибируется в условиях, препятствующих образованию или элонгации псевдоциклической ДНК (Garafutdinov et al., 2020a, 2020b, 2025).
  2. Обнаружено, что при определенных условиях ДНК-полимераза Bst обеспечивает амплификацию ДНК в присутствии не только ионов Mg2+ и Mn2+, но также Ca2+, Cd2+ и Cu2+. Наиболее предпочтительным альтернативным кофактором является Mn2+, который в сочетании с Mg2+ ингибирует протекание мультимеризации (Garafutdinov et al., 2020).
  3. Изучена обратно-транскриптазная активность различных форм (мутантных и дикого типа) ДНК-полимеразы Taq. Исследовано влияние кофактора на проявление указанной активности. Показана применимость отдельных форм ДНК-полимеразы Taq для эффективной амплификации РНК-матриц с помощью классической полимеразной цепной реакции. Предложен способ детекции вирусных РНК с помощью ДНК-полимеразы Taq, не требующий проведения этапа обратной транскрипции, характеризующийся высокими чувствительностью и специфичностью, а также возможностью высокоэффективного обнаружения мишеней в препаратах, содержащих разрушенную РНК (Sakhabutdinova et al., 2022).
  4. Реализовано проведение конвекционной полимеразной цепной реакции в стандартных ПЦР-пробирках. Показана возможность достоверного обнаружения до 102 копий НК-мишеней за 15 мин реакции (Garafutdinov et al., 2022).
  5. Показана возможность использования полиморфного локуса в составе генов NLGNX и NLGNY для установления половой принадлежности биоматериалов человека при проведении судебно-медицинской экспертизы. Существенное различие в расположении данных локусов относительно псевдоаутосомной области, а также сочетание разных типов полиморфизма, с одной стороны, и возможность использования гендер-специфичных праймеров “в одной пробирке” (режим мультиплексной ПЦР), с другой, позволяет рекомендовать их в качестве альтернативного или дополнительного маркера при определении половой идентичности человека, в том числе в составе систем для ДНК-регистрации населения (Гарафутдинов и др., 2022).
  6. Предложен новый способ оценки уровня специфических миРНК, основанный на мультимеризации, не требующий проведения этапа обратной транскрипции и использования флуорогенных зондов (Garafutdinov et al., 2023).
  7. Предложен способ обнаружения вирусных РНК, обеспечивающий детекцию генетического материала даже в препаратах, подвергнувшихся многократному замораживанию (Сахабутдинова и др., 2023).
  8. Разработана компьютерная программа LAMPrimers iQ для подбора праймеров для петлевой изотермической амплификации (LAMP). На примере генетического материала коронавируса SARS-CoV-2 показана бóльшая специфичность праймеров, подобранных с помощью LAMPrimers iQ, по сравнению с праймерами, сконструированными с использованием альтернативных программ (Akhmetzyanova et al., 2024).
  9. Методами молекулярного докинга показано, ДНК-полимераза Bst exo- образует чуть более прочные комплексы с пурин-богатыми нуклеотидными последовательностями, что подтверждается более ранним началом мультимеризации для ДНК-матриц, содержащих олигопуриновые концевые мотивы (Гарафутдинов и др., 2024).

Основные научные публикации лаборатории

Статьи в научных журналах (за 2020-2024 гг):

  1. Garafutdinov R.R., Gilvanov A.R., Sakhabutdinova A.R. The influence of reaction conditions on DNA multimerization during isothermal amplification with Bst DNA polymerase // Biochem. Biotechnol., 2020, 190(2), 758-771. https://doi.org/10.1007/s12010-019-03127-6.
  2. Garafutdinov R.R., Sakhabutdinova A.R., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. Prevention of DNA multimerization during isothermal amplification with Bst exo- DNA polymerase // Biochimie, 2020, 168, 259-267, https://doi.org/1016/j.biochi.2019.11.013.
  3. Garafutdinov R.R., Sakhabutdinova A.R., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. Data on multimerization efficiency for short linear DNA templates and phosphoryl guanidine primers during isothermal amplification with Bst exo- DNA polymerase // Data-in-Brief, 2020, 29, 105188.
  4. Сахабутдинова А.Р., Мирсаева Л.Р., Оскорбин И.П., Филипенко М.Л., Гарафутдинов Р.Р. Устранение мультимеризации ДНК, возникающей при изотермической амплификации в присутствии ДНК полимеразы Bst exo- // Биоорг. химия, 2020, 46, 56-64.
  5. Шарипов Т.И., Гарафутдинов Р.Р., Бахтизин Р.З. Исследование одноцепочечных ДНК с повторяющейся нуклеотидной последовательностью методами сканирующей зондовой микроскопии // Известия РАН, Сер. физ., 2020, 84(5), 675-678.
  6. Sakhabutdinova A.R., Chemeris A.V., Garafutdinov R.R. Enhancement of PCR efficiency using mono- and disaccharides // Biochem. 2020, 606, 113858. https://doi.org/10.1016/j.ab.2020.113858.
  7. Garafutdinov R.R., Galimova А.А., Sakhabutdinova А.R. The influence of quality of primers on the formation of primer dimers in PCR // Nucleot. Nucleic acids, 2020, 39(9), 1251-1269. https://doi.org/10.1080/15257770.2020.1803354.
  8. Garafutdinov R.R., Gilvanov A.R., Kupova O.Y., Sakhabutdinova A.R. Effect of metal ions on isothermal amplification with Bst exo- DNA polymerase // J. Biol. Macromol. 2020, 161, 1447-1455. https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.08.028.
  9. Garafutdinov R.R., Sakhabutdinova A.R.,A. Slominsky, F.G. Aminev, Chemeris A.V. A new digital approach to SNP encoding for DNA identification // Forensic Sci. Int., 2020, 317, 110520. https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2020.110520.
  10. Garafutdinov R.R., Kupova O.Y., Gilvanov A.R., Sakhabutdinova A.R. Data on molecular docking simulations of quaternary complexes ‘Bst exo- polymerase-DNA-dCTP-metal cations’ // Data-in-Brief, 2020, 106549, https://doi.org/1016/j.dib.2020.106549.
  11. Мавзютов А.Р., Глазутдинова Л.Р., Саньчоков Д.В., Щекин В.С., Гарафутдинов Р.Р., Чижова А.В., Габдрахманова А.Р. Морфометрическая характеристика эффектов фракций липополисахарида Ensifer meliloti на паренхиматозные органы лабораторных крыс с вторичным иммунодефицитом // Инфекция и иммунитет, 2021, 11(1), 93-100, https://doi.org/15789/2220-7619-MCO-1242.
  12. Гарафутдинов Р.Р., Сахабутдинова А.Р., Гильванов А.Р., Чемерис А.В. Амплификация нуклеиновых кислот “катящимся кольцом” – универсальный метод анализа широкого круга биологических мишеней // Биоорг. химия, 2021, 47(6), 721-740. https://doi.org/31857/S0132342321060075.
  13. Sakhabutdinova A.R., Kamalov M.I., Salakhieva D.V., Mavzyutov A.R., Garafutdinov R.R. Inhibition of nonspecific polymerase activity using poly(aspartic) acid as a model anionic polyelectrolyte // Biochem., 2021, 628, 114267, https://doi.org/10.1016/j.ab.2021.114267.
  14. Garafutdinov R.R., Chemeris D.A., Sakhabutdinova A.R., Moiseev K.V., Urmancheev S.F., Mikhaylenko C.I., Privalov L.Yu., Chemeris A.V. Convective polymerase chain reaction in standard microtubes // Biochem., 2022, 114565, https://doi.org/10.1016/j.ab.2022.114565.
  15. Garafutdinov R.R., Chemeris D.A., Sakhabutdinova A.R., Kiryanova O.Yu., Mikhaylenko C.I., Chemeris A.V. Encoding of non-biological information for its long-term storage in DNA // Biosystems, 2022, 104664, 215-216. https://doi.org/1016/j.biosystems.2022.104664.
  16. Аминев Ф.Г., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Михайленко К.И., Сагитов А.М. О возможностях применения новых технологий ДНК-идентификации личности в целях всеобщей геномной регистрации населения Российской Федерации // Правовое государство: теория и практика, 2022, 67, 30-41.
  17. Гарафутдинов Р.Р., Сахабутдинова А.Р., Аминев Ф.Г., Чемерис А.В. “Новый полиморфный ДНК-маркер для определения пола человека по его биологическому материалу” // Суд-мед. экспертиза, 2022, 65(4), 36-40. https://doi.org/17116/sudmed20226504136.
  18. Sakhabutdinova A.R., Gazizov R.R., Chemeris A.V., Garafutdinov R.R. Reverse transcriptase-free detection of viral RNA using Hemo KlenTaq DNA polymerase // Biochem., 2022, 659. 114960. https://doi.org/10.1016/j.ab.2022.114960.
  19. Ахметзянова Л.У., Давлеткулов Т.М., Гарафутдинов Р.Р., Губайдуллин И.М. Применение алгоритма Ахо-Корасик для подбора праймеров для петлевой изотермической амплификации //Мат. биол. биоинформ. 2022, 17(2), 250-265. https://doi.org/17537/2022.17.
  20. Аминев Ф.Г., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В. Геном человека от матери + геном человека от отца = персональные данные. Правовые вопросы ДНК-идентификации личности и ДНК-регистрации населения // Правовое государство: теория и практика, 2022, 70, 119-125.
  21. Garafutdinov R.R., Burkhanova G.F., Maksimov I.V., Sakhabutdinova A.R. New method for microRNA detection based on multimerization // Biochem. 2023, 664, 115049. https://doi.org/10.1016/j.ab.2023.115049.
  22. Sharipov T.I., Sakhautdinov M., Talipov R.F., Garafutdinov R.R. Formation of quasi-stable nanostructures from L-N-stearoyl glutamic acid and its dimethyl ester on solid surfaces // J. Nanopart. Res., 2023, 25(4), 64. https://doi.org/10.1007/s11051-023-05723-4.
  23. Сахабутдинова А.Р., Чемерис А.В., Гарафутдинов Р.Р. Обнаружение специфических РНК-мишеней с помощью мультимеризации // Биохимия, 2023, 88(5), 832-840. https://doi.org/31857/S032097252305010X.
  24. Akhmetzianova L.U., Davletkulov T.M., Sakhabutdinova A.R., Chemeris A.V., Gubaydullin I.M., Garafutdinov R.R. LAMPrimers iQ: New primer design software for loop-mediated isothermal amplification (LAMP) // Biochem. 2024, 684, 115376. https://doi.org/10.1016/j.ab.2023.115376.
  25. Frunze O., Yun Y., Kim H., Garafutdinov R.R., Na Y.-E., Kwon H.-W. The effect of seasonal temperatures on the physiology of the overwintered honey bee // PLoS ONE, 2024, 19(12), e0315062. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0315062.
  26. Kiryanova O.Yu., Garafutdinov R.R., Gubaydullin I.M., Chemeris A.V.A novel approach to encode melodies in DNA // Biosystems, 2024, 237, 105136. https://doi.org/1016/j.biosystems.2024.105136.
  27. Чемерис А.В., Халиков А.А., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис Д.А., Сахабутдинова А.Р., Халиуллина А.Ф., Галяутдинов Р.Р., Сагидуллин Р.Х., Аминев Ф.Г. Генетические проблемы ДНК-портретирования как части ДНК-фенотипирования. Обзор литературы // Суд. мед. 2024, 10(3), 398-410. https://doi.org/17816/fm16167.
  28. Гарафутдинов Р.Р., Купова О.Ю., Сахабутдинова А.Р. Влияние нуклеотидного контекста на протекание неспецифической амплификации ДНК под действием ДНК-полимеразы Bst exo- // Биохимия, 2024, 89(1), 53-64. https://doi.org/1134/S0006297924010036.

Книги, главы в книгах

  1. ДНК-криминалистика / А.В. Чемерис, Ф.Г. Аминев, Р.Р. Гарафутдинов, В.А. Анисимов, А.М. Сагитов, Э.К. Хуснутдинова, А.Р. Сахабутдинова, Д.А. Чемерис, К.И. Михайленко / Под ред. Ф.Г. Аминева, А.В. Чемериса. – М.: Наука, 2022. – 466 с. ISBN 978-5-02-040915-6 (в пер.).
  2. ДНК-криминалистика / А.В. Чемерис, Ф.Г. Аминев, Р.Р. Гарафутдинов, В.А. Анисимов, А.М. Сагитов, Э.К. Хуснутдинова, А.Р. Сахабутдинова, Д.А. Чемерис, К.И. Михайленко / Под ред. Ф.Г. Аминева, А.В. Чемериса. – М.: Наука, 2024. – 466 с. ISBN 978-5-02-040915-6 (в пер.).

Патенты

  1. Кирьянова О.Ю., Кирьянов И.И., Кулуев Б.Р., Чемерис А.В., Гарафутдинов Р.Р., Губайдуллин И.М. (2020) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ № 2020610703. ABCDNA_GS.
  2. Губайдуллин И.М., Кирьянова О.Ю., Кирьянов И.И., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В. (2020) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ № 2020667097. GATCGGenerator.
  3. Ахметзянова Л.У., Давлеткулов Т.М., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Губайдуллин И.М. (2022) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2022617417. LAMPrimers iQ.
  4. Сагитова М.А., Чемерис А.В., Аминев Ф.Г., Гарафутдинов Р.Р., Сагитов А.М., Анисимов В.А. (2022) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2022683416. SNPMOD.
  5. Ахметзянова Л.У., Давлеткулов Т.М., Хайритдинов В.Д., Гарафутдинов Р.Р., Губайдуллин И.М. (2023) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2023662840. Дизайн праймеров для петлевой изотермической реакции.
  6. Ахметзянова Л.У., Арсланова Р.Х., Хайритдинов В.Д., Гарафутдинов Р.Р., Губайдуллин И.М., Чемерис А.В. (2024) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2024687333. AlignDNA.
  7. Ахметзянова Л.У., Хайритдинов В.Д., Арсланова Р.Х., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В. (2025) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2025617292. Дизайн олигонуклеотидных шпилечных структур для лигирования на поддерживающей матрице и последующей LAMP-амплификации (LigLAMP).
  8. Ахметзянова Л.У., Хайритдинов В.Д., Губайдуллин И.М., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Арсланова Р.Х. (2025) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2025615182. Дизайн праймеров для LAMP-амплификации микроРНК (mirLAMP).
  9. Ахметзянова Л.У., Хайритдинов В.Д., Чемерис А.В., Гарафутдинов Р.Р. (2025) Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ №2025663243. Дизайн множественных внутренних праймеров для петлевой изотермической амплификации (MIP-LAMP).

Гранты фондов

2025-2026 гг. Грант РНФ №25-24-00356. “Влияние нуклеотидного контекста на эффективность лигирования нуклеиновых кислот под действием ряда НК-лигаз”. Руководитель – Сахабутдинова А.Р.

2022-2023 гг. Грант РНФ №25-24-00356. “Неспецифическая активность цепь-вытесняющих ДНК-полимераз и разработка новых способов амплификации нуклеиновых кислот in vitro“. Руководитель – Гарафутдинов Р.Р.

2020-2021 гг. Грант РФФИ №20-14-50120. “Амплификация нуклеиновых кислот “катящимся кольцом” как универсальный метод анализа широкого круга биологических мишеней”. Руководитель – Гарафутдинов Р.Р.

2019-2021 гг. Грант РФФИ №19-34-90010. “Механизм мультимеризации ДНК под действием ДНК полимеразы Bst exo-“. Руководитель – Гарафутдинов Р.Р.

2011-2013 гг. Проект №14.740.11.1059 в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы “Разработка комплексной системы однозначной ДНК-идентификации личности, основанной на новых принципах генетического штрих-кодирования”. Руководитель – Гарафутдинов Р.Р.

2010-2012 гг. Проект № № 14.740.11.0244 в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы “Разработка олигонуклеотидных гибридизационных зондов для высокочувствительной детекции нуклеиновых кислот in vitro в режиме реального времени. Руководитель – Гарафутдинов Р.Р.

Участие в международных конференциях

  1. Ахметзянова Л.У., Давлеткулов Т.М., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Губайдуллин И.М. Параллельный поиск с использованием алгоритма Рабина-Карпа для петлевой изотермической амплификации ДНК // В сборнике: Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ’2021). Короткие статьи и описания плакатов. XV международная конференция. Челябинск, 2021. С. 278.
  2. Кирьянова О.Ю., Кирьянов И.И., Гарафутдинов Р.Р., Чемерис А.В., Губайдуллин И.М. Генератор нуклеотидных последовательностей для хранения и передачи небиологической информации в молекулах ДНК // В сборнике: Информационные технологии и нанотехнологии (ИТНТ-2021). Сборник трудов по материалам VII Международной конференции и молодежной школы. Самара, 2021. С. 30412.
  3. Шарипов Т.И., Кудояров Д.Ш., Гарафутдинов Р.Р., Сафаргалин И.Н. Электропроводность специфических олигонуклеотидов. // Физика твердого тела: Материалы XV Международной научной конференции – Астана: Изд-во ЕНУ имени Л.Н. Гумилева, 2022. С. 112-115.
  4. Кудояров Д.Ш., Шарипов Т.И., Гарафутдинов Р.Р. Исследование проводимости гомоолигонуклеотидов. // Физика конденсированного состояния и ее приложения: сборник трудов IV Междунар. науч.- практ. конференции 22–24 сентября 2022 г., Республика Башкортостан, г. Стерлитамак / отв. ред. А.И. Филиппов. – Стерлитамак: Стерлитамакский филиал БашГУ, 2022. С. 320-324.
  5. Чемерис А.В., Гарафутдинов Р.Р., Аминев Ф.Г., Алексеев Я.И. Генетические и этические аспекты судебно-медицинского ДНК-фенотипирования как предтечи геномной регистрации населения Российской Федерации // Международная научно-практическая конференция “Теория и практика фундаментальных и прикладных исследований в сфере судебно-экспертной деятельности и ДНК-регистрации населения Российской Федерации”, г. Уфа, 13-14 октября 2022 г., с. 233-243
  6. Akhmetzianova L.U., Davletkulov T.M., Garafutdinov R.R., Gubaydullin I.M., Chemeris A.V. Design primers for LAMP-amplification // В книге: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022). Abstracts the Thirteenth International Multiconference. Novosibirsk, 2022. С. 24-25.
  7. Сахабутдинова А.Р., Бурханова Г.Ф., Максимов И.В., Гарафутдинов Р.Р. Метод определения микроРНК с помощью мультимеризации // Материалы Международной научно-практической конференции «Молекулярная диагностика – 2023», г. Москва, 14-16 ноября 2023 г.
  8. Михайлова Е.В., Гарафутдинов Р.Р., Слинкин А.А. Культуры волосовидных корней растений рода withania – источник биологически активных веществ для фармацевтической и пищевой промышленности, в книге: Plamic2024. Материалы IV Международной научной конференции «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» и III Всероссийской конференции с международным участием «Механизмы адаптации микроорганизмов к различным условиям среды обитания». Иркутск, 2024. С. 62-63.

 

Защита диссертаций

07.06.2017 г. Галимова А.А. Дисс. канд. биол. наук “Фрагментация ДНК ультразвуком и ее ПЦР-амплификация с помощью сближенных праймеров”.

28.02.2025 г. Гарафутдинов Р.Р. Дисс. д-ра хим. наук “Молекулярные основы новых амплификационно-опосредованных методов анализа нуклеиновых кислот”.

 

Заведующий лабораторией – Гималова Галия Фуатовна,

кандидат биологических наук

Тел.: +7 (347) 235 60 88

e-mail: galiyagimalova@ufaras.ru

 

Основные направления научной деятельности лаборатории

  • изучение онкологических заболеваний на основе анализа полногеномных данных;
  • исследование вклада различных классов РНК в патогенез онкопатологии;
  • исследование роли молекулярных маркеров, циркулирующих в биологических жидкостях, в развитии онкопатологии и формировании резистентности к различным видам терапии.

Исследования направлены на изучение молекулярных механизмов патогенеза онкозаболеваний, в том числе с учетом этно-специфических особенностей жителей РБ.

Краткая история лаборатории

Лаборатория структурно-функциональной геномики человека создана приказом Руководителя УФИЦ РАН Мартыненко В.Б. от 18.12.2023 г. № 424/к на основании Соглашения № МНЛ-НОЦ-6 от 21.11.2023 г. между АНО «УК НОЦ РБ» и УФИЦ РАН в целях реализации технологического проекта «Геномика и цифровые системы предиктивной аналитики для персонализированной медицины».

 

Состав лаборатории

 

 

Гималова

Галия Фуатовна

к.б.н., с.н.с.

 

 

 

Вафина

Айгуль Ринатовна

м.н.с.

 

 

Мустафин

Салих Амирович

м.н.с.

 

 

Диаров

Виталий Олегович,

м.н.с.

 

Основные результаты, полученные за последние 5 лет

В лаборатории проводятся исследования генетических и эпигенетических маркеров рака легкого. У пациентов с мелкоклеточным раком легкого проведен поиск мутаций в генах BRAF, EGFR, KRAS, PIK3CA, распространенных у больных с немелкоклеточным типом рака легкого. Выявлены носители мутаций H1047X и Е545 гена PIK3CA, а также мутация Q61K в гене KRAS. Суммарная частота мутаций в гене PIK3CA составила 10%, что согласуется с данными литературы.

Кроме того, в лаборатории ведется работа по изучению молекулярно-генетических основ рака мочевого пузыря (РМП), создан банк ДНК и РНК. Проводится оценка роли в развитии рака мочевого пузыря различных классов некодирующих РНК посредством анализа их экспрессии. По результатам анализа данных из базы Атлас ракового генома выявлены дифференциально экспрессированные в нормальных и опухолевых тканях мочевого пузыря днРНК H19 и UCA1. Анализ экспрессии днРНК H19 и UCA1 в парных образцах больных РМП показал повышенную экспрессию данных днРНК в опухолевой ткани по сравнению с нормальной тканью (fold change 4.03, p=0.0003; fold change 4.8, p=0.012, соответственно).

 

Основные научные публикации лаборатории

Gilyazova, I., Gimalova, G., Nizamova, A., Galimova, E., Ishbulatova, E., Pavlov, V., Khusnutdinova, E. Non-Coding RNAs as Key Regulators in Lung Cancer. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 560. https://doi.org/10.3390/ijms25010560 (Q1)

Central Asian and Transcaucasian Parkinson’s Disease Consortium; Kaiyrzhanov R., Irina Gilyazova, Elza Khusnutdinova et al. A biobank for Parkinson’s disease and atypical parkinsonism in central Asian and Transcaucasian regions. Lancet Neurol. 2024 Sep; 23(9):859-860. doi: 10.1016/S1474-4422(24)00313-2. PMID: 39152022. (Q1)

Elena V Kovalenko, Layal Shaheen, Ekaterina Vergasova, Ekaterina Vergasova… Alexander Rakitko. GWAS and polygenic risk score of severe COVID-19 in Eastern Europe. Front. Med. 2024. DOI: 10.3389/fmed.2024.1409714 (Q1)

Султанбаев А.В., Тузанкина И.А., Мусин Ш.И., Колядина И.В., Меньшиков К.В., Султанбаев М.В., Гилязова И.Р., Кудлай Д.А. Специфический противоопухолевый иммунитет и механизмы ускользания опухоли от иммунологического надзора// Онкология. Журнал им. П.А. Герцена 2024, Т. 13, №6, с. 70-77. 10.17116/onkolog20241306170.

Мамадалиева Л.И., Иванова Е.А., Нургалиева А.Х., Хуснутдинова Э.К., Бермишева М.А. Мутация сайта сплайсинга c.290+1G>A в гене STK11 в семье с синдромом Пейтца-Егерса. Вопросы онкологии. 2024. Том 70, №1. С.127-131. (doi 10.37469/0507-3758-2024-70-1-127-131)

Галимов Ш.Н., Галимова Э.Ф., Гилязова И.Р., Громенко И.Д., Громенко Ю.Ю., Громенко Д.Д., Галимов К.Ш., Котенко В.Д., Ткешелашвили Т.З., Абдеева Г.Р., Литвицкий П.Ф., Павлов В.Н. Экспрессия экзосомальных микроРНК miR-34a и miR-210 при мужском бесплодии: связь с морфокинетическими параметрами и фрагментацией ДНК сперматозоидов. Вестник урологии. 2024;12(4):34-42. https://doi.org/10.21886/2308-6424-2024-12-4-34-42

Низамова А.Р., Гималова Г.Ф., Любченко Л.Н., Хуснутдинова Э.К. Частота соматических мутаций в генах PIK3CA и KRAS у больных мелкоклеточным раком легкого из Республики Башкортостан // Генетические аспекты мультифакториальной патологии: материалы Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, приуроченной к 80-летнему юбилею и памяти профессора Иванова Владимира Петровича (Курск, 20 сентября 2024 г.) / редкол.: В.А. Лазаренко, В.А. Липатов, А.В. Полоников [и др.]. – Курск: Изд-во КГМУ, 2024. – С.131-134.

Лаборатория геномных и пост-геномных технологий в животноводстве

Laboratory of livestock genomic and post-genomic technologies

Реализуемый проект: Разработка эффективных инструментов для развития животноводства с использованием генетических технологий и анализа больших данных (№ 075-15-2024-666, 2024-2028 гг.)

Цель проекта:

  1. Исследование генома и транскриптома племенных свиней пород ландрас, йоркшир и дюрок для идентификации новых генетических маркеров хозяйственно-ценных признаков животных и разработки эффективных постгеномных подходов направленной селекции, генетической паспортизации и получения линий с новыми характеристиками.
  2. Создание в Республике Башкортостан научной школы по геномным и пост-геномным исследованиям в области животноводства

Задачи проекта:

– Создание биобанка ДНК и РНК тканей племенных животных с целевыми признаками.

– Поиск информативных биомаркеров, ассоциированных с устойчивостью и подверженностью экономически значимым заболеваниям и хозяйственно-ценными признакам, с использованием методов GWAS, секвенирования генома и транскриптома.

– Выявление генов, задействованных в формировании хозяйственно-ценных признаков животных, с использованием комбинированных полногеномных и транскриптомных исследований.

– Разработка подходов к усовершенствованию хозяйственных признаков животных с применением методов генной инженерии и геномного редактирования.

– Разработка комплементарных классической геномной селекции подходов отбора животных по пост-геномным данным, включая биохимические, протеомные и транскриптомные маркеры и аллели, напрямую связанные с контролем генетической экспрессии.

– Развитие новой цифровой платформы SwineTSS_Russia, представляющей собой совокупность мультиомиксных данных: генетических цифровых атласов экспрессии генов, аллель-специфичной экспрессии и активности регуляторных элементов генома, связанных с полезными признаками свиней.

– Ретроспективный анализ баз метаданных по фенотипам и другим характеристикам свиней для выделения и последующего геномного и постгеномного анализа наиболее контрастных по признакам животных для выделения генетических основ фенотипических проявлений.

– Подготовка образовательных программ и проведение стажировок для обучения молодых специалистов современным методам направленной селекции, транскриптомного анализа и геномного редактирования.

Планируемые результаты:

В результате реализации данного проекта будет собрана коллекция ДНК и тканеспецифичной РНК свиней пород Ландрас, Йоркшир и Дюрок (DanBred) с изучаемыми признаками, на основе анализа которой будут разработаны генетические технологии, позволяющие повысить эффективность животноводства в Республике Башкортостан и Российской Федерации:

– способы отбора животных по изучаемым признакам (отсутствие заболеваний, высокая мясная продуктивность и др.) для проведения геномной селекции;

– способы определения экономически значимых заболеваний и особенностей животных, таких как хромота и склонность к каннибализму, и предрасположенности к ним;

– технологии генетического усовершенствования животных для придания им новых признаков;

– системно пополняемые цифровые генетические ресурсы, отражающие мультиомиксные данные свиней с различными контрастными фенотипами.

Заведующий лабораторией:

Гусев Олег Александрович 

Профессор Университета Джунтендо (Juntendo University), Токио, Япония

2010 г. – медаль им. Зельдовича РАН и Международной космической ассоциации COSPAR за генетические исследования ангидробиоза и открытия в областиустойчивости ДНК к радиации

2014 г. – Young Researcher Award (Japan Society of Cytoprotection and Cytology) за выдающиеся успехи в исследовании генетического контроля адаптаций к экстремальным условиям среды

Scopus AuthorID: 55289623600

Индустриальные партнеры: https://tavros.ru/

И.о. директора Института биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра РАН

Карунас Александра Станиславовна

доктор биологических наук, кандидат медицинских наук, доцент, профессор РАО

e-mail: carunas@list.ru

внутренний телефон — 2-54

 Karynas

Научный руководитель ИБГ УФИЦ РАН

Хуснутдинова Эльза Камилевна,

доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАО,академик АН РБ,

заслуженный деятель науки РБ, заслуженный деятель науки РФ

e-mail: ekkh@anrb.ru

внутренний телефон — 2-22

Заместитель директора по научной работе ИБГ УФИЦ РАН

Ласточкина Оксана Владимировна,

кандидат биологических наук

e-mail: oksana.lastochkina@ufaras.ru

внутренний телефон — 2-44

 

 

Ученый секретарь ИБГ УФИЦ РАН

Бермишева Марина Алексеевна,

доктор биологических наук

e-mail: molgen@anrb.ru

внутренний телефон — 2-88

 

Информация о  диссертационном совете 24.1.218.01

Ссылки на видеотрансляцию заседаний диссертационного совета

Диссертационный Совет 24.1.218.01 по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук на базе федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук утвержден приказом Минобрнауки России № 271/нк от 13.11.2018 года,  №661 /нк от 30 октября 2020 года,  03 июня 2021 года №561/нк, 25 января 2022 №75/нк по специальностям:

1.5.3.  Молекулярная биология, биологические науки

1.5.4.  Биохимия, биологические науки

1.5.7.  Генетика, биологические науки

Приказ о создании совета № 271/нк от 13.11.2018 года 

Приказ о частичных  изменениях состава совета  №661 /нк от 30 октября 2020 года

Приказ о советах по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук № 561/нк от 03 июня 2021 года  

Приказ о частичных  изменениях совета  25 января 2022 №75/нк

Приказ о частичных изменениях совета 22 марта 2022 №257/нк.

Контактная информация диссертационного совета 24.1.218.01

Председатель диссертационного совета – директор ИБГ УФИЦ РАН, член корр. РАО, доктор биологических  наук, профессор Хуснутдинова Эльза Камилевна

e-mail: molgen@anrb.ru, тел. +7 (347) 2356088,

Заместитель председателя диссертационного совета –  главный научный сотрудник ИБГ УФИЦ РАН, доктор биологических  наук, профессор  Вахитов Венер Абсатарович

Заместитель председателя диссертационного совета –   заместитель директора по научной работе  ИБГ УФИЦ РАН, доктор биологических  наук, доцент  Карунас Александра Станиславовна

Заместитель председателя диссертационного совета – главный научный сотрудник ИБГ УФИЦ РАН, доктор биологических  наук, профессор  Чемерис Алексей Викторович

Ученый секретарь диссертационного совета –  главный  научный сотрудник ИБГ УФИЦ РАН, доктор биологических  наук,  доцент Корытина Гульназ Фаритовна

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Состав  диссертационного совета 24.1.218.01 на базе Федерального государственного бюджетного  научного учреждения Уфимский федеральный исследовательский  центр Российской академии наук


п/ п
Фамилия, Имя, ОтчествоУченая степень, шифр специальности в совете
1.       Хуснутдинова Эльза Камилевна (председатель)д. биол. наук, профессор, член-корр. РАО
1.5.7.  Генетика (биологические науки)
2.       Карунас Александра Станиславовна
(зам. председателя)
д. биол. наук, доцент
1.5.7. Генетика (биологические науки)
3.       Вахитов Венер Абсатарович
(зам. председателя) 
д. биол. наук, профессор
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
4.       Чемерис Алексей Викторович
(зам. председателя)
д. биол. наук, профессор
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
5.       Корытина Гульназ Фаритовна
(ученый секретарь)
д. биол. наук, доцент
1.5.7.   Генетика (биологические науки)
6.       Баймиев Алексей Ханифовичд. биол. наук, доцент
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
7.       Баймиев Андрей Ханифовичд. биол. наук
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
8.       Вахитова Юлия Венеровнад. биол. наук, член-корр. РАН
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
9.       Веселов Дмитрий Станиславовичд. биол. наук
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
10.   Викторова Татьяна Викторовнад. мед. наук, профессор
1.5.7.  Генетика (биологические науки)
11.   Джемилева Лиля Усеиновнад. мед. наук, доцент
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
12.   Высоцкая Лидия Борисовнад. биол. наук, старший научный сотрудник 1.5.4. (Биохимия)
13.   Бермишева Марина Алексеевнад. биол. наук
1.5.7.  Генетика (биологические науки)
14.   Кудоярова Гузель Радомесовнад. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
15.   Кулуев Булат Разяповичд. биол. наук
1.5.3. Молекулярная биология (биологические науки)
16.   Максимов Игорь Владимировичд. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
17.   Мелентьев Александр Ивановичд. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
18.   Салтыкова Елена Станиславовнад. биол. наук
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
19.   Хайруллин Рамиль Магзинуровичд. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
20.   Хидиятова Ирина Михайловнад. биол. наук, профессор
1.5.7.  Генетика (биологические науки)
21.   Хусаинова Рита Игоревнад. биол. наук, доцент
1.5.7.  Генетика (биологические науки)
22.   Шакирова Фарида Миннихановнад. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)
23.   Яруллина Любовь Георгиевнад. биол. наук, профессор
1.5.4. Биохимия (биологические науки)

Объявления о защитах диссертаций 2025 г.

Объявления о защитах диссертаций 2024 г.

Объявления о защитах диссертаций 2023 г.

Объявления о защитах диссертаций 2022 г.

Объявления о защитах диссертаций 2021 г.

Объявления о защитах диссертаций 2020 г.

Объявления о защитах диссертаций 2019 г.

Объявления о защитах диссертаций 2017 г.

Объявления о защитах диссертаций 2016 г.

Объявления о защитах диссертаций 2015 г.

Объявления о защитах диссертаций 2015 г.

Диссертации соискателей

За 2025 год

За 2024 год

За 2023 год

За 2022 год

За 2021 год

За 2020 год

За 2019 год

За 2017 год

За 2016 год

За 2015 год

За 2014 год

Соискателям ученых степеней

Рекомендации по подготовке к защите диссертации.

Сайт ВАК МОН РФ  (http://vak1.ed.gov.ru)

Положение о совете по защите докторских и кандидатских диссертаций

Приказы ВАК МОН о создании  диссертационного совета

Правила оформления диссертаций и авторефератов  ГОСТ

«Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук (по состоянию на 09.02.2016)»:

Journals_VAK_09.02.2016

Perechen_Journals_VAK_2016

Информационные сайты

Высшая аттестационная комиссия: https://vak.minobrnauki.gov.ru/main

Центр информационных технологий и систем органов исполнительной власти (ЦИТиС): http://www.citis.ru/

Научная электронная библиотека: http://www.elibrary.ru/

РОСРИД – https://rosrid.ru 

Архив диссертационного совета

Защиты 2010-2013 года

Защиты 2006-2009 года

Контактная информация диссертационного совета 24.1.218.01

Адрес:

450054,  Республика Башкортостан, г. Уфа, Пр. Октября, 71,  Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (ИБГ УФИЦ РАН), ком.404

 

Телефон:

+7 (347) 2356088

факс +7 (347) 2356088

 

E-mail:

dissovet-ibg@mail.ru

 

Сайт:

ufaras.ru/?page_id=9758

Новости

Структура и контакты

Фамилия Имя ОтчествоДолжностьВнутренний  телефонE-mail
Яруллина Любовь ГеоргиевнаПредседатель профкома2-26,4-24yarullina@bk.ru
Гилязова Ирина РишатовнаЗам. председателя профкома2-33gilyasova_irina@mail.ru
Тимашева Янина РимовнаПредседатель ревизионной комиссии2-36ianina_t@mail.ru
Вершинина Зиля РифовнаКультмассовый сектор2-42zilyaver@mail.ru
Масленникова Дилара РинатовнаДетский сектор2-53dishaoil@mail.ru
Садовников Сергей ВалентиновичСпортивный сектор2-47s_sadovnikov@mail.ru
Чубукова Ольга ВячеславовнаЖилищная комиссия2-42

Контакты

Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук

проспект Октября, 71, г. Уфа, Республика Башкортостан, Российская Федерация, 450054

тел./факс: +7 347 235-60-88, e-mail: molgen@anrb.ru

Обед 13:00 -14:00

2025 © УФИЦ РАН

It-studio